{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001218646981092233],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217061393545555],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217322955885444],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001218646913296595],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3569500183782, 582.1744849505776, 0, 2, 0.2672731885386957, 0, 0.003435396177092484, 0.006489916226296015, 0.5368885802342497, 1, 0.002437360411912421],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217432842581738],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001218281077544441],
[211.738417970371, 579.5974812386805, 0, 1, 0.2675708484627144, 0, 0.001725335310054938, 0.003259385831302789, 0.7324291515372856, 1, 0.00121825906323232],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.2429255749947, 0, 1, 0.2676907865124976, 0, 0.001726391390982176, 0.003261380907385036, 0.7323092134875024, 1, 0.001217613208153262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.7882152146769, 0, 1, 0.2675790987238722, 0, 0.001718838528949929, 0.003247112555401383, 0.7324209012761278, 1, 0.001217747904557227],
[212.3838623066852, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2673407648258469, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2673407648258469, 0.001217122544123849],
[212.4523170063764, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2673717975930829, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7326282024069171, 1, 0.001217155760581766],
[212.5372221035465, 582.0578657811925, 0, 1, 0.267478650880329, 0, 0.001718042240796589, 0.003245608262114445, 0.7325213491196709, 1, 0.001217885082975908],
[212.3683770548714, 582.3196301619589, 0, 1, 0.2672349087016318, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7327650912983682, 1, 0.001217885082660525],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217155760564371],
[212.4152772539672, 581.77517761877, 0, 1, 0.2674613827838123, 0, 0.001718877048163247, 0.003247185323272874, 0.7325386172161876, 1, 0.001218400734342425],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2674597167879816, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7325402832120184, 1, 0.001217266895977162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001217204625412957],
[212.3838623066852, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672730164276239, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672730164276239, 0.00121718919205899],
[212.5159699221596, 582.0791179625794, 0, 1, 0.2674519049543714, 0, 0.001717979513678908, 0.003245489762320571, 0.7325480950456287, 1, 0.001217227895979009],
[212.5162690470927, 582.4834518496482, 0, 2, 0.2673161555420163, 0, 0.003433573938708638, 0.006486473777784732, 0.5368256159297309, 1, 0.002437074431741096],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217057028810254],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.2112255780537, 1, 0, 0.2672856471741654, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217057028305574],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217057028354369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.8145973836876, 581.7804905010513, 0, 1, 0.2678277283971301, 0, 0.001718861351192375, 0.003247155669625751, 0.7321722716028698, 1, 0.001217208936808526],
[211.4792292946834, 580.1158585900555, 0, 1, 0.2671558130303558, 0, 0.001723793592594509, 0.003256473323793606, 0.7328441869696442, 1, 0.001217437066237908],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3444331244822, 580.6552877722586, 0, 1, 0.2668491257612916, 0, 0.001722192187100541, 0.003253448057721097, 0.7331508742387085, 1, 0.001217972171070443],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217433584831744],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.888885667671, 579.7831918536912, 0, 1, 0.2676472894320988, 0, 0.001724782667125595, 0.003258341815960859, 0.7323527105679012, 1, 0.001217972133537747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217646433211361],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3183579326684, 580.6813629640724, 0, 1, 0.2668162025277022, 0, 0.00172211485296433, 0.003253301963343747, 0.7331837974722978, 1, 0.001217975153891102],
[212.2754577227802, 582.3196301619589, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787072, 1, 0.001217014070944455],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 579.5871458725746, 1, 0, 0.2681712589390809, 0.004708455666730395, 0, -0.008894893414642809, 1, 0.2681712589390809, 0.001218260309935809],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3444331244822, 580.0687589175621, 0, 1, 0.2679718551596444, 0, 0.001723933558956098, 0.003256737738700763, 0.7320281448403556, 1, 0.001217612426643801],
[212.788495318687, 582.0133281387037, 0, 1, 0.2677252228650613, 0, 0.001718173711241339, 0.003245856627114778, 0.7322747771349387, 1, 0.001217979200245284],
[211.6720764998609, 580.2003385653135, 0, 1, 0.2673057837005717, 0, 0.001723542599910823, 0.003255999165528716, 0.7326942162994283, 1, 0.001218113589754285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5476839943746, 580.2749455123146, 0, 1, 0.2671654940275832, 0, 0.001723321001076684, 0.003255580536120266, 0.7328345059724168, 1, 0.001218088660598665],
[212.4523170063764, 582.0791179625794, 0, 1, 0.267393217758184, 0, 0.001717979513678908, 0.003245489762320571, 0.7326067822418161, 1, 0.001218073623004646],
[211.888885667671, 579.7831918536912, 0, 1, 0.2676472894320988, 0, 0.001724782667125595, 0.003258341815960859, 0.7323527105679012, 1, 0.001217902984744575],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7644931621847, 579.5029513471756, 0, 1, 0.2676269504471944, 0, 0.001725616750829813, 0.003259917510025545, 0.7323730495528056, 1, 0.001222139829198527],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217438250148048],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217974820406006],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217437909520212],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 579.9461764448871, 0, 1, 0.2675680801499459, 0, 0.001724297944561121, 0.003257426111141308, 0.7324319198500541, 1, 0.001217971804319081],
[212.5476839943746, 581.9520369023662, 0, 1, 0.2675239253129944, 0, 0.001718354669437766, 0.003246198481001413, 0.7324760746870056, 1, 0.001217438250542176],
[211.3966372544834, 580.6030836422574, 0, 1, 0.266915040090077, 0, 0.001722347035649154, 0.003253740587041286, 0.733084959909923, 1, 0.001217972130568588],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3145973836876, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129063, 1, 0.001217438250148048],
[211.5351671004786, 580.4645537962622, 0, 1, 0.2670899515734275, 0, 0.00172275807964493, 0.00325451710333239, 0.7329100484265725, 1, 0.001217645905978948],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.2112255780537, 1, 0, 0.2672856471741654, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217438250542176],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3966372544834, 580.6030836422574, 0, 1, 0.266915040090077, 0, 0.001722347035649154, 0.003253740587041286, 0.733084959909923, 1, 0.00121765345881816],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001217438268727224],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5351671004786, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2672004900852027, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7327995099147973, 1, 0.001217902962053965],
[212.3838623066852, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2673407648258469, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2673407648258469, 0.001217438305263821],
[211.888885667671, 579.7831918536912, 0, 1, 0.2676472894320988, 0, 0.001724782667125595, 0.003258341815960859, 0.7323527105679012, 1, 0.001217972174144425],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217438357759203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217905084265222],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217438457201712],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3444331244822, 580.6552877722586, 0, 1, 0.2668491257612916, 0, 0.001722192187100541, 0.003253448057721097, 0.7331508742387085, 1, 0.00121765997258738],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217797236685299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217972168715818],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217793694411848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3444331244822, 580.0687589175621, 0, 1, 0.2679718551596444, 0, 0.001723933558956098, 0.003256737738700763, 0.7320281448403556, 1, 0.001217628067539215],
[212.788495318687, 582.0133281387037, 0, 1, 0.2677252228650613, 0, 0.001718173711241339, 0.003245856627114778, 0.7322747771349387, 1, 0.001218076008558185],
[211.738417970371, 580.1158585900555, 0, 1, 0.267395686602967, 0, 0.001723793592594509, 0.003256473323793606, 0.732604313397033, 1, 0.001223397907331715],
[211.6036218001697, 580.396099096571, 0, 2, 0.2671763843055169, 0, 0.003445922539991475, 0.006509801913378506, 0.5370304517195355, 1, 0.002439314491502646],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001215898199254145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6299728382048, 580.4219521885371, 0, 1, 0.2671920440456724, 0, 0.001722884526040759, 0.003254755977242048, 0.7328079559543277, 1, 0.001217619282510132],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331552, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001218067893712346],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 579.9461764448871, 0, 1, 0.2675680801499459, 0, 0.001724297944561121, 0.003257426111141308, 0.7324319198500541, 1, 0.00121797710615168],
[211.738417970371, 579.6659359383716, 0, 1, 0.267547704185093, 0, 0.00172513155940617, 0.003259000919469221, 0.7324522958149069, 1, 0.001218545773683549],
[211.7514555662778, 579.3937096667772, 0, 1, 0.2676518354301011, 0, 0.001725942106922637, 0.003260532150572748, 0.7323481645698988, 1, 0.00121722625840676],
[211.738417970371, 579.6659359383716, 0, 0, 0.267547704185093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004826218281511578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.9520369023663, 0, 1, 0.2675239253129943, 0, 0.001718354669437765, 0.003246198481001412, 0.7324760746870056, 1, 0.0007342821545294039],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217430623974687],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217779334087189],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217438339948978],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 2, 0.2675036428497422, 0, 0.003447462080199345, 0.006512710307770602, 0.5365509132383981, 1, 0.002437066322385023],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217513749183626],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001217269784284804],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.728014305656, 580.6763396030866, 0, 1, 0.267196934571664, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.732803065428336, 1, 0.001218390577360395],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217647480777517],
[211.738417970371, 580.1683835942786, 0, 1, 0.2673779509811233, 0, 0.001723637530547195, 0.003256178502014409, 0.7326220490188767, 1, 0.001218577220899731],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6219991515447, 579.9991907981948, 0, 1, 0.2673273553541192, 0, 0.001724140336512884, 0.003257128368762578, 0.7326726446458808, 1, 0.00121760388378237],
[211.6430509823728, 579.9520369023662, 0, 1, 0.2673627644000606, 0, 0.001724280520405083, 0.003257393194613731, 0.7326372355999393, 1, 0.001217783367717405],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001217603884585932],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001218529620812531],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001223653895226216],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.505331359684, 580.0897565250549, 0, 1, 0.2671887870411855, 0, 0.001723871157440114, 0.003256619854011412, 0.7328112129588145, 1, 0.00121734846984668],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6219991515448, 579.9991907981948, 0, 1, 0.2673273553541193, 0, 0.001724140336512884, 0.003257128368762578, 0.7326726446458807, 1, 0.001217603882716495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9397905088429, 579.6552973758961, 1, 0, 0.2677376271689328, 0.004718321168474857, 0, -0.008913530647890858, 1, 0.2677376271689329, 0.001217866152384986],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217863354353565],
[211.738417970371, 579.9064554728531, 0, 1, 0.2674664171693858, 0, 0.001724416051179504, 0.003257649230112036, 0.7325335828306142, 1, 0.001223149691019817],
[211.8628104758572, 579.825196740973, 0, 1, 0.2676089678567425, 0, 0.001724657716878649, 0.003258105768473661, 0.7323910321432575, 1, 0.001216158887098039],
[211.505331359684, 580.0897565250549, 0, 1, 0.2671887870411855, 0, 0.001723871157440114, 0.003256619854011412, 0.7328112129588145, 1, 0.001216032359724891],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217000128465927],
[212.0236818378722, 579.3122173711793, 0, 1, 0.2679313323833685, 0, 0.001726184896527525, 0.003260990812140472, 0.7320686676166315, 1, 0.0012198042593262],
[211.8337849583691, 579.7613029263698, 0, 1, 0.2676037133131041, 0, 0.001724847786412197, 0.003258464834877158, 0.7323962866868958, 1, 0.001216829399419373],
[211.5745962826816, 580.0204916020573, 1, 0, 0.2672762874868777, 0.004726465358175209, 0, -0.008928916095787318, 1, 0.2672762874868777, 0.001217545413756037],
[211.9661916987766, 579.6288961859624, 0, 1, 0.267770979055949, 0, 0.001725241799675857, 0.003259209177870333, 0.732229020944051, 1, 0.001218753842132577],
[211.9661916987766, 579.6288961859624, 0, 1, 0.267770979055949, 0, 0.001725241799675857, 0.003259209177870333, 0.732229020944051, 1, 0.001216696598325408],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217505458324958],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217624720737687],
[211.738417970371, 579.623583303681, 0, 1, 0.2675620229799801, 0, 0.001725257613398508, 0.003259239052076959, 0.7324379770200199, 1, 0.001218795469746261],
[211.238417970371, 580.356669914368, 0, 1, 0.2668516027996482, 0, 0.001723078327242367, 0.003255122093258413, 0.7331483972003519, 1, 0.001217545454445242],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001216896240537578],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217987103718979],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.00122018197898039],
[211.9022396580603, 579.6928482266787, 1, 0, 0.2676901902262872, 0.004719157294484793, 0, -0.008915110200140261, 1, 0.2676901902262872, 0.001218070078694148],
[211.8628104758573, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001218231512264679],
[212.0956481135096, 579.7061753438811, 0, 1, 0.2678645613461676, 0, 0.001725011812073247, 0.003258774700972451, 0.7321354386538323, 1, 0.001217935651985846],
[211.9976066460585, 579.5974812386805, 0, 1, 0.2678106646828089, 0, 0.001725335310054938, 0.003259385831302789, 0.7321893353171911, 1, 0.001223161372961424],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 1, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0.001724564106760517, -0.005664078880542705, 0.9284527169307925, 0.4634191946439573, 0.002437526048081479],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1430509823728, 579.4520369023662, 0, 1, 0.2679944004569949, 0, 0.001725768374800783, 0.003260203947693509, 0.7320055995430051, 1, 0.001217348466289895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[209.1820963825817, 570.4927832665342, 1.5, 2.5, 0.2682940054150799, 0.00717078576962241, 0.004382176380366236, -0.005268050725797805, 0.8226794828896304, 0.503144869212595, 0.001227578935501189],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8020708861542, 580.0522056742723, 0, 2, 0.2674760712364374, 0, 0.003447965511440703, 0.006513661355746932, 0.536591306211205, 1, 0.002445369243687781],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001223453268101405],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.6870749415397, 564.0905360483582, 1.25, 4.25, 0.2652943665274706, 0.006136864601540196, 0.007534251557866337, 0.002639848161544741, 0.6219317176415029, 0.7254005732567997, 0.001228719665238204],
[211.5745962826816, 580.0580424528399, 1, 0, 0.2672636093183711, 0.004726465358175209, 0, -0.008928916095787318, 1, 0.2672636093183711, 0.001217673069992542],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001218253451306622],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218344069235321],
[211.0796196436674, 580.4017239016983, 0, 1, 0.2666893179037629, 0, 0.001722944572386157, 0.003254869412703706, 0.7333106820962372, 1, 0.00121775940938959],
[210.9552271381811, 580.1214833951828, 0, 1, 0.2666684840158545, 0, 0.001723776878848655, 0.003256441749324511, 0.7333315159841456, 1, 0.001217625782897342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1560885782796, 582.1798106307718, 1, 0, 0.2670861140602244, 0.004713510730242503, 0, -0.008904443095966596, 1, 0.2670861140602243, 0.001217439435375703],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217056039302524],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217974895246374],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217789577674573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.7288646073097, 0, 1, 0.2674188295768787, 0, 0.001721973989834658, 0.003253035854323472, 0.7325811704231213, 1, 0.00121818049250199],
[211.728014305656, 580.6763396030866, 0, 1, 0.267196934571664, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.732803065428336, 1, 0.001217636894087137],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.7224022984416, 579.6819516103009, 1, 0, 0.268451834280229, 0.004700962330225272, 0, -0.008880737514226441, 1, 0.2684518342802289, 0.001218416842285627],
[212.2541163706566, 580.1502375380859, 0, 1, 0.2678608658870405, 0, 0.001723691442829672, 0.003256280349422629, 0.7321391341129595, 1, 0.001218428580469247],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217823441900905],
[211.9872029813435, 580.1579622517115, 0, 1, 0.2676115594532162, 0, 0.001723668492144442, 0.003256236992552913, 0.7323884405467838, 1, 0.001217743298851243],
[211.728014305656, 580.6763396030866, 0, 1, 0.267196934571664, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.732803065428336, 1, 0.001217505392865683],
[211.7541163706566, 580.650237538086, 0, 1, 0.2672298749068248, 0, 0.001722207165952305, 0.003253476354746565, 0.7327701250931753, 1, 0.001217505458140696],
[212.3918359933453, 580.0125179153972, 0, 1, 0.268034665566471, 0, 0.001724100720436285, 0.003257053528771762, 0.7319653344335291, 1, 0.001217505392637306],
[212.2594292529379, 580.1449246558046, 0, 1, 0.2678675706486374, 0, 0.00172370722814354, 0.003256310169961318, 0.7321324293513627, 1, 0.001217624794169591],
[211.8233812936542, 580.5809726150884, 1, 0, 0.2673172859901384, 0.004720914159205511, 0, -0.008918429149184457, 1, 0.2673172859901385, 0.001217703233354091],
[212.2594292529379, 580.1449246558046, 0, 1, 0.2678675706486373, 0, 0.00172370722814354, 0.003256310169961318, 0.7321324293513627, 1, 0.00121689691570865],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.00121794655752705],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.00121793565633836],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217906532461038],
[212.0825699693417, 580.3217839394008, 0, 1, 0.2676443774232042, 0, 0.001723181909890916, 0.0032553177745356, 0.7323556225767958, 1, 0.00121778602174118],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217743189642215],
[212.0002405772504, 580.1449246558046, 0, 1, 0.2676280180475233, 0, 0.00172370722814354, 0.003256310169961318, 0.7323719819524767, 1, 0.001217954935767462],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001217703233576135],
[211.8918359933453, 580.5125179153972, 0, 1, 0.2674036745862554, 0, 0.001722615738918033, 0.003254248202936182, 0.7325963254137446, 1, 0.001217545454628243],
[212.1885755198155, 580.2157783889271, 1, 0, 0.2677781545156076, 0.004712789072409857, 0, -0.008903079789193084, 1, 0.2677781545156076, 0.001217786018991605],
[212.3918359933453, 580.0125179153972, 0, 1, 0.268034665566471, 0, 0.001724100720436285, 0.003257053528771762, 0.7319653344335291, 1, 0.001217743301794303],
[212.1510246690328, 580.2533292397097, 1, 0, 0.2677307660193211, 0.004713623238728423, 0, -0.008904655639327163, 1, 0.2677307660193211, 0.001218069901413584],
[212.3918359933453, 580.0125179153972, 1, 0, 0.268034665566471, 0.004708278900283776, 0, -0.008894559479524109, 1, 0.2680346655664709, 0.001218566352283603],
[212.2594292529379, 580.1449246558046, 0, 1, 0.2678675706486374, 0, 0.00172370722814354, 0.003256310169961318, 0.7321324293513627, 1, 0.001216957421770119],
[212.1036218001697, 580.2078127764815, 0, 1, 0.2677023359046953, 0, 0.001723520397311917, 0.003255957221892677, 0.7322976640953047, 1, 0.001221586950784053],
[211.8233812936542, 580.5809726150883, 1, 0, 0.2673172859901384, 0.004720914159205512, 0, -0.008918429149184458, 1, 0.2673172859901385, 0.00121794638657051],
[212.228014305656, 580.3830751757383, 0, 1, 0.2677580683920494, 0, 0.001722999933616608, 0.003254973997365646, 0.7322419316079506, 1, 0.00121793404487573],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001218070078333918],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.00122362909112662],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217936438005349],
[212.0825699693417, 580.3217839394008, 0, 1, 0.2676443774232041, 0, 0.001723181909890916, 0.0032553177745356, 0.7323556225767959, 1, 0.001218069901430245],
[211.9872029813435, 580.3534980116158, 0, 1, 0.2675455176235194, 0, 0.001723087744669689, 0.003255139884020012, 0.7324544823764806, 1, 0.001217636374014724],
[212.1220573776579, 580.3752158631759, 0, 1, 0.2676628230027936, 0, 0.001723023266099894, 0.003255018075502219, 0.7323371769972064, 1, 0.001216957421898421],
[211.9872029813435, 580.1579622517115, 0, 1, 0.2676115594532162, 0, 0.001723668492144442, 0.003256236992552913, 0.7323884405467838, 1, 0.001217892440399076],
[211.8313955285753, 580.5729583801673, 1, 0, 0.2673273998100355, 0.004720735552464901, 0, -0.008918091737507825, 1, 0.2673273998100355, 0.00121693710570989],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1115954868298, 580.6973914339146, 0, 1, 0.2675443883534511, 0, 0.001722067318970906, 0.003253212165364323, 0.7324556116465488, 1, 0.00121760389708312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001222872465005374],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001223219256269303],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1510246690328, 580.9630241467431, 1, 0, 0.2674911949747988, 0.004713623238728423, 0, -0.008904655639327163, 1, 0.2674911949747989, 0.001218196663768064],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.7719983809158, 0, 1, 0.2674042794042246, 0, 0.001721846099308875, 0.003252794252261967, 0.7325957205957754, 1, 0.001217711590880046],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001216762991617628],
[211.7043528121465, 578.2389808800865, 1, 3.5, 0.2679994168982099, 0.004723568442106332, 0.006052860695543146, 0.002511208291665084, 0.6503442576611776, 0.7543586805245053, 0.003676290751859207],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.6763396030866, 0, 1, 0.2674365498004013, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.7325634501995987, 1, 0.001217444543896941],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.00126383706490481],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 0, 0.2675240260047297, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002029803211992651],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001015895050979197],
[211.5825699693417, 580.8217839394009, 1, 0, 0.2670133864429884, 0.004726287236916065, 0, -0.008928579601249169, 1, 0.2670133864429884, 0.001218417985797547],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001218851592507169],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001218426089931094],
[211.7858304428716, 580.618523465871, 1, 0, 0.2672698974938519, 0.004721751204548815, 0, -0.008920010438175776, 1, 0.2672698974938519, 0.001217464284270213],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001218315234644089],
[212.228014305656, 580.3830751757383, 0, 1, 0.2677580683920495, 0, 0.001722999933616608, 0.003254973997365646, 0.7322419316079505, 1, 0.001218112495220367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217992398189673],
[211.728014305656, 580.6763396030866, 0, 1, 0.267196934571664, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.732803065428336, 1, 0.001219118117910186],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.728014305656, 580.650237538086, 0, 1, 0.2672057364181785, 0, 0.001722207165952305, 0.003253476354746565, 0.7327942635818214, 1, 0.001218196473949797],
[211.8233812936542, 580.5809726150884, 1, 0, 0.2673172859901384, 0.004720914159205511, 0, -0.008918429149184457, 1, 0.2673172859901385, 0.001218252256149326],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001217439944883242],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.32764439688, 0, 1, 0.2675121398281395, 0, 0.001717246312487372, 0.003244104648620492, 0.7324878601718605, 1, 0.001217790302156038],
[211.6720764998609, 580.2003385653135, 0, 1, 0.2673057837005717, 0, 0.001723542599910823, 0.003255999165528716, 0.7326942162994283, 1, 0.001217146097961448],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5476839943746, 579.920098058798, 0, 1, 0.2672852752712078, 0, 0.001724375484394076, 0.003257572594106922, 0.7327147247287922, 1, 0.001217972183910354],
[212.4523170063764, 582.0791179625794, 0, 1, 0.267393217758184, 0, 0.001717979513678908, 0.003245489762320571, 0.7326067822418161, 1, 0.001217434539857214],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217057028417364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.8358981875502, 582.1638227091906, 0, 1, 0.2677182049164449, 0, 0.001717729547924059, 0.003245017544059623, 0.7322817950835551, 1, 0.001222723912558432],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 579.9461764448871, 0, 1, 0.2675680801499459, 0, 0.001724297944561121, 0.003257426111141308, 0.7324319198500541, 1, 0.001218216943531802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.9520369023662, 0, 1, 0.2675239253129944, 0, 0.001718354669437766, 0.003246198481001413, 0.7324760746870056, 1, 0.001218076478218277],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217973271262618],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217791538156519],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2674597167879816, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7325402832120184, 1, 0.001217053775347986],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001218403512019662],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001218779075963915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218332733308694],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218080777750218],
[212.8068726700621, 581.7882152146769, 0, 1, 0.2678180068247931, 0, 0.001718838528949929, 0.003247112555401383, 0.7321819931752069, 1, 0.001216844062008671],
[212.2754577227802, 582.3196301619588, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787071, 1, 0.001217307824311203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4392388622085, 579.7463206987147, 0, 1, 0.2681685323574379, 0, 0.001724892361187894, 0.003258549042504217, 0.7318314676425621, 1, 0.001217717540258544],
[212.8358981875502, 581.8521090292801, 0, 1, 0.2678232164757936, 0, 0.001718649781416669, 0.003246755986430693, 0.7321767835242063, 1, 0.001222992289342224],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.0159307169694, 0, 1, 0.2676170705591552, 0, 0.001718166028149999, 0.003245842112742464, 0.7323829294408448, 1, 0.00121798452369128],
[210.738417970371, 580.856669914368, 1, 0, 0.266219966742714, 0.004745219261067986, 0, -0.008964344690457648, 1, 0.266219966742714, 0.001283269793532851],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0476839943746, 582.5474038903644, 0, 1, 0.2668625658873107, 0, 0.001716598500519969, 0.003242880846420654, 0.7331374341126893, 1, 0.001217176346820852],
[212.9949180913316, 582.0048028054092, 0, 1, 0.2679182300228714, 0, 0.001718198879424618, 0.003245904173130617, 0.7320817699771286, 1, 0.001216982453594165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217975992588077],
[211.7514555662778, 579.5844436427736, 0, 1, 0.2675873238885353, 0, 0.001725374121007894, 0.003259459150308913, 0.7324126761114647, 1, 0.001217223023643115],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217391052538034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3343088546555, 579.0015903543959, 0, 1, 0.2683238673575733, 0, 0.001727110972852283, 0.003262740292391663, 0.7316761326424267, 1, 0.001216446316227318],
[212.3212712587487, 579.5855303059009, 0, 1, 0.2681139634604025, 0, 0.001725370886109264, 0.003259453039158983, 0.7318860365395975, 1, 0.001216463412564358],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.8391106385634, 581.7559772461756, 0, 1, 0.2678585783926178, 0, 0.001718933778271848, 0.003247292493926084, 0.7321414216073822, 1, 0.001216772357983837],
[211.2330782149028, 580.1028209941486, 0, 1, 0.2669322577505108, 0, 0.001723832334216639, 0.003256546511824659, 0.7330677422494891, 1, 0.001217563741047813],
[211.2200406189959, 580.3750472657431, 0, 1, 0.2668283872041293, 0, 0.001723023766633644, 0.003255019021076454, 0.7331716127958707, 1, 0.001217786984767296],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217791936124286],
[211.7514555662778, 579.5844436427736, 0, 1, 0.2675873238885353, 0, 0.001725374121007894, 0.003259459150308913, 0.7324126761114647, 1, 0.001218008054104905],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001220241408711401],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218093529119891],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9523170063764, 581.6427708783626, 0, 1, 0.2680010489031194, 0, 0.001719268338003856, 0.00324792452136091, 0.7319989510968806, 1, 0.001223542918818392],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4922668905903, 579.5844436427736, 0, 1, 0.2673473559194997, 0, 0.001725374121007894, 0.003259459150308913, 0.7326526440805003, 1, 0.001217348466914996],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7644931621847, 579.0530286954918, 0, 1, 0.2677792124088723, 0, 0.001726957550421298, 0.003262450457195661, 0.7322207875911277, 1, 0.0012178306239909],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9203006149529, 579.156409918411, 1, 0, 0.2678884333127073, 0.004718755103207139, 0, -0.008914350407800638, 1, 0.2678884333127073, 0.001218616207794977],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2644931621847, 579.8122173711793, 0, 1, 0.2670594271695154, 0, 0.001724696324154599, 0.003258178702707072, 0.7329405728304846, 1, 0.001217905047453601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7644931621847, 579.4075843591775, 0, 1, 0.2676592098973146, 0, 0.001725900776921994, 0.003260454072753487, 0.7323407901026855, 1, 0.001218069901413584],
[212.1217233053234, 579.1617228006924, 0, 1, 0.2680729950173928, 0, 0.001726633443875108, 0.003261838177206764, 0.7319270049826072, 1, 0.001217911490202865],
[210.6029747370615, 577.5181964347834, 1, 0.5, 0.2672215674956673, 0.004748271012071427, 0.0008657735861600039, -0.007334549421400468, 0.9703989274115808, 0.3727234998756663, 0.001219217496571936],
[212.5607215902814, 581.77517761877, 0, 1, 0.2675955119262968, 0, 0.001718877048163247, 0.003247185323272874, 0.7324044880737033, 1, 0.001217723649685451],
[211.3183579326684, 580.6813629640724, 0, 1, 0.2668162025277022, 0, 0.00172211485296433, 0.003253301963343747, 0.7331837974722978, 1, 0.001217979996328415],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2754577227802, 582.3196301619588, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787071, 1, 0.001216922220026267],
[212.319910265969, 582.1822582866788, 0, 1, 0.267236413781921, 0, 0.00171767515372751, 0.003244914786252196, 0.732763586218079, 1, 0.001218762931450599],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1115954868298, 580.5978203169444, 0, 1, 0.2675779942285125, 0, 0.001722362649336346, 0.003253770083354559, 0.7324220057714874, 1, 0.001217606797400501],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.2778588383949, 0, 1, 0.2675288933879436, 0, 0.001717393139411024, 0.003244382024033732, 0.7324711066120564, 1, 0.001217958692253517],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.0852444487947, 580.864690889461, 0, 2, 0.2665386219883161, 0, 0.003443142665355435, 0.006504550363752933, 0.5379655930347983, 1, 0.002436949198309809],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.00121767937145269],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 0, 0.2674832388565824, 0, 0, 0, 1, 1, 1.361395704974615e-05],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001204298568490841],
[211.4107745949923, 579.856669914368, 0, 1, 0.26717992261906, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7328200773809399, 1, 0.001217972161435497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4107745949923, 580.2115173678847, 0, 1, 0.267060158286834, 0, 0.001723509392809842, 0.003255936432937663, 0.732939841713166, 1, 0.001217607065703232],
[211.4107745949923, 579.856669914368, 0, 0, 0.26717992261906, 0, 0, 0, 1, 1, 3.974217921466373e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2673407648258469, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2673407648258469, 0.00117796298202793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6776879843054, 579.9173999004336, 0, 2, 0.2674065203587101, 0, 0.003448767014653089, 0.006515175500967848, 0.5366932064129329, 1, 0.002437243368358473],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217518690849344],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217978936294667],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217423540793213],
[211.5055803327186, 580.1417116820217, 0, 1, 0.2671714821311868, 0, 0.001723716774476827, 0.003256328204243278, 0.7328285178688132, 1, 0.001217613214202487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001218077069495392],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217790294509505],
[211.8233812936542, 580.5809726150883, 1, 0, 0.2673172859901384, 0.004720914159205511, 0, -0.008918429149184457, 1, 0.2673172859901385, 0.001217751642882986],
[212.1430104341117, 580.1684241425395, 1, 0, 0.2677520494797153, 0.004713801307682415, 0, -0.008904992035053986, 1, 0.2677520494797152, 0.001218872008422489],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.3276443968799, 0, 1, 0.2675121398281396, 0, 0.001717246312487373, 0.003244104648620493, 0.7324878601718604, 1, 0.001218076831714544],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1430509823728, 579.4520369023662, 0, 1, 0.2679944004569949, 0, 0.001725768374800783, 0.003260203947693509, 0.7320055995430051, 1, 0.001218014874365168],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001217593441645914],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217641982672473],
[211.3356728934271, 580.2594149913119, 0, 1, 0.2669744622318814, 0, 0.001723367125400236, 0.003255667671047483, 0.7330255377681186, 1, 0.001217394623160532],
[211.1718512057377, 580.4232366790012, 1, 0, 0.2667675108621766, 0.004735479630880032, 0, -0.008945945245172005, 1, 0.2667675108621765, 0.001216890617815295],
[211.3356728934271, 580.2594149913119, 0, 1, 0.2669744622318814, 0, 0.001723367125400236, 0.003255667671047483, 0.7330255377681186, 1, 0.001217392187301709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3463114559027, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672383893300694, 0.004709288299588227, 0, -0.008896466367867424, 1, 0.2672383893300694, 0.001217659715925083],
[211.2200406189959, 580.3228431357418, 0, 1, 0.266845985168939, 0, 0.001723178764765758, 0.003255311832979591, 0.733154014831061, 1, 0.001218191922900333],
[211.018668080524, 580.5242156742138, 1, 0, 0.2665915800790761, 0.004738917220434751, 0, -0.008952439304977763, 1, 0.2665915800790761, 0.001217317999846235],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2884953186871, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671744041200828, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328255958799172, 1, 0.001217959208755569],
[212.4528782566483, 579.5556807733942, 0, 1, 0.2682456847648657, 0, 0.001725459749899336, 0.003259620914572294, 0.7317543152351343, 1, 0.001218215737610651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9049141375132, 581.8969093198775, 0, 1, 0.2678716981440431, 0, 0.00171851746242956, 0.003246506018421994, 0.7321283018559569, 1, 0.001218077532563253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 579.7937235675779, 0, 1, 0.2677346673470866, 0, 0.001724751337159732, 0.003258282629525484, 0.7322653326529134, 1, 0.001218218726225785],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.0159307169694, 0, 1, 0.2676170705591552, 0, 0.001718166028149999, 0.003245842112742464, 0.7323829294408448, 1, 0.001218075328864954],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7644931621847, 579.5029513471757, 0, 1, 0.2676269504471944, 0, 0.001725616750829812, 0.003259917510025545, 0.7323730495528056, 1, 0.001217650171906563],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217434919469064],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2200406189959, 580.3228431357418, 0, 1, 0.266845985168939, 0, 0.001723178764765758, 0.003255311832979591, 0.733154014831061, 1, 0.001217612492580825],
[212.2884953186871, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671744041200828, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328255958799172, 1, 0.001218080400183879],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.0159307169694, 0, 1, 0.2676170705591552, 0, 0.001718166028149999, 0.003245842112742464, 0.7323829294408448, 1, 0.001217885082660525],
[212.3463114559026, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672383893300694, 0.004709288299588228, 0, -0.008896466367867426, 1, 0.2672383893300694, 0.001217208195436166],
[212.3145973836876, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129063, 1, 0.001217831727050546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.6730724154903, 578.126547221765, 0.375, 2.375, 0.2670805958455867, 0.001780009166337231, 0.004108097113708511, 0.004398065016965961, 0.5854072279116358, 0.5744950618443747, 0.002447221638367097],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2674597167879816, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7325402832120184, 1, 0.001221003377929133],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 580.0207833918884, 1, 0, 0.2674277957314105, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674277957314104, 0.001255776497122704],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0956481135096, 579.5154413678847, 0, 1, 0.2679291017164239, 0, 0.001725579559432629, 0.003259847250573762, 0.7320708982835762, 1, 0.001217402856796996],
[211.738417970371, 579.6659359383716, 0, 1, 0.267547704185093, 0, 0.00172513155940617, 0.003259000919469221, 0.7324522958149069, 1, 0.00121750909448229],
[211.738417970371, 579.6659359383716, 0, 0, 0.267547704185093, 0, 0, 0, 1, 1, 6.579161873905001e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.9520369023663, 0, 1, 0.2675239253129943, 0, 0.001718354669437765, 0.003246198481001412, 0.7324760746870056, 1, 0.001152161344678191],
[211.4107745949923, 579.7613029263698, 0, 1, 0.2672121281849511, 0, 0.001724847786412197, 0.003258464834877158, 0.7327878718150489, 1, 0.001217113584439329],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2673407648258469, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2673407648258469, 0.001217434786389841],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001217446960243374],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217660712260324],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217976650001264],
[212.3918765416064, 582.2032113431327, 1, 0, 0.2672957331098114, 0.004708278001414549, 0, -0.008894557781441652, 1, 0.2672957331098114, 0.00121736072899478],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1430509823728, 582.4520369023663, 1, 0, 0.2669825854915748, 0.004713800406703357, 0, -0.008904990332985781, 1, 0.2669825854915748, 0.001217204623545953],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217432115459318],
[212.3463114559026, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672383893300694, 0.004709288299588228, 0, -0.008896466367867426, 1, 0.2672383893300694, 0.001217278801919912],
[212.5793980665895, 582.0156898181496, 0, 1, 0.2675317294403228, 0, 0.001718166739306374, 0.003245843456210601, 0.7324682705596772, 1, 0.00121769589670378],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4107745949923, 580.4960269696571, 0, 1, 0.2669642111638477, 0, 0.001722664675622785, 0.003254340650822207, 0.7330357888361523, 1, 0.001218412835809247],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217101861415343],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4792292946834, 581.4489808569101, 0, 1, 0.2667066533731376, 0, 0.001719841349667946, 0.003249007015927747, 0.7332933466268624, 1, 0.001219012646906636],
[211.738417970371, 580.878078501312, 0, 1, 0.267138545454101, 0, 0.001721531655283048, 0.003252200226047733, 0.732861454545899, 1, 0.001218289655604228],
[211.738417970371, 580.5663648214014, 0, 1, 0.2672436448310807, 0, 0.001722455968160726, 0.003253946374914933, 0.7327563551689193, 1, 0.001217919307096413],
[210.2601139973127, 576.5760845627409, 0.6875, 2.5625, 0.2672222177653982, 0.003269759475203113, 0.004444339730017293, 0.002218936932408492, 0.6606799222774451, 0.6359509077154353, 0.001225536669786716],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 580.5663648214014, 0, 0, 0.2672436448310807, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001154519569364429],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.4022513438812, 0, 1, 0.2673724149734465, 0, 0.001717026329641619, 0.00324368907202712, 0.7326275850265536, 1, 0.001102461261794453],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217045545556367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6299728382048, 580.4219521885371, 0, 1, 0.2671920440456724, 0, 0.001722884526040759, 0.003254755977242048, 0.7328079559543277, 1, 0.00121761997291098],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5055803327186, 580.1417116820217, 0, 1, 0.2671714821311867, 0, 0.001723716774476827, 0.003256328204243278, 0.7328285178688132, 1, 0.001217272965546615],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001217960181562714],
[211.6219991515447, 580.7088857052282, 0, 1, 0.2670879088473233, 0, 0.001722033233201819, 0.003253147772853394, 0.7329120911526767, 1, 0.001218029036772478],
[211.9528281047498, 580.0927660113351, 1, 1, 0.2676018018145622, 0.004718030936137297, 0.001723862214100529, -0.005656379401883261, 0.9283892756655998, 0.4635928792947243, 0.002462281416806279],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.4022513438812, 0, 1, 0.2673724149734465, 0, 0.001717026329641619, 0.00324368907202712, 0.7326275850265536, 1, 0.00121795800015747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217658990948797],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3248055777829, 580.7012192177158, 0, 1, 0.2668154820194791, 0, 0.001722055967692193, 0.00325319072130253, 0.7331845179805209, 1, 0.001219981654151286],
[212.4547646622834, 582.4022513438811, 0, 1, 0.2672867703046553, 0, 0.001717026329641619, 0.00324368907202712, 0.7327132296953447, 1, 0.001218736217475003],
[212.2754577227801, 582.3196301619589, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787072, 1, 0.001217436895506483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217231055351856],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217698361462817],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001223170334619514],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8068726700621, 579.7882152146769, 0, 1, 0.2675697157697654, 0, 0.001724767723382808, 0.003258313585260878, 0.7324302842302346, 1, 0.001217564622097561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.7115056820639, 581.8835822026751, 1, 0, 0.2676979872205289, 0.004701203147396653, 0, -0.008881192449607268, 1, 0.267697987220529, 0.001217776272117818],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217681815273601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0971894488496, 0, 1, 0.2674750584791393, 0, 0.001717926178181406, 0.0032453890045352, 0.7325249415208608, 1, 0.001222426285909396],
[212.7115056820639, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2676428072967441, 0.004701203147396654, 0, -0.008881192449607269, 1, 0.2676428072967441, 0.001217230791997785],
[212.7115056820639, 581.8835822026751, 1, 0, 0.2676979872205288, 0.004701203147396654, 0, -0.008881192449607269, 1, 0.2676979872205288, 0.001217231055351856],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217885082995137],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217155760581766],
[212.9523170063764, 581.6427708783626, 0, 1, 0.2680010489031194, 0, 0.001719268338003856, 0.00324792452136091, 0.7319989510968806, 1, 0.001223099786038819],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.4242204663032, 575.3485172340872, 1.5, 0.5, 0.2677927222088691, 0.007128456965058385, 0.0008690384784576914, -0.01182486662651761, 0.9641435289659815, 0.2677927222088692, 0.001219972037678472],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217992609848325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4547646622833, 582.4022513438812, 0, 1, 0.2672867703046552, 0, 0.001717026329641619, 0.00324368907202712, 0.7327132296953448, 1, 0.001218281995045433],
[212.5476839943746, 581.9520369023662, 0, 1, 0.2675239253129944, 0, 0.001718354669437766, 0.003246198481001413, 0.7324760746870056, 1, 0.001217957633841669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.00121860988446656],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 0, 0.2674832388565824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005227145274484229],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.0006943843891683926],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2722447489971, 580.3228431357418, 1, 0, 0.2668943352257886, 0.004733229398816935, 0, -0.008941694260183253, 1, 0.2668943352257886, 0.001226014429872431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3145973836877, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870938, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129062, 1, 0.001218305909502495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2200406189959, 580.1158585900555, 0, 1, 0.2669157823246899, 0, 0.001723793592594509, 0.003256473323793606, 0.7330842176753101, 1, 0.00123250631117979],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001218305923819534],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001218646969408959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.0130560733096, 580.5820318114294, 0, 1, 0.2665669093995621, 0, 0.001722409487734191, 0.003253858567262242, 0.7334330906004379, 1, 0.001217749926890397],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2722447489971, 580.2591902199586, 0, 1, 0.2669157981796179, 0, 0.001723367792970122, 0.003255668932174994, 0.733084201820382, 1, 0.001216821318102599],
[211.505331359684, 580.0897565250549, 0, 1, 0.2671887870411855, 0, 0.001723871157440114, 0.003256619854011412, 0.7328112129588145, 1, 0.001217662468385425],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001217658986324004],
[211.0391581383102, 580.5559297464288, 0, 1, 0.2665998834103917, 0, 0.001722486928066988, 0.003254004862258941, 0.7334001165896082, 1, 0.001217262788743338],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3145973836877, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870938, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129062, 1, 0.00121765747556883],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.785475768939, 0, 1, 0.2675800215336687, 0, 0.001718846622422658, 0.003247127845038235, 0.7324199784663312, 1, 0.001216508805894428],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2674597167879816, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7325402832120184, 1, 0.001217266974470358],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217885139502054],
[212.3918765416064, 582.4362979538196, 1, 0, 0.2672173475436214, 0.004708278001414549, 0, -0.008894557781441652, 1, 0.2672173475436214, 0.001217058888692355],
[212.5476839943746, 582.0213018253638, 0, 1, 0.2675006044630525, 0, 0.001718150172276772, 0.003245812158907846, 0.7324993955369475, 1, 0.001217117014963602],
[212.3145973836877, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870938, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129062, 1, 0.001217155760564371],
[212.2884953186871, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671744041200828, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328255958799172, 1, 0.001217885082975827],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[213.0476839943746, 581.5474038903644, 0, 1, 0.2681210685073836, 0, 0.001719550277948664, 0.003248457143081471, 0.7318789314926164, 1, 0.001217266895977162],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217117015060635],
[212.5085443334671, 582.0865435512719, 1, 0, 0.2674425598315463, 0.00470569314347571, 0, -0.008889674644063842, 1, 0.2674425598315463, 0.001221059021223263],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217189375685555],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217266895962009],
[212.7884953186871, 582.0133281387037, 0, 1, 0.2677252228650613, 0, 0.001718173711241339, 0.003245856627114778, 0.7322747771349387, 1, 0.001217885042631183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4232914888883, 581.8169489423341, 0, 1, 0.2674547078772486, 0, 0.001718753642048186, 0.003246952192854351, 0.7325452921227513, 1, 0.00121711697715664],
[212.7115056820639, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2676428072967441, 0.004701203147396654, 0, -0.008881192449607269, 1, 0.2676428072967441, 0.001217230792040082],
[212.1904538512359, 582.1978984608513, 0, 1, 0.2671117385264402, 0, 0.001717629010073184, 0.0032448276148066, 0.7328882614735598, 1, 0.001217117017832284],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001216993230090629],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 0, 0.2674832388565824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000344854349204763],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.0008731718311967863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217957778129066],
[212.2754577227802, 582.3196301619588, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787071, 1, 0.001218281221048786],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001217463955021513],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7858208392341, 579.8353691105054, 0, 1, 0.2675342999000323, 0, 0.0017246274602635, 0.003258048609739271, 0.7324657000999677, 1, 0.001222348656697371],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217487072251499],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217723206488007],
[212.0673582057968, 580.3111951675461, 0.5, 1, 0.2676338945608459, 0.002357741447011304, 0.001723213352296749, -0.001198707213272254, 0.7985247174460821, 0.3732528686715437, 0.001218179020053322],
[212.5607215902814, 581.77517761877, 0, 1, 0.2675955119262968, 0, 0.001718877048163247, 0.003247185323272874, 0.7324044880737032, 1, 0.001217885082975827],
[212.5476839943746, 582.0156898181496, 0, 1, 0.2675024938218771, 0, 0.001718166739306374, 0.003245843456210601, 0.7324975061781229, 1, 0.001218321152984314],
[212.5476839943746, 582.4022513438812, 1, 0, 0.2673724149734465, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2673724149734464, 0.001217432842581738],
[212.5476839943746, 581.785475768939, 0, 1, 0.2675800215336687, 0, 0.001718846622422658, 0.003247127845038235, 0.7324199784663312, 1, 0.001216992835781679],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331552, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001217885082975908],
[212.682538390689, 582.0054688261413, 0, 1, 0.2676302353366944, 0, 0.001718196913195542, 0.003245900458664706, 0.7323697646633056, 1, 0.001217058920143051],
[212.3838623066852, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672730164276239, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672730164276239, 0.001217525750914631],
[212.5793980665895, 582.0156898181494, 0, 1, 0.2675317294403228, 0, 0.001718166739306374, 0.003245843456210601, 0.7324682705596772, 1, 0.001217059029671331],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 1, 0, 0.2674597167879816, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674597167879816, 0.001219806469640484],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217885083045383],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217155761400544],
[212.8068726700621, 581.7882152146769, 0, 1, 0.2678180068247931, 0, 0.001718838528949929, 0.003247112555401383, 0.7321819931752069, 1, 0.00121705889438087],
[212.2807706050615, 582.3143172796775, 0, 1, 0.2671559059975641, 0, 0.001717285614187833, 0.003244178894713343, 0.7328440940024359, 1, 0.00121711701774868],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.7754577227802, 581.8196301619588, 0, 1, 0.2677784710313294, 0, 0.001718745721456036, 0.003246937229811702, 0.7322215289686707, 1, 0.001217058888692355],
[212.704256242249, 581.5791179625794, 1, 0, 0.2677939173222543, 0.004701363374981548, 0, -0.008881495140636048, 1, 0.2677939173222543, 0.001217432842581738],
[212.6720764998609, 582.0159307169694, 0, 1, 0.2676170705591552, 0, 0.001718166028149999, 0.003245842112742464, 0.7323829294408448, 1, 0.00121788513981769],
[212.5346463984677, 582.2242631739607, 0, 1, 0.2674202753043801, 0, 0.001717551231115927, 0.00324468068010366, 0.7325797246956199, 1, 0.001217266895944536],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218321296075431],
[212.586823655282, 582.0082642294569, 1, 0, 0.267541074563148, 0.004703960399829576, 0, -0.008886401262909132, 1, 0.2675410745631479, 0.001219806469640484],
[213.0950868632377, 581.526103086502, 1, 0, 0.2681719158240873, 0.004692740760568497, 0, -0.008865205885392212, 1, 0.2681719158240874, 0.001217266895760895],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217117018014349],
[212.5476839943746, 581.7882152146768, 0, 1, 0.2675790987238723, 0, 0.001718838528949929, 0.003247112555401384, 0.7324209012761278, 1, 0.001217884964994118],
[212.5476839943746, 581.8143172796775, 0, 1, 0.2675703063004978, 0, 0.001718761416315063, 0.003246966879469272, 0.7324296936995022, 1, 0.001218281221772144],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.00121788508308141],
[212.4523170063764, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2673717975930829, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7326282024069171, 1, 0.001217189375722014],
[212.680090734782, 582.0079164820482, 0, 1, 0.2676271553154977, 0, 0.001718189687254614, 0.003245886807909784, 0.7323728446845024, 1, 0.001217433004738254],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217189259988105],
[212.7115056820639, 581.883582202675, 1, 0, 0.267697987220529, 0.004701203147396653, 0, -0.008881192449607268, 1, 0.267697987220529, 0.001217266895976942],
[212.9523170063764, 581.6427708783626, 1, 0, 0.2680010489031194, 0.004695886919934556, 0, -0.008871149395155788, 1, 0.2680010489031194, 0.001221059021311504],
[212.5607215902814, 581.77517761877, 0, 1, 0.2675955119262968, 0, 0.001718877048163247, 0.003247185323272874, 0.7324044880737032, 1, 0.001217885082677125],
[212.3463114559026, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672383893300694, 0.004709288299588228, 0, -0.008896466367867426, 1, 0.2672383893300694, 0.001217189375722014],
[212.7754577227801, 582.2242631739607, 0, 1, 0.2676421791479052, 0, 0.001717551231115927, 0.00324468068010366, 0.7323578208520949, 1, 0.001217135886440744],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217885082677125],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.00121718937681198],
[212.296410779234, 582.298677105505, 0, 1, 0.2671755891977385, 0, 0.001717331739393275, 0.003244266031306564, 0.7328244108022615, 1, 0.001217884964994118],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218281221698294],
[212.6009473207168, 579.7038354710555, 0, 2, 0.2683322781059003, 0, 0.003450037549561563, 0.00651757570888959, 0.5353376552617016, 1, 0.002440088862961848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9312651755484, 582.0186701627073, 0, 1, 0.2678549374118068, 0, 0.001718157941085366, 0.003245826835211351, 0.7321450625881931, 1, 0.001216778137510526],
[212.5476839943746, 582.2804905010513, 0, 1, 0.267413374128697, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.732586625871303, 1, 0.001216927062705675],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001218084417055509],
[212.2917693818883, 579.6937632833325, 5, 13, 0.2680500597876778, 0.023552491057746, 0.02242563371109806, -0.002128782068134232, 0.6533089537266898, 0.5519097477990415, 0.0223787993316303],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.00121766885627097],
[212.4523170063764, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2673717975930829, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7326282024069171, 1, 0.001217680299957525],
[212.5956481135096, 579.3753600657502, 0, 1, 0.2684386750498187, 0, 0.00172599676984281, 0.003260635416034524, 0.7315613249501813, 1, 0.001217589748997097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9049141375132, 581.8969093198775, 0, 1, 0.2678716981440431, 0, 0.00171851746242956, 0.003246506018421994, 0.7321283018559569, 1, 0.001217957862373449],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217156030265408],
[212.4523170063764, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2673717975930829, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7326282024069171, 1, 0.001217885082677125],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217267064065083]
],
"NAMES": [
["epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2"],
["epi_isl_423338_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423561_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1"],
["epi_isl_432477_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1"],
["epi_isl_433855_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_425439_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_434038_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_423726_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_421990_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_430199_Washington_20200317_null_4"],
["Node17"],
["epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3"],
["epi_isl_425611_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_429010_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_432755_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2"],
["epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1"],
["epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1"],
["epi_isl_431997_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_433987_England_20200412_null_3"],
["Node40"],
["epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_7"],
["epi_isl_434197_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_433037_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1"],
["Node793"],
["epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_2"],
["epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1"],
["Node790"],
["epi_isl_423960_England_20200319_null_4"],
["epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_8"],
["Node787"],
["epi_isl_432279_Wales_20200405_null_1"],
["epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1"],
["Node784"],
["epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3"],
["epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2"],
["epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2"],
["Node624"],
["epi_isl_419452_Wales_20200320_null_2"],
["epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2"],
["epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_4"],
["Node619"],
["epi_isl_423505_England_20200330_null_7"],
["epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2"],
["epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2"],
["Node607"],
["epi_isl_432425_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3"],
["epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1"],
["Node600"],
["epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_3"],
["epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1"],
["Node590"],
["epi_isl_430006_Amman_20200323_null_3"],
["epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11"],
["epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1"],
["Node585"],
["epi_isl_425632_England_20200330_null_4"],
["epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1"],
["Node582"],
["epi_isl_433959_England_20200411_null_2"],
["epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1"],
["Node579"],
["epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3"],
["Node576"],
["epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2"],
["epi_isl_422963_Washington_20200316_null_3"],
["Node573"],
["epi_isl_421854_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1"],
["Node570"],
["epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1"],
["epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_7"],
["Node567"],
["epi_isl_434098_Washington_20200402_null_1"],
["epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1"],
["Node564"],
["epi_isl_420669_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2"],
["Node561"],
["epi_isl_423586_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2"],
["Node558"],
["epi_isl_423922_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1"],
["Node548"],
["epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_2"],
["epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1"],
["Node545"],
["epi_isl_431959_Wales_20200331_null_2"],
["epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1"],
["Node542"],
["epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1"],
["epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1"],
["Node539"],
["epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2"],
["epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1"],
["epi_isl_421858_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1"],
["Node528"],
["epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1"],
["Node527"],
["epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2"],
["epi_isl_432269_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_429004_California_20200328_null_3"],
["Node369"],
["epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3"],
["epi_isl_425585_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_430011_Amman_20200319_null_27"],
["Node356"],
["epi_isl_423647_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1"],
["epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1"],
["Node351"],
["epi_isl_418730_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_421893_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423914_England_20200318_null_1"],
["Node339"],
["epi_isl_433732_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_423687_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_424013_England_20200321_null_9"],
["Node335"],
["epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2"],
["epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1"],
["epi_isl_420518_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1"],
["Node330"],
["epi_isl_432960_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423957_England_20200319_null_1"],
["Node327"],
["epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1"],
["epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_418698_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423846_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423913_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_424021_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_420685_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5"],
["epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_423998_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["epi_isl_432529_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_425627_England_20200329_null_5"],
["Node311"],
["epi_isl_431943_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_422006_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_434485_Athens_20200312_null_1"],
["epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1"],
["epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_423047_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1"],
["epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6"],
["epi_isl_418713_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_2"],
["epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6"],
["epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2"],
["epi_isl_423995_England_20200321_null_2"],
["epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_422436_England_20200327_null_1"],
["Node295"],
["epi_isl_423341_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423663_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423080_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_431082_Cincinnati_20200410_null_1512"],
["epi_isl_423840_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1"],
["epi_isl_433817_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1"],
["Node346"],
["epi_isl_432979_England_20200401_null_2"],
["Node239"],
["epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1"],
["epi_isl_433561_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2"],
["Node364"],
["epi_isl_424136_England_20200320_null_3"],
["epi_isl_433764_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1"],
["Node522"],
["epi_isl_423619_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1"],
["epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2"],
["Node490"],
["epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1"],
["epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1"],
["epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2"],
["epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1"],
["epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1"],
["epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_427605_New_York_20200316_null_2"],
["epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2"],
["epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1"],
["epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2"],
["epi_isl_434528_Louisiana_20200326_null_1"],
["epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2"],
["epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2"],
["epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1"],
["epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1"],
["epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1"],
["epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1"],
["epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1"],
["epi_isl_420704_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_434216_Washington_20200406_null_1"],
["epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1"],
["epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1"],
["epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1"],
["epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1"],
["epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3"],
["epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1"],
["epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1"],
["Node447"],
["epi_isl_423863_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_423633_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1"],
["epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_434168_Washington_20200330_null_1"],
["epi_isl_430912_Washington_20200408_null_11"],
["Node452"],
["epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1"],
["epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1"],
["Node461"],
["epi_isl_431118_Fujian_20200313_null_3026"],
["epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1"],
["epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1"],
["epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1"],
["epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1"],
["epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1"],
["Node479"],
["epi_isl_430955_Washington_20200401_null_1"],
["epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1"],
["epi_isl_423562_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_423564_England_20200401_null_1"],
["Node500"],
["epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1"],
["epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_86"],
["Node495"],
["epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2"],
["epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1"],
["epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1"],
["Node506"],
["epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_423558_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_424012_England_20200320_null_28"],
["Node512"],
["epi_isl_421775_England_20200325_null_1"],
["Node376"],
["epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1"],
["epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423926_England_20200318_null_1"],
["Node517"],
["epi_isl_418728_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_424103_England_20200313_null_4"],
["Node204"],
["epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1"],
["epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1"],
["epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9"],
["epi_isl_423166_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2"],
["Node552"],
["epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2"],
["Node555"],
["epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1"],
["epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1"],
["Node70"],
["epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1"],
["epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1"],
["epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_6"],
["Node596"],
["epi_isl_433419_Scotland_20200408_null_1"],
["epi_isl_433876_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1"],
["epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4"],
["epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7"],
["Node616"],
["epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5"],
["epi_isl_413752_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2"],
["Node63"],
["epi_isl_434048_England_20200417_null_2"],
["epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2"],
["epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_425639_England_20200330_null_3"],
["epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2"],
["Node691"],
["epi_isl_423203_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_423363_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1"],
["epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6"],
["Node648"],
["epi_isl_425602_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1"],
["epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_27"],
["Node643"],
["epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_3"],
["epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1"],
["epi_isl_421932_England_20200331_null_1"],
["Node638"],
["epi_isl_423155_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_423340_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_423670_England_20200320_null_14"],
["epi_isl_423952_England_20200319_null_3"],
["Node687"],
["epi_isl_423567_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_433861_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_433165_Scotland_20200418_null_5"],
["epi_isl_431080_Cincinnati_20200302_null_276"],
["epi_isl_421866_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_433530_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_423431_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_433983_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_433410_Scotland_20200407_null_1"],
["epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1"],
["Node660"],
["epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6"],
["Node656"],
["epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_423897_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1"],
["epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_3"],
["Node700"],
["epi_isl_421891_England_20200327_null_8"],
["epi_isl_423517_England_20200330_null_1"],
["Node703"],
["epi_isl_423364_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_418938_Washington_20200316_null_4"],
["Node781"],
["epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_23"],
["epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["Node775"],
["epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1"],
["Node774"],
["epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_432692_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_424037_England_20200320_null_1"],
["Node769"],
["epi_isl_432133_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_432291_Wales_20200408_null_1"],
["epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1"],
["Node716"],
["epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1"],
["epi_isl_423919_England_20200320_null_1"],
["Node721"],
["epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_423175_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_28"],
["Node726"],
["epi_isl_421872_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423572_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8"],
["epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1"],
["Node76"],
["epi_isl_416615_unknown_20200217_null_3"],
["Node74"],
["epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1"],
["epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6"],
["epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_51"],
["Node735"],
["epi_isl_433722_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_434464_Athens_20200316_null_1"],
["epi_isl_420942_Wales_20200321_null_6"],
["Node744"],
["epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1"],
["epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2"],
["Node750"],
["epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_422108_Wales_20200325_null_2"],
["epi_isl_424177_Washington_20200317_null_2"],
["Node755"],
["epi_isl_427420_Doha_20200323_null_32"],
["epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1"],
["epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1"],
["Node760"],
["epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2"],
["epi_isl_416605_unknown_20200216_null_2"],
["epi_isl_425325_England_20200329_null_3"],
["Node765"],
["epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2"],
["epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2"],
["epi_isl_430925_Connecticut_20200404_null_3"],
["epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1"],
["epi_isl_433708_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1"],
["Node824"],
["epi_isl_422350_Wales_20200325_null_18"],
["epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_432068_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_422370_Wales_20200326_null_137"],
["epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_422163_Wales_20200330_null_3"],
["Node804"],
["epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1"],
["Node803"],
["epi_isl_432004_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1"],
["Node820"],
["epi_isl_423396_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8"],
["Node82"],
["epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7"],
["epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2"],
["epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2"],
["epi_isl_432288_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4"],
["Node883"],
["epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1"],
["epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1"],
["epi_isl_434135_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_434254_Washington_20200401_null_1"],
["epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1"],
["Node854"],
["epi_isl_433523_Scotland_20200330_null_1"],
["epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_4"],
["Node849"],
["epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2"],
["epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_146"],
["Node843"],
["epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1"],
["Node842"],
["epi_isl_433409_Scotland_20200407_null_1"],
["epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1"],
["epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2"],
["epi_isl_425609_England_20200325_null_5"],
["epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1"],
["Node860"],
["epi_isl_433035_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1"],
["epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2"],
["Node865"],
["epi_isl_424154_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_427346_Liege_20200330_null_4"],
["epi_isl_427174_Washington_20200326_null_8"],
["epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5"],
["Node879"],
["epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1"],
["epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1"],
["epi_isl_425280_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_432954_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1"],
["epi_isl_423542_England_20200330_null_2"],
["epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18"],
["epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1"],
["Node891"],
["epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_6"],
["epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1"],
["epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6"],
["epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5"],
["epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_2"],
["epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3"],
["epi_isl_423821_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423575_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423239_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423659_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2"],
["Node131"],
["epi_isl_424122_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2"],
["Node128"],
["epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_6"],
["epi_isl_424115_England_20200312_null_6"],
["epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1"],
["epi_isl_422356_Wales_20200327_null_46"],
["epi_isl_423291_England_20200326_null_1"],
["Node195"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_3"],
["Node194"],
["epi_isl_421830_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423309_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_432443_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4"],
["Node142"],
["epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_420706_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_420671_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1"],
["epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1"],
["epi_isl_423531_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_421963_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_423802_England_20200223_null_1"],
["epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1"],
["epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1"],
["Node164"],
["epi_isl_431240_Fujian_20200316_null_8311"],
["epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_423290_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_421972_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1"],
["epi_isl_429816_NB_20200314_null_51"],
["epi_isl_432744_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1"],
["Node176"],
["epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["Node183"],
["epi_isl_433176_Scotland_20200419_null_2"],
["epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2"],
["Node190"],
["epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5"],
["epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1"],
["epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2"],
["epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3"],
["epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1"],
["epi_isl_433407_Scotland_20200322_null_1"],
["epi_isl_429020_California_20200331_null_1"],
["epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1"],
["epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1"],
["epi_isl_433988_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1"],
["epi_isl_423712_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_434214_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4"],
["epi_isl_434555_Manila_20200326_null_1"],
["epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1"],
["epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1"],
["Node111"],
["epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1"],
["Node110"],
["epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2"],
["epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1"],
["epi_isl_421663_India_20200310_null_1"],
["Node946"],
["epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2"],
["epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5"],
["epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1"],
["epi_isl_421665_India_20200310_null_3"],
["epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3"],
["epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1"],
["epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1"],
["epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_13"],
["epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1"],
["epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1"],
["epi_isl_431089_Cincinnati_20200413_null_1"],
["epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2"],
["epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1"],
["epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_433645_Scotland_20200405_null_1"],
["epi_isl_423876_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_432311_Wales_20200301_null_1"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_434356_Ghent_20200327_null_1"],
["epi_isl_418738_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1"],
["epi_isl_421956_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_423060_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2"],
["epi_isl_423511_England_20200401_null_17"],
["epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1"],
["epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1"],
["epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1"],
["epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2"],
["epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3"],
["epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_423410_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_433929_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1"],
["Node988"],
["epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29"],
["epi_isl_423319_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2"],
["epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_6"],
["Node101"],
["epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2"],
["epi_isl_433870_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_421827_England_20200324_null_2"],
["Node993"],
["epi_isl_433358_Scotland_20200327_null_4"],
["epi_isl_432831_England_20200330_null_2"],
["epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001218646981092233],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217061393545555],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217322955885444],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001218646913296595],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3569500183782, 582.1744849505776, 0, 2, 0.2672731885386957, 0, 0.003435396177092484, 0.006489916226296015, 0.5368885802342497, 1, 0.002437360411912421],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217432842581738],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001218281077544441],
[211.738417970371, 579.5974812386805, 0, 1, 0.2675708484627144, 0, 0.001725335310054938, 0.003259385831302789, 0.7324291515372856, 1, 0.00121825906323232],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.2429255749947, 0, 1, 0.2676907865124976, 0, 0.001726391390982176, 0.003261380907385036, 0.7323092134875024, 1, 0.001217613208153262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.7882152146769, 0, 1, 0.2675790987238722, 0, 0.001718838528949929, 0.003247112555401383, 0.7324209012761278, 1, 0.001217747904557227],
[212.3838623066852, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2673407648258469, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2673407648258469, 0.001217122544123849],
[212.4523170063764, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2673717975930829, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7326282024069171, 1, 0.001217155760581766],
[212.5372221035465, 582.0578657811925, 0, 1, 0.267478650880329, 0, 0.001718042240796589, 0.003245608262114445, 0.7325213491196709, 1, 0.001217885082975908],
[212.3683770548714, 582.3196301619589, 0, 1, 0.2672349087016318, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7327650912983682, 1, 0.001217885082660525],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217155760564371],
[212.4152772539672, 581.77517761877, 0, 1, 0.2674613827838123, 0, 0.001718877048163247, 0.003247185323272874, 0.7325386172161876, 1, 0.001218400734342425],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2674597167879816, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7325402832120184, 1, 0.001217266895977162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001217204625412957],
[212.3838623066852, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672730164276239, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672730164276239, 0.00121718919205899],
[212.5159699221596, 582.0791179625794, 0, 1, 0.2674519049543714, 0, 0.001717979513678908, 0.003245489762320571, 0.7325480950456287, 1, 0.001217227895979009],
[212.5162690470927, 582.4834518496482, 0, 2, 0.2673161555420163, 0, 0.003433573938708638, 0.006486473777784732, 0.5368256159297309, 1, 0.002437074431741096],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217057028810254],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.2112255780537, 1, 0, 0.2672856471741654, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217057028305574],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217057028354369],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.8145973836876, 581.7804905010513, 0, 1, 0.2678277283971301, 0, 0.001718861351192375, 0.003247155669625751, 0.7321722716028698, 1, 0.001217208936808526],
[211.4792292946834, 580.1158585900555, 0, 1, 0.2671558130303558, 0, 0.001723793592594509, 0.003256473323793606, 0.7328441869696442, 1, 0.001217437066237908],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3444331244822, 580.6552877722586, 0, 1, 0.2668491257612916, 0, 0.001722192187100541, 0.003253448057721097, 0.7331508742387085, 1, 0.001217972171070443],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217433584831744],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.888885667671, 579.7831918536912, 0, 1, 0.2676472894320988, 0, 0.001724782667125595, 0.003258341815960859, 0.7323527105679012, 1, 0.001217972133537747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217646433211361],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3183579326684, 580.6813629640724, 0, 1, 0.2668162025277022, 0, 0.00172211485296433, 0.003253301963343747, 0.7331837974722978, 1, 0.001217975153891102],
[212.2754577227802, 582.3196301619589, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787072, 1, 0.001217014070944455],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 579.5871458725746, 1, 0, 0.2681712589390809, 0.004708455666730395, 0, -0.008894893414642809, 1, 0.2681712589390809, 0.001218260309935809],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3444331244822, 580.0687589175621, 0, 1, 0.2679718551596444, 0, 0.001723933558956098, 0.003256737738700763, 0.7320281448403556, 1, 0.001217612426643801],
[212.788495318687, 582.0133281387037, 0, 1, 0.2677252228650613, 0, 0.001718173711241339, 0.003245856627114778, 0.7322747771349387, 1, 0.001217979200245284],
[211.6720764998609, 580.2003385653135, 0, 1, 0.2673057837005717, 0, 0.001723542599910823, 0.003255999165528716, 0.7326942162994283, 1, 0.001218113589754285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5476839943746, 580.2749455123146, 0, 1, 0.2671654940275832, 0, 0.001723321001076684, 0.003255580536120266, 0.7328345059724168, 1, 0.001218088660598665],
[212.4523170063764, 582.0791179625794, 0, 1, 0.267393217758184, 0, 0.001717979513678908, 0.003245489762320571, 0.7326067822418161, 1, 0.001218073623004646],
[211.888885667671, 579.7831918536912, 0, 1, 0.2676472894320988, 0, 0.001724782667125595, 0.003258341815960859, 0.7323527105679012, 1, 0.001217902984744575],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7644931621847, 579.5029513471756, 0, 1, 0.2676269504471944, 0, 0.001725616750829813, 0.003259917510025545, 0.7323730495528056, 1, 0.001222139829198527],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217438250148048],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217974820406006],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217437909520212],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 579.9461764448871, 0, 1, 0.2675680801499459, 0, 0.001724297944561121, 0.003257426111141308, 0.7324319198500541, 1, 0.001217971804319081],
[212.5476839943746, 581.9520369023662, 0, 1, 0.2675239253129944, 0, 0.001718354669437766, 0.003246198481001413, 0.7324760746870056, 1, 0.001217438250542176],
[211.3966372544834, 580.6030836422574, 0, 1, 0.266915040090077, 0, 0.001722347035649154, 0.003253740587041286, 0.733084959909923, 1, 0.001217972130568588],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3145973836876, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129063, 1, 0.001217438250148048],
[211.5351671004786, 580.4645537962622, 0, 1, 0.2670899515734275, 0, 0.00172275807964493, 0.00325451710333239, 0.7329100484265725, 1, 0.001217645905978948],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.2112255780537, 1, 0, 0.2672856471741654, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217438250542176],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3966372544834, 580.6030836422574, 0, 1, 0.266915040090077, 0, 0.001722347035649154, 0.003253740587041286, 0.733084959909923, 1, 0.00121765345881816],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001217438268727224],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5351671004786, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2672004900852027, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7327995099147973, 1, 0.001217902962053965],
[212.3838623066852, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2673407648258469, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2673407648258469, 0.001217438305263821],
[211.888885667671, 579.7831918536912, 0, 1, 0.2676472894320988, 0, 0.001724782667125595, 0.003258341815960859, 0.7323527105679012, 1, 0.001217972174144425],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217438357759203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217905084265222],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217438457201712],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3444331244822, 580.6552877722586, 0, 1, 0.2668491257612916, 0, 0.001722192187100541, 0.003253448057721097, 0.7331508742387085, 1, 0.00121765997258738],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217797236685299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217972168715818],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217793694411848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3444331244822, 580.0687589175621, 0, 1, 0.2679718551596444, 0, 0.001723933558956098, 0.003256737738700763, 0.7320281448403556, 1, 0.001217628067539215],
[212.788495318687, 582.0133281387037, 0, 1, 0.2677252228650613, 0, 0.001718173711241339, 0.003245856627114778, 0.7322747771349387, 1, 0.001218076008558185],
[211.738417970371, 580.1158585900555, 0, 1, 0.267395686602967, 0, 0.001723793592594509, 0.003256473323793606, 0.732604313397033, 1, 0.001223397907331715],
[211.6036218001697, 580.396099096571, 0, 2, 0.2671763843055169, 0, 0.003445922539991475, 0.006509801913378506, 0.5370304517195355, 1, 0.002439314491502646],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001215898199254145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6299728382048, 580.4219521885371, 0, 1, 0.2671920440456724, 0, 0.001722884526040759, 0.003254755977242048, 0.7328079559543277, 1, 0.001217619282510132],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331552, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001218067893712346],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 579.9461764448871, 0, 1, 0.2675680801499459, 0, 0.001724297944561121, 0.003257426111141308, 0.7324319198500541, 1, 0.00121797710615168],
[211.738417970371, 579.6659359383716, 0, 1, 0.267547704185093, 0, 0.00172513155940617, 0.003259000919469221, 0.7324522958149069, 1, 0.001218545773683549],
[211.7514555662778, 579.3937096667772, 0, 1, 0.2676518354301011, 0, 0.001725942106922637, 0.003260532150572748, 0.7323481645698988, 1, 0.00121722625840676],
[211.738417970371, 579.6659359383716, 0, 0, 0.267547704185093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004826218281511578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.9520369023663, 0, 1, 0.2675239253129943, 0, 0.001718354669437765, 0.003246198481001412, 0.7324760746870056, 1, 0.0007342821545294039],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217430623974687],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217779334087189],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217438339948978],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 2, 0.2675036428497422, 0, 0.003447462080199345, 0.006512710307770602, 0.5365509132383981, 1, 0.002437066322385023],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217513749183626],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001217269784284804],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.728014305656, 580.6763396030866, 0, 1, 0.267196934571664, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.732803065428336, 1, 0.001218390577360395],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217647480777517],
[211.738417970371, 580.1683835942786, 0, 1, 0.2673779509811233, 0, 0.001723637530547195, 0.003256178502014409, 0.7326220490188767, 1, 0.001218577220899731],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6219991515447, 579.9991907981948, 0, 1, 0.2673273553541192, 0, 0.001724140336512884, 0.003257128368762578, 0.7326726446458808, 1, 0.00121760388378237],
[211.6430509823728, 579.9520369023662, 0, 1, 0.2673627644000606, 0, 0.001724280520405083, 0.003257393194613731, 0.7326372355999393, 1, 0.001217783367717405],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001217603884585932],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001218529620812531],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001223653895226216],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.505331359684, 580.0897565250549, 0, 1, 0.2671887870411855, 0, 0.001723871157440114, 0.003256619854011412, 0.7328112129588145, 1, 0.00121734846984668],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6219991515448, 579.9991907981948, 0, 1, 0.2673273553541193, 0, 0.001724140336512884, 0.003257128368762578, 0.7326726446458807, 1, 0.001217603882716495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9397905088429, 579.6552973758961, 1, 0, 0.2677376271689328, 0.004718321168474857, 0, -0.008913530647890858, 1, 0.2677376271689329, 0.001217866152384986],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217863354353565],
[211.738417970371, 579.9064554728531, 0, 1, 0.2674664171693858, 0, 0.001724416051179504, 0.003257649230112036, 0.7325335828306142, 1, 0.001223149691019817],
[211.8628104758572, 579.825196740973, 0, 1, 0.2676089678567425, 0, 0.001724657716878649, 0.003258105768473661, 0.7323910321432575, 1, 0.001216158887098039],
[211.505331359684, 580.0897565250549, 0, 1, 0.2671887870411855, 0, 0.001723871157440114, 0.003256619854011412, 0.7328112129588145, 1, 0.001216032359724891],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217000128465927],
[212.0236818378722, 579.3122173711793, 0, 1, 0.2679313323833685, 0, 0.001726184896527525, 0.003260990812140472, 0.7320686676166315, 1, 0.0012198042593262],
[211.8337849583691, 579.7613029263698, 0, 1, 0.2676037133131041, 0, 0.001724847786412197, 0.003258464834877158, 0.7323962866868958, 1, 0.001216829399419373],
[211.5745962826816, 580.0204916020573, 1, 0, 0.2672762874868777, 0.004726465358175209, 0, -0.008928916095787318, 1, 0.2672762874868777, 0.001217545413756037],
[211.9661916987766, 579.6288961859624, 0, 1, 0.267770979055949, 0, 0.001725241799675857, 0.003259209177870333, 0.732229020944051, 1, 0.001218753842132577],
[211.9661916987766, 579.6288961859624, 0, 1, 0.267770979055949, 0, 0.001725241799675857, 0.003259209177870333, 0.732229020944051, 1, 0.001216696598325408],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217505458324958],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217624720737687],
[211.738417970371, 579.623583303681, 0, 1, 0.2675620229799801, 0, 0.001725257613398508, 0.003259239052076959, 0.7324379770200199, 1, 0.001218795469746261],
[211.238417970371, 580.356669914368, 0, 1, 0.2668516027996482, 0, 0.001723078327242367, 0.003255122093258413, 0.7331483972003519, 1, 0.001217545454445242],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001216896240537578],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217987103718979],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.00122018197898039],
[211.9022396580603, 579.6928482266787, 1, 0, 0.2676901902262872, 0.004719157294484793, 0, -0.008915110200140261, 1, 0.2676901902262872, 0.001218070078694148],
[211.8628104758573, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001218231512264679],
[212.0956481135096, 579.7061753438811, 0, 1, 0.2678645613461676, 0, 0.001725011812073247, 0.003258774700972451, 0.7321354386538323, 1, 0.001217935651985846],
[211.9976066460585, 579.5974812386805, 0, 1, 0.2678106646828089, 0, 0.001725335310054938, 0.003259385831302789, 0.7321893353171911, 1, 0.001223161372961424],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 1, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0.001724564106760517, -0.005664078880542705, 0.9284527169307925, 0.4634191946439573, 0.002437526048081479],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1430509823728, 579.4520369023662, 0, 1, 0.2679944004569949, 0, 0.001725768374800783, 0.003260203947693509, 0.7320055995430051, 1, 0.001217348466289895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[209.1814046679484, 570.4935949834811, 1, 0, 0.2682930769377849, 0.004780539654504118, 0, -0.009031069569529475, 1, 0.2682930769377849, 0.001227578935501189],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8020708861542, 580.0522056742723, 0, 2, 0.2674760712364374, 0, 0.003447965511440703, 0.006513661355746932, 0.536591306211205, 1, 0.002445369243687781],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001223453268101405],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.6877099786389, 564.0901845191671, 1, 1, 0.2652950956759031, 0.00490947637491173, 0.00177276617718921, -0.005925659039015558, 0.9296185122103136, 0.4602087035621195, 0.001228719665238204],
[211.5745962826816, 580.0580424528399, 1, 0, 0.2672636093183711, 0.004726465358175209, 0, -0.008928916095787318, 1, 0.2672636093183711, 0.001217673069992542],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001218253451306622],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218344069235321],
[211.0796196436674, 580.4017239016983, 0, 1, 0.2666893179037629, 0, 0.001722944572386157, 0.003254869412703706, 0.7333106820962372, 1, 0.00121775940938959],
[210.9552271381811, 580.1214833951828, 0, 1, 0.2666684840158545, 0, 0.001723776878848655, 0.003256441749324511, 0.7333315159841456, 1, 0.001217625782897342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1560885782796, 582.1798106307718, 1, 0, 0.2670861140602244, 0.004713510730242503, 0, -0.008904443095966596, 1, 0.2670861140602243, 0.001217439435375703],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217056039302524],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217974895246374],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217789577674573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.7288646073097, 0, 1, 0.2674188295768787, 0, 0.001721973989834658, 0.003253035854323472, 0.7325811704231213, 1, 0.00121818049250199],
[211.728014305656, 580.6763396030866, 0, 1, 0.267196934571664, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.732803065428336, 1, 0.001217636894087137],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.7224022984416, 579.6819516103009, 1, 0, 0.268451834280229, 0.004700962330225272, 0, -0.008880737514226441, 1, 0.2684518342802289, 0.001218416842285627],
[212.2541163706566, 580.1502375380859, 0, 1, 0.2678608658870405, 0, 0.001723691442829672, 0.003256280349422629, 0.7321391341129595, 1, 0.001218428580469247],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217823441900905],
[211.9872029813435, 580.1579622517115, 0, 1, 0.2676115594532162, 0, 0.001723668492144442, 0.003256236992552913, 0.7323884405467838, 1, 0.001217743298851243],
[211.728014305656, 580.6763396030866, 0, 1, 0.267196934571664, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.732803065428336, 1, 0.001217505392865683],
[211.7541163706566, 580.650237538086, 0, 1, 0.2672298749068248, 0, 0.001722207165952305, 0.003253476354746565, 0.7327701250931753, 1, 0.001217505458140696],
[212.3918359933453, 580.0125179153972, 0, 1, 0.268034665566471, 0, 0.001724100720436285, 0.003257053528771762, 0.7319653344335291, 1, 0.001217505392637306],
[212.2594292529379, 580.1449246558046, 0, 1, 0.2678675706486374, 0, 0.00172370722814354, 0.003256310169961318, 0.7321324293513627, 1, 0.001217624794169591],
[211.8233812936542, 580.5809726150884, 1, 0, 0.2673172859901384, 0.004720914159205511, 0, -0.008918429149184457, 1, 0.2673172859901385, 0.001217703233354091],
[212.2594292529379, 580.1449246558046, 0, 1, 0.2678675706486373, 0, 0.00172370722814354, 0.003256310169961318, 0.7321324293513627, 1, 0.00121689691570865],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.00121794655752705],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.00121793565633836],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217906532461038],
[212.0825699693417, 580.3217839394008, 0, 1, 0.2676443774232042, 0, 0.001723181909890916, 0.0032553177745356, 0.7323556225767958, 1, 0.00121778602174118],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217743189642215],
[212.0002405772504, 580.1449246558046, 0, 1, 0.2676280180475233, 0, 0.00172370722814354, 0.003256310169961318, 0.7323719819524767, 1, 0.001217954935767462],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001217703233576135],
[211.8918359933453, 580.5125179153972, 0, 1, 0.2674036745862554, 0, 0.001722615738918033, 0.003254248202936182, 0.7325963254137446, 1, 0.001217545454628243],
[212.1885755198155, 580.2157783889271, 1, 0, 0.2677781545156076, 0.004712789072409857, 0, -0.008903079789193084, 1, 0.2677781545156076, 0.001217786018991605],
[212.3918359933453, 580.0125179153972, 0, 1, 0.268034665566471, 0, 0.001724100720436285, 0.003257053528771762, 0.7319653344335291, 1, 0.001217743301794303],
[212.1510246690328, 580.2533292397097, 1, 0, 0.2677307660193211, 0.004713623238728423, 0, -0.008904655639327163, 1, 0.2677307660193211, 0.001218069901413584],
[212.3918359933453, 580.0125179153972, 1, 0, 0.268034665566471, 0.004708278900283776, 0, -0.008894559479524109, 1, 0.2680346655664709, 0.001218566352283603],
[212.2594292529379, 580.1449246558046, 0, 1, 0.2678675706486374, 0, 0.00172370722814354, 0.003256310169961318, 0.7321324293513627, 1, 0.001216957421770119],
[212.1036218001697, 580.2078127764815, 0, 1, 0.2677023359046953, 0, 0.001723520397311917, 0.003255957221892677, 0.7322976640953047, 1, 0.001221586950784053],
[211.8233812936542, 580.5809726150883, 1, 0, 0.2673172859901384, 0.004720914159205512, 0, -0.008918429149184458, 1, 0.2673172859901385, 0.00121794638657051],
[212.228014305656, 580.3830751757383, 0, 1, 0.2677580683920494, 0, 0.001722999933616608, 0.003254973997365646, 0.7322419316079506, 1, 0.00121793404487573],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001218070078333918],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.00122362909112662],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217936438005349],
[212.0825699693417, 580.3217839394008, 0, 1, 0.2676443774232041, 0, 0.001723181909890916, 0.0032553177745356, 0.7323556225767959, 1, 0.001218069901430245],
[211.9872029813435, 580.3534980116158, 0, 1, 0.2675455176235194, 0, 0.001723087744669689, 0.003255139884020012, 0.7324544823764806, 1, 0.001217636374014724],
[212.1220573776579, 580.3752158631759, 0, 1, 0.2676628230027936, 0, 0.001723023266099894, 0.003255018075502219, 0.7323371769972064, 1, 0.001216957421898421],
[211.9872029813435, 580.1579622517115, 0, 1, 0.2676115594532162, 0, 0.001723668492144442, 0.003256236992552913, 0.7323884405467838, 1, 0.001217892440399076],
[211.8313955285753, 580.5729583801673, 1, 0, 0.2673273998100355, 0.004720735552464901, 0, -0.008918091737507825, 1, 0.2673273998100355, 0.00121693710570989],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1115954868298, 580.6973914339146, 0, 1, 0.2675443883534511, 0, 0.001722067318970906, 0.003253212165364323, 0.7324556116465488, 1, 0.00121760389708312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001222872465005374],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001223219256269303],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1510246690328, 580.9630241467431, 1, 0, 0.2674911949747988, 0.004713623238728423, 0, -0.008904655639327163, 1, 0.2674911949747989, 0.001218196663768064],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.7719983809158, 0, 1, 0.2674042794042246, 0, 0.001721846099308875, 0.003252794252261967, 0.7325957205957754, 1, 0.001217711590880046],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001216762991617628],
[211.7032952210692, 578.2384709677547, 1, 3, 0.2679986098753318, 0.00472359203930085, 0.00518817088558484, 0.000877650680581514, 0.7075729905470438, 0.7128904600613821, 0.003676290751859207],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.6763396030866, 0, 1, 0.2674365498004013, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.7325634501995987, 1, 0.001217444543896941],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.00126383706490481],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 0, 0.2675240260047297, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002029803211992651],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001015895050979197],
[211.5825699693417, 580.8217839394009, 1, 0, 0.2670133864429884, 0.004726287236916065, 0, -0.008928579601249169, 1, 0.2670133864429884, 0.001218417985797547],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001218851592507169],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001218426089931094],
[211.7858304428716, 580.618523465871, 1, 0, 0.2672698974938519, 0.004721751204548815, 0, -0.008920010438175776, 1, 0.2672698974938519, 0.001217464284270213],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001218315234644089],
[212.228014305656, 580.3830751757383, 0, 1, 0.2677580683920495, 0, 0.001722999933616608, 0.003254973997365646, 0.7322419316079505, 1, 0.001218112495220367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217992398189673],
[211.728014305656, 580.6763396030866, 0, 1, 0.267196934571664, 0, 0.00172212975077224, 0.003253330107266691, 0.732803065428336, 1, 0.001219118117910186],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.728014305656, 580.650237538086, 0, 1, 0.2672057364181785, 0, 0.001722207165952305, 0.003253476354746565, 0.7327942635818214, 1, 0.001218196473949797],
[211.8233812936542, 580.5809726150884, 1, 0, 0.2673172859901384, 0.004720914159205511, 0, -0.008918429149184457, 1, 0.2673172859901385, 0.001218252256149326],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 1, 0, 0.2675240260047297, 0.00471726588179008, 0, -0.008911537072237316, 1, 0.2675240260047298, 0.001217439944883242],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.32764439688, 0, 1, 0.2675121398281395, 0, 0.001717246312487372, 0.003244104648620492, 0.7324878601718605, 1, 0.001217790302156038],
[211.6720764998609, 580.2003385653135, 0, 1, 0.2673057837005717, 0, 0.001723542599910823, 0.003255999165528716, 0.7326942162994283, 1, 0.001217146097961448],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5476839943746, 579.920098058798, 0, 1, 0.2672852752712078, 0, 0.001724375484394076, 0.003257572594106922, 0.7327147247287922, 1, 0.001217972183910354],
[212.4523170063764, 582.0791179625794, 0, 1, 0.267393217758184, 0, 0.001717979513678908, 0.003245489762320571, 0.7326067822418161, 1, 0.001217434539857214],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217057028417364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.8358981875502, 582.1638227091906, 0, 1, 0.2677182049164449, 0, 0.001717729547924059, 0.003245017544059623, 0.7322817950835551, 1, 0.001222723912558432],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 579.9461764448871, 0, 1, 0.2675680801499459, 0, 0.001724297944561121, 0.003257426111141308, 0.7324319198500541, 1, 0.001218216943531802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.9520369023662, 0, 1, 0.2675239253129944, 0, 0.001718354669437766, 0.003246198481001413, 0.7324760746870056, 1, 0.001218076478218277],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217973271262618],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217791538156519],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2674597167879816, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7325402832120184, 1, 0.001217053775347986],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001218403512019662],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001218779075963915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218332733308694],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218080777750218],
[212.8068726700621, 581.7882152146769, 0, 1, 0.2678180068247931, 0, 0.001718838528949929, 0.003247112555401383, 0.7321819931752069, 1, 0.001216844062008671],
[212.2754577227802, 582.3196301619588, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787071, 1, 0.001217307824311203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4392388622085, 579.7463206987147, 0, 1, 0.2681685323574379, 0, 0.001724892361187894, 0.003258549042504217, 0.7318314676425621, 1, 0.001217717540258544],
[212.8358981875502, 581.8521090292801, 0, 1, 0.2678232164757936, 0, 0.001718649781416669, 0.003246755986430693, 0.7321767835242063, 1, 0.001222992289342224],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.0159307169694, 0, 1, 0.2676170705591552, 0, 0.001718166028149999, 0.003245842112742464, 0.7323829294408448, 1, 0.00121798452369128],
[210.738417970371, 580.856669914368, 1, 0, 0.266219966742714, 0.004745219261067986, 0, -0.008964344690457648, 1, 0.266219966742714, 0.001283269793532851],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0476839943746, 582.5474038903644, 0, 1, 0.2668625658873107, 0, 0.001716598500519969, 0.003242880846420654, 0.7331374341126893, 1, 0.001217176346820852],
[212.9949180913316, 582.0048028054092, 0, 1, 0.2679182300228714, 0, 0.001718198879424618, 0.003245904173130617, 0.7320817699771286, 1, 0.001216982453594165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8628104758572, 580.1369104208835, 0, 1, 0.2675036428497422, 0, 0.001723731040099672, 0.003256355153885301, 0.7324963571502578, 1, 0.001217975992588077],
[211.7514555662778, 579.5844436427736, 0, 1, 0.2675873238885353, 0, 0.001725374121007894, 0.003259459150308913, 0.7324126761114647, 1, 0.001217223023643115],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217391052538034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3343088546555, 579.0015903543959, 0, 1, 0.2683238673575733, 0, 0.001727110972852283, 0.003262740292391663, 0.7316761326424267, 1, 0.001216446316227318],
[212.3212712587487, 579.5855303059009, 0, 1, 0.2681139634604025, 0, 0.001725370886109264, 0.003259453039158983, 0.7318860365395975, 1, 0.001216463412564358],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.8391106385634, 581.7559772461756, 0, 1, 0.2678585783926178, 0, 0.001718933778271848, 0.003247292493926084, 0.7321414216073822, 1, 0.001216772357983837],
[211.2330782149028, 580.1028209941486, 0, 1, 0.2669322577505108, 0, 0.001723832334216639, 0.003256546511824659, 0.7330677422494891, 1, 0.001217563741047813],
[211.2200406189959, 580.3750472657431, 0, 1, 0.2668283872041293, 0, 0.001723023766633644, 0.003255019021076454, 0.7331716127958707, 1, 0.001217786984767296],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217791936124286],
[211.7514555662778, 579.5844436427736, 0, 1, 0.2675873238885353, 0, 0.001725374121007894, 0.003259459150308913, 0.7324126761114647, 1, 0.001218008054104905],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001220241408711401],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218093529119891],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9523170063764, 581.6427708783626, 0, 1, 0.2680010489031194, 0, 0.001719268338003856, 0.00324792452136091, 0.7319989510968806, 1, 0.001223542918818392],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4922668905903, 579.5844436427736, 0, 1, 0.2673473559194997, 0, 0.001725374121007894, 0.003259459150308913, 0.7326526440805003, 1, 0.001217348466914996],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7644931621847, 579.0530286954918, 0, 1, 0.2677792124088723, 0, 0.001726957550421298, 0.003262450457195661, 0.7322207875911277, 1, 0.0012178306239909],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9203006149529, 579.156409918411, 1, 0, 0.2678884333127073, 0.004718755103207139, 0, -0.008914350407800638, 1, 0.2678884333127073, 0.001218616207794977],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2644931621847, 579.8122173711793, 0, 1, 0.2670594271695154, 0, 0.001724696324154599, 0.003258178702707072, 0.7329405728304846, 1, 0.001217905047453601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7644931621847, 579.4075843591775, 0, 1, 0.2676592098973146, 0, 0.001725900776921994, 0.003260454072753487, 0.7323407901026855, 1, 0.001218069901413584],
[212.1217233053234, 579.1617228006924, 0, 1, 0.2680729950173928, 0, 0.001726633443875108, 0.003261838177206764, 0.7319270049826072, 1, 0.001217911490202865],
[210.6029747370615, 577.5181964347834, 1, 0, 0.2672215674956673, 0.004748271012071427, 0, -0.008970109850379498, 1, 0.2672215674956673, 0.001219217496571936],
[212.5607215902814, 581.77517761877, 0, 1, 0.2675955119262968, 0, 0.001718877048163247, 0.003247185323272874, 0.7324044880737033, 1, 0.001217723649685451],
[211.3183579326684, 580.6813629640724, 0, 1, 0.2668162025277022, 0, 0.00172211485296433, 0.003253301963343747, 0.7331837974722978, 1, 0.001217979996328415],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2754577227802, 582.3196301619588, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787071, 1, 0.001216922220026267],
[212.319910265969, 582.1822582866788, 0, 1, 0.267236413781921, 0, 0.00171767515372751, 0.003244914786252196, 0.732763586218079, 1, 0.001218762931450599],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1115954868298, 580.5978203169444, 0, 1, 0.2675779942285125, 0, 0.001722362649336346, 0.003253770083354559, 0.7324220057714874, 1, 0.001217606797400501],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.2778588383949, 0, 1, 0.2675288933879436, 0, 0.001717393139411024, 0.003244382024033732, 0.7324711066120564, 1, 0.001217958692253517],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.0852444487947, 580.864690889461, 0, 2, 0.2665386219883161, 0, 0.003443142665355435, 0.006504550363752933, 0.5379655930347983, 1, 0.002436949198309809],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.00121767937145269],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 0, 0.2674832388565824, 0, 0, 0, 1, 1, 1.361395704974615e-05],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001204298568490841],
[211.4107745949923, 579.856669914368, 0, 1, 0.26717992261906, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7328200773809399, 1, 0.001217972161435497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4107745949923, 580.2115173678847, 0, 1, 0.267060158286834, 0, 0.001723509392809842, 0.003255936432937663, 0.732939841713166, 1, 0.001217607065703232],
[211.4107745949923, 579.856669914368, 0, 0, 0.26717992261906, 0, 0, 0, 1, 1, 3.974217921466373e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2673407648258469, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2673407648258469, 0.00117796298202793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6776879843054, 579.9173999004336, 0, 2, 0.2674065203587101, 0, 0.003448767014653089, 0.006515175500967848, 0.5366932064129329, 1, 0.002437243368358473],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217518690849344],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.001217978936294667],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217423540793213],
[211.5055803327186, 580.1417116820217, 0, 1, 0.2671714821311868, 0, 0.001723716774476827, 0.003256328204243278, 0.7328285178688132, 1, 0.001217613214202487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001218077069495392],
[211.9872029813435, 580.417150927399, 0, 1, 0.2675240260047297, 0, 0.001722898777891359, 0.003254782900866484, 0.7324759739952702, 1, 0.001217790294509505],
[211.8233812936542, 580.5809726150883, 1, 0, 0.2673172859901384, 0.004720914159205511, 0, -0.008918429149184457, 1, 0.2673172859901385, 0.001217751642882986],
[212.1430104341117, 580.1684241425395, 1, 0, 0.2677520494797153, 0.004713801307682415, 0, -0.008904992035053986, 1, 0.2677520494797152, 0.001218872008422489],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.3276443968799, 0, 1, 0.2675121398281396, 0, 0.001717246312487373, 0.003244104648620493, 0.7324878601718604, 1, 0.001218076831714544],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1430509823728, 579.4520369023662, 0, 1, 0.2679944004569949, 0, 0.001725768374800783, 0.003260203947693509, 0.7320055995430051, 1, 0.001218014874365168],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001217593441645914],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217641982672473],
[211.3356728934271, 580.2594149913119, 0, 1, 0.2669744622318814, 0, 0.001723367125400236, 0.003255667671047483, 0.7330255377681186, 1, 0.001217394623160532],
[211.1718512057377, 580.4232366790012, 1, 0, 0.2667675108621766, 0.004735479630880032, 0, -0.008945945245172005, 1, 0.2667675108621765, 0.001216890617815295],
[211.3356728934271, 580.2594149913119, 0, 1, 0.2669744622318814, 0, 0.001723367125400236, 0.003255667671047483, 0.7330255377681186, 1, 0.001217392187301709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3463114559027, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672383893300694, 0.004709288299588227, 0, -0.008896466367867424, 1, 0.2672383893300694, 0.001217659715925083],
[211.2200406189959, 580.3228431357418, 0, 1, 0.266845985168939, 0, 0.001723178764765758, 0.003255311832979591, 0.733154014831061, 1, 0.001218191922900333],
[211.018668080524, 580.5242156742138, 1, 0, 0.2665915800790761, 0.004738917220434751, 0, -0.008952439304977763, 1, 0.2665915800790761, 0.001217317999846235],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2884953186871, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671744041200828, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328255958799172, 1, 0.001217959208755569],
[212.4528782566483, 579.5556807733942, 0, 1, 0.2682456847648657, 0, 0.001725459749899336, 0.003259620914572294, 0.7317543152351343, 1, 0.001218215737610651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9049141375132, 581.8969093198775, 0, 1, 0.2678716981440431, 0, 0.00171851746242956, 0.003246506018421994, 0.7321283018559569, 1, 0.001218077532563253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9872029813435, 579.7937235675779, 0, 1, 0.2677346673470866, 0, 0.001724751337159732, 0.003258282629525484, 0.7322653326529134, 1, 0.001218218726225785],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.0159307169694, 0, 1, 0.2676170705591552, 0, 0.001718166028149999, 0.003245842112742464, 0.7323829294408448, 1, 0.001218075328864954],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7644931621847, 579.5029513471757, 0, 1, 0.2676269504471944, 0, 0.001725616750829812, 0.003259917510025545, 0.7323730495528056, 1, 0.001217650171906563],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217434919469064],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2200406189959, 580.3228431357418, 0, 1, 0.266845985168939, 0, 0.001723178764765758, 0.003255311832979591, 0.733154014831061, 1, 0.001217612492580825],
[212.2884953186871, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671744041200828, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328255958799172, 1, 0.001218080400183879],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6720764998609, 582.0159307169694, 0, 1, 0.2676170705591552, 0, 0.001718166028149999, 0.003245842112742464, 0.7323829294408448, 1, 0.001217885082660525],
[212.3463114559026, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672383893300694, 0.004709288299588228, 0, -0.008896466367867426, 1, 0.2672383893300694, 0.001217208195436166],
[212.3145973836876, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129063, 1, 0.001217831727050546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.6730724154903, 578.126547221765, 0.375, 2.375, 0.2670805958455867, 0.001780009166337231, 0.004108097113708511, 0.004398065016965961, 0.5854072279116358, 0.5744950618443747, 0.002447221638367097],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2674597167879816, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7325402832120184, 1, 0.001221003377929133],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 580.0207833918884, 1, 0, 0.2674277957314105, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674277957314104, 0.001255776497122704],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0956481135096, 579.5154413678847, 0, 1, 0.2679291017164239, 0, 0.001725579559432629, 0.003259847250573762, 0.7320708982835762, 1, 0.001217402856796996],
[211.738417970371, 579.6659359383716, 0, 1, 0.267547704185093, 0, 0.00172513155940617, 0.003259000919469221, 0.7324522958149069, 1, 0.00121750909448229],
[211.738417970371, 579.6659359383716, 0, 0, 0.267547704185093, 0, 0, 0, 1, 1, 6.579161873905001e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.9520369023663, 0, 1, 0.2675239253129943, 0, 0.001718354669437765, 0.003246198481001412, 0.7324760746870056, 1, 0.001152161344678191],
[211.4107745949923, 579.7613029263698, 0, 1, 0.2672121281849511, 0, 0.001724847786412197, 0.003258464834877158, 0.7327878718150489, 1, 0.001217113584439329],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3838623066852, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2673407648258469, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2673407648258469, 0.001217434786389841],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 1, 0, 0.2674832388565824, 0.004722808499211193, 0, -0.008922007807163696, 1, 0.2674832388565824, 0.001217446960243374],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217660712260324],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217976650001264],
[212.3918765416064, 582.2032113431327, 1, 0, 0.2672957331098114, 0.004708278001414549, 0, -0.008894557781441652, 1, 0.2672957331098114, 0.00121736072899478],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1430509823728, 582.4520369023663, 1, 0, 0.2669825854915748, 0.004713800406703357, 0, -0.008904990332985781, 1, 0.2669825854915748, 0.001217204623545953],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217432115459318],
[212.3463114559026, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672383893300694, 0.004709288299588228, 0, -0.008896466367867426, 1, 0.2672383893300694, 0.001217278801919912],
[212.5793980665895, 582.0156898181496, 0, 1, 0.2675317294403228, 0, 0.001718166739306374, 0.003245843456210601, 0.7324682705596772, 1, 0.00121769589670378],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4107745949923, 580.4960269696571, 0, 1, 0.2669642111638477, 0, 0.001722664675622785, 0.003254340650822207, 0.7330357888361523, 1, 0.001218412835809247],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217101861415343],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4792292946834, 581.4489808569101, 0, 1, 0.2667066533731376, 0, 0.001719841349667946, 0.003249007015927747, 0.7332933466268624, 1, 0.001219012646906636],
[211.738417970371, 580.878078501312, 0, 1, 0.267138545454101, 0, 0.001721531655283048, 0.003252200226047733, 0.732861454545899, 1, 0.001218289655604228],
[211.738417970371, 580.5663648214014, 0, 1, 0.2672436448310807, 0, 0.001722455968160726, 0.003253946374914933, 0.7327563551689193, 1, 0.001217919307096413],
[210.2602255749722, 576.5756256226705, 0, 1, 0.2672224775408176, 0, 0.00173437786052793, 0.003276468401119071, 0.7327775224591824, 1, 0.001225536669786716],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 580.5663648214014, 0, 0, 0.2672436448310807, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001154519569364429],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.4022513438812, 0, 1, 0.2673724149734465, 0, 0.001717026329641619, 0.00324368907202712, 0.7326275850265536, 1, 0.001102461261794453],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217045545556367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6299728382048, 580.4219521885371, 0, 1, 0.2671920440456724, 0, 0.001722884526040759, 0.003254755977242048, 0.7328079559543277, 1, 0.00121761997291098],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5055803327186, 580.1417116820217, 0, 1, 0.2671714821311867, 0, 0.001723716774476827, 0.003256328204243278, 0.7328285178688132, 1, 0.001217272965546615],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001217960181562714],
[211.6219991515447, 580.7088857052282, 0, 1, 0.2670879088473233, 0, 0.001722033233201819, 0.003253147772853394, 0.7329120911526767, 1, 0.001218029036772478],
[211.9528281047498, 580.0927660113351, 1, 1, 0.2676018018145622, 0.004718030936137297, 0.001723862214100529, -0.005656379401883261, 0.9283892756655998, 0.4635928792947243, 0.002462281416806279],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.4022513438812, 0, 1, 0.2673724149734465, 0, 0.001717026329641619, 0.00324368907202712, 0.7326275850265536, 1, 0.00121795800015747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217658990948797],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3248055777829, 580.7012192177158, 0, 1, 0.2668154820194791, 0, 0.001722055967692193, 0.00325319072130253, 0.7331845179805209, 1, 0.001219981654151286],
[212.4547646622834, 582.4022513438811, 0, 1, 0.2672867703046553, 0, 0.001717026329641619, 0.00324368907202712, 0.7327132296953447, 1, 0.001218736217475003],
[212.2754577227801, 582.3196301619589, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787072, 1, 0.001217436895506483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217231055351856],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217698361462817],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001223170334619514],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8068726700621, 579.7882152146769, 0, 1, 0.2675697157697654, 0, 0.001724767723382808, 0.003258313585260878, 0.7324302842302346, 1, 0.001217564622097561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.7115056820639, 581.8835822026751, 1, 0, 0.2676979872205289, 0.004701203147396653, 0, -0.008881192449607268, 1, 0.267697987220529, 0.001217776272117818],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217681815273601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0971894488496, 0, 1, 0.2674750584791393, 0, 0.001717926178181406, 0.0032453890045352, 0.7325249415208608, 1, 0.001222426285909396],
[212.7115056820639, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2676428072967441, 0.004701203147396654, 0, -0.008881192449607269, 1, 0.2676428072967441, 0.001217230791997785],
[212.7115056820639, 581.8835822026751, 1, 0, 0.2676979872205288, 0.004701203147396654, 0, -0.008881192449607269, 1, 0.2676979872205288, 0.001217231055351856],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217885082995137],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217155760581766],
[212.9523170063764, 581.6427708783626, 0, 1, 0.2680010489031194, 0, 0.001719268338003856, 0.00324792452136091, 0.7319989510968806, 1, 0.001223099786038819],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.4240316873648, 575.3487060130257, 1, 1, 0.2677924819626384, 0.004752308906835028, 0.001738076386631102, -0.005694282561394945, 0.92828718660429, 0.4638721505295668, 0.001219972037678472],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217992609848325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4547646622833, 582.4022513438812, 0, 1, 0.2672867703046552, 0, 0.001717026329641619, 0.00324368907202712, 0.7327132296953448, 1, 0.001218281995045433],
[212.5476839943746, 581.9520369023662, 0, 1, 0.2675239253129944, 0, 0.001718354669437766, 0.003246198481001413, 0.7324760746870056, 1, 0.001217957633841669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.00121860988446656],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 0, 0.2674832388565824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005227145274484229],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.0006943843891683926],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2722447489971, 580.3228431357418, 1, 0, 0.2668943352257886, 0.004733229398816935, 0, -0.008941694260183253, 1, 0.2668943352257886, 0.001226014429872431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3145973836877, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870938, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129062, 1, 0.001218305909502495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2200406189959, 580.1158585900555, 0, 1, 0.2669157823246899, 0, 0.001723793592594509, 0.003256473323793606, 0.7330842176753101, 1, 0.00123250631117979],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001218305923819534],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001218646969408959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.0130560733096, 580.5820318114294, 0, 1, 0.2665669093995621, 0, 0.001722409487734191, 0.003253858567262242, 0.7334330906004379, 1, 0.001217749926890397],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2722447489971, 580.2591902199586, 0, 1, 0.2669157981796179, 0, 0.001723367792970122, 0.003255668932174994, 0.733084201820382, 1, 0.001216821318102599],
[211.505331359684, 580.0897565250549, 0, 1, 0.2671887870411855, 0, 0.001723871157440114, 0.003256619854011412, 0.7328112129588145, 1, 0.001217662468385425],
[212.3145973836876, 582.2804905010514, 0, 1, 0.2671984770870937, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792982, 0.7328015229129063, 1, 0.001217658986324004],
[211.0391581383102, 580.5559297464288, 0, 1, 0.2665998834103917, 0, 0.001722486928066988, 0.003254004862258941, 0.7334001165896082, 1, 0.001217262788743338],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3145973836877, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870938, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129062, 1, 0.00121765747556883],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 581.785475768939, 0, 1, 0.2675800215336687, 0, 0.001718846622422658, 0.003247127845038235, 0.7324199784663312, 1, 0.001216508805894428],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2674597167879816, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7325402832120184, 1, 0.001217266974470358],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217885139502054],
[212.3918765416064, 582.4362979538196, 1, 0, 0.2672173475436214, 0.004708278001414549, 0, -0.008894557781441652, 1, 0.2672173475436214, 0.001217058888692355],
[212.5476839943746, 582.0213018253638, 0, 1, 0.2675006044630525, 0, 0.001718150172276772, 0.003245812158907846, 0.7324993955369475, 1, 0.001217117014963602],
[212.3145973836877, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671984770870938, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328015229129062, 1, 0.001217155760564371],
[212.2884953186871, 582.2804905010513, 0, 1, 0.2671744041200828, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.7328255958799172, 1, 0.001217885082975827],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[213.0476839943746, 581.5474038903644, 0, 1, 0.2681210685073836, 0, 0.001719550277948664, 0.003248457143081471, 0.7318789314926164, 1, 0.001217266895977162],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217117015060635],
[212.5085443334671, 582.0865435512719, 1, 0, 0.2674425598315463, 0.00470569314347571, 0, -0.008889674644063842, 1, 0.2674425598315463, 0.001221059021223263],
[212.5607215902814, 581.8705446067682, 0, 1, 0.2675633885959848, 0, 0.001718595328924591, 0.003246653118495329, 0.7324366114040153, 1, 0.001217189375685555],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217266895962009],
[212.7884953186871, 582.0133281387037, 0, 1, 0.2677252228650613, 0, 0.001718173711241339, 0.003245856627114778, 0.7322747771349387, 1, 0.001217885042631183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4232914888883, 581.8169489423341, 0, 1, 0.2674547078772486, 0, 0.001718753642048186, 0.003246952192854351, 0.7325452921227513, 1, 0.00121711697715664],
[212.7115056820639, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2676428072967441, 0.004701203147396654, 0, -0.008881192449607269, 1, 0.2676428072967441, 0.001217230792040082],
[212.1904538512359, 582.1978984608513, 0, 1, 0.2671117385264402, 0, 0.001717629010073184, 0.0032448276148066, 0.7328882614735598, 1, 0.001217117017832284],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001216993230090629],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 0, 0.2674832388565824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000344854349204763],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.738417970371, 579.856669914368, 0, 1, 0.2674832388565824, 0, 0.001724564106760517, 0.003257928926620991, 0.7325167611434176, 1, 0.0008731718311967863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217957778129066],
[212.2754577227802, 582.3196301619588, 0, 1, 0.2671492197212929, 0, 0.001717269946269668, 0.003244149295950612, 0.7328507802787071, 1, 0.001218281221048786],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001217463955021513],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7858208392341, 579.8353691105054, 0, 1, 0.2675342999000323, 0, 0.0017246274602635, 0.003258048609739271, 0.7324657000999677, 1, 0.001222348656697371],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217487072251499],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217723206488007],
[212.0671697043107, 580.3111951675461, 0, 1, 0.2676337203358728, 0, 0.001723213352296749, 0.0032553771733849, 0.7323662796641273, 1, 0.001218179020053322],
[212.5607215902814, 581.77517761877, 0, 1, 0.2675955119262968, 0, 0.001718877048163247, 0.003247185323272874, 0.7324044880737032, 1, 0.001217885082975827],
[212.5476839943746, 582.0156898181496, 0, 1, 0.2675024938218771, 0, 0.001718166739306374, 0.003245843456210601, 0.7324975061781229, 1, 0.001218321152984314],
[212.5476839943746, 582.4022513438812, 1, 0, 0.2673724149734465, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2673724149734464, 0.001217432842581738],
[212.5476839943746, 581.785475768939, 0, 1, 0.2675800215336687, 0, 0.001718846622422658, 0.003247127845038235, 0.7324199784663312, 1, 0.001216992835781679],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331552, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001217885082975908],
[212.682538390689, 582.0054688261413, 0, 1, 0.2676302353366944, 0, 0.001718196913195542, 0.003245900458664706, 0.7323697646633056, 1, 0.001217058920143051],
[212.3838623066852, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672730164276239, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672730164276239, 0.001217525750914631],
[212.5793980665895, 582.0156898181494, 0, 1, 0.2675317294403228, 0, 0.001718166739306374, 0.003245843456210601, 0.7324682705596772, 1, 0.001217059029671331],
[212.5476839943746, 582.1427708783626, 1, 0, 0.2674597167879816, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674597167879816, 0.001219806469640484],
[212.288495318687, 582.306592566052, 0, 1, 0.2671656275699011, 0, 0.001717308395210326, 0.003244221931067786, 0.732834372430099, 1, 0.001217885083045383],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217155761400544],
[212.8068726700621, 581.7882152146769, 0, 1, 0.2678180068247931, 0, 0.001718838528949929, 0.003247112555401383, 0.7321819931752069, 1, 0.00121705889438087],
[212.2807706050615, 582.3143172796775, 0, 1, 0.2671559059975641, 0, 0.001717285614187833, 0.003244178894713343, 0.7328440940024359, 1, 0.00121711701774868],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.7754577227802, 581.8196301619588, 0, 1, 0.2677784710313294, 0, 0.001718745721456036, 0.003246937229811702, 0.7322215289686707, 1, 0.001217058888692355],
[212.704256242249, 581.5791179625794, 1, 0, 0.2677939173222543, 0.004701363374981548, 0, -0.008881495140636048, 1, 0.2677939173222543, 0.001217432842581738],
[212.6720764998609, 582.0159307169694, 0, 1, 0.2676170705591552, 0, 0.001718166028149999, 0.003245842112742464, 0.7323829294408448, 1, 0.00121788513981769],
[212.5346463984677, 582.2242631739607, 0, 1, 0.2674202753043801, 0, 0.001717551231115927, 0.00324468068010366, 0.7325797246956199, 1, 0.001217266895944536],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218321296075431],
[212.586823655282, 582.0082642294569, 1, 0, 0.267541074563148, 0.004703960399829576, 0, -0.008886401262909132, 1, 0.2675410745631479, 0.001219806469640484],
[213.0950868632377, 581.526103086502, 1, 0, 0.2681719158240873, 0.004692740760568497, 0, -0.008865205885392212, 1, 0.2681719158240874, 0.001217266895760895],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217117018014349],
[212.5476839943746, 581.7882152146768, 0, 1, 0.2675790987238723, 0, 0.001718838528949929, 0.003247112555401384, 0.7324209012761278, 1, 0.001217884964994118],
[212.5476839943746, 581.8143172796775, 0, 1, 0.2675703063004978, 0, 0.001718761416315063, 0.003246966879469272, 0.7324296936995022, 1, 0.001218281221772144],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.00121788508308141],
[212.4523170063764, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2673717975930829, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7326282024069171, 1, 0.001217189375722014],
[212.680090734782, 582.0079164820482, 0, 1, 0.2676271553154977, 0, 0.001718189687254614, 0.003245886807909784, 0.7323728446845024, 1, 0.001217433004738254],
[212.3838623066852, 582.2112255780538, 1, 0, 0.2672856471741653, 0.004708455666730394, 0, -0.008894893414642807, 1, 0.2672856471741654, 0.001217189259988105],
[212.7115056820639, 581.883582202675, 1, 0, 0.267697987220529, 0.004701203147396653, 0, -0.008881192449607268, 1, 0.267697987220529, 0.001217266895976942],
[212.9523170063764, 581.6427708783626, 1, 0, 0.2680010489031194, 0.004695886919934556, 0, -0.008871149395155788, 1, 0.2680010489031194, 0.001221059021311504],
[212.5607215902814, 581.77517761877, 0, 1, 0.2675955119262968, 0, 0.001718877048163247, 0.003247185323272874, 0.7324044880737032, 1, 0.001217885082677125],
[212.3463114559026, 582.2487764288364, 1, 0, 0.2672383893300694, 0.004709288299588228, 0, -0.008896466367867426, 1, 0.2672383893300694, 0.001217189375722014],
[212.7754577227801, 582.2242631739607, 0, 1, 0.2676421791479052, 0, 0.001717551231115927, 0.00324468068010366, 0.7323578208520949, 1, 0.001217135886440744],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217885082677125],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.00121718937681198],
[212.296410779234, 582.298677105505, 0, 1, 0.2671755891977385, 0, 0.001717331739393275, 0.003244266031306564, 0.7328244108022615, 1, 0.001217884964994118],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001218281221698294],
[212.6009473207168, 579.7038354710555, 0, 2, 0.2683322781059003, 0, 0.003450037549561563, 0.00651757570888959, 0.5353376552617016, 1, 0.002440088862961848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9312651755484, 582.0186701627073, 0, 1, 0.2678549374118068, 0, 0.001718157941085366, 0.003245826835211351, 0.7321450625881931, 1, 0.001216778137510526],
[212.5476839943746, 582.2804905010513, 0, 1, 0.267413374128697, 0, 0.001717385377517117, 0.003244367360792983, 0.732586625871303, 1, 0.001216927062705675],
[212.4312651755484, 582.1899247741912, 0, 1, 0.2673365219331551, 0, 0.001717652534759788, 0.003244872056040578, 0.7326634780668448, 1, 0.001218084417055509],
[212.2917693818883, 579.6937632833325, 5, 13, 0.2680500597876778, 0.023552491057746, 0.02242563371109806, -0.002128782068134232, 0.6533089537266898, 0.5519097477990415, 0.0223787993316303],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.00121766885627097],
[212.4523170063764, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2673717975930829, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7326282024069171, 1, 0.001217680299957525],
[212.5956481135096, 579.3753600657502, 0, 1, 0.2684386750498187, 0, 0.00172599676984281, 0.003260635416034524, 0.7315613249501813, 1, 0.001217589748997097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9049141375132, 581.8969093198775, 0, 1, 0.2678716981440431, 0, 0.00171851746242956, 0.003246506018421994, 0.7321283018559569, 1, 0.001217957862373449],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 0, 1, 0.2674918171973472, 0, 0.001718073121391951, 0.00324566659962971, 0.7325081828026528, 1, 0.001217156030265408],
[212.4523170063764, 582.1427708783626, 0, 1, 0.2673717975930829, 0, 0.001717791665592885, 0.003245134892524276, 0.7326282024069171, 1, 0.001217885082677125],
[212.5476839943746, 582.0474038903644, 1, 0, 0.2674918171973472, 0.004704826612114328, 0, -0.00888803765209758, 1, 0.2674918171973472, 0.001217267064065083]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.0005582976888970612, 2.999441702311102, 0, 0.75, 0.0001860992296323538, 0, 0.2500465334672506, 0.4723708624056295, 0.9998604223306874, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.7146533146027562, 2.233187954556352, 0.25, 0.5, 0.2424327666756005, 0.3498199684961426, 0.2238951714654625, -0.2378885407720595, 0.8746789536195242, 0.1879815695707137, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.001228942377567215, 2.998771057622431, 0, 1, 0.0004096474591890718, 0, 0.333469938446334, 0.6299686711348793, 0.999590352540811, 1, 0.529343686005199],
[0.8141613358175592, 2, 0, 0, 0.2893086922399324, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9400914923595624, 2.073928444928204, 2, 1, 0.3119061956854622, 2.127452504628186, 0.4821767127238657, -3.122668170818503, 0.9696560576263111, 0.2311685399735555, 0.5268814045883927],
[0.8128299770465132, 2.201023785794443, 1.25, 1.5, 0.2696978821826821, 1.537836983500512, 0.6815010404163291, -1.625291641774992, 0.8838039144326834, 0.4716862659519897, 0.5268814045883927],
[1.003516888855351, 2.010287895877247, 0, 2, 0.3329734208197525, 0, 0.9948823768484376, 1.888247275733054, 0.4449244573329029, 1, 0.5268814045883927],
[0.5346727107642313, 2.465327289235768, 2, 0, 0.1782242369214104, 3.740606093663003, 0, -7.066497990922035, 1, 0.03176387862621888, 0.529343686005199],
[1.000060645344358, 1.295631307970315, 1, 2, 0.4356249295121689, 0.9999393583332771, 1.54364902090327, 1.027139223428185, 0.5960290458736071, 0.8202356926545871, 0.529343686005199],
[1.002377968657326, 2.004755937314652, 0, 0.75, 0.3333333333333334, 0, 0.3741103772485227, 0.708424431828052, 0.7377879464668811, 1, 0.5280879095080763],
[1.003916832672733, 1.991262027689782, 0, 7, 0.3351775902128349, 0, 3.515358552847636, 6.656767726650394, 0.05740365575344197, 1, 0.5280879095080763],
[0.9980792123738718, 2.009054693598106, 0, 2, 0.3319038139245312, 0, 0.9954930576917799, 1.885089659824063, 0.4463525138485875, 1, 0.5280879095080763],
[0.7153538669655173, 2.23963234287793, 0, 1, 0.2420836566284403, 0, 0.4465018569588073, 0.8455066834889898, 0.7579163433715597, 1, 0.5280879095080763],
[0.2343242051991419, 2.586957398545182, 1, 2, 0.08305594340109598, 4.267591558243604, 0.7731089816649988, -6.617236474574433, 0.9804510187207256, 0.2290459049622817, 0.5280879095080763],
[0.545747234271893, 1.650311482857985, 0, 1, 0.2485121322189205, 0, 0.6059462170548647, 1.14743436868175, 0.7514878677810796, 1, 0.5280879095080763],
[1.002377968657326, 2.004755937314652, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4988138363313636, 0.9445659091040695, 0.6666666666666666, 1, 0.5280879095080763],
[0.5453880632496642, 1.750363303443707, 1, 0, 0.2375640808330217, 1.833556814649657, 0, -3.472067399455613, 0.9999999999999999, 0.2375640808330217, 0.5280879095080763],
[0.9383348435180406, 2.068799062453937, 1, 0, 0.312036268705749, 1.065717645367151, 0, -2.018068632474253, 1, 0.312036268705749, 0.5280879095080763],
[0.234006480813287, 2.581009995437043, 0, 2, 0.08312792581768094, 0, 0.7748904512325764, 1.463870207049123, 0.840654400415388, 1, 0.529343686005199],
[0.4818114275633211, 2.518188572436681, 0.5, 0, 0.1606038091877736, 1.037750396516464, 0, -1.960447293417365, 1, 0.0838143251435185, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 2.5, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 1.25, 0.4722829545520348, 0.6652935103855546, 0.7580750871325256, 0.529343686005199],
[0.9994645428505006, 2.0005354571495, 1, 1, 0.3331548476168334, 1.000535744017464, 0.4998661715423273, -0.9458308197714463, 0.8890078475094045, 0.5553175427430714, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[1.000089986979006, 1.8082646247797, 0, 2, 0.3561124306708223, 0, 1.106032807694648, 2.089441768998043, 0.4145912019366366, 1, 0.529343686005199],
[0.4819993582203829, 2.515615483397327, 1, 3, 0.1607942926918071, 2.074691559117748, 1.192551095268548, -1.66647961838641, 0.876124199967777, 0.5040090925238178, 0.529343686005199],
[0.4819996178271019, 2.5180003821729, 1, 0, 0.1606665392757005, 2.07469044168145, 0, -3.919363726312726, 1, 0.1606665392757005, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9989032402342316, 2.000364724934112, 1, 1, 0.3330490145711822, 1.001097963968473, 0.499908835391475, -0.9468123297348174, 0.8890783538931646, 0.5551763830355289, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.9999999999999998, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.529343686005199],
[0.9983915818442689, 2.001608418155731, 0, 1, 0.3327971939480896, 0, 0.4995982185773346, 0.9438068910345475, 0.6672028060519104, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9988499480709464, 2.001150051929054, 2, 1, 0.3329499826903154, 2.002302752142651, 0.4997126522501535, -2.838590767431464, 0.9630905996092564, 0.2587482721389569, 0.529343686005199],
[0.456173646310927, 2.543826353689074, 0, 1, 0.1520578821036423, 0, 0.3931085934972697, 0.7426339519867415, 0.8479421178963578, 1, 0.529343686005199],
[1.000930849187545, 1.999069150812455, 4, 1, 0.3336436163958484, 3.996280065947409, 0.5002328206573462, -6.604494089036375, 0.9958655846962584, 0.04542089427012264, 0.529343686005199],
[0.4568306568949853, 2.542572076227311, 0, 2, 0.1523072083152491, 0, 0.7866050361756571, 1.486000602202199, 0.7185830690742865, 1, 0.529343686005199],
[0.5546057466404013, 1.654165082520973, 0, 2, 0.2510924806313989, 0, 1.209069167964765, 2.284091035616679, 0.5608624725668316, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[1.000089965909817, 1.808264910604326, 0, 2, 0.3561123895962799, 0, 1.106032632868817, 2.089441438729005, 0.4145912548314128, 1, 0.529343686005199],
[0.9995612491832574, 2.000438750816743, 0, 2, 0.3331870830610857, 0, 0.9997806727066431, 1.888717480039657, 0.4446394661965834, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 1.889131818208139, 0.4444444444444445, 1, 0.529343686005199],
[0.8080529202762013, 2.191947079723796, 4, 1, 0.2693509734254007, 4.950170836128847, 0.4562153937247465, -8.489674215855223, 0.998582272553873, 0.02064656418072808, 0.529343686005199],
[0.9997861465957352, 1.293571315147941, 0, 2, 0.4359486749333799, 0, 1.546107258702832, 2.920800416778083, 0.31815389730941, 1, 0.529343686005199],
[0.0008215701977538015, 2.533978612094123, 0, 1, 0.000324116355795338, 0, 0.3946363221959411, 0.7455200328809913, 0.9996758836442047, 1, 0.529343686005199],
[0.997018820513354, 2.002981179486647, 0, 1, 0.3323396068377846, 0, 0.4992558144037553, 0.9431600444155516, 0.6676603931622154, 1, 0.529343686005199],
[0.533736493548077, 2.466263506451923, 1, 0, 0.1779121645160257, 1.873583710479268, 0, -3.539446601542852, 1, 0.1779121645160257, 0.529343686005199],
[0.9994036728308158, 2.000596327169185, 0, 1, 0.3331345576102718, 0, 0.4998509626452157, 0.9442843578950452, 0.6668654423897282, 1, 0.529343686005199],
[0.9995608831704327, 2.000146027290324, 1, 1, 0.3332195154415601, 1.000439309737867, 0.4999634958427205, -0.9454647842729355, 0.8889647545288921, 0.555403785412012, 0.529343686005199],
[0.9994635526695864, 2.000536447330414, 0, 3, 0.3331545175565288, 0, 1.499597772389154, 2.832937866334397, 0.2965347812879175, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9994633915559341, 2.000536608444066, 1, 1, 0.3331544638519781, 1.000536896547287, 0.4998658838729066, -0.945833540497662, 0.8890081032155011, 0.5553170309194573, 0.529343686005199],
[0.9982112819524812, 2.001788718047519, 0, 1, 0.3327370939841603, 0, 0.4995532200697824, 0.9437218829221589, 0.6672629060158397, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 4, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 2, 1.889131818208139, 0.4609053497942389, 0.868312757201646, 0.529343686005199],
[0.9982105627128136, 2.001789437287187, 0, 2, 0.3327368542376045, 0, 0.9991060811622567, 1.887443087688863, 0.4452401056927278, 1, 0.529343686005199],
[0.4819996178819668, 2.517940365784077, 1, 1, 0.1606697535638511, 2.074690441445293, 0.3971499935379144, -3.169095036472962, 0.9741852302897315, 0.2955247374174335, 0.529343686005199],
[0.278764134443881, 2.06013198096654, 0, 37, 0.1191861975430082, 0, 17.96001437861322, 33.92883461811392, 0.009135075143610175, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9994032997738321, 2.000596700226168, 0, 3, 0.333134433257944, 0, 1.499552608309735, 2.832852545434928, 0.2965615755271641, 1, 0.529343686005199],
[0.9997807101744012, 2.000219289825599, 1, 1, 0.3332602367248003, 1.000219337924174, 0.4999451835539446, -0.9450838228479709, 0.88893761461813, 0.5554580880677307, 0.529343686005199],
[0.5447570643157684, 2.269617975876956, 0, 1, 0.1935623563085836, 0, 0.4406027845340847, 0.8323567394544445, 0.8064376436914165, 1, 0.529343686005199],
[0.9361817297937755, 2.063818270206225, 1, 1, 0.3120605765979251, 1.068168677271968, 0.4845387864020003, -1.1025537968998, 0.9026181965333706, 0.5267393497292208, 0.529343686005199],
[0.4555474568112105, 2.54445254318879, 0, 0, 0.1518491522704035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.2351157773017706, 2.579901548580713, 0, 2, 0.0835219645506316, 0, 0.775223380558946, 1.464499154432782, 0.8399319894611339, 1, 0.529343686005199],
[0.814108895312887, 1.999549316711942, 1, 1, 0.2893417870847288, 1.228336904015364, 0.5001126962171653, -1.375711521740994, 0.9162813302466155, 0.494964904416073, 0.529343686005199],
[0.001375997592530497, 2.533900057835454, 0, 2, 0.0005427407360963743, 0, 0.789297112889476, 1.491086289979331, 0.9989148130953138, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.646281432807601, 0, 0, 0.2485251742814465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1.804762116389809, 1.192256842970131, 1, 0, 0.6021857521966574, 0.5540896447895136, 0, -1.046748378111516, 1, 0.6021857521966574, 0.529343686005199],
[1, 1.999780571764395, 0, 2, 0.3333577160318181, 0, 1.000109726156311, 1.889339105381316, 0.4444119347743141, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.999780716230532, 2.000219283769468, 1, 3, 0.3332602387435106, 1.000219331865386, 1.499835555202936, 0.9438409043999498, 0.5927225385284929, 0.8023824909289352, 0.529343686005199],
[0.2334338624695505, 2.580552689544728, 0, 3, 0.08295486071262716, 0, 1.16254165712434, 2.196194434466007, 0.7712090899960655, 1, 0.529343686005199],
[1.00052608591854, 2.006475316580991, 1, 1, 0.3327321647029713, 0.9994741907023277, 0.4983863951558535, -0.9488301229237334, 0.8892893065720748, 0.5547536359780174, 0.5281111796940192],
[1.004138865586731, 2.010075935404542, 0, 1, 0.3331344751065862, 0, 0.4974936430940072, 0.9442842410694831, 0.6668655248934138, 1, 0.5268473426291144],
[0.8095326941690405, 2.195800624907842, 1, 3, 0.2693653609170035, 1.235280560257629, 1.366244260052486, 0.2479998054416652, 0.7052161989024457, 0.7150287598783953, 0.5280798489402941],
[0.4827753011184236, 2.52440450550045, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280798489402941],
[1.002393268872958, 2.004786537745915, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4988062225938287, 0.9445659091040696, 0.6666666666666667, 1, 0.5280798489402941],
[0.8112028151887991, 2.068366482779572, 0, 0, 0.2817097736668914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280798489402941],
[0.8112028151887991, 2.19597699143007, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280798489402941],
[0.7160115071965171, 2.238959826579674, 0, 2, 0.2423074291829145, 0, 0.8932719454172972, 1.69154711585727, 0.574098031871404, 1, 0.5280798489402941],
[1.81172982592959, 1.195449980689281, 3, 0, 0.6024680738883424, 1.655876034640383, 0, -3.135654651400265, 0.9999999999999999, 0.2186764993331003, 0.5280798489402941],
[0.7122298952592918, 2.243847362984285, 1, 2, 0.2409375104365439, 1.404041035985921, 0.8913262252116956, -0.9709039490961411, 0.8538206191019735, 0.5626465149575789, 0.5280798489402941],
[0.7139247976369695, 2.233991133357427, 0, 2, 0.2421794970917461, 0, 0.8952587009574359, 1.691261697506378, 0.5742919146281188, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.517773865044675, 0, 1, 0.1605731841155318, 0, 0.3971762571227802, 0.7503183047674612, 0.8394268158844682, 1, 0.529343686005199],
[1.0000299961896, 1.999373676641372, 1, 2, 0.333409605798651, 0.9999700047101442, 1.000313259780273, 0.0006484540747417513, 0.7406390383037156, 0.703805388689593, 0.529343686005199],
[0.9981213852183776, 2.001878614781623, 0, 1, 0.3327071284061258, 0, 0.4995307870397956, 0.943679503971432, 0.6672928715938742, 1, 0.529343686005199],
[0.9994036728307911, 2.000596327169209, 0, 1, 0.3331345576102637, 0, 0.4998509626452096, 0.9442843578950336, 0.6668654423897363, 1, 0.529343686005199],
[0.8075037122959511, 2.001662360142323, 1.375, 2.375, 0.2874531770188515, 1.702778549575337, 1.186513793380784, -0.9752921775465986, 0.7933266817958573, 0.5602522105710064, 0.529343686005199],
[1.00002997905452, 1.80885934825272, 0, 1, 0.3560232755817421, 0, 0.5528345810667682, 1.044377397298999, 0.6439767244182579, 1, 0.529343686005199],
[0.8085844050893271, 2.18870385169053, 1, 3, 0.2697719858142811, 1.23672926871441, 1.370674245253799, 0.2530397170697016, 0.7045144150581018, 0.7156626181531134, 0.529343686005199],
[0.9988673396522606, 2.00113266034774, 0, 2, 0.3329557798840868, 0, 0.9994339903744598, 1.888062551415119, 0.4449479915900469, 1, 0.529343686005199],
[0.7188893336658152, 2.227679267253987, 0, 3, 0.2439750879858715, 0, 1.346692966127945, 2.544080531669398, 0.4321239317462762, 1, 0.529343686005199],
[0.9968996956850281, 2.003100304314972, 1, 1, 0.332299898561676, 1.003109946094267, 0.4992261235475095, -0.9519029618534238, 0.8895767774158997, 0.554176574539252, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[0.9994030690856589, 2.000596930914341, 0, 8.5, 0.3331343563618863, 0, 4.248731900290984, 8.026414619875631, 0.03193933869362462, 1, 0.529343686005199],
[0.9989027345192111, 2.000364893108477, 1, 2, 0.3330488834400239, 1.001098470794874, 0.9998175867264346, -0.002419758849124349, 0.7411199263073809, 0.7033242753327922, 0.529343686005199],
[1.01591207850134, 1.98408792149866, 1, 1, 0.3386373595004468, 0.9843371499974549, 0.5040099227279508, -0.9074014481865126, 0.8853247387505651, 0.5625994577514588, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -0.9445659091040695, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.529343686005199],
[0.9994037390088636, 2.000596260991137, 0, 1.5, 0.3331345796696211, 0, 0.7497764687698001, 1.416426583696771, 0.5445744946241378, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9888230311965305, 2.01117696880347, 1, 2, 0.3296076770655101, 1.011303305496379, 0.9944425731912994, -0.03185214587581525, 0.7456942984884931, 0.6987083492699945, 0.529343686005199],
[0.4826802397023007, 2.014460150211205, 0, 4.5, 0.1932931931468296, 0, 2.233849103209215, 4.220035417948245, 0.3803826910602274, 1, 0.529343686005199],
[0.9997405883723425, 2.000259411627658, 1, 2, 0.3332468627907808, 1.000259478939512, 0.9998703110075871, -0.0007351895228249475, 0.7408560273190297, 0.703588394692011, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2, 0, 0, 0.1940756983709108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 5, 0.3333333333333333, 0, 2.5, 4.722829545520348, 0.131687242798354, 1, 0.529343686005199],
[1.025686980742851, 1.456848297731872, 1, 1, 0.4131610896474496, 0.9749563158886472, 0.6864132672954854, -0.5450958540201193, 0.8292979140013321, 0.6556200932962313, 0.529343686005199],
[0.9997805848352715, 2.000219415164729, 2, 1, 0.3332601949450905, 2.000438926636617, 0.4999451522260345, -2.834630532262258, 0.9629873370768783, 0.2591617467582747, 0.529343686005199],
[0.8081354151930774, 2, 1, 0, 0.2877836342295882, 1.237416379977708, 0, -2.337642655787822, 1, 0.2877836342295882, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190587556746251, 0, 1, 0.2697685077687427, 0, 0.4564985302323782, 0.8623858984272359, 0.7302314922312573, 1, 0.529343686005199],
[0.7144602862773416, 2.233335583721427, 0, 0, 0.2423710181389324, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.2331237670678322, 1.958540951554431, 0, 1, 0.1063683532827867, 0, 0.5105841668545824, 0.9645607954782853, 0.8936316467172133, 1, 0.529343686005199],
[0.4925802391575202, 2.507419760842482, 0, 1, 0.1641934130525066, 0, 0.398816351221546, 0.7534166587142951, 0.8358065869474933, 1, 0.529343686005199],
[0.4561732719839163, 2.543826728016084, 0, 1, 0.1520577573279721, 0, 0.3931085356508909, 0.7426338427073067, 0.847942242672028, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8097695984518305, 1.993318332650301, 0, 2, 0.2888848364216108, 0, 1.003352032257093, 1.895464249000675, 0.5056847758711193, 1, 0.529343686005199],
[0.4556376492756844, 2.544362350724316, 1, 0, 0.1518792164252281, 2.194726448943968, 0, -4.146127566963012, 1, 0.1518792164252281, 0.529343686005199],
[0.4572021447587836, 2.542797855241217, 1, 0, 0.1524007149195945, 2.18721633628292, 0, -4.131939974176698, 1, 0.1524007149195945, 0.529343686005199],
[0.004070166510366987, 2.995929833489632, 1, 3, 0.00135672217012233, 245.6901941119443, 1.001358565365874, -462.2494647913401, 0.9999889757980486, 0.00541585449606663, 0.529343686005199],
[0.5023030082622869, 2.49748303476435, 1, 2, 0.1674462781870563, 1.990830203186502, 0.8008062405872198, -2.248112132176438, 0.9252750350183758, 0.4229189679523111, 0.529343686005199],
[0.9994637505326883, 2.000536249467312, 0, 1, 0.333154583510896, 0, 0.499865973568973, 0.9443127155087357, 0.666845416489104, 1, 0.529343686005199],
[0.004128252750318924, 2.533050554774706, 0, 2, 0.001627103591625048, 0, 0.789561817560283, 1.491586351995381, 0.9967484402828477, 1, 0.529343686005199],
[1.015312065576391, 1.984687934423609, 1, 2, 0.3384373551921303, 0.9849188578610083, 1.007715099845577, 0.04306510606862152, 0.7339095931533562, 0.7104570970689026, 0.529343686005199],
[0.8445957782027317, 2.154997051568937, 1, 0, 0.2815701417272101, 1.183998340754157, 0, -2.335464194616944, 1, 0.2815701417272101, 0.5069648866735686],
[0.005941126913938727, 2.532015884272206, 1, 3, 0.002340909198915891, 168.3182356623047, 1.184826690320037, -315.73704077457, 0.9999672233974082, 0.009330808941749646, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8079420833248534, 2.065055555910221, 2.5, 0, 0.2812191949938271, 3.094281201088039, 0, -5.845505071458713, 1, 0.07069514610304994, 0.529343686005199],
[1.000073876001018, 1.999691314105053, 0.75, 1, 0.3333840526250176, 0.7499445970921815, 0.500077183386448, -0.4720324815648777, 0.8146060674653401, 0.5082068522974039, 0.529343686005199],
[0.9998339746510644, 2.000073745565448, 1, 0.75, 0.3332882434726703, 1.000166052917929, 0.3749861732163104, -1.181047202847865, 0.922256762730929, 0.5080831507230478, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269106843697197, 0, 1, 0.193510236793467, 0, 0.4407020333915339, 0.8325442336289726, 0.806489763206533, 1, 0.529343686005199],
[0.8088893273430457, 2.191110672656952, 1, 1, 0.2696297757810154, 1.236263066153555, 0.4563895436588764, -1.473283885522758, 0.9272997840122794, 0.4665593355743102, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[1.026075191813747, 1.455547456811209, 0, 0, 0.4134694661907143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9976150464792798, 2.002384953520721, 0, 2, 0.3325383488264265, 0, 0.9988089435467804, 1.88688175556508, 0.4455050557873531, 1, 0.529343686005199],
[0.4819993581388798, 2, 1, 0, 0.1941980188505389, 2.074691559468565, 0, -3.91936583795993, 1, 0.194198018850539, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 1, 0.160540882874986, 0, 0.3970810805830969, 0.7501385037379986, 0.8394591171250141, 1, 0.529343686005199],
[0.9998884223405241, 2.000008884792356, 1.6875, 0.8125, 0.3333075502161629, 1.687688308311366, 0.40624819528457, -2.420809290647155, 0.9334531901615353, 0.3252272420052129, 0.529343686005199],
[0.8107663035234595, 2.196195415201765, 1, 1, 0.2696297390401022, 1.233401037579092, 0.4553328875373004, -1.473284247134696, 0.9272998038251663, 0.4665592819053709, 0.5281181493354122],
[0.4819993581388929, 2.00045005527814, 1, 0.75, 0.1941628117510891, 2.074691559468508, 0.3749156336201161, -3.211100785344397, 0.9743766444286399, 0.3146178574930651, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9988076021009369, 2.001192397899064, 0, 2, 0.3329358673669789, 0, 0.9994041562918611, 1.888006190900415, 0.4449745570454448, 1, 0.529343686005199],
[0.8088886996428408, 2.063818966126067, 1, 1, 0.2815771020774347, 1.236264025497628, 0.4845386230155014, -1.420108376384305, 0.9207143355856739, 0.4838685397405433, 0.529343686005199],
[0.001376062468238909, 2.533900053217259, 0, 2, 0.0005427663124049287, 0, 0.7892971143280205, 1.491086292696931, 0.99891476197046, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9983913012101368, 2.001608698789863, 0, 1, 0.3327971004033789, 0, 0.4995981485315197, 0.9438067587087698, 0.667202899596621, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 1, 0.160540882874986, 0, 0.3970810805830969, 0.7501385037379986, 0.8394591171250141, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.465636773979889, 0, 1, 0.1634137276586566, 0, 0.4055747426194725, 0.7661841509440221, 0.8365862723413433, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2, 0, 0, 0.2880702707002053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190075576443585, 0, 1, 0.2698145565956708, 0, 0.4566052472142891, 0.862587500873307, 0.7301854434043292, 1, 0.529343686005199],
[0.48181115011109, 2, 0.5, 0, 0.1941369108965133, 1.037750994107787, 0, -1.960448422346148, 1, 0.1023012258538577, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.466173221373811, 0, 0, 0.1633839892126449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4555474568112105, 2.54445254318879, 0, 0, 0.1518491522704035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 2.5, 0.3333333333333333, 0, 1.25, 2.361414772760174, 0.3628873693012117, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2, 0, 0, 0.2880702707002053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9961937397499605, 2.003209898878034, 0, 3, 0.3321306032040575, 0, 1.49759643344427, 2.829157073254599, 0.2979028313280129, 1, 0.529343686005199],
[0.989042409467438, 2.010957590532562, 0, 1, 0.3296808031558127, 0, 0.4972755291846657, 0.9394190245990423, 0.6703191968441873, 1, 0.529343686005199],
[0.9964156780414305, 2.00358432195857, 0, 4, 0.3321385593471435, 0, 1.996422090231704, 3.771504493230314, 0.198950703802045, 1, 0.529343686005199],
[1.000089981856163, 1.808045390481048, 0, 1, 0.3561402315956684, 0, 0.5530834597763834, 1.044847561988208, 0.6438597684043317, 1, 0.529343686005199],
[0.5338267786261883, 2.466173221373811, 0, 0, 0.1779422595420628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.5342900478942336, 2.465709952105766, 1, 0, 0.1780966826314112, 1.871642573057915, 0, -3.535779537076659, 1, 0.1780966826314112, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1.000150180411056, 1.807448538575399, 1, 1, 0.3562297466683954, 0.9998498421397127, 0.5532660978487296, -0.8436555608346238, 0.8731003675885708, 0.5855598609253616, 0.529343686005199],
[0.9964221030717056, 2.003217578338217, 0, 2, 0.3321805979721393, 0, 0.9983937948762979, 1.886097485002385, 0.4459827537248494, 1, 0.529343686005199],
[0.4822185712578489, 2.517185097970478, 0, 2, 0.160771481413141, 0, 0.7945383125033326, 1.500987606935448, 0.7043045064094939, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0.5, 0.3333333333333333, 0, 0.2499999999999999, 0.4722829545520347, 0.816496580927726, 1, 0.529343686005199],
[0.9969709529762204, 2.002815109197446, 1, 3, 0.3323473515487329, 1.003038250025978, 1.497891635739726, 0.9348432762998661, 0.5943454452615853, 0.8012979698145886, 0.529343686005199],
[1.001485893871985, 2.005804577563495, 0, 1.5, 0.3330193419573276, 0, 0.7478295825917849, 1.41618186031961, 0.544715658556305, 1, 0.5280604162116661],
[0.4831709919681753, 2.524119479467307, 1, 0, 0.1606665523525372, 2.069660672149512, 0, -3.919363407311173, 1, 0.1606665523525372, 0.5280604162116661],
[1.00243015714516, 2.00486031429032, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.535661539513318, 2.471628931922162, 0, 1, 0.1781209845212022, 0, 0.4045914769343268, 0.7661840662795516, 0.8218790154787978, 1, 0.5280604162116661],
[1.00243015714516, 2.00486031429032, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.5457756484268196, 1.750095245826033, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.4833903327178288, 2.522704682364137, 0, 3, 0.1608034111671778, 0, 1.189199838162812, 2.252014734780152, 0.5910049653058896, 1, 0.5280604162116661],
[0.8112326676141769, 2.196057803821301, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.8112326676141769, 2.005080112535414, 0, 1, 0.2880477883465372, 0, 0.4987331896357522, 0.9444623651469486, 0.7119522116534629, 1, 0.5280604162116661],
[0.2364428171734694, 1.967081364160647, 0, 2, 0.1073021204742649, 0, 1.016734760665784, 1.925413701636442, 0.7969095041097438, 1, 0.5280604162116661],
[0.5338267786261883, 2.466173221373811, 0, 0, 0.1779422595420628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.4820002065016839, 2.001733205561139, 1, 2, 0.1940627783000941, 2.074687907828741, 0.9991341475695543, -2.03186283069904, 0.9016358631679122, 0.4765157236019113, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.5449760811620674, 1.745329011804517, 0, 1, 0.2379491198948396, 0, 0.5729578739804984, 1.082392950229449, 0.7620508801051604, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.00055404554305668, 2.534246325066859, 0, 1, 0.0002185756122969823, 0, 0.3945946335637353, 0.7454412775594338, 0.999781424387703, 1, 0.529343686005199],
[0.5446180427922847, 1.7456870501743, 1, 1, 0.2377927920890454, 1.836149230152106, 0.5728403609914814, -2.386556980955878, 0.9434545880304961, 0.4190401722085867, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[1, 1.300191474988204, 1, 3, 0.434746416058745, 0.9999999999999998, 2.30735246131899, 2.46976113229043, 0.4161573253092566, 0.8979123284178725, 0.529343686005199],
[0.9993734729187715, 2.000626527081229, 1, 1, 0.3331244909729238, 1.000626919863501, 0.4998434172813496, -0.9460460487616595, 0.8890280735140302, 0.555277055459878, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.465636547540394, 0, 1, 0.1634137402138205, 0, 0.4055747798667059, 0.766184221308956, 0.8365862597861795, 1, 0.529343686005199],
[1.000701564364088, 2.006262874600142, 0, 1, 0.3327946121999323, 0, 0.4984391689943946, 0.9438032389781548, 0.6672053878000677, 1, 0.5281176715753265],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[1.026075191813747, 1.455547456811209, 0, 0, 0.4134694661907143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 1, 0.2697553413345367, 0, 0.4564680198311986, 0.8623282602575812, 0.7302446586654634, 1, 0.529343686005199],
[0.4822215592850674, 2.517778440714935, 0, 1, 0.160740519761689, 0, 0.3971755353167793, 0.7503169411807783, 0.839259480238311, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2, 0, 0, 0.2880702707002053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.808135574317833, 2.191864425682165, 1, 0, 0.2693785247726112, 1.237416136326042, 0, -2.337642195497707, 1, 0.2693785247726113, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 1.80926602400361, 0, 0, 0.3559648646498974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8088893682662078, 2.19111063173379, 1, 0, 0.2696297894220694, 1.236263003608792, 0, -2.335463775790932, 1, 0.2696297894220694, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.000599026477171, 0, 1, 0.1940288627143433, 0, 0.499850288221367, 0.9442830838194934, 0.8059711372856567, 1, 0.529343686005199],
[0.8073693384078051, 2, 1, 0, 0.2875892841608448, 1.238590509235931, 0, -2.33986074072822, 1, 0.2875892841608447, 0.529343686005199],
[0.2331239145535338, 1.963563122009426, 0, 6, 0.1061252288893599, 0, 3.055669528902059, 5.772562532977957, 0.5101055856187343, 1, 0.529343686005199],
[1.80926602400361, 1.190733975996389, 0, 0, 0.6030886746678701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8088893479903224, 2, 1, 0, 0.2879747999219189, 1.236263034597365, 0, -2.335463834332432, 1, 0.2879747999219189, 0.529343686005199],
[1, 1.80926602400361, 0, 0, 0.3559648646498974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.999463894199112, 2.000536105800888, 0, 1, 0.3331546313997039, 0, 0.4998660094663291, 0.9443127833235733, 0.6668453686002961, 1, 0.529343686005199],
[0.5478012736405655, 1.643047741397732, 0, 2, 0.2500406325951173, 0, 1.21725008324993, 2.29954586298395, 0.5624390527583319, 1, 0.529343686005199],
[0.7133710589103843, 2.234009519333937, 0, 2, 0.2420356109340047, 0, 0.8952513329470027, 1.691247778363431, 0.5745100150921875, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.8081352037237389, 2.191864796276259, 1, 1, 0.2693784012412465, 1.237416703779495, 0.4562325202261069, -1.475759897031654, 0.9274352769447098, 0.4661920794272031, 0.529343686005199],
[0.9983918293691776, 2.001608170630823, 0, 1, 0.3327972764563925, 0, 0.4995982803591584, 0.9438070077485566, 0.6672027235436075, 1, 0.529343686005199],
[0.9982111898002305, 2.001608664828896, 0, 2, 0.3327570448138264, 0, 0.9991963140162398, 1.88761354944437, 0.4452131612455781, 1, 0.529343686005199],
[0.9988067070388961, 2.001193292961104, 0, 1, 0.3329355690129653, 0, 0.4997018546470994, 0.9440026732314543, 0.6670644309870347, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9998902658007861, 2.000109734199214, 0, 1.5, 0.3332967552669286, 0, 0.7499588519329696, 1.41677112953342, 0.5443758533655414, 1, 0.529343686005199],
[0.670708752091704, 1.815650734892191, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2894507845836787],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8094854724654345, 2.190514527534563, 0, 1, 0.2698284908218117, 0, 0.4565137493634912, 0.862414649372067, 0.7301715091781883, 1, 0.529343686005199],
[0.9328672062044213, 2.06713279379558, 2, 0, 0.3109557354014736, 2.14392786743726, 0, -4.050162350318851, 1, 0.0966934693790712, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2, 0, 0, 0.2880702707002053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4827531526103145, 2.517246847389687, 1, 0, 0.1609177175367714, 2.071452034218438, 0, -3.913245947734027, 1, 0.1609177175367714, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.5338267786261883, 2.466173221373811, 0, 0, 0.1779422595420628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.481336633632693, 2.517847467601736, 0, 1, 0.1604891921888291, 0, 0.3971646467339445, 0.7502963712124899, 0.8395108078111708, 1, 0.529343686005199],
[0.2386868488242547, 2.059787895499975, 0, 4, 0.1038457565886505, 0, 1.941947522237029, 3.668594853548429, 0.6449574478855066, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 1.889131818208139, 0.4444444444444445, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -0.9445659091040695, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.529343686005199],
[0.5455012031509182, 1.647095684964495, 0, 1, 0.2487922910534589, 0, 0.6071292694944774, 1.146947220767482, 0.7512077089465411, 1, 0.529343686005199],
[0.5356399777467826, 2.464360022253217, 2, 2, 0.1785466592489275, 3.733851249141594, 0.8115697308591125, -5.520574997949027, 0.9802813034306923, 0.1487872694168348, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9365718555700776, 2.063428144429924, 0, 0, 0.3121906185233591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8097056323931319, 2.190294367606866, 0, 1, 0.2699018774643775, 0, 0.4565596363618505, 0.8625013359607095, 0.7300981225356225, 1, 0.529343686005199],
[0.9994036728308252, 2.000536272961598, 0, 18, 0.333141226454397, 0, 8.997587418573902, 16.99762867953719, 0.0006801577459224316, 1, 0.529343686005199],
[1, 1.809485472465432, 0, 1, 0.3559370602911364, 0, 0.5526432873967735, 1.04401601834039, 0.6440629397088635, 1, 0.529343686005199],
[0.9995608831704327, 2.000439116829568, 1, 1, 0.3331869610568108, 1.000439309737867, 0.499890244890266, -0.9456031649779315, 0.8889864489817273, 0.5553603710953489, 0.529343686005199],
[1.001672450502532, 1.295751968115721, 0, 1, 0.4359979994923927, 0, 0.771752638318734, 1.461319314264766, 0.5640020005076073, 1, 0.5281204667489297],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1.002315516513747, 2.004631033027493, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5281208135401936],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 1, 0.160540882874986, 0, 0.3970810805830969, 0.7501385037379986, 0.8394591171250141, 1, 0.529343686005199],
[1.000930547373273, 1.999069452626727, 1, 1, 0.333643515791091, 0.9990703177401119, 0.5002327451335045, -0.9423699305288551, 0.8886820043705601, 0.5559690359527419, 0.529343686005199],
[1.000029996189608, 1.999373676641218, 0, 1, 0.3334096057986696, 0, 0.500156629890175, 0.9448618036132816, 0.6665903942013304, 1, 0.529343686005199],
[0.000793087416803228, 2.998992479037355, 0, 2, 0.0002643813696792609, 0, 0.6668906354316629, 1.259844318658999, 0.9994713071581502, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1.000930667328573, 1.998411136431199, 0, 2, 0.3337167728179142, 0, 1.000795063408042, 1.890633797789765, 0.4439333388241749, 1, 0.529343686005199],
[0.5332130661422451, 2.466786933857755, 0, 1, 0.1777376887140817, 0, 0.4053856400301755, 0.7658269112256757, 0.8222623112859183, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2, 0, 0, 0.1940756983709108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4819993693123668, 2.517404303576229, 1, 1, 0.1606983993748911, 2.074691511374023, 0.3972345636254765, -3.168937293666087, 0.9741760244383479, 0.2955728231881302, 0.529343686005199],
[0.5457756484268196, 1.750095245826033, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[1.003363476538447, 2.003780318072741, 0, 2, 0.3336599594394115, 0, 0.9981134069245789, 1.890150021251542, 0.4440090496542867, 1, 0.5280604162116661],
[1.001276969924471, 2.006013501511009, 1, 1, 0.3329498694705498, 0.9987246586480786, 0.4985011313467035, -0.947284651423043, 0.8891443844195439, 0.5550441233606435, 0.5280604162116661],
[0.9988475027577784, 2.008442968677702, 1, 1, 0.3321420103063723, 1.001153827024686, 0.4978981308383229, -0.953026738487134, 0.8896816849896416, 0.5539657056023863, 0.5280604162116661],
[1.00243015714516, 2.00486031429032, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.9989280115078887, 2.001071988492112, 0, 2, 0.3329760038359628, 0, 0.9994642928898727, 1.888119796861158, 0.4449210114586415, 1, 0.529343686005199],
[0.8088890930269337, 2.191110906973064, 1, 0, 0.2696296976756447, 1.236263424269837, 0, -2.335464570475098, 1, 0.2696296976756447, 0.529343686005199],
[1.000934943711407, 1.999065056288593, 1, 1, 0.3336449812371358, 0.9990659295918469, 0.5002338452439219, -0.9423595624847516, 0.8886810264952711, 0.555970988969543, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[0.713389024555417, 2.234647031208679, 0, 2, 0.2419878899244042, 0, 0.8949959309315336, 1.690765290289574, 0.5745823590212571, 1, 0.529343686005199]
],
"RESOLVED": [
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.7144602862773416, 2.233335583721427, 0, 0, 0.2423710181389324, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.001228942377567215, 2.998771057622431, 0, 1, 0.0004096474591890718, 0, 0.333469938446334, 0.6299686711348793, 0.999590352540811, 1, 0.529343686005199],
[0.8141613358175592, 2, 0, 0, 0.2893086922399324, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9400914923595624, 2.073928444928204, 2, 1, 0.3119061956854622, 2.127452504628186, 0.4821767127238657, -3.122668170818503, 0.9696560576263111, 0.2311685399735555, 0.5268814045883927],
[0.8128898670101139, 2.20113007027765, 1, 1, 0.26970288316726, 1.230178946230558, 0.4543120888234744, -1.47256451005934, 0.9272603548112672, 0.4666661211457873, 0.5268814045883927],
[1.003516888855351, 2.010287895877247, 0, 2, 0.3329734208197525, 0, 0.9948823768484376, 1.888247275733054, 0.4449244573329029, 1, 0.5268814045883927],
[0.5346727107642313, 2.465327289235768, 2, 0, 0.1782242369214104, 3.740606093663003, 0, -7.066497990922035, 1, 0.03176387862621888, 0.529343686005199],
[1.000060645344358, 1.295631307970315, 1, 2, 0.4356249295121689, 0.9999393583332771, 1.54364902090327, 1.027139223428185, 0.5960290458736071, 0.8202356926545871, 0.529343686005199],
[1.002377968657326, 2.004755937314652, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280879095080763],
[1.003916832672733, 1.991262027689782, 0, 7, 0.3351775902128349, 0, 3.515358552847636, 6.656767726650394, 0.05740365575344197, 1, 0.5280879095080763],
[0.9980792123738718, 2.009054693598106, 0, 2, 0.3319038139245312, 0, 0.9954930576917799, 1.885089659824063, 0.4463525138485875, 1, 0.5280879095080763],
[0.7153538669655173, 2.23963234287793, 0, 1, 0.2420836566284403, 0, 0.4465018569588073, 0.8455066834889898, 0.7579163433715597, 1, 0.5280879095080763],
[0.2343242051991419, 2.586957398545182, 1, 2, 0.08305594340109598, 4.267591558243604, 0.7731089816649988, -6.617236474574433, 0.9804510187207256, 0.2290459049622817, 0.5280879095080763],
[0.545747234271893, 1.650311482857985, 0, 1, 0.2485121322189205, 0, 0.6059462170548647, 1.14743436868175, 0.7514878677810796, 1, 0.5280879095080763],
[1.002377968657326, 2.004755937314652, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4988138363313636, 0.9445659091040695, 0.6666666666666666, 1, 0.5280879095080763],
[0.5453880632496642, 1.750363303443707, 1, 0, 0.2375640808330217, 1.833556814649657, 0, -3.472067399455613, 0.9999999999999999, 0.2375640808330217, 0.5280879095080763],
[0.9383348435180406, 2.068799062453937, 1, 0, 0.312036268705749, 1.065717645367151, 0, -2.018068632474253, 1, 0.312036268705749, 0.5280879095080763],
[0.234006480813287, 2.581009995437043, 0, 2, 0.08312792581768094, 0, 0.7748904512325764, 1.463870207049123, 0.840654400415388, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 1.5, 0.9445659091040697, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.529343686005199],
[0.9994645428505006, 2.0005354571495, 1, 1, 0.3331548476168334, 1.000535744017464, 0.4998661715423273, -0.9458308197714463, 0.8890078475094045, 0.5553175427430714, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[1.000089986979006, 1.8082646247797, 0, 2, 0.3561124306708223, 0, 1.106032807694648, 2.089441768998043, 0.4145912019366366, 1, 0.529343686005199],
[0.4819993582203829, 2.515615483397327, 1, 3, 0.1607942926918071, 2.074691559117748, 1.192551095268548, -1.66647961838641, 0.876124199967777, 0.5040090925238178, 0.529343686005199],
[0.4819996178271019, 2.5180003821729, 1, 0, 0.1606665392757005, 2.07469044168145, 0, -3.919363726312726, 1, 0.1606665392757005, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9989032402342316, 2.000364724934112, 1, 1, 0.3330490145711822, 1.001097963968473, 0.499908835391475, -0.9468123297348174, 0.8890783538931646, 0.5551763830355289, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.9999999999999998, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.529343686005199],
[0.9983915818442689, 2.001608418155731, 0, 1, 0.3327971939480896, 0, 0.4995982185773346, 0.9438068910345475, 0.6672028060519104, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9988499480709464, 2.001150051929054, 2, 1, 0.3329499826903154, 2.002302752142651, 0.4997126522501535, -2.838590767431464, 0.9630905996092564, 0.2587482721389569, 0.529343686005199],
[0.456173646310927, 2.543826353689074, 0, 1, 0.1520578821036423, 0, 0.3931085934972697, 0.7426339519867415, 0.8479421178963578, 1, 0.529343686005199],
[1.000930849187545, 1.999069150812455, 4, 1, 0.3336436163958484, 3.996280065947409, 0.5002328206573462, -6.604494089036375, 0.9958655846962584, 0.04542089427012264, 0.529343686005199],
[0.4568306568949853, 2.542572076227311, 0, 2, 0.1523072083152491, 0, 0.7866050361756571, 1.486000602202199, 0.7185830690742865, 1, 0.529343686005199],
[0.5546057466404013, 1.654165082520973, 0, 2, 0.2510924806313989, 0, 1.209069167964765, 2.284091035616679, 0.5608624725668316, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[1.000089965909817, 1.808264910604326, 0, 2, 0.3561123895962799, 0, 1.106032632868817, 2.089441438729005, 0.4145912548314128, 1, 0.529343686005199],
[0.9995612491832574, 2.000438750816743, 0, 2, 0.3331870830610857, 0, 0.9997806727066431, 1.888717480039657, 0.4446394661965834, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 1.889131818208139, 0.4444444444444445, 1, 0.529343686005199],
[0.8080529202762013, 2.191947079723796, 4, 1, 0.2693509734254007, 4.950170836128847, 0.4562153937247465, -8.489674215855223, 0.998582272553873, 0.02064656418072808, 0.529343686005199],
[0.9997861465957352, 1.293571315147941, 0, 2, 0.4359486749333799, 0, 1.546107258702832, 2.920800416778083, 0.31815389730941, 1, 0.529343686005199],
[0.0008215701977538015, 2.533978612094123, 0, 1, 0.000324116355795338, 0, 0.3946363221959411, 0.7455200328809913, 0.9996758836442047, 1, 0.529343686005199],
[0.997018820513354, 2.002981179486647, 0, 1, 0.3323396068377846, 0, 0.4992558144037553, 0.9431600444155516, 0.6676603931622154, 1, 0.529343686005199],
[0.533736493548077, 2.466263506451923, 1, 0, 0.1779121645160257, 1.873583710479268, 0, -3.539446601542852, 1, 0.1779121645160257, 0.529343686005199],
[0.9994036728308158, 2.000596327169185, 0, 1, 0.3331345576102718, 0, 0.4998509626452157, 0.9442843578950452, 0.6668654423897282, 1, 0.529343686005199],
[0.9995608831704327, 2.000146027290324, 1, 1, 0.3332195154415601, 1.000439309737867, 0.4999634958427205, -0.9454647842729355, 0.8889647545288921, 0.555403785412012, 0.529343686005199],
[0.9994635526695864, 2.000536447330414, 0, 3, 0.3331545175565288, 0, 1.499597772389154, 2.832937866334397, 0.2965347812879175, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9994633915559341, 2.000536608444066, 1, 1, 0.3331544638519781, 1.000536896547287, 0.4998658838729066, -0.945833540497662, 0.8890081032155011, 0.5553170309194573, 0.529343686005199],
[0.9982112819524812, 2.001788718047519, 0, 1, 0.3327370939841603, 0, 0.4995532200697824, 0.9437218829221589, 0.6672629060158397, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 4, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 2, 1.889131818208139, 0.4609053497942389, 0.868312757201646, 0.529343686005199],
[0.9982105627128136, 2.001789437287187, 0, 2, 0.3327368542376045, 0, 0.9991060811622567, 1.887443087688863, 0.4452401056927278, 1, 0.529343686005199],
[0.4819996178819668, 2.517940365784077, 1, 1, 0.1606697535638511, 2.074690441445293, 0.3971499935379144, -3.169095036472962, 0.9741852302897315, 0.2955247374174335, 0.529343686005199],
[0.278764134443881, 2.06013198096654, 0, 37, 0.1191861975430082, 0, 17.96001437861322, 33.92883461811392, 0.009135075143610175, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9994032997738321, 2.000596700226168, 0, 3, 0.333134433257944, 0, 1.499552608309735, 2.832852545434928, 0.2965615755271641, 1, 0.529343686005199],
[0.9997807101744012, 2.000219289825599, 1, 1, 0.3332602367248003, 1.000219337924174, 0.4999451835539446, -0.9450838228479709, 0.88893761461813, 0.5554580880677307, 0.529343686005199],
[0.5447570643157684, 2.269617975876956, 0, 1, 0.1935623563085836, 0, 0.4406027845340847, 0.8323567394544445, 0.8064376436914165, 1, 0.529343686005199],
[0.9361817297937755, 2.063818270206225, 1, 1, 0.3120605765979251, 1.068168677271968, 0.4845387864020003, -1.1025537968998, 0.9026181965333706, 0.5267393497292208, 0.529343686005199],
[0.4555474568112105, 2.54445254318879, 0, 0, 0.1518491522704035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.2351157773017706, 2.579901548580713, 0, 2, 0.0835219645506316, 0, 0.775223380558946, 1.464499154432782, 0.8399319894611339, 1, 0.529343686005199],
[0.814108895312887, 1.999549316711942, 1, 1, 0.2893417870847288, 1.228336904015364, 0.5001126962171653, -1.375711521740994, 0.9162813302466155, 0.494964904416073, 0.529343686005199],
[0.001375997592530497, 2.533900057835454, 0, 2, 0.0005427407360963743, 0, 0.789297112889476, 1.491086289979331, 0.9989148130953138, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.646281432807601, 0, 0, 0.2485251742814465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1.804762116389809, 1.192256842970131, 1, 0, 0.6021857521966574, 0.5540896447895136, 0, -1.046748378111516, 1, 0.6021857521966574, 0.529343686005199],
[1, 1.999780571764395, 0, 2, 0.3333577160318181, 0, 1.000109726156311, 1.889339105381316, 0.4444119347743141, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.999780716230532, 2.000219283769468, 1, 3, 0.3332602387435106, 1.000219331865386, 1.499835555202936, 0.9438409043999498, 0.5927225385284929, 0.8023824909289352, 0.529343686005199],
[0.2334338624695505, 2.580552689544728, 0, 3, 0.08295486071262716, 0, 1.16254165712434, 2.196194434466007, 0.7712090899960655, 1, 0.529343686005199],
[1.00052608591854, 2.006475316580991, 1, 1, 0.3327321647029713, 0.9994741907023277, 0.4983863951558535, -0.9488301229237334, 0.8892893065720748, 0.5547536359780174, 0.5281111796940192],
[1.004138865586731, 2.010075935404542, 0, 1, 0.3331344751065862, 0, 0.4974936430940072, 0.9442842410694831, 0.6668655248934138, 1, 0.5268473426291144],
[0.8095326941690405, 2.195800624907842, 1, 3, 0.2693653609170035, 1.235280560257629, 1.366244260052486, 0.2479998054416652, 0.7052161989024457, 0.7150287598783953, 0.5280798489402941],
[0.4827753011184236, 2.52440450550045, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280798489402941],
[1.002393268872958, 2.004786537745915, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4988062225938287, 0.9445659091040696, 0.6666666666666667, 1, 0.5280798489402941],
[0.8112028151887991, 2.068366482779572, 0, 0, 0.2817097736668914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280798489402941],
[0.8112028151887991, 2.19597699143007, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280798489402941],
[0.7160115071965171, 2.238959826579674, 0, 2, 0.2423074291829145, 0, 0.8932719454172972, 1.69154711585727, 0.574098031871404, 1, 0.5280798489402941],
[1.81172982592959, 1.195449980689281, 3, 0, 0.6024680738883424, 1.655876034640383, 0, -3.135654651400265, 0.9999999999999999, 0.2186764993331003, 0.5280798489402941],
[0.7122298952592918, 2.243847362984285, 1, 2, 0.2409375104365439, 1.404041035985921, 0.8913262252116956, -0.9709039490961411, 0.8538206191019735, 0.5626465149575789, 0.5280798489402941],
[0.7139247976369695, 2.233991133357427, 0, 2, 0.2421794970917461, 0, 0.8952587009574359, 1.691261697506378, 0.5742919146281188, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.517773865044675, 0, 1, 0.1605731841155318, 0, 0.3971762571227802, 0.7503183047674612, 0.8394268158844682, 1, 0.529343686005199],
[1.0000299961896, 1.999373676641372, 1, 2, 0.333409605798651, 0.9999700047101442, 1.000313259780273, 0.0006484540747417513, 0.7406390383037156, 0.703805388689593, 0.529343686005199],
[0.9981213852183776, 2.001878614781623, 0, 1, 0.3327071284061258, 0, 0.4995307870397956, 0.943679503971432, 0.6672928715938742, 1, 0.529343686005199],
[0.9994036728307911, 2.000596327169209, 0, 1, 0.3331345576102637, 0, 0.4998509626452096, 0.9442843578950336, 0.6668654423897363, 1, 0.529343686005199],
[0.8075037122959511, 2.001662360142323, 1.375, 2.375, 0.2874531770188515, 1.702778549575337, 1.186513793380784, -0.9752921775465986, 0.7933266817958573, 0.5602522105710064, 0.529343686005199],
[1.00002997905452, 1.80885934825272, 0, 1, 0.3560232755817421, 0, 0.5528345810667682, 1.044377397298999, 0.6439767244182579, 1, 0.529343686005199],
[0.8085844050893271, 2.18870385169053, 1, 3, 0.2697719858142811, 1.23672926871441, 1.370674245253799, 0.2530397170697016, 0.7045144150581018, 0.7156626181531134, 0.529343686005199],
[0.9988673396522606, 2.00113266034774, 0, 2, 0.3329557798840868, 0, 0.9994339903744598, 1.888062551415119, 0.4449479915900469, 1, 0.529343686005199],
[0.7188893336658152, 2.227679267253987, 0, 3, 0.2439750879858715, 0, 1.346692966127945, 2.544080531669398, 0.4321239317462762, 1, 0.529343686005199],
[0.9968996956850281, 2.003100304314972, 1, 1, 0.332299898561676, 1.003109946094267, 0.4992261235475095, -0.9519029618534238, 0.8895767774158997, 0.554176574539252, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[0.9994030690856589, 2.000596930914341, 0, 8, 0.3331343563618863, 0, 3.998806494391514, 7.554272583412357, 0.03911170494965824, 1, 0.529343686005199],
[0.9989027345192111, 2.000364893108477, 1, 2, 0.3330488834400239, 1.001098470794874, 0.9998175867264346, -0.002419758849124349, 0.7411199263073809, 0.7033242753327922, 0.529343686005199],
[1.01591207850134, 1.98408792149866, 1, 1, 0.3386373595004468, 0.9843371499974549, 0.5040099227279508, -0.9074014481865126, 0.8853247387505651, 0.5625994577514588, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -0.9445659091040695, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.529343686005199],
[0.9994037390088636, 2.000596260991137, 0, 1, 0.3331345796696211, 0, 0.4998509791798667, 0.9442843891311804, 0.6668654203303789, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9888230311965305, 2.01117696880347, 1, 2, 0.3296076770655101, 1.011303305496379, 0.9944425731912994, -0.03185214587581525, 0.7456942984884931, 0.6987083492699945, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.013950237879289, 0, 4, 0.1929908163490294, 0, 1.986146392679515, 3.752092346030189, 0.4241445664934118, 1, 0.529343686005199],
[0.9997405883723425, 2.000259411627658, 1, 2, 0.3332468627907808, 1.000259478939512, 0.9998703110075871, -0.0007351895228249475, 0.7408560273190297, 0.703588394692011, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2, 0, 0, 0.1940756983709108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 5, 0.3333333333333333, 0, 2.5, 4.722829545520348, 0.131687242798354, 1, 0.529343686005199],
[1.025686980742851, 1.456848297731872, 1, 1, 0.4131610896474496, 0.9749563158886472, 0.6864132672954854, -0.5450958540201193, 0.8292979140013321, 0.6556200932962313, 0.529343686005199],
[0.9997805848352715, 2.000219415164729, 2, 1, 0.3332601949450905, 2.000438926636617, 0.4999451522260345, -2.834630532262258, 0.9629873370768783, 0.2591617467582747, 0.529343686005199],
[0.8081354151930774, 2, 1, 0, 0.2877836342295882, 1.237416379977708, 0, -2.337642655787822, 1, 0.2877836342295882, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190587556746251, 0, 1, 0.2697685077687427, 0, 0.4564985302323782, 0.8623858984272359, 0.7302314922312573, 1, 0.529343686005199],
[0.7144602862773416, 2.233335583721427, 0, 0, 0.2423710181389324, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.2331237670678322, 1.958540951554431, 0, 1, 0.1063683532827867, 0, 0.5105841668545824, 0.9645607954782853, 0.8936316467172133, 1, 0.529343686005199],
[0.4925802391575202, 2.507419760842482, 0, 1, 0.1641934130525066, 0, 0.398816351221546, 0.7534166587142951, 0.8358065869474933, 1, 0.529343686005199],
[0.4561732719839163, 2.543826728016084, 0, 1, 0.1520577573279721, 0, 0.3931085356508909, 0.7426338427073067, 0.847942242672028, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8097695984518305, 1.993318332650301, 0, 2, 0.2888848364216108, 0, 1.003352032257093, 1.895464249000675, 0.5056847758711193, 1, 0.529343686005199],
[0.4556376492756844, 2.544362350724316, 1, 0, 0.1518792164252281, 2.194726448943968, 0, -4.146127566963012, 1, 0.1518792164252281, 0.529343686005199],
[0.4572021447587836, 2.542797855241217, 1, 0, 0.1524007149195945, 2.18721633628292, 0, -4.131939974176698, 1, 0.1524007149195945, 0.529343686005199],
[0.004070166510366987, 2.995929833489632, 1, 3, 0.00135672217012233, 245.6901941119443, 1.001358565365874, -462.2494647913401, 0.9999889757980486, 0.00541585449606663, 0.529343686005199],
[0.5023030082622869, 2.49748303476435, 1, 2, 0.1674462781870563, 1.990830203186502, 0.8008062405872198, -2.248112132176438, 0.9252750350183758, 0.4229189679523111, 0.529343686005199],
[0.9994637505326883, 2.000536249467312, 0, 1, 0.333154583510896, 0, 0.499865973568973, 0.9443127155087357, 0.666845416489104, 1, 0.529343686005199],
[0.004128252750318924, 2.533050554774706, 0, 2, 0.001627103591625048, 0, 0.789561817560283, 1.491586351995381, 0.9967484402828477, 1, 0.529343686005199],
[1.015312065576391, 1.984687934423609, 1, 2, 0.3384373551921303, 0.9849188578610083, 1.007715099845577, 0.04306510606862152, 0.7339095931533562, 0.7104570970689026, 0.529343686005199],
[0.8445957782027317, 2.154997051568937, 1, 0, 0.2815701417272101, 1.183998340754157, 0, -2.335464194616944, 1, 0.2815701417272101, 0.5069648866735686],
[0.005941126913938727, 2.532015884272206, 1, 3, 0.002340909198915891, 168.3182356623047, 1.184826690320037, -315.73704077457, 0.9999672233974082, 0.009330808941749646, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8081322158744408, 2.064821841591338, 3, 0, 0.2812896411532912, 3.712263836374652, 0, -7.012955730878769, 0.9999999999999999, 0.02225672281056779, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269106843697197, 0, 1, 0.193510236793467, 0, 0.4407020333915339, 0.8325442336289726, 0.806489763206533, 1, 0.529343686005199],
[0.8088893273430457, 2.191110672656952, 1, 1, 0.2696297757810154, 1.236263066153555, 0.4563895436588764, -1.473283885522758, 0.9272997840122794, 0.4665593355743102, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[1.026075191813747, 1.455547456811209, 0, 0, 0.4134694661907143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9976150464792798, 2.002384953520721, 0, 2, 0.3325383488264265, 0, 0.9988089435467804, 1.88688175556508, 0.4455050557873531, 1, 0.529343686005199],
[0.4819993581388798, 2, 1, 0, 0.1941980188505389, 2.074691559468565, 0, -3.91936583795993, 1, 0.194198018850539, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 1, 0.160540882874986, 0, 0.3970810805830969, 0.7501385037379986, 0.8394591171250141, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.8107663035234595, 2.196195415201765, 1, 1, 0.2696297390401022, 1.233401037579092, 0.4553328875373004, -1.473284247134696, 0.9272998038251663, 0.4665592819053709, 0.5281181493354122],
[0.4819993581388929, 2, 1, 0, 0.1941980188505432, 2.074691559468508, 0, -3.919365837959824, 1, 0.1941980188505432, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9988076021009369, 2.001192397899064, 0, 2, 0.3329358673669789, 0, 0.9994041562918611, 1.888006190900415, 0.4449745570454448, 1, 0.529343686005199],
[0.8088886996428408, 2.063818966126067, 1, 1, 0.2815771020774347, 1.236264025497628, 0.4845386230155014, -1.420108376384305, 0.9207143355856739, 0.4838685397405433, 0.529343686005199],
[0.001376062468238909, 2.533900053217259, 0, 2, 0.0005427663124049287, 0, 0.7892971143280205, 1.491086292696931, 0.99891476197046, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9983913012101368, 2.001608698789863, 0, 1, 0.3327971004033789, 0, 0.4995981485315197, 0.9438067587087698, 0.667202899596621, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 1, 0.160540882874986, 0, 0.3970810805830969, 0.7501385037379986, 0.8394591171250141, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.465636773979889, 0, 1, 0.1634137276586566, 0, 0.4055747426194725, 0.7661841509440221, 0.8365862723413433, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2, 0, 0, 0.2880702707002053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190075576443585, 0, 1, 0.2698145565956708, 0, 0.4566052472142891, 0.862587500873307, 0.7301854434043292, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2, 0, 0, 0.1940756983709108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.466173221373811, 0, 0, 0.1633839892126449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4555474568112105, 2.54445254318879, 0, 0, 0.1518491522704035, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 1.889131818208139, 0.4444444444444445, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2, 0, 0, 0.2880702707002053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9961937397499605, 2.003209898878034, 0, 3, 0.3321306032040575, 0, 1.49759643344427, 2.829157073254599, 0.2979028313280129, 1, 0.529343686005199],
[0.989042409467438, 2.010957590532562, 0, 1, 0.3296808031558127, 0, 0.4972755291846657, 0.9394190245990423, 0.6703191968441873, 1, 0.529343686005199],
[0.9964156780414305, 2.00358432195857, 0, 4, 0.3321385593471435, 0, 1.996422090231704, 3.771504493230314, 0.198950703802045, 1, 0.529343686005199],
[1.000089981856163, 1.808045390481048, 0, 1, 0.3561402315956684, 0, 0.5530834597763834, 1.044847561988208, 0.6438597684043317, 1, 0.529343686005199],
[0.5338267786261883, 2.466173221373811, 0, 0, 0.1779422595420628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.5342900478942336, 2.465709952105766, 1, 0, 0.1780966826314112, 1.871642573057915, 0, -3.535779537076659, 1, 0.1780966826314112, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1.000150180411056, 1.807448538575399, 1, 1, 0.3562297466683954, 0.9998498421397127, 0.5532660978487296, -0.8436555608346238, 0.8731003675885708, 0.5855598609253616, 0.529343686005199],
[0.9964221030717056, 2.003217578338217, 0, 2, 0.3321805979721393, 0, 0.9983937948762979, 1.886097485002385, 0.4459827537248494, 1, 0.529343686005199],
[0.4822185712578489, 2.517185097970478, 0, 2, 0.160771481413141, 0, 0.7945383125033326, 1.500987606935448, 0.7043045064094939, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9969709529762204, 2.002815109197446, 1, 3, 0.3323473515487329, 1.003038250025978, 1.497891635739726, 0.9348432762998661, 0.5943454452615853, 0.8012979698145886, 0.529343686005199],
[1.001802609311197, 2.005487862124283, 0, 1, 0.3331246578362627, 0, 0.498631788746288, 0.9442703399802229, 0.6668753421637373, 1, 0.5280604162116661],
[0.4831709919681753, 2.524119479467307, 1, 0, 0.1606665523525372, 2.069660672149512, 0, -3.919363407311173, 1, 0.1606665523525372, 0.5280604162116661],
[1.00243015714516, 2.00486031429032, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.535661539513318, 2.471628931922162, 0, 1, 0.1781209845212022, 0, 0.4045914769343268, 0.7661840662795516, 0.8218790154787978, 1, 0.5280604162116661],
[1.00243015714516, 2.00486031429032, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.5457756484268196, 1.750095245826033, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.4833903327178288, 2.522704682364137, 0, 3, 0.1608034111671778, 0, 1.189199838162812, 2.252014734780152, 0.5910049653058896, 1, 0.5280604162116661],
[0.8112326676141769, 2.196057803821301, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.8112326676141769, 2.005080112535414, 0, 1, 0.2880477883465372, 0, 0.4987331896357522, 0.9444623651469486, 0.7119522116534629, 1, 0.5280604162116661],
[0.2364428171734694, 1.967081364160647, 0, 2, 0.1073021204742649, 0, 1.016734760665784, 1.925413701636442, 0.7969095041097438, 1, 0.5280604162116661],
[0.5338267786261883, 2.466173221373811, 0, 0, 0.1779422595420628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.4820002065016839, 2.001733205561139, 1, 2, 0.1940627783000941, 2.074687907828741, 0.9991341475695543, -2.03186283069904, 0.9016358631679122, 0.4765157236019113, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.5449760811620674, 1.745329011804517, 0, 1, 0.2379491198948396, 0, 0.5729578739804984, 1.082392950229449, 0.7620508801051604, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.00055404554305668, 2.534246325066859, 0, 1, 0.0002185756122969823, 0, 0.3945946335637353, 0.7454412775594338, 0.999781424387703, 1, 0.529343686005199],
[0.5446180427922847, 1.7456870501743, 1, 1, 0.2377927920890454, 1.836149230152106, 0.5728403609914814, -2.386556980955878, 0.9434545880304961, 0.4190401722085867, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[1, 1.300191474988204, 1, 3, 0.434746416058745, 0.9999999999999998, 2.30735246131899, 2.46976113229043, 0.4161573253092566, 0.8979123284178725, 0.529343686005199],
[0.9993734729187715, 2.000626527081229, 1, 1, 0.3331244909729238, 1.000626919863501, 0.4998434172813496, -0.9460460487616595, 0.8890280735140302, 0.555277055459878, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.465636547540394, 0, 1, 0.1634137402138205, 0, 0.4055747798667059, 0.766184221308956, 0.8365862597861795, 1, 0.529343686005199],
[1.000701564364088, 2.006262874600142, 0, 1, 0.3327946121999323, 0, 0.4984391689943946, 0.9438032389781548, 0.6672053878000677, 1, 0.5281176715753265],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[1.026075191813747, 1.455547456811209, 0, 0, 0.4134694661907143, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 1, 0.2697553413345367, 0, 0.4564680198311986, 0.8623282602575812, 0.7302446586654634, 1, 0.529343686005199],
[0.4822215592850674, 2.517778440714935, 0, 1, 0.160740519761689, 0, 0.3971755353167793, 0.7503169411807783, 0.839259480238311, 1, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2, 0, 0, 0.2880702707002053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.808135574317833, 2.191864425682165, 1, 0, 0.2693785247726112, 1.237416136326042, 0, -2.337642195497707, 1, 0.2693785247726113, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 1.80926602400361, 0, 0, 0.3559648646498974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8088893682662078, 2.19111063173379, 1, 0, 0.2696297894220694, 1.236263003608792, 0, -2.335463775790932, 1, 0.2696297894220694, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.000599026477171, 0, 1, 0.1940288627143433, 0, 0.499850288221367, 0.9442830838194934, 0.8059711372856567, 1, 0.529343686005199],
[0.8073693384078051, 2, 1, 0, 0.2875892841608448, 1.238590509235931, 0, -2.33986074072822, 1, 0.2875892841608447, 0.529343686005199],
[0.2331239145535338, 1.963563122009426, 0, 6, 0.1061252288893599, 0, 3.055669528902059, 5.772562532977957, 0.5101055856187343, 1, 0.529343686005199],
[1.80926602400361, 1.190733975996389, 0, 0, 0.6030886746678701, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8088893479903224, 2, 1, 0, 0.2879747999219189, 1.236263034597365, 0, -2.335463834332432, 1, 0.2879747999219189, 0.529343686005199],
[1, 1.80926602400361, 0, 0, 0.3559648646498974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.999463894199112, 2.000536105800888, 0, 1, 0.3331546313997039, 0, 0.4998660094663291, 0.9443127833235733, 0.6668453686002961, 1, 0.529343686005199],
[0.5478012736405655, 1.643047741397732, 0, 2, 0.2500406325951173, 0, 1.21725008324993, 2.29954586298395, 0.5624390527583319, 1, 0.529343686005199],
[0.7133710589103843, 2.234009519333937, 0, 2, 0.2420356109340047, 0, 0.8952513329470027, 1.691247778363431, 0.5745100150921875, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -1.889131818208139, 1, 0.3333333333333333, 0.529343686005199],
[0.8081352037237389, 2.191864796276259, 1, 1, 0.2693784012412465, 1.237416703779495, 0.4562325202261069, -1.475759897031654, 0.9274352769447098, 0.4661920794272031, 0.529343686005199],
[0.9983918293691776, 2.001608170630823, 0, 1, 0.3327972764563925, 0, 0.4995982803591584, 0.9438070077485566, 0.6672027235436075, 1, 0.529343686005199],
[0.9982111898002305, 2.001608664828896, 0, 2, 0.3327570448138264, 0, 0.9991963140162398, 1.88761354944437, 0.4452131612455781, 1, 0.529343686005199],
[0.9988067070388961, 2.001193292961104, 0, 1, 0.3329355690129653, 0, 0.4997018546470994, 0.9440026732314543, 0.6670644309870347, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9999270733657249, 2.000072926634275, 0, 1, 0.3333090244552416, 0, 0.4999817690061937, 0.9445314683535926, 0.6666909755447584, 1, 0.529343686005199],
[0.670708752091704, 1.815650734892191, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2894507845836787],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8094854724654345, 2.190514527534563, 0, 1, 0.2698284908218117, 0, 0.4565137493634912, 0.862414649372067, 0.7301715091781883, 1, 0.529343686005199],
[0.9328672062044213, 2.06713279379558, 2, 0, 0.3109557354014736, 2.14392786743726, 0, -4.050162350318851, 1, 0.0966934693790712, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2, 0, 0, 0.2880702707002053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4827531526103145, 2.517246847389687, 1, 0, 0.1609177175367714, 2.071452034218438, 0, -3.913245947734027, 1, 0.1609177175367714, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 2.269708792628769, 0, 0, 0.1934688449660676, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.5338267786261883, 2.466173221373811, 0, 0, 0.1779422595420628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.481336633632693, 2.517847467601736, 0, 1, 0.1604891921888291, 0, 0.3971646467339445, 0.7502963712124899, 0.8395108078111708, 1, 0.529343686005199],
[0.2386868488242547, 2.059787895499975, 0, 4, 0.1038457565886505, 0, 1.941947522237029, 3.668594853548429, 0.6449574478855066, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 1.889131818208139, 0.4444444444444445, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 0, 0.160540882874986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -0.9445659091040695, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.529343686005199],
[0.5455012031509182, 1.647095684964495, 0, 1, 0.2487922910534589, 0, 0.6071292694944774, 1.146947220767482, 0.7512077089465411, 1, 0.529343686005199],
[0.5356399777467826, 2.464360022253217, 2, 2, 0.1785466592489275, 3.733851249141594, 0.8115697308591125, -5.520574997949027, 0.9802813034306923, 0.1487872694168348, 0.529343686005199],
[0.8092660240036094, 2.190733975996388, 0, 0, 0.2697553413345367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.9365718555700776, 2.063428144429924, 0, 0, 0.3121906185233591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.8097056323931319, 2.190294367606866, 0, 1, 0.2699018774643775, 0, 0.4565596363618505, 0.8625013359607095, 0.7300981225356225, 1, 0.529343686005199],
[0.9994036728308252, 2.000536272961598, 0, 18, 0.333141226454397, 0, 8.997587418573902, 16.99762867953719, 0.0006801577459224316, 1, 0.529343686005199],
[1, 1.809485472465432, 0, 1, 0.3559370602911364, 0, 0.5526432873967735, 1.04401601834039, 0.6440629397088635, 1, 0.529343686005199],
[0.9995608831704327, 2.000439116829568, 1, 1, 0.3331869610568108, 1.000439309737867, 0.499890244890266, -0.9456031649779315, 0.8889864489817273, 0.5553603710953489, 0.529343686005199],
[1.001672450502532, 1.295751968115721, 0, 1, 0.4359979994923927, 0, 0.771752638318734, 1.461319314264766, 0.5640020005076073, 1, 0.5281204667489297],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1.002315516513747, 2.004631033027493, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5281208135401936],
[0.4816226486249582, 2.518377351375044, 0, 1, 0.160540882874986, 0, 0.3970810805830969, 0.7501385037379986, 0.8394591171250141, 1, 0.529343686005199],
[1.000930547373273, 1.999069452626727, 1, 1, 0.333643515791091, 0.9990703177401119, 0.5002327451335045, -0.9423699305288551, 0.8886820043705601, 0.5559690359527419, 0.529343686005199],
[1.000029996189608, 1.999373676641218, 0, 1, 0.3334096057986696, 0, 0.500156629890175, 0.9448618036132816, 0.6665903942013304, 1, 0.529343686005199],
[0.000793087416803228, 2.998992479037355, 0, 2, 0.0002643813696792609, 0, 0.6668906354316629, 1.259844318658999, 0.9994713071581502, 1, 0.529343686005199],
[0.5444525431887889, 1.745852549777795, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[1.000930667328573, 1.998411136431199, 0, 2, 0.3337167728179142, 0, 1.000795063408042, 1.890633797789765, 0.4439333388241749, 1, 0.529343686005199],
[0.5332130661422451, 2.466786933857755, 0, 1, 0.1777376887140817, 0, 0.4053856400301755, 0.7658269112256757, 0.8222623112859183, 1, 0.529343686005199],
[0.4816226486249582, 2, 0, 0, 0.1940756983709108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.529343686005199],
[0.4819993693123668, 2.517404303576229, 1, 1, 0.1606983993748911, 2.074691511374023, 0.3972345636254765, -3.168937293666087, 0.9741760244383479, 0.2955728231881302, 0.529343686005199],
[0.5457756484268196, 1.750095245826033, 0, 0, 0.2377205311470407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[1.003363476538447, 2.003780318072741, 0, 2, 0.3336599594394115, 0, 0.9981134069245789, 1.890150021251542, 0.4440090496542867, 1, 0.5280604162116661],
[1.001276969924471, 2.006013501511009, 1, 1, 0.3329498694705498, 0.9987246586480786, 0.4985011313467035, -0.947284651423043, 0.8891443844195439, 0.5550441233606435, 0.5280604162116661],
[0.9988475027577784, 2.008442968677702, 1, 1, 0.3321420103063723, 1.001153827024686, 0.4978981308383229, -0.953026738487134, 0.8896816849896416, 0.5539657056023863, 0.5280604162116661],
[1.00243015714516, 2.00486031429032, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5280604162116661],
[0.9989280115078887, 2.001071988492112, 0, 2, 0.3329760038359628, 0, 0.9994642928898727, 1.888119796861158, 0.4449210114586415, 1, 0.529343686005199],
[0.8088890930269337, 2.191110906973064, 1, 0, 0.2696296976756447, 1.236263424269837, 0, -2.335464570475098, 1, 0.2696296976756447, 0.529343686005199],
[1.000934943711407, 1.999065056288593, 1, 1, 0.3336449812371358, 0.9990659295918469, 0.5002338452439219, -0.9423595624847516, 0.8886810264952711, 0.555970988969543, 0.529343686005199],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 0.9445659091040695, 0.6666666666666667, 1, 0.529343686005199],
[0.713389024555417, 2.234647031208679, 0, 2, 0.2419878899244042, 0, 0.8949959309315336, 1.690765290289574, 0.5745823590212571, 1, 0.529343686005199]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node101":{
"Global MG94xREV":0.00121766885627097,
"Nucleotide GTR":0.001212992544247545,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node110":{
"Global MG94xREV":0.001217957778129066,
"Nucleotide GTR":0.001213280356535701,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node111":{
"Global MG94xREV":0.0008731718311967863,
"Nucleotide GTR":0.0008698185189134719,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "P", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "CCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node128":{
"Global MG94xREV":0.001218281995045433,
"Nucleotide GTR":0.001213603328335666,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node131":{
"Global MG94xREV":0.001217992609848325,
"Nucleotide GTR":0.001213315054487896,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "S", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "TCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node142":{
"Global MG94xREV":0.001218305909502495,
"Nucleotide GTR":0.001213627150952109,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "I", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "ATT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node164":{
"Global MG94xREV":0.001218305923819534,
"Nucleotide GTR":0.001213627165214166,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node17":{
"Global MG94xREV":0.001217747904557227,
"Nucleotide GTR":0.001213071288958285,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node176":{
"Global MG94xREV":0.001217658986324004,
"Nucleotide GTR":0.001212982712204932,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node183":{
"Global MG94xREV":0.00121765747556883,
"Nucleotide GTR":0.001212981207251633,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node190":{
"Global MG94xREV":0.001216508805894428,
"Nucleotide GTR":0.001211836948906126,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "E", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "GAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node194":{
"Global MG94xREV":0.0006943843891683926,
"Nucleotide GTR":0.0006917176887340143,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node195":{
"Global MG94xREV":0.0005227145274484229,
"Nucleotide GTR":0.0005207071046446461,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node204":{
"Global MG94xREV":0.001217057028417364,
"Nucleotide GTR":0.001212383066045844,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node239":{
"Global MG94xREV":0.001218344069235321,
"Nucleotide GTR":0.001213665164137031,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.001217348466289895,
"Nucleotide GTR":0.00121267338468598,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "L", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CTA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node311":{
"Global MG94xREV":0.001217000128465927,
"Nucleotide GTR":0.001212326384611884,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node327":{
"Global MG94xREV":0.001217603882716495,
"Nucleotide GTR":0.001212927820216257,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node330":{
"Global MG94xREV":0.00121734846984668,
"Nucleotide GTR":0.001212673388229108,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node335":{
"Global MG94xREV":0.001217603884585932,
"Nucleotide GTR":0.001212927822078515,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node339":{
"Global MG94xREV":0.00121760388378237,
"Nucleotide GTR":0.001212927821278038,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node346":{
"Global MG94xREV":0.001217673069992542,
"Nucleotide GTR":0.001212996741786822,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node351":{
"Global MG94xREV":0.001217647480777517,
"Nucleotide GTR":0.001212971250844124,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node356":{
"Global MG94xREV":0.001217269784284804,
"Nucleotide GTR":0.001212595004849747,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node364":{
"Global MG94xREV":0.001217439435375703,
"Nucleotide GTR":0.001212764004415865,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node369":{
"Global MG94xREV":0.001217438339948978,
"Nucleotide GTR":0.001212762913195994,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node376":{
"Global MG94xREV":0.001217790302156038,
"Nucleotide GTR":0.001213113523734175,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node40":{
"Global MG94xREV":0.001217204625412957,
"Nucleotide GTR":0.001212530096212777,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node447":{
"Global MG94xREV":0.00121760389708312,
"Nucleotide GTR":0.001212927834527708,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "H", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAT", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node452":{
"Global MG94xREV":0.001217711590880046,
"Nucleotide GTR":0.001213035114739452,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node461":{
"Global MG94xREV":0.001217444543896941,
"Nucleotide GTR":0.001212769093318437,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node479":{
"Global MG94xREV":0.001015895050979197,
"Nucleotide GTR":0.001011993627191469,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTA", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node490":{
"Global MG94xREV":0.001218428580469247,
"Nucleotide GTR":0.001213749350815643,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node495":{
"Global MG94xREV":0.001217992398189673,
"Nucleotide GTR":0.001213314843642095,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node500":{
"Global MG94xREV":0.001218315234644089,
"Nucleotide GTR":0.001213636440281609,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node506":{
"Global MG94xREV":0.001218196473949797,
"Nucleotide GTR":0.0012135181356736,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node512":{
"Global MG94xREV":0.001217439944883242,
"Nucleotide GTR":0.001212764511966701,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node517":{
"Global MG94xREV":0.001217434539857214,
"Nucleotide GTR":0.00121275912769803,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node522":{
"Global MG94xREV":0.001217789577674573,
"Nucleotide GTR":0.001213112802034996,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node527":{
"Global MG94xREV":0.0007342821545294039,
"Nucleotide GTR":0.0007314622314853604,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node528":{
"Global MG94xREV":0.0004826218281511578,
"Nucleotide GTR":0.0004807683765775807,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node539":{
"Global MG94xREV":0.001218067893712346,
"Nucleotide GTR":0.001213390049233217,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node542":{
"Global MG94xREV":0.001215898199254145,
"Nucleotide GTR":0.001211228687227825,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTT", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node545":{
"Global MG94xREV":0.001218076008558185,
"Nucleotide GTR":0.001213398132914956,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.001217793694411848,
"Nucleotide GTR":0.00121311690296243,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node552":{
"Global MG94xREV":0.001218076478218277,
"Nucleotide GTR":0.001213398600771375,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node555":{
"Global MG94xREV":0.001217791538156519,
"Nucleotide GTR":0.001213114754987942,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node558":{
"Global MG94xREV":0.001217797236685299,
"Nucleotide GTR":0.001213120431632202,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node561":{
"Global MG94xREV":0.001217438457201712,
"Nucleotide GTR":0.001212763029998435,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node564":{
"Global MG94xREV":0.001217438357759203,
"Nucleotide GTR":0.001212762930937823,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node567":{
"Global MG94xREV":0.001217438305263821,
"Nucleotide GTR":0.001212762878644044,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node570":{
"Global MG94xREV":0.001217438268727224,
"Nucleotide GTR":0.001212762842247761,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node573":{
"Global MG94xREV":0.001217438250542176,
"Nucleotide GTR":0.00121276282413255,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node576":{
"Global MG94xREV":0.001217438250148048,
"Nucleotide GTR":0.001212762823739936,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node579":{
"Global MG94xREV":0.001217438250542176,
"Nucleotide GTR":0.00121276282413255,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "S", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "TCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node582":{
"Global MG94xREV":0.001217437909520212,
"Nucleotide GTR":0.001212762484420241,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node585":{
"Global MG94xREV":0.001217438250148048,
"Nucleotide GTR":0.001212762823739936,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node590":{
"Global MG94xREV":0.001218073623004646,
"Nucleotide GTR":0.00121339575652285,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node596":{
"Global MG94xREV":0.001218332733308694,
"Nucleotide GTR":0.001213653871744679,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node600":{
"Global MG94xREV":0.001217979200245284,
"Nucleotide GTR":0.001213301696382838,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node607":{
"Global MG94xREV":0.001217014070944455,
"Nucleotide GTR":0.001212340273545986,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node616":{
"Global MG94xREV":0.001222992289342224,
"Nucleotide GTR":0.00121829553330896,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node619":{
"Global MG94xREV":0.001217646433211361,
"Nucleotide GTR":0.001212970207301023,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node624":{
"Global MG94xREV":0.001217433584831744,
"Nucleotide GTR":0.001212758176340224,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node63":{
"Global MG94xREV":0.001217176346820852,
"Nucleotide GTR":0.001212501926221233,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node632":{
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node638":{
"Global MG94xREV":0.001218093529119891,
"Nucleotide GTR":0.001213415586191036,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.001217791936124286,
"Nucleotide GTR":0.001213115151427364,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node648":{
"Global MG94xREV":0.001216772357983837,
"Nucleotide GTR":0.001212099488855168,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node656":{
"Global MG94xREV":0.001216922220026267,
"Nucleotide GTR":0.001212248775370294,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node660":{
"Global MG94xREV":0.001217723649685451,
"Nucleotide GTR":0.001213047127234452,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node687":{
"Global MG94xREV":0.001217348466914996,
"Nucleotide GTR":0.001212673385308683,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node691":{
"Global MG94xREV":0.001217391052538034,
"Nucleotide GTR":0.001212715807386716,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node70":{
"Global MG94xREV":0.001217053775347986,
"Nucleotide GTR":0.00121237982546949,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node700":{
"Global MG94xREV":0.001217958692253517,
"Nucleotide GTR":0.001213281267149567,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node703":{
"Global MG94xREV":0.00121767937145269,
"Nucleotide GTR":0.001213003019046963,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node716":{
"Global MG94xREV":0.001217423540793213,
"Nucleotide GTR":0.001212748170874624,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "L", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CTT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node721":{
"Global MG94xREV":0.001218077069495392,
"Nucleotide GTR":0.001213399189777762,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node726":{
"Global MG94xREV":0.001218076831714544,
"Nucleotide GTR":0.001213398952910083,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node735":{
"Global MG94xREV":0.001217659715925083,
"Nucleotide GTR":0.001212983439004065,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node74":{
"Global MG94xREV":0.001217641982672473,
"Nucleotide GTR":0.001212965773853898,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"Node744":{
"Global MG94xREV":0.001217959208755569,
"Nucleotide GTR":0.001213281781668055,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node750":{
"Global MG94xREV":0.001218077532563253,
"Nucleotide GTR":0.001213399651067265,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node755":{
"Global MG94xREV":0.001218075328864954,
"Nucleotide GTR":0.001213397455832008,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node76":{
"Global MG94xREV":0.001217593441645914,
"Nucleotide GTR":0.00121291741924336,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node760":{
"Global MG94xREV":0.001217434919469064,
"Nucleotide GTR":0.001212759505852027,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node765":{
"Global MG94xREV":0.001218080400183879,
"Nucleotide GTR":0.001213402507675136,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node769":{
"Global MG94xREV":0.001217518690849344,
"Nucleotide GTR":0.001212842955518311,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAT", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node774":{
"Global MG94xREV":0.00117796298202793,
"Nucleotide GTR":0.001173439155679216,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node775":{
"Global MG94xREV":3.974217921466373e-05,
"Nucleotide GTR":3.958955411503867e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node781":{
"Global MG94xREV":0.001204298568490841,
"Nucleotide GTR":0.001199673603463095,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node784":{
"Global MG94xREV":0.001217208936808526,
"Nucleotide GTR":0.001212534391050946,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node787":{
"Global MG94xREV":0.001217057028354369,
"Nucleotide GTR":0.001212383065983091,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node790":{
"Global MG94xREV":0.001217057028305574,
"Nucleotide GTR":0.001212383065934483,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAT", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node793":{
"Global MG94xREV":0.001217057028810254,
"Nucleotide GTR":0.001212383066437225,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "L", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CTT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node803":{
"Global MG94xREV":0.001152161344678191,
"Nucleotide GTR":0.001147736606440617,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node804":{
"Global MG94xREV":6.579161873905001e-05,
"Nucleotide GTR":6.553895387358543e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node82":{
"Global MG94xREV":0.001217660712260324,
"Nucleotide GTR":0.001212984431513,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node820":{
"Global MG94xREV":0.001217434786389841,
"Nucleotide GTR":0.001212759373283881,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node824":{
"Global MG94xREV":0.001221003377929133,
"Nucleotide GTR":0.001216314260072953,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "N", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "AAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node842":{
"Global MG94xREV":0.001102461261794453,
"Nucleotide GTR":0.001098227390797967,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node843":{
"Global MG94xREV":0.0001154519569364429,
"Nucleotide GTR":0.0001150085774646189,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node849":{
"Global MG94xREV":0.001218289655604228,
"Nucleotide GTR":0.001213610959475002,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node854":{
"Global MG94xREV":0.001217101861415343,
"Nucleotide GTR":0.00121242772686804,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node860":{
"Global MG94xREV":0.001217960181562714,
"Nucleotide GTR":0.00121328275073925,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node865":{
"Global MG94xREV":0.00121795800015747,
"Nucleotide GTR":0.001213280577711431,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "V", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node879":{
"Global MG94xREV":0.001218736217475003,
"Nucleotide GTR":0.001214055806378166,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node883":{
"Global MG94xREV":0.001217204623545953,
"Nucleotide GTR":0.001212530094352944,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTT", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node891":{
"Global MG94xREV":0.001217776272117818,
"Nucleotide GTR":0.001213099547576644,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node946":{
"Global MG94xREV":0.001217487072251499,
"Nucleotide GTR":0.00121281145834792,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node988":{
"Global MG94xREV":0.001216778137510526,
"Nucleotide GTR":0.001212105246186274,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "G", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GGG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node993":{
"Global MG94xREV":0.001217957862373449,
"Nucleotide GTR":0.001213280440456553,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "L", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TTG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216696598325408,
"Nucleotide GTR":0.001212024020142671,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "G", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GGA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002440088862961848,
"Nucleotide GTR":0.002430717992688434,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "V", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "V", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GTG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GTC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217266895760895,
"Nucleotide GTR":0.00121259212741887,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "CTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00123250631117979,
"Nucleotide GTR":0.001227773017680301,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "-", "-", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "Y", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "NNN", "NNN", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TAT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218400734342425,
"Nucleotide GTR":0.00121372161162855,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Q", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAA", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217885082677125,
"Nucleotide GTR":0.001213207940261974,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "L", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "TTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218215737610651,
"Nucleotide GTR":0.001213537325354661,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217307824311203,
"Nucleotide GTR":0.001212632898787961,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "I", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ATA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217266895976942,
"Nucleotide GTR":0.001212592127634088,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAC", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217058888692355,
"Nucleotide GTR":0.001212384919176671,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTG", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTK", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "PL", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CYT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001283269793532851,
"Nucleotide GTR":0.001278341548933434,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACG", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218762931450599,
"Nucleotide GTR":0.001214082417761925,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "K", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AAA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217919307096413,
"Nucleotide GTR":0.001213242033246461,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217885082677125,
"Nucleotide GTR":0.001213207940261974,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "V", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GTT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217432115459318,
"Nucleotide GTR":0.001212756712610747,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTT", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "SG", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "RGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218069901413584,
"Nucleotide GTR":0.001213392049224117,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTC", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "LF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "YTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCW", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002437360411912421,
"Nucleotide GTR":0.002428000019929865,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "C", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "F", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "TGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TTC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00121718919205899,
"Nucleotide GTR":0.001212514722128767,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217059029671331,
"Nucleotide GTR":0.001212385059614234,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "V", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "GTC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217545454445242,
"Nucleotide GTR":0.001212869616331811,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "M", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ATG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217612426643801,
"Nucleotide GTR":0.001212936331331628,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121793565633836,
"Nucleotide GTR":0.001213258319701095,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACT", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217505392865683,
"Nucleotide GTR":0.001212829708603971,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "F", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "TTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "HY", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "YAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217831727050546,
"Nucleotide GTR":0.001213154789541315,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "I", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "ATT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217972161435497,
"Nucleotide GTR":0.001213294684604759,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217262788743338,
"Nucleotide GTR":0.001212588036173824,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217749926890397,
"Nucleotide GTR":0.001213073303524925,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "H", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CAT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "RI", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "TI", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AKA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "AYT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418698_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122018197898039,
"Nucleotide GTR":0.001215496015608913,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCT", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418713_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "AV", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GYT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418728_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218577220899731,
"Nucleotide GTR":0.001213897420410279,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418730_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219806469640484,
"Nucleotide GTR":0.001215121948367844,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATT", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418738_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217266895977162,
"Nucleotide GTR":0.001212592127634307,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "P", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "CCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002437074431741096,
"Nucleotide GTR":0.00242771513803128,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "F", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "P", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "TTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CCA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217936438005349,
"Nucleotide GTR":0.001213259098366184,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "V", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GTC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218281221772144,
"Nucleotide GTR":0.001213602558032042,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "Y", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TAT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":1.361395704974615e-05,
"Nucleotide GTR":1.356167427129594e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218646981092233,
"Nucleotide GTR":0.001213966912697082,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "D", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GAT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217892440399076,
"Nucleotide GTR":0.00121321526972747,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "Y", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "TAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218113589754285,
"Nucleotide GTR":0.001213435569784956,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218529620812531,
"Nucleotide GTR":0.00121385000312554,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCA", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "HD", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "SAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "LF", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "YTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "HY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCY", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "YAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "GV", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GKA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAY", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTY", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "SL", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TYA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQ", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "MAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001223161372961424,
"Nucleotide GTR":0.001218463967582686,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "T", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "ACT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218179020053322,
"Nucleotide GTR":0.001213500748806733,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "D", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "GAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAY", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "PS", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "YCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218070078333918,
"Nucleotide GTR":0.00121339222546501,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGC", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "NK", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAS", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAY", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAR", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218252256149326,
"Nucleotide GTR":0.001213573703648245,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121736072899478,
"Nucleotide GTR":0.001212685600297412,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAG", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218566352283603,
"Nucleotide GTR":0.001213886593533775,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTA", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218412835809247,
"Nucleotide GTR":0.00121373366662113,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216158887098039,
"Nucleotide GTR":0.001211488373931143,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121705889438087,
"Nucleotide GTR":0.001212384924843339,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "G", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GGT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217613214202487,
"Nucleotide GTR":0.001212937115865789,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAT", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "TI", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "AYT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420518_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "PL", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "TS", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CYT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "AST", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "ED", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAW", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217645905978948,
"Nucleotide GTR":0.001212969682093381,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217823441900905,
"Nucleotide GTR":0.001213146536209803,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420669_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420669_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "SL"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TYG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_420671_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "SF", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TYC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420685_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216957421770119,
"Nucleotide GTR":0.001212283841926048,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "V", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "GTA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420704_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "YTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420706_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217117018014349,
"Nucleotide GTR":0.001212442825259937,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCG", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217505458324958,
"Nucleotide GTR":0.001212829773811857,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "V", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GTC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "PL", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CYT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217402856796996,
"Nucleotide GTR":0.001212727566312828,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "L", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TTG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218795469746261,
"Nucleotide GTR":0.001214114831098142,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "Y", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TAT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217266895944536,
"Nucleotide GTR":0.001212592127601807,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "S", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TCA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217155760564371,
"Nucleotide GTR":0.001212481419023815,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGT", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121797710615168,
"Nucleotide GTR":0.001213299610331349,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001217976650001264,
"Nucleotide GTR":0.001213299155932725,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218851592507169,
"Nucleotide GTR":0.001214170738326282,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "T", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "ACT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001219118117910186,
"Nucleotide GTR":0.001214436240170274,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "D", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GAT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217392187301709,
"Nucleotide GTR":0.001212716937792464,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "A", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GCT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00121798452369128,
"Nucleotide GTR":0.001213306999384773,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217267064065083,
"Nucleotide GTR":0.001212592295076705,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCC", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222348656697371,
"Nucleotide GTR":0.001217654372458519,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "F", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTC", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421663_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217432842581738,
"Nucleotide GTR":0.001212757436940739,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGC", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCY", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "L", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TTG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421827_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421830_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "HY", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "YAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421830_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421854_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421854_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421858_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218545773683549,
"Nucleotide GTR":0.001213866093963382,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "N", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "AAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421858_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "KE", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "RAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217905047453601,
"Nucleotide GTR":0.001213227828366106,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "M", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ATG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421866_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "QP", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CMA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTY", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421872_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421891_England_20200327_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421891_England_20200327_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421893_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001227578935501189,
"Nucleotide GTR":0.001222864565000354,
"amino-acid": [
["IM", "D", "MLV", "F", "M", "R", "I", "LF", "T", "I", "G", "TPAS", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATN", "GAT", "NTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTN", "ACA", "ATA", "GGA", "NCT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421932_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "AS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "KCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421932_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421956_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217884964994118,
"Nucleotide GTR":0.001213207823030915,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "Y", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "TAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421956_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["IM", "DY", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATN", "KAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421972_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "PL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CYT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421972_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217613208153262,
"Nucleotide GTR":0.001212937109839796,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421990_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217545413756037,
"Nucleotide GTR":0.001212869575798869,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAT", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422006_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422108_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218218726225785,
"Nucleotide GTR":0.001213540302492376,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422108_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "AS", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "KCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217790294509505,
"Nucleotide GTR":0.001213113516117008,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422163_Wales_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00121750909448229,
"Nucleotide GTR":0.00121283339600496,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "V", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GTT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422163_Wales_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218281221698294,
"Nucleotide GTR":0.001213602557958476,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "N", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "AAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "HY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "YAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000344854349204763,
"Nucleotide GTR":0.0003435299772039419,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "P", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "CCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422350_Wales_20200325_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "HY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "YAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422350_Wales_20200325_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218070078694148,
"Nucleotide GTR":0.001213392225823855,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTC", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_46":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001255776497122704,
"Nucleotide GTR":0.001250953837249302,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGC", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217978936294667,
"Nucleotide GTR":0.00121330143344589,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "L", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CTT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_137":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_137",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217680299957525,
"Nucleotide GTR":0.001213003943985986,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "VF", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "KTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "PL", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGY", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CYA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422436_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "H", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAT", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217973271262618,
"Nucleotide GTR":0.001213295790169721,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216993230090629,
"Nucleotide GTR":0.001212319512728974,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTG", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0223787993316303,
"Nucleotide GTR":0.02229285622169088,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "P", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "S", "F", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "G", "I", "N", "F", "V", "E", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "-", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "T", "N", "A", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CCA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTT", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TCG", "TTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGT", "CTG", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTT", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "GGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "GAA", "ATA", "ATT", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTG", "NNN", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "ACA", "AAT", "GCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218403512019662,
"Nucleotide GTR":0.001213724378638449,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACA", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222723912558432,
"Nucleotide GTR":0.0012180281871942,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAC", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217155760564371,
"Nucleotide GTR":0.001212481419023815,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422963_Washington_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422963_Washington_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002462281416806279,
"Nucleotide GTR":0.002452825318676506,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "-", "-", "-", "I", "L", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "NNN", "NNN", "NNN", "ATC", "TTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423047_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217624720737687,
"Nucleotide GTR":0.001212948578211514,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "P", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "CCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423047_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121788508308141,
"Nucleotide GTR":0.001213207940664705,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "S", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "TCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423080_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002445369243687781,
"Nucleotide GTR":0.002435978094741924,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "I", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "H", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "ATC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "CAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423080_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423155_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "VL", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "KTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423155_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423166_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCY", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423166_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423175_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217751642882986,
"Nucleotide GTR":0.00121307501292745,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423175_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "VL", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "KTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423203_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423239_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["MV", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["RTG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423239_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423290_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "PS", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "PL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "YCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CYT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423290_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423291_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "DY", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "AS", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "KAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "KCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423291_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423309_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "IV", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "RTA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423309_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218084417055509,
"Nucleotide GTR":0.00121340650912045,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTT", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423319_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217061393545555,
"Nucleotide GTR":0.001212387414410279,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "V", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GTT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423338_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423340_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "VL", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "TI", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "KTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AYA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423340_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423341_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "VL", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "KTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423341_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216446316227318,
"Nucleotide GTR":0.00121177469922313,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423363_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423364_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACK", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423364_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423396_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423396_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423410_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121718937681198,
"Nucleotide GTR":0.001212514906172233,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGT", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423410_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423431_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCR", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423431_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423505_England_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "TI", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "AYA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423505_England_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423511_England_20200401_null_17":{
"Global MG94xREV":0.001217433004738254,
"Nucleotide GTR":0.001212757598474512,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "N", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAC", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423511_England_20200401_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423517_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002436949198309809,
"Nucleotide GTR":0.002427590385544054,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423517_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "PS", "S", "D", "CF", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "YCT", "TCA", "GAT", "TKT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423542_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "LF", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "YTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423542_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "KE", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "RAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423558_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423561_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217322955885444,
"Nucleotide GTR":0.001212647972251198,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "F", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "TTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423561_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423562_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "LF", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "EG", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "YTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GRA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423564_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "MI", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "LF", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATK", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "YTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423567_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423572_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTK", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423572_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTK", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423575_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423586_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423586_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423619_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCY", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423619_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423633_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "CF", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "ILVF", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAY", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TKT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "NTY", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423633_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423647_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423647_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219972037678472,
"Nucleotide GTR":0.001215286880561527,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "AS", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAY", "KCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAC", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423659_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423663_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "AV", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GYC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423663_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423670_England_20200320_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423670_England_20200320_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACK", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423712_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "GV", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GKT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423712_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "DY", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "KAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423726_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "TI", "QE", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "AYT", "SAR", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423802_England_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423821_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "KR", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "ARA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423821_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423840_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "DY", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "KAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423840_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423846_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "WC", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGK", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423846_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTW", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423863_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423876_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217432842581738,
"Nucleotide GTR":0.001212757436940739,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "CGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423876_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423897_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "VF", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "KTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423897_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "TI", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "AYA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423913_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423914_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "LF", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTK", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423914_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423919_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423919_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423922_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423922_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423926_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217972183910354,
"Nucleotide GTR":0.001213294706993304,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423926_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423952_England_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "TI", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AYA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423952_England_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423957_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "LF"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTK"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_423957_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423960_England_20200319_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTY", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423960_England_20200319_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423995_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002437526048081479,
"Nucleotide GTR":0.00242816501999297,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "A", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GCT", "GCA", "CTC", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423995_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223149691019817,
"Nucleotide GTR":0.001218452330504182,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "E", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "GAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423998_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424012_England_20200320_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424012_England_20200320_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424013_England_20200321_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424013_England_20200321_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATY", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424021_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424037_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002437243368358473,
"Nucleotide GTR":0.002427883425867726,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "I", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATT", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAT", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424037_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424103_England_20200313_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424103_England_20200313_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424115_England_20200312_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "AS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "KCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424115_England_20200312_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "TPAS", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "RG", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "AS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "NCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "NGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "KCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424122_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424136_England_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217056039302524,
"Nucleotide GTR":0.001212382080729582,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424136_England_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCM", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424154_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121765997258738,
"Nucleotide GTR":0.00121298369468068,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424177_Washington_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424177_Washington_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218260309935809,
"Nucleotide GTR":0.001213581726505121,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGC", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217122544123849,
"Nucleotide GTR":0.001212448330147071,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAT", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121761997291098,
"Nucleotide GTR":0.001212943848618269,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217972130568588,
"Nucleotide GTR":0.001213294653856391,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221059021311504,
"Nucleotide GTR":0.001216369689763551,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTA", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217636894087137,
"Nucleotide GTR":0.001212960704810667,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001216927062705675,
"Nucleotide GTR":0.001212253599451971,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "C", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TGT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216829399419373,
"Nucleotide GTR":0.001212156311229872,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "R", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CGC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217505458140696,
"Nucleotide GTR":0.001212829773628302,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "I", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ATT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217117014963602,
"Nucleotide GTR":0.001212442822220906,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "C", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TGT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217606797400501,
"Nucleotide GTR":0.001212930723706765,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121765345881816,
"Nucleotide GTR":0.001212977205926815,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218216943531802,
"Nucleotide GTR":0.001213538526644615,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121818049250199,
"Nucleotide GTR":0.001213502215600637,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAY", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217703233354091,
"Nucleotide GTR":0.001213026789309577,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAT", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217885082660525,
"Nucleotide GTR":0.001213207940245437,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425280_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217231055351856,
"Nucleotide GTR":0.001212556424650647,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACC", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425280_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425325_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217612492580825,
"Nucleotide GTR":0.00121293639701543,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425325_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425439_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218281077544441,
"Nucleotide GTR":0.001213602414358228,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "I", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "ATT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425439_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217513749183626,
"Nucleotide GTR":0.001212838032830472,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425585_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425602_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217563741047813,
"Nucleotide GTR":0.001212887832706865,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425602_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425609_England_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425609_England_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425611_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217155760581766,
"Nucleotide GTR":0.001212481419041143,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "F", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TTC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425611_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425627_England_20200329_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425627_England_20200329_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425632_England_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425632_England_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425639_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217223023643115,
"Nucleotide GTR":0.001212548423786727,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425639_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222426285909396,
"Nucleotide GTR":0.001217731703544815,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "E", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "GAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001219012646906636,
"Nucleotide GTR":0.001214331174215535,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223453268101405,
"Nucleotide GTR":0.001218754741734194,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "AV", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GYT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217189375685555,
"Nucleotide GTR":0.001212514905050134,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "L", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TTA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001217866152384986,
"Nucleotide GTR":0.001213189082669364,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218872008422489,
"Nucleotide GTR":0.001214191075836714,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGA", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218231512264679,
"Nucleotide GTR":0.001213553039428011,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "H", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAT", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217189375722014,
"Nucleotide GTR":0.001212514905086454,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATT", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217786984767296,
"Nucleotide GTR":0.001213110219085468,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_23":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001217957633841669,
"Nucleotide GTR":0.001213280212802423,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "S", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "TCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223542918818392,
"Nucleotide GTR":0.001218844048158292,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "CTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001218008054104905,
"Nucleotide GTR":0.001213330439432651,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217650171906563,
"Nucleotide GTR":0.001212973931638211,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002439314491502646,
"Nucleotide GTR":0.002429946595110468,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "F", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTT", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "TTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003676290751859207,
"Nucleotide GTR":0.003662172395660812,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "NTSIHPRLDAGVYCF", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "H", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "NNT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "CAC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217505392637306,
"Nucleotide GTR":0.00121282970837647,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "L", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CTA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217972168715818,
"Nucleotide GTR":0.00121329469185712,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219806469640484,
"Nucleotide GTR":0.001215121948367844,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCT", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218416842285627,
"Nucleotide GTR":0.001213737657711117,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATC", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001216890617815295,
"Nucleotide GTR":0.001212217294523845,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221586950784053,
"Nucleotide GTR":0.001216895591785921,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "K", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "AAG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121722625840676,
"Nucleotide GTR":0.001212551646127647,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218646969408959,
"Nucleotide GTR":0.001213966901058676,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "I", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "ATT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001225536669786716,
"Nucleotide GTR":0.001220830142363798,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "EDAGV", "-", "NHDY", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "S", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GNN", "NNN", "NAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "TCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217954935767462,
"Nucleotide GTR":0.001213277525089847,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "L", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "TTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217463955021513,
"Nucleotide GTR":0.001212788429896899,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "F", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTT", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217619282510132,
"Nucleotide GTR":0.001212943160868822,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217971804319081,
"Nucleotide GTR":0.001213294328859806,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "S", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "TCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217189375722014,
"Nucleotide GTR":0.001212514905086454,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "F", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TTC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217564622097561,
"Nucleotide GTR":0.001212888710373047,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218088660598665,
"Nucleotide GTR":0.001213410736366785,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218390577360395,
"Nucleotide GTR":0.001213711493653198,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "F", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "TTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217885042631183,
"Nucleotide GTR":0.001213207900369824,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "C", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGT", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001217885082995137,
"Nucleotide GTR":0.001213207940578765,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "F", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "TTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001217525750914631,
"Nucleotide GTR":0.001212849988470259,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGT", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219217496571936,
"Nucleotide GTR":0.001214535237180125,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "PL", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGT", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CYT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002447221638367097,
"Nucleotide GTR":0.00243782337552039,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "IM", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "F", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "AT-", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "TTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001217987103718979,
"Nucleotide GTR":0.001213309569504184,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "A", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GCA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427174_Washington_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427174_Washington_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217189259988105,
"Nucleotide GTR":0.001212514789797007,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAT", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001219981654151286,
"Nucleotide GTR":0.001215296460103425,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "K", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "AAA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218646913296595,
"Nucleotide GTR":0.001213966845161806,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "I", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "ATT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427346_Liege_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001217658990948797,
"Nucleotide GTR":0.001212982716811965,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCT", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427346_Liege_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218112495220367,
"Nucleotide GTR":0.001213434479454464,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "C", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGT", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217786018991605,
"Nucleotide GTR":0.001213109257018723,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATC", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218426089931094,
"Nucleotide GTR":0.001213746869842103,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217662468385425,
"Nucleotide GTR":0.001212986180893913,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "T", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ACT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001217230792040082,
"Nucleotide GTR":0.001212556162350091,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAC", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "LV", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "STT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "TI", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "AYA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427420_Doha_20200323_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427420_Doha_20200323_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001217446960243374,
"Nucleotide GTR":0.001212771500385178,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218281221048786,
"Nucleotide GTR":0.001213602557311461,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "I", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "ATA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217905084265222,
"Nucleotide GTR":0.001213227865036357,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216896240537578,
"Nucleotide GTR":0.001212222895652735,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTG", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217230791997785,
"Nucleotide GTR":0.001212556162307958,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAC", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218779075963915,
"Nucleotide GTR":0.001214098500274163,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217972133537747,
"Nucleotide GTR":0.001213294656814146,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427605_New_York_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121794655752705,
"Nucleotide GTR":0.001213269179025068,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCT", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427605_New_York_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001216992835781679,
"Nucleotide GTR":0.001212319119934321,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "E", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "GAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217607065703232,
"Nucleotide GTR":0.001212930990979112,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001217231055351856,
"Nucleotide GTR":0.001212556424650647,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAC", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217703233576135,
"Nucleotide GTR":0.001213026789530768,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCT", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "G", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GGG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223170334619514,
"Nucleotide GTR":0.001218472894824596,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "L", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "CTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217437066237908,
"Nucleotide GTR":0.001212761644376461,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "V", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "GTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121711701774868,
"Nucleotide GTR":0.001212442824995287,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "M", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATG", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217394623160532,
"Nucleotide GTR":0.001212719364296663,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217974820406006,
"Nucleotide GTR":0.001213297333363808,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217278801919912,
"Nucleotide GTR":0.001212603987853704,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATT", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218014874365168,
"Nucleotide GTR":0.001213337233500518,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "L", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CTG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121689691570865,
"Nucleotide GTR":0.001212223568230893,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "V", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "GTA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAY", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "V", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "S", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "TCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217155760581766,
"Nucleotide GTR":0.001212481419041143,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "V", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GTT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429004_California_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429004_California_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429010_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217885082975908,
"Nucleotide GTR":0.001213207940559608,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "S", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGT", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429010_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429020_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217117015060635,
"Nucleotide GTR":0.001212442822317564,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACG", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429020_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217906532461038,
"Nucleotide GTR":0.00121322930767055,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "A", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "GCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217266974470358,
"Nucleotide GTR":0.001212592205826061,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "P", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "CCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217975153891102,
"Nucleotide GTR":0.001213297665568196,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001223099786038819,
"Nucleotide GTR":0.001218402617177312,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "L", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "CTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121778602174118,
"Nucleotide GTR":0.001213109259757738,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "CTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121793404487573,
"Nucleotide GTR":0.001213256714427093,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "C", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGT", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217743301794303,
"Nucleotide GTR":0.001213066703871724,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "L", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CTG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217272965546615,
"Nucleotide GTR":0.001212598173894303,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "S", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AGT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217436895506483,
"Nucleotide GTR":0.001212761474300711,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "I", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ATA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217636374014724,
"Nucleotide GTR":0.00121296018673553,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "C", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TGC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217545454628243,
"Nucleotide GTR":0.001212869616514109,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "F", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "TTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223653895226216,
"Nucleotide GTR":0.001218954598374457,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "P", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "CCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001217885139502054,
"Nucleotide GTR":0.001213207996868674,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "L", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CTT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121860988446656,
"Nucleotide GTR":0.001213929958536575,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "T", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "ACA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217464284270213,
"Nucleotide GTR":0.001212788757881158,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATT", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_86":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_86",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429816_NB_20200314_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429816_NB_20200314_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121693710570989,
"Nucleotide GTR":0.001212263603887225,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAG", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217146097961448,
"Nucleotide GTR":0.001212471793528965,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121775940938959,
"Nucleotide GTR":0.00121308274960771,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217624794169591,
"Nucleotide GTR":0.00121294865136141,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "T", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ACA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430006_Amman_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217902984744575,
"Nucleotide GTR":0.001213225773578668,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430006_Amman_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00126383706490481,
"Nucleotide GTR":0.001258983449382143,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGG", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430011_Amman_20200319_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430011_Amman_20200319_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002029803211992651,
"Nucleotide GTR":0.0002022007994831149,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTA", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217885082975908,
"Nucleotide GTR":0.001213207940559608,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "F", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTT", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "I", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "ATT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430199_Washington_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430199_Washington_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217885082975827,
"Nucleotide GTR":0.001213207940559529,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "C", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "TGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217979996328415,
"Nucleotide GTR":0.001213302489408706,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217628067539215,
"Nucleotide GTR":0.001212951912160049,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217975992588077,
"Nucleotide GTR":0.001213298501044255,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222872465005374,
"Nucleotide GTR":0.001218176169143184,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "-", "D", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "NNN", "GAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223219256269303,
"Nucleotide GTR":0.001218521628596624,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "T", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "-", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "ACT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "NNN", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217135886440744,
"Nucleotide GTR":0.00121246162122439,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "P", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CCA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217430623974687,
"Nucleotide GTR":0.001212755226853982,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122362909112662,
"Nucleotide GTR":0.001218929889532049,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "L", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217743298851243,
"Nucleotide GTR":0.001213066700939967,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "Y", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "TAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218069901430245,
"Nucleotide GTR":0.001213392049240714,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "S", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TCC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTT", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001217681815273601,
"Nucleotide GTR":0.001213005453482672,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001217717540258544,
"Nucleotide GTR":0.00121304104127007,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001217902962053965,
"Nucleotide GTR":0.0012132257509752,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001228719665238204,
"Nucleotide GTR":0.001224000913900859,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "AV", "G", "L", "E", "A", "PL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "YSCF", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "GV", "T", "TI", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "TI", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GYT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CYT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGY", "CGN", "TNC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GKC", "ACA", "AYA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "AYC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "LF", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "EA", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "LF", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACN", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTK", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GMA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "YTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCM", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "YAG", "CTG", "TAC", "TMA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "PS", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "YCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "VF", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "KTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217972171070443,
"Nucleotide GTR":0.001213294694202704,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "VF", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "KTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGY", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "QH", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAK", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "HL", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CWT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_146":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_146",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "LF", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "PS", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "YTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "YCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "AV", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GYT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "GC", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "KNTRSIM", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTY", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "KGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "YAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "ANN", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217863354353565,
"Nucleotide GTR":0.001213186295383451,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "S", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "TCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "LF", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "LF", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "ILVF", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "YTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "YTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "NTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002437066322385023,
"Nucleotide GTR":0.002427707059818221,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "GC", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "KGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001216957421898421,
"Nucleotide GTR":0.001212283842053858,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "R", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AGG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "PR", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CST", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "HY", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "YAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "HY", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "YAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCY", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001217935651985846,
"Nucleotide GTR":0.001213258315365295,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "L", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TTG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "SL", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TYG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "PLSF", "Y", "L", "Y", "TPAS", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "LF", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "YYC", "TAT", "CTT", "TAT", "NCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "YTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAY", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "NHDY", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGY", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "NAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["TM", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "QH", "-", "KQE", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "ILVF", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "SRGC", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["AYG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAN", "NNN", "NAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "NTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "NGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217723206488007,
"Nucleotide GTR":0.001213046685739055,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "P", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "CCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "SF", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "PL", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TYC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CYA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001217885082975827,
"Nucleotide GTR":0.001213207940559529,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "L", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "TTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217974895246374,
"Nucleotide GTR":0.001213297407916762,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222139829198527,
"Nucleotide GTR":0.00121744634693678,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "G", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GGT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "TI", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "AYT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAK", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217058920143051,
"Nucleotide GTR":0.001212384950506584,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "R", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AGG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217885083045383,
"Nucleotide GTR":0.001213207940628817,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "F", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430912_Washington_20200408_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430912_Washington_20200408_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430925_Connecticut_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217208195436166,
"Nucleotide GTR":0.001212533652525739,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATT", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430925_Connecticut_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216762991617628,
"Nucleotide GTR":0.001212090158459371,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACG", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430955_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218417985797547,
"Nucleotide GTR":0.001213738796831515,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTT", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430955_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218321152984314,
"Nucleotide GTR":0.001213642335893152,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "Y", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TAC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431080_Cincinnati_20200302_null_276":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431080_Cincinnati_20200302_null_276",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431082_Cincinnati_20200410_null_1512":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431082_Cincinnati_20200410_null_1512",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431089_Cincinnati_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217155761400544,
"Nucleotide GTR":0.001212481419856775,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCT", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431089_Cincinnati_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431118_Fujian_20200313_null_3026":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431118_Fujian_20200313_null_3026",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431240_Fujian_20200316_null_8311":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431240_Fujian_20200316_null_8311",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431943_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0012198042593262,
"Nucleotide GTR":0.001215119746542007,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "L", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "TTA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431943_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431959_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001223397907331715,
"Nucleotide GTR":0.001218699593570937,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "F", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTT", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TTT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431959_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431997_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "LF", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTK", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431997_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "L", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CTA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432004_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217113584439329,
"Nucleotide GTR":0.001212439404871152,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432004_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432068_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "SL", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TYA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432068_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "PL", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "GV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CYT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GKT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "LF", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "YTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432269_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217779334087189,
"Nucleotide GTR":0.001213102597786886,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432269_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432279_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "MI", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATK", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432279_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432288_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTK", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432288_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432291_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "L", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CTT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432291_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432311_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121788513981769,
"Nucleotide GTR":0.001213207997183097,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "N", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAT", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432311_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432425_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "WC", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGK", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432425_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432443_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001226014429872431,
"Nucleotide GTR":0.001221306067668882,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "-", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "NNN", "GTT", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432443_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432477_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432477_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432529_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216032359724891,
"Nucleotide GTR":0.001211362332471281,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "I", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ATT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432529_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432692_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAT", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432692_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432744_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216821318102599,
"Nucleotide GTR":0.001212148260948432,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "S", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "TCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432744_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432755_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217885082660525,
"Nucleotide GTR":0.001213207940245437,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "I", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "ATA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432755_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432831_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217885082677125,
"Nucleotide GTR":0.001213207940261974,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "F", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "TTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432831_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432954_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217698361462817,
"Nucleotide GTR":0.001213021936128222,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "V", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GTT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432954_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432960_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432960_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432979_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218253451306622,
"Nucleotide GTR":0.00121357489421568,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432979_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433035_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218029036772478,
"Nucleotide GTR":0.001213351341518791,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "V", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433035_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433037_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "L", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CTT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433037_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433165_Scotland_20200418_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001218616207794977,
"Nucleotide GTR":0.001213936257581005,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAA", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433165_Scotland_20200418_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433176_Scotland_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "E", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "GAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433176_Scotland_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433358_Scotland_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001217156030265408,
"Nucleotide GTR":0.001212481687689097,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "L", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CTT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433358_Scotland_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433407_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217266895977162,
"Nucleotide GTR":0.001212592127634307,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "T", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ACG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433407_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433409_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217045545556367,
"Nucleotide GTR":0.001212371627283404,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433409_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433410_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217911490202865,
"Nucleotide GTR":0.001213234246372761,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "L", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TTG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433410_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433419_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218080777750218,
"Nucleotide GTR":0.001213402883791477,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "S", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "TCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433419_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433523_Scotland_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433523_Scotland_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433530_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "RG", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "RGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433530_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433561_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217625782897342,
"Nucleotide GTR":0.001212949636292071,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433561_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433645_Scotland_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217058888692355,
"Nucleotide GTR":0.001212384919176671,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "G", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GGA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433645_Scotland_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433708_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "N", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "AAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433708_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433722_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218191922900333,
"Nucleotide GTR":0.001213513602101897,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433722_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433732_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217783367717405,
"Nucleotide GTR":0.001213106615926425,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "F", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "TTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433732_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433764_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433764_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433817_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433817_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433855_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217432842581738,
"Nucleotide GTR":0.001212757436940739,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "H", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "CAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433855_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433861_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0012178306239909,
"Nucleotide GTR":0.001213153690717838,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "Y", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "TAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433861_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433870_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217589748997097,
"Nucleotide GTR":0.001212913740775723,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "S", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TCG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433870_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433876_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216844062008671,
"Nucleotide GTR":0.001212170917509246,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "R", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CGT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433876_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433929_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217884964994118,
"Nucleotide GTR":0.001213207823030915,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "M", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "ATG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433929_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433959_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "S", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "TCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433959_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433983_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218069901413584,
"Nucleotide GTR":0.001213392049224117,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "P", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "CCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433983_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433987_England_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433987_England_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433988_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217266895962009,
"Nucleotide GTR":0.001212592127619213,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "A", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GCC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433988_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434038_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121825906323232,
"Nucleotide GTR":0.001213580484589448,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434038_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434048_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001216982453594165,
"Nucleotide GTR":0.001212308777618358,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "R", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CGG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434048_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434098_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217972174144425,
"Nucleotide GTR":0.001213294697264879,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434098_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434135_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121769589670378,
"Nucleotide GTR":0.001213019480834798,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "T", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ACC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434135_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434168_Washington_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218196663768064,
"Nucleotide GTR":0.001213518324762892,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGC", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434168_Washington_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434197_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217227895979009,
"Nucleotide GTR":0.001212553277410996,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "I", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ATC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434197_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434214_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121711697715664,
"Nucleotide GTR":0.001212442784559136,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "E", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAG", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434214_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434216_Washington_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121794638657051,
"Nucleotide GTR":0.001213269008725068,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGT", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434216_Washington_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434254_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434254_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434356_Ghent_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218321296075431,
"Nucleotide GTR":0.001213642478434745,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "N", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "AAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434356_Ghent_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216463412564358,
"Nucleotide GTR":0.001211791729903726,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434464_Athens_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217317999846235,
"Nucleotide GTR":0.001212643035245067,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434464_Athens_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434485_Athens_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218753842132577,
"Nucleotide GTR":0.001214073363350345,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "I", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATA", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434485_Athens_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434528_Louisiana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217743189642215,
"Nucleotide GTR":0.001213066592150342,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "S", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "TCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434528_Louisiana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220241408711401,
"Nucleotide GTR":0.001215555217107131,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCT", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221059021223263,
"Nucleotide GTR":0.001216369689675648,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATA", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434555_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217117017832284,
"Nucleotide GTR":0.001212442825078569,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "W", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "-", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TGG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "NNN", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434555_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":10495.20245833759,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02327728891719319],
[0.01834848433086471],
[0.01212610692112965],
[0.03324924959663236],
[0.01698555432947897],
[0.0133889809321951],
[0.008848480965572628],
[0.02426214399138476],
[0.01150562157010289],
[0.009069385951555559],
[0.005993756311117118],
[0.01643461507521972],
[0.02510335442609991],
[0.01978789312526943],
[0.01307738031403902],
[0.03585759922452203],
[0.01441099939059339],
[0.01135957015660429],
[0.007507288330368897],
[0.02058465302292316],
[0.01051577844661337],
[0.008289135248564687],
[0.005478105902116387],
[0.01502072442878349],
[0.007123145054606481],
[0.005614868461953314],
[0.003710742211180555],
[0.01017469124845948],
[0.0155415188866418],
[0.01225070998533494],
[0.008096222906653634],
[0.02219948561926595],
[0.02234893863218056],
[0.01761670578402858],
[0.0116424906865943],
[0.03192319524170743],
[0.01630813247597341],
[0.01285499846075483],
[0.008495583776576929],
[0.02329451548578233],
[0.01104675167757158],
[0.008707678578202586],
[0.005754711918983809],
[0.01577916591000856],
[0.02410217656904158],
[0.0189987077399785],
[0.01255582517138709],
[0.03442751805921217],
[0.01976369586216571],
[0.03581375141529795],
[0.01829564359457336],
[0.01442166787602829],
[0.009530960895313271],
[0.02613347381522939],
[0.009768904197804943],
[0.006456052427479846],
[0.01770221060777389],
[0.02703956648686354],
[0.02131412570263422],
[0.01408603362217657],
[0.03862328204563394]
],
"Log Likelihood":-4597.672400264444,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.140151204045187, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":647
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":11407.93918768243,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2703074420477209],
[0.2105562627557848],
[0.1846572199196196],
[0.3344790752768747]
],
"Log Likelihood":-4654.4198517768,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.4344433995041813,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1884401248240513,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.3168535824001865,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.231851330289035,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.463244678331407
},
"display order":0,
"estimated parameters":1047
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-30/sequences.ORF3a.compressed.fas",
"number of sequences":521,
"number of sites":276,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2,epi_isl_423338_England_20200327_null_1,epi_isl_423561_England_20200331_null_2,epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1,epi_isl_432477_England_20200402_null_1,epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1,epi_isl_433855_England_20200408_null_1,epi_isl_425439_England_20200101_null_1,(epi_isl_434038_England_20200414_null_1,epi_isl_423726_England_20200322_null_1,epi_isl_421990_England_20200331_null_1,epi_isl_430199_Washington_20200317_null_4)Node17,epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3,epi_isl_425611_England_20200329_null_3,epi_isl_429010_California_20200328_null_1,epi_isl_432755_England_20200331_null_1,epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2,epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1,(epi_isl_431997_Wales_20200407_null_1,epi_isl_433987_England_20200412_null_3)Node40,epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_7,epi_isl_434197_Washington_20200331_null_1,epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1,(epi_isl_433037_England_20200403_null_1,epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1)Node793,(epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_2,epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1)Node790,(epi_isl_423960_England_20200319_null_4,epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_8)Node787,(epi_isl_432279_Wales_20200405_null_1,epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1)Node784,(epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3,epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2,epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2)Node624,(epi_isl_419452_Wales_20200320_null_2,epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2,epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_4)Node619,(epi_isl_423505_England_20200330_null_7,epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2,epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2)Node607,(epi_isl_432425_Wales_20200401_null_1,epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1,epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3,epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1)Node600,(epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1,epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_3,epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1)Node590,(epi_isl_430006_Amman_20200323_null_3,epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11,epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1)Node585,(epi_isl_425632_England_20200330_null_4,epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1)Node582,(epi_isl_433959_England_20200411_null_2,epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1)Node579,(epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1,epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3)Node576,(epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2,epi_isl_422963_Washington_20200316_null_3)Node573,(epi_isl_421854_England_20200327_null_2,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1)Node570,(epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1,epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_7)Node567,(epi_isl_434098_Washington_20200402_null_1,epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1)Node564,(epi_isl_420669_England_20200327_null_1,epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2)Node561,(epi_isl_423586_England_20200402_null_2,epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2)Node558,(epi_isl_423922_England_20200319_null_1,epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1)Node548,(epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_2,epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1)Node545,(epi_isl_431959_Wales_20200331_null_2,epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1)Node542,(epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1,epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1)Node539,((epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1,epi_isl_421858_England_20200326_null_2,epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1)Node528,epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1)Node527,(epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2,epi_isl_432269_Wales_20200407_null_1,epi_isl_429004_California_20200328_null_3)Node369,(epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1,(epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3,epi_isl_425585_England_20200324_null_1,epi_isl_430011_Amman_20200319_null_27)Node356,(epi_isl_423647_England_20200322_null_1,epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1)Node351,epi_isl_418730_England_20200318_null_1,(epi_isl_421893_England_20200327_null_1,epi_isl_423914_England_20200318_null_1)Node339,epi_isl_433732_England_20200405_null_1,(epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_424013_England_20200321_null_9)Node335,epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2,epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1,(epi_isl_420518_England_20200323_null_1,epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1)Node330,(epi_isl_432960_England_20200330_null_1,epi_isl_423957_England_20200319_null_1)Node327,epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1,epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_418698_England_20200317_null_1,epi_isl_421871_England_20200327_null_1,epi_isl_423846_England_20200324_null_1,epi_isl_423913_England_20200318_null_1,epi_isl_424021_England_20200320_null_1,epi_isl_420685_England_20200329_null_1,epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5,epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_423998_England_20200321_null_1,(epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1,epi_isl_432529_England_20200331_null_1,epi_isl_425627_England_20200329_null_5)Node311,epi_isl_431943_Wales_20200330_null_1,epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_422006_England_20200403_null_1,epi_isl_434485_Athens_20200312_null_1,epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1,epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1,epi_isl_423047_England_20200324_null_1,epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1,epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1,epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1,epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6,epi_isl_418713_England_20200317_null_1,epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1,epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_2,epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6,epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2,epi_isl_423995_England_20200321_null_2,(epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1,epi_isl_422436_England_20200327_null_1)Node295,epi_isl_423341_England_20200327_null_1,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_423663_England_20200323_null_1,epi_isl_423080_England_20200323_null_2,epi_isl_431082_Cincinnati_20200410_null_1512,epi_isl_423840_England_20200324_null_1,epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1,(epi_isl_433817_England_20200326_null_1,epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1)Node346,epi_isl_432979_England_20200401_null_2)Node239,(epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1,epi_isl_433561_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2)Node364,(epi_isl_424136_England_20200320_null_3,epi_isl_433764_England_20200405_null_1,epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1)Node522,(epi_isl_423619_England_20200320_null_1,epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1,epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1,(epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1,epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2)Node490,epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1,epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1,epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1,epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1,epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1,epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1,epi_isl_427605_New_York_20200316_null_2,epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2,epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1,epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2,epi_isl_434528_Louisiana_20200326_null_1,epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2,epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2,epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1,epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1,epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1,epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1,epi_isl_420704_England_20200328_null_1,epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1,epi_isl_434216_Washington_20200406_null_1,epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1,epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1,epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1,epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1,epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3,epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1,epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1,(epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1,epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1)Node447,epi_isl_423863_England_20200317_null_1,epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_423633_England_20200321_null_1,epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1,epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1,(epi_isl_434168_Washington_20200330_null_1,epi_isl_430912_Washington_20200408_null_11)Node452,epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1,(epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1,epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1)Node461,epi_isl_431118_Fujian_20200313_null_3026,epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1,epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1,epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1,(epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1,epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1)Node479,epi_isl_430955_Washington_20200401_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1,(epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1,(epi_isl_423562_England_20200401_null_1,epi_isl_423564_England_20200401_null_1)Node500,epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1,epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_86)Node495,epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2,(epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1,epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1)Node506,epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1,(epi_isl_423558_England_20200331_null_1,epi_isl_424012_England_20200320_null_28)Node512,epi_isl_421775_England_20200325_null_1)Node376,(epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1,epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423926_England_20200318_null_1)Node517,(epi_isl_418728_England_20200318_null_1,epi_isl_424103_England_20200313_null_4)Node204,epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1,epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1,epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9,epi_isl_423166_England_20200319_null_1,(epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2)Node552,(epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1,epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2)Node555,epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1,(epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1,epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1)Node70,epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1,(epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1,epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_6)Node596,epi_isl_433419_Scotland_20200408_null_1,epi_isl_433876_England_20200408_null_1,epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1,(epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4,epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7)Node616,epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5,(epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2)Node63,epi_isl_434048_England_20200417_null_2,(epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2,epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1,epi_isl_425639_England_20200330_null_3,epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2)Node691,epi_isl_423203_England_20200324_null_2,(epi_isl_423363_England_20200329_null_1,epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1,epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6)Node648,(epi_isl_425602_England_20200325_null_1,epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1,epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_27)Node643,(epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_3,epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1,epi_isl_421932_England_20200331_null_1)Node638,epi_isl_423155_England_20200323_null_2,epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1,(epi_isl_423340_England_20200327_null_2,(epi_isl_423670_England_20200320_null_14,epi_isl_423952_England_20200319_null_3)Node687,epi_isl_423567_England_20200401_null_1,epi_isl_433861_England_20200407_null_1,epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_433165_Scotland_20200418_null_5,epi_isl_431080_Cincinnati_20200302_null_276,epi_isl_421866_England_20200327_null_1,epi_isl_433530_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_423431_England_20200329_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_433983_England_20200413_null_1,epi_isl_433410_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1)Node660,(epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1,epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6)Node656,epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_423897_England_20200318_null_1,(epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1,epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_3)Node700,(epi_isl_421891_England_20200327_null_8,epi_isl_423517_England_20200330_null_1)Node703,(epi_isl_423364_England_20200328_null_1,epi_isl_418938_Washington_20200316_null_4)Node781,((epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1,epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_23,epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1)Node775,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1)Node774,(epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_432692_England_20200407_null_1,epi_isl_424037_England_20200320_null_1)Node769,(epi_isl_432133_Wales_20200404_null_1,epi_isl_432291_Wales_20200408_null_1,epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1)Node716,(epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1,epi_isl_423919_England_20200320_null_1)Node721,(epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1,epi_isl_423175_England_20200324_null_1,epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_28)Node726,epi_isl_421872_England_20200327_null_1,(epi_isl_423572_England_20200401_null_1,(epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8,epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1)Node76,epi_isl_416615_unknown_20200217_null_3)Node74,(epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1,epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6,epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1,epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_51)Node735,(epi_isl_433722_England_20200403_null_1,epi_isl_434464_Athens_20200316_null_1,epi_isl_420942_Wales_20200321_null_6)Node744,(epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1,epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2)Node750,epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1,(epi_isl_422108_Wales_20200325_null_2,epi_isl_424177_Washington_20200317_null_2)Node755,epi_isl_427420_Doha_20200323_null_32,(epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1,epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1)Node760,epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2,(epi_isl_416605_unknown_20200216_null_2,epi_isl_425325_England_20200329_null_3)Node765,epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2,epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2,epi_isl_430925_Connecticut_20200404_null_3,epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1,(epi_isl_433708_England_20200101_null_1,epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1)Node824,epi_isl_422350_Wales_20200325_null_18,((epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1,epi_isl_432068_Wales_20200329_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1,epi_isl_422370_Wales_20200326_null_137,epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1,epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1,epi_isl_422163_Wales_20200330_null_3)Node804,epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1)Node803,(epi_isl_432004_Wales_20200326_null_1,epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1)Node820,(epi_isl_423396_England_20200328_null_2,epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8)Node82,epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7,epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2,epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2,(epi_isl_432288_Wales_20200331_null_1,epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4)Node883,epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1,epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1,epi_isl_434135_Washington_20200326_null_1,epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1,(epi_isl_434254_Washington_20200401_null_1,epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1)Node854,(((epi_isl_433523_Scotland_20200330_null_1,epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_4)Node849,epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2,epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_146)Node843,epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1)Node842,epi_isl_433409_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1,(epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2,epi_isl_425609_England_20200325_null_5,epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1)Node860,(epi_isl_433035_England_20200403_null_1,epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1,epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2)Node865,epi_isl_424154_England_20200320_null_1,epi_isl_427346_Liege_20200330_null_4,(epi_isl_427174_Washington_20200326_null_8,epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5)Node879,epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1,epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1,epi_isl_425280_England_20200101_null_1,epi_isl_432954_England_20200330_null_1,epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1,epi_isl_423542_England_20200330_null_2,epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1,(epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18,epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1)Node891,epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_6,epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1,epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1,epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1,epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6,epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5,epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_2,epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3,epi_isl_423821_England_20200323_null_1,epi_isl_423575_England_20200331_null_1,epi_isl_423239_England_20200324_null_1,(epi_isl_423659_England_20200323_null_1,epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2)Node131,(epi_isl_424122_England_20200312_null_1,epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2)Node128,epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_6,epi_isl_424115_England_20200312_null_6,epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1,((epi_isl_422356_Wales_20200327_null_46,epi_isl_423291_England_20200326_null_1)Node195,epi_isl_422113_Wales_20200328_null_3)Node194,epi_isl_421830_England_20200325_null_1,epi_isl_423309_England_20200325_null_1,(epi_isl_432443_Wales_20200406_null_1,epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4)Node142,epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_420706_England_20200328_null_1,epi_isl_420671_England_20200328_null_1,epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_423802_England_20200223_null_1,(epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1)Node164,epi_isl_431240_Fujian_20200316_null_8311,epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_423290_England_20200326_null_1,epi_isl_421972_England_20200401_null_1,(epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1,epi_isl_429816_NB_20200314_null_51,epi_isl_432744_England_20200401_null_1,epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1)Node176,(epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1)Node183,(epi_isl_433176_Scotland_20200419_null_2,epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2)Node190,epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5,epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1,epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2,epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3,epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1,epi_isl_433407_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_429020_California_20200331_null_1,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1,epi_isl_433988_England_20200413_null_1,epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1,epi_isl_423712_England_20200322_null_1,epi_isl_434214_Washington_20200331_null_1,epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4,epi_isl_434555_Manila_20200326_null_1,epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1,((epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1,epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1)Node111,epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1)Node110,epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2,epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1,(epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1,epi_isl_421663_India_20200310_null_1)Node946,epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2,epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5,epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_3,epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3,epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1,epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1,epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_13,epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1,epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1,epi_isl_431089_Cincinnati_20200413_null_1,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2,epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_433645_Scotland_20200405_null_1,epi_isl_423876_England_20200318_null_3,epi_isl_432311_Wales_20200301_null_1,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_434356_Ghent_20200327_null_1,epi_isl_418738_England_20200317_null_1,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1,epi_isl_421956_England_20200331_null_2,epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_423511_England_20200401_null_17,epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1,epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1,epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1,epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1,epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2,epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3,epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1,epi_isl_423410_England_20200330_null_1,epi_isl_433929_England_20200412_null_1,epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1,(epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1)Node988,epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29,epi_isl_423319_England_20200326_null_2,(epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2,epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_6)Node101,epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2,(epi_isl_433870_England_20200407_null_1,epi_isl_421827_England_20200324_null_2)Node993,epi_isl_433358_Scotland_20200327_null_4,epi_isl_432831_England_20200330_null_2,epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node101":"test",
"Node110":"test",
"Node111":"test",
"Node128":"test",
"Node131":"test",
"Node142":"test",
"Node164":"test",
"Node17":"test",
"Node176":"test",
"Node183":"test",
"Node190":"test",
"Node194":"test",
"Node195":"test",
"Node204":"test",
"Node239":"test",
"Node295":"test",
"Node311":"test",
"Node327":"test",
"Node330":"test",
"Node335":"test",
"Node339":"test",
"Node346":"test",
"Node351":"test",
"Node356":"test",
"Node364":"test",
"Node369":"test",
"Node376":"test",
"Node40":"test",
"Node447":"test",
"Node452":"test",
"Node461":"test",
"Node479":"test",
"Node490":"test",
"Node495":"test",
"Node500":"test",
"Node506":"test",
"Node512":"test",
"Node517":"test",
"Node522":"test",
"Node527":"test",
"Node528":"test",
"Node539":"test",
"Node542":"test",
"Node545":"test",
"Node548":"test",
"Node552":"test",
"Node555":"test",
"Node558":"test",
"Node561":"test",
"Node564":"test",
"Node567":"test",
"Node570":"test",
"Node573":"test",
"Node576":"test",
"Node579":"test",
"Node582":"test",
"Node585":"test",
"Node590":"test",
"Node596":"test",
"Node600":"test",
"Node607":"test",
"Node616":"test",
"Node619":"test",
"Node624":"test",
"Node63":"test",
"Node638":"test",
"Node643":"test",
"Node648":"test",
"Node656":"test",
"Node660":"test",
"Node687":"test",
"Node691":"test",
"Node70":"test",
"Node700":"test",
"Node703":"test",
"Node716":"test",
"Node721":"test",
"Node726":"test",
"Node735":"test",
"Node74":"test",
"Node744":"test",
"Node750":"test",
"Node755":"test",
"Node76":"test",
"Node760":"test",
"Node765":"test",
"Node769":"test",
"Node774":"test",
"Node775":"test",
"Node781":"test",
"Node784":"test",
"Node787":"test",
"Node790":"test",
"Node793":"test",
"Node803":"test",
"Node804":"test",
"Node82":"test",
"Node820":"test",
"Node824":"test",
"Node842":"test",
"Node843":"test",
"Node849":"test",
"Node854":"test",
"Node860":"test",
"Node865":"test",
"Node879":"test",
"Node883":"test",
"Node891":"test",
"Node946":"test",
"Node988":"test",
"Node993":"test",
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":"test",
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_2":"test",
"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_3":"test",
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":"test",
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_7":"test",
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":"test",
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420669_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_6":"test",
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":"test",
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7":"test",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_421830_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421854_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421858_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421891_England_20200327_null_8":"test",
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421932_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421956_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421972_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422108_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422163_Wales_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422350_Wales_20200325_null_18":"test",
"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_46":"test",
"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_137":"test",
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422963_Washington_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423047_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423080_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423155_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423166_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423175_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423239_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423290_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423291_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423309_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423340_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_423341_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423364_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423396_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_423410_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423431_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423505_England_20200330_null_7":"test",
"epi_isl_423511_England_20200401_null_17":"test",
"epi_isl_423517_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423542_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423561_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423572_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423586_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_423619_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423633_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423647_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423663_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423670_England_20200320_null_14":"test",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423712_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_423821_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423840_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423846_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423876_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_423897_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423914_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423919_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423922_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423926_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423952_England_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_423957_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423960_England_20200319_null_4":"test",
"epi_isl_423995_England_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424012_England_20200320_null_28":"test",
"epi_isl_424013_England_20200321_null_9":"test",
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424037_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424103_England_20200313_null_4":"test",
"epi_isl_424115_England_20200312_null_6":"test",
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424136_England_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424177_Washington_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_2":"test",
"epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_425280_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425325_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_425439_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425602_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425609_England_20200325_null_5":"test",
"epi_isl_425611_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_425627_England_20200329_null_5":"test",
"epi_isl_425632_England_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_425639_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_28":"test",
"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_23":"test",
"epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_6":"test",
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6":"test",
"epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_6":"test",
"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_3":"test",
"epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5":"test",
"epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_13":"test",
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6":"test",
"epi_isl_427174_Washington_20200326_null_8":"test",
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11":"test",
"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_427346_Liege_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4":"test",
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427420_Doha_20200323_null_32":"test",
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8":"test",
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8":"test",
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_427605_New_York_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6":"test",
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_8":"test",
"epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3":"test",
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_429004_California_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_429010_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429020_California_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_86":"test",
"epi_isl_429816_NB_20200314_null_51":"test",
"epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_430006_Amman_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_430011_Amman_20200319_null_27":"test",
"epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4":"test",
"epi_isl_430199_Washington_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2":"test",
"epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6":"test",
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4":"test",
"epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7":"test",
"epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_27":"test",
"epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6":"test",
"epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_146":"test",
"epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3":"test",
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3":"test",
"epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18":"test",
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6":"test",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_4":"test",
"epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_51":"test",
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5":"test",
"epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_430912_Washington_20200408_null_11":"test",
"epi_isl_430925_Connecticut_20200404_null_3":"test",
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430955_Washington_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_431080_Cincinnati_20200302_null_276":"test",
"epi_isl_431082_Cincinnati_20200410_null_1512":"test",
"epi_isl_431089_Cincinnati_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_431118_Fujian_20200313_null_3026":"test",
"epi_isl_431240_Fujian_20200316_null_8311":"test",
"epi_isl_431943_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_431959_Wales_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_431997_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432004_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_432068_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_432269_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432279_Wales_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_432288_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432291_Wales_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_432311_Wales_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_432425_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432443_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_432477_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_432529_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432692_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432744_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432755_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432831_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_432954_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_432960_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_432979_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_433035_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_433037_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_433165_Scotland_20200418_null_5":"test",
"epi_isl_433176_Scotland_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_433358_Scotland_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_433407_Scotland_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_433409_Scotland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433410_Scotland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433419_Scotland_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433523_Scotland_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_433530_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_433561_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433645_Scotland_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_433708_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_433722_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_433732_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_433764_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_433817_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_433855_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433861_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433870_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433876_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433929_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_433959_England_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_433983_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_433987_England_20200412_null_3":"test",
"epi_isl_433988_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_434038_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_434048_England_20200417_null_2":"test",
"epi_isl_434098_Washington_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_434135_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434168_Washington_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_434197_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_434214_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_434216_Washington_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_434254_Washington_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434356_Ghent_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_434464_Athens_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_434485_Athens_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_434528_Louisiana_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434555_Manila_20200326_null_1":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":42
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":16
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":58
}
}
}