{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[211.8388480376283, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2674744915771568, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7325255084228433, 1, 0.001217897652581235],
[211.745189314929, 580.1887526914271, 0, 2, 0.2673773380371535, 0, 0.003447154035169135, 0.00759624705685394, 0.5367359648215272, 1, 0.002437102737976505],
[212.2854212618852, 579.9120482297487, 0, 1, 0.26797033496978, 0, 0.001724399420658047, 0.003799935799321375, 0.73202966503022, 1, 0.001217473771721971],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001218280102702086],
[212.0619337639183, 580.0169915159478, 0, 1, 0.2677282869115477, 0, 0.001724087422657004, 0.003799248271617947, 0.7322717130884524, 1, 0.001217327558340091],
[211.9325067603276, 580.3006432704024, 0, 1, 0.267512798160626, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.732487201839374, 1, 0.001217316208031233],
[212.0774900338375, 579.5950939687278, 1, 0, 0.2678853535152232, 0.004715257615697203, 0, -0.01039067631446605, 1, 0.2678853535152232, 0.001217327328720576],
[211.8388480376283, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2674744915771568, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7325255084228433, 1, 0.001217897427654838],
[211.6740163025389, 580.3006432704024, 0, 1, 0.267273723652573, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327262763474269, 1, 0.001217473622573932],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217897430552087],
[211.9325067603276, 580.4243493068568, 1, 0, 0.2674710329538155, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2674710329538155, 0.001217327557370237],
[211.726957458653, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673332149605168, 0.004723064138846299, 0, -0.01040787899177336, 1, 0.2673332149605168, 0.001217897649817929],
[211.9727219116753, 580.0237289966924, 1, 0, 0.2676435250038767, 0.004717588145217475, 0, -0.01039581193585943, 1, 0.2676435250038767, 0.001220085968485083],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.001217897427695961],
[211.8030797567368, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2675666069848333, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7324333930151667, 1, 0.001218348129672195],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217316211998557],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217473771721971],
[211.9509305762489, 579.8806885970293, 0, 1, 0.2676717188908659, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785744, 0.7323282811091341, 1, 0.001217897654062387],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217392582846086],
[211.7676750252382, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2674402864163682, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2674402864163682, 0.001217897651082689],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217473771721971],
[212.0973384954169, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2677451462758242, 0.004714816353160453, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2677451462758242, 0.001218044003452127],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217263196279518],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001218257061641727],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001218257061641727],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.00121750754768481],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217997187931941],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217404992308783],
[211.8971020288289, 580.5056901568395, 0, 2, 0.2674108472590783, 0, 0.003445271999762216, 0.00759209974989439, 0.5366868667136616, 1, 0.002437121930126864],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217897652581235],
[211.5261654830268, 580.4702854253409, 1, 0, 0.2670796886026702, 0.004727547524517677, 0, -0.01041775870845079, 1, 0.2670796886026703, 0.001217473772789045],
[211.726957458653, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673332149605168, 0.004723064138846299, 0, -0.01040787899177336, 1, 0.2673332149605168, 0.001217897649645231],
[211.6692058826898, 580.3272450256778, 0, 1, 0.2672602959772348, 0, 0.001723165694134786, 0.003797217124328708, 0.7327397040227652, 1, 0.001217392718420415],
[211.7669974459639, 580.4661525847661, 1, 0, 0.2673038832542537, 0.004722171122321209, 0, -0.01040591111506079, 1, 0.2673038832542537, 0.001217316208081588],
[211.921999988401, 580.0744509199667, 0, 1, 0.2675794818844711, 0, 0.0017239166427931, 0.003798871936233651, 0.732420518115529, 1, 0.001217473772824719],
[211.9325067603276, 579.8272450256778, 0, 1, 0.2676727457821171, 0, 0.001724651624391528, 0.003800491562669528, 0.7323272542178829, 1, 0.001218401602672358],
[212.0973384954169, 579.8991124129508, 1, 0, 0.2678008698803578, 0.004714816353160453, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2678008698803578, 0.001218044008522965],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217473772789045],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217897427695961],
[211.6740163025389, 580.3006432704024, 0, 1, 0.267273723652573, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327262763474269, 1, 0.001217473772963648],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217473767749674],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001218280038213345],
[212.8033555643341, 579.9139056616669, 0, 2, 0.2684479901891081, 0, 0.003448787795005624, 0.007599847256677599, 0.5351683430583553, 1, 0.002439937344879908],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3211018009812, 580.0357542662032, 0, 1, 0.2679614622820635, 0, 0.001724031652609224, 0.003799125375148282, 0.7320385377179366, 1, 0.001216805616304939],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217997113012974],
[211.9140829444063, 580.2471996990508, 0, 1, 0.2675138101135731, 0, 0.001723403405511749, 0.003797740951906244, 0.732486189886427, 1, 0.001218043775696917],
[212.3388480376283, 579.6576028707394, 0, 1, 0.2681058075375081, 0, 0.001725156359629419, 0.003801603811651209, 0.731894192462492, 1, 0.001222963397798959],
[212.1909972181162, 579.8054536902514, 0, 1, 0.2679191263732901, 0, 0.001724716443481797, 0.003800634399867592, 0.7320808736267099, 1, 0.001217316211998557],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217392409872878],
[212.097338495417, 579.8991124129507, 1, 0, 0.2678008698803578, 0.004714816353160452, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2678008698803578, 0.001218044008566111],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.0012174737718609],
[212.0731181151192, 580.0058071647469, 0, 1, 0.2677424071599774, 0, 0.001724120668529714, 0.003799321533172304, 0.7322575928400226, 1, 0.001216597525280365],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.001217014131885398],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9859335360706, 580.0323087077235, 0, 1, 0.2676528421056474, 0, 0.001724041893852325, 0.003799147943043993, 0.7323471578943526, 1, 0.001222501976214838],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217095359850455],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217822783121808],
[211.9325067603276, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2675611072319028, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7324388927680971, 1, 0.001218043775696917],
[211.9325067603276, 580.1576028707394, 1, 0, 0.2675611072319028, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675611072319029, 0.001220086486813655],
[211.9636565810153, 580.0327943273523, 0, 1, 0.2676320788280137, 0, 0.001724040450436379, 0.003799144762291401, 0.7323679211719863, 1, 0.001217316212857201],
[212.1740163025389, 580.0234531890951, 0, 1, 0.2678297072050664, 0, 0.001724068215693318, 0.00379920594660436, 0.7321702927949336, 1, 0.001217473771721971],
[212.0973384954169, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2677451462758242, 0.004714816353160453, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2677451462758242, 0.001218044008509641],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.0012174737718609],
[211.9509305762489, 579.8806885970295, 0, 1, 0.2676717188908658, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785743, 0.7323282811091342, 1, 0.001217897649645231],
[211.9325067603276, 580.0421528126137, 0, 1, 0.2676001109361359, 0, 0.00172401263451461, 0.003799083466331975, 0.7323998890638641, 1, 0.001217392410100946],
[211.9325067603276, 579.7860133607218, 0, 1, 0.2676866858286001, 0, 0.001724774273535013, 0.003800761835824053, 0.7323133141713999, 1, 0.001217316208081588],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217473772789045],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.00121828003798795],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217473772807214],
[212.4859335360706, 579.5323087077235, 1, 0, 0.2682841406961742, 0.004706193880030391, 0, -0.01037070320775812, 1, 0.2682841406961742, 0.001218043775710621],
[211.9325067603276, 579.8054536902515, 0, 1, 0.2676801130511874, 0, 0.001724716443481796, 0.003800634399867592, 0.7323198869488126, 1, 0.001217473772963648],
[212.3388480376283, 579.6576028707394, 1, 0, 0.2681058075375081, 0.004709453824590737, 0, -0.01037788691467095, 1, 0.268105807537508, 0.001221196680933042],
[211.9325067603276, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2675611072319028, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7324388927680971, 1, 0.001218044008506569],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001218401602827934],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7669974459639, 580.2294534624037, 1, 0, 0.2673837707266, 0.004722171122321209, 0, -0.01040591111506079, 1, 0.2673837707266, 0.001216208752295477],
[212.0626113431926, 580.0163139366734, 0, 1, 0.2677291423556867, 0, 0.001724089436748465, 0.003799252709927396, 0.7322708576443133, 1, 0.001217545565259481],
[211.9325067603276, 580.1098802665241, 0, 1, 0.2675772284812614, 0, 0.001723811357152826, 0.00379863992579057, 0.7324227715187386, 1, 0.001222536967958469],
[211.726957458653, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673332149605168, 0.004723064138846299, 0, -0.01040787899177336, 1, 0.2673332149605168, 0.001217270665346708],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.2370318614583, 1, 0, 0.2675342795041666, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675342795041666, 0.001255522160896516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2854212618852, 579.7247307843502, 0, 1, 0.2680337123374305, 0, 0.001724956599051812, 0.003801163613538726, 0.7319662876625694, 1, 0.001217926639959259],
[211.9325067603276, 579.8766267026416, 0, 1, 0.2676560522021802, 0, 0.001724504754892968, 0.003800167916849006, 0.7323439477978197, 1, 0.001216722516029851],
[211.9325067603276, 579.8766267026416, 0, 0, 0.2676560522021802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000523851504633947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2676243963926296, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7323756036073703, 1, 0.0006930897111784938],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001218304884929935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.001216850641412117],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001222862752097698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0036797727177, 579.9927711356499, 0, 1, 0.2676826133874255, 0, 0.001724159420197528, 0.003799406927453957, 0.7323173866125745, 1, 0.001217638679613825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0973384954169, 579.8991124129507, 1, 0, 0.2678008698803578, 0.004714816353160453, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2678008698803578, 0.001217713111846857],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217598852754638],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.4533045097636, 0, 1, 0.2677992247803864, 0, 0.00172576459952374, 0.003802944146449122, 0.7322007752196136, 1, 0.001217258123437565],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.8054536902515, 0, 1, 0.2676801130511874, 0, 0.001724716443481796, 0.003800634399867592, 0.7323198869488126, 1, 0.001217102489812014],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001216850635880582],
[212.1958076379653, 579.8006432704024, 0, 1, 0.2679252001629435, 0, 0.001724730752900577, 0.003800665932511387, 0.7320747998370565, 1, 0.001217506276959511],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 0, 0.2675927480700891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002779824783096041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.0009400911252972383],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001216582388381528],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217405167895264],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5456304276153, 580.8571617580532, 0, 1, 0.2669672955645617, 0, 0.001721593647865763, 0.003793752918284397, 0.7330327044354383, 1, 0.001217244212499525],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217067301719715],
[212.5803575798396, 579.7774129284754, 1, 0, 0.2682883483851804, 0.00470410348060698, 0, -0.01036609674390251, 1, 0.2682883483851803, 0.001218161704974199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5456304276153, 580.2591989245857, 0, 1, 0.2680932589692798, 0, 0.001723367767117409, 0.003797662418122912, 0.7319067410307203, 1, 0.001217429001304443],
[212.1740163025389, 580.0234531890951, 0, 1, 0.2678297072050665, 0, 0.001724068215693318, 0.00379920594660436, 0.7321702927949335, 1, 0.001217881787410464],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5087827957726, 580.8940093898958, 0, 1, 0.2669207944262441, 0, 0.001721484442661553, 0.003793512270578317, 0.7330792055737558, 1, 0.001217234293885064],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.001217289489313755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6524839791014, 579.9152569495637, 0, 1, 0.26830827574427, 0, 0.001724389879411246, 0.003799914773957498, 0.73169172425573, 1, 0.001217532677304869],
[212.357547661147, 579.8038519902175, 1, 0, 0.2680735867142819, 0.004709039122996805, 0, -0.01037697306639778, 1, 0.2680735867142819, 0.001217844438946622],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.0163139366734, 0, 1, 0.2677291423556867, 0, 0.001724089436748465, 0.003799252709927396, 0.7322708576443133, 1, 0.001218096466695113],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0994589750352, 579.9736697404544, 0, 1, 0.2677776221483468, 0, 0.001724216205276203, 0.003799532060674681, 0.7322223778516532, 1, 0.001217238010171229],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9509305762489, 579.8806885970295, 0, 1, 0.2676717188908658, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785743, 0.7323282811091342, 1, 0.001217217756338545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217235148077795],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217326556099665],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217664531900969],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.8766267026416, 0, 1, 0.2676560522021802, 0, 0.001724504754892968, 0.003800167916849006, 0.7323439477978197, 1, 0.001219971259420407],
[211.9509305762489, 579.5997124289316, 0, 1, 0.267766734130316, 0, 0.001725328668313679, 0.003801983515987694, 0.732233265869684, 1, 0.00121899111862671],
[211.9325067603276, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2676243963926296, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7323756036073703, 1, 0.0009126324487251197],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 0, 0.2675927480700891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003027723987400084],
[211.8752938977941, 580.4024804838513, 0, 1, 0.267425517601018, 0, 0.001722942326446214, 0.003796724904912459, 0.7325744823989819, 1, 0.001217430460250177],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.745189314929, 580.4866489482323, 0, 1, 0.267276798391675, 0, 0.001722692506041047, 0.003796174393534631, 0.7327232016083249, 1, 0.001217359311137105],
[211.8388480376283, 580.0950939687278, 0, 1, 0.2674956038643032, 0, 0.001723855296135134, 0.003798736750986556, 0.7325043961356967, 1, 0.001217332545141702],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217234081858409],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217067883674408],
[212.0994589750352, 579.9736697404544, 0, 1, 0.2677776221483468, 0, 0.001724216205276203, 0.003799532060674681, 0.7322223778516532, 1, 0.001217238294588678],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9693543921702, 579.6974330460188, 0, 1, 0.267750722596431, 0, 0.001725037826621902, 0.00380134260893143, 0.732249277403569, 1, 0.001222294159995904],
[211.9509305762489, 579.8806885970295, 0, 1, 0.2676717188908658, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785743, 0.7323282811091342, 1, 0.00121706771030895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217295280119324],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.00121706807827042],
[211.5892130984681, 580.8135790872003, 0, 1, 0.2670222962173642, 0, 0.001721722831569448, 0.003794037591182358, 0.7329777037826357, 1, 0.001217235651602673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217062008250844],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7329478730138, 580.3401808424758, 0, 1, 0.267314898330641, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.732685101669359, 1, 0.001217356822640583],
[211.7676750252382, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2674402864163682, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2674402864163683, 0.001217061963692547],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217234918570841],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217061871990516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217341245740507],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.0012170670634288],
[212.3228205089226, 580.8007819943792, 0, 1, 0.2677045795116641, 0, 0.001721760767205161, 0.003794121187232375, 0.7322954204883358, 1, 0.001217421738301123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.2942447239918, 0, 1, 0.2676352324327104, 0, 0.001723263687503285, 0.003797433065313492, 0.7323647675672895, 1, 0.001217408439790616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2867764204338, 580.5990348496573, 0, 1, 0.2668147015812227, 0, 0.001722359046392394, 0.003795439572331743, 0.7331852984187773, 1, 0.001217240457169858],
[211.5445892989482, 580.1933711516309, 1, 0, 0.2671901561705566, 0.00472713579351742, 0, -0.01041685140626266, 1, 0.2671901561705565, 0.001217067260209532],
[211.7329478730138, 580.6698443126546, 0, 1, 0.2672036872674251, 0, 0.001722149014271115, 0.003794976739552345, 0.732796312732575, 1, 0.001217235154864674],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.001217067617052161],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217233490848747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217068165643257],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5892130984681, 580.8135790872003, 0, 1, 0.2670222962173642, 0, 0.001721722831569448, 0.003794037591182358, 0.7329777037826357, 1, 0.001217233686103671],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217069914771493],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5456304276153, 580.2591989245857, 0, 1, 0.2680932589692798, 0, 0.001723367767117409, 0.003797662418122912, 0.7319067410307203, 1, 0.001217427080178357],
[212.1740163025389, 580.0234531890951, 0, 1, 0.2678297072050665, 0, 0.001724068215693318, 0.00379920594660436, 0.7321702927949335, 1, 0.001217342710897524],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001218652338047653],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001218025036467935],
[212.0626113431926, 580.1528633970772, 0, 1, 0.2676829954788726, 0, 0.001723683641143325, 0.00379835848714542, 0.7323170045211274, 1, 0.001217420958003433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2676243963926296, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7323756036073703, 1, 0.001217346391059749],
[211.8398014245, 580.6065734320212, 0, 1, 0.2673238318023163, 0, 0.001722336683322244, 0.003795390292431837, 0.7326761681976837, 1, 0.00121697831376745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0813109667113, 580.7496138316842, 0, 1, 0.2674987873620599, 0, 0.001721912466548493, 0.003794455476236739, 0.7325012126379401, 1, 0.001217430321264576],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.357547661147, 580.4515858018221, 1, 0, 0.2678545676354344, 0.004709039122996805, 0, -0.01037697306639778, 1, 0.2678545676354345, 0.001217232478461483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.745189314929, 580.1262437894155, 0, 1, 0.2673984443217406, 0, 0.001723762733897275, 0.003798532778196323, 0.7326015556782594, 1, 0.001217242997739213],
[211.8752938977941, 580.4024804838513, 0, 1, 0.267425517601018, 0, 0.001722942326446214, 0.003796724904912459, 0.7325744823989819, 1, 0.001217364796578795],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0990572033583, 580.6475673575993, 0, 1, 0.2675496187963259, 0, 0.001722215085737433, 0.003795122336522031, 0.732450381203674, 1, 0.001218113008719748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217767260813654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.00121841859468068],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001218471504283918],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001223287353502627],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217594337305033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001223536375153864],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1380560620021, 579.8583948463656, 1, 0, 0.2678522811796615, 0.00471391139601905, 0, -0.0103877097463453, 1, 0.2678522811796615, 0.00121784455235879],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217811758117691],
[212.0626113431926, 580.0163139366734, 0, 1, 0.2677291423556867, 0, 0.001724089436748465, 0.003799252709927396, 0.7322708576443133, 1, 0.001216633057653888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217533350645644],
[211.9325067603276, 580.1098802665241, 0, 1, 0.2675772284812614, 0, 0.001723811357152826, 0.00379863992579057, 0.7324227715187386, 1, 0.001222805425816361],
[212.0309759028759, 579.9654750054917, 1, 1, 0.2677170783526749, 0.004716292021681141, 0.001724240567924377, -0.006593370014125349, 0.9283275659583079, 0.4637617226636574, 0.002438132810967043],
[212.0261654830268, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2677110045630214, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7322889954369786, 1, 0.00121722458915581],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.00121782264313846],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9950156623391, 580.2599257038172, 0, 2, 0.2675843400822178, 0, 0.003446731217176736, 0.007595315323053368, 0.5364326988928004, 1, 0.002446217442124041],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217156174227643],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217899412093202],
[211.4325067603276, 580.5639441480402, 0, 1, 0.2669614321097379, 0, 0.001722463149976476, 0.003795668977962046, 0.7330385678902621, 1, 0.001217822994668498],
[212.1555924866176, 579.8408584217501, 0, 1, 0.267874423229156, 0, 0.001724611133340736, 0.003800402335433882, 0.732125576770844, 1, 0.001217224383139918],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217822643212102],
[211.9325067603276, 579.8272450256778, 0, 1, 0.2676727457821171, 0, 0.001724651624391528, 0.003800491562669528, 0.7323272542178829, 1, 0.001218412142112674],
[212.097338495417, 579.8991124129508, 1, 0, 0.2678008698803578, 0.004714816353160452, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2678008698803578, 0.001217844421512836],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.001218418020933395],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217811758237389],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001220867455367543],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217630748726005],
[212.1909972181162, 579.8054536902514, 0, 1, 0.2679191263732901, 0, 0.001724716443481797, 0.003800634399867592, 0.7320808736267099, 1, 0.001223846314604352],
[212.0626113431926, 580.3401808424759, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670013, 0.003797132484135448, 0.7323802825602562, 1, 0.001217806600312385],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 1, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0.001723947868314302, -0.006598843842492102, 0.9283941211802977, 0.4635796173204761, 0.002437745129227432],
[212.2854212618852, 579.9120482297487, 0, 1, 0.26797033496978, 0, 0.001724399420658047, 0.003799935799321375, 0.73202966503022, 1, 0.001218197697096023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001218058286176106],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9342254682689, 580.8749079947002, 0, 1, 0.2673206154204429, 0, 0.001721541051673597, 0.003793637015813586, 0.7326793845795572, 1, 0.001217693909965423],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001216893507886091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217002533068295],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001217844227730518],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217783166019886],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001169327375542395],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 0, 0.267646659163985, 0, 0, 0, 1, 1, 4.742660332815148e-05],
[211.9342254682689, 580.8749079947002, 0, 1, 0.2673206154204429, 0, 0.001721541051673597, 0.003793637015813586, 0.7326793845795572, 1, 0.00121819545983808],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.00121761455913181],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9248669830076, 579.8842664799615, 1, 0, 0.2685701488490142, 0.00469649230815208, 0, -0.01034932454696269, 1, 0.2685701488490142, 0.001218475131209735],
[212.4560168036953, 580.3531166592738, 0, 1, 0.2679787704711386, 0, 0.001723088876917502, 0.003797047847715375, 0.7320212295288614, 1, 0.001216915647161083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.3579270791229, 0, 1, 0.2677339521440154, 0, 0.001723074594729651, 0.003797016375078435, 0.7322660478559846, 1, 0.001217820985199736],
[212.5990572033583, 580.2100762596108, 0, 1, 0.2681591927110266, 0, 0.001723513673610448, 0.00379798394183697, 0.7318408072889735, 1, 0.00121782287929774],
[211.9560168036953, 580.8531166592738, 0, 1, 0.2673481016520043, 0, 0.001721605637155591, 0.003793779338225787, 0.7326518983479957, 1, 0.001217822994787602],
[212.4696301997676, 580.3395032632015, 0, 1, 0.2679959415599892, 0, 0.001723129296518817, 0.003797136917502915, 0.7320040584400107, 1, 0.001217897183916132],
[212.4696301997676, 580.3395032632015, 0, 1, 0.2679959415599892, 0, 0.001723129296518817, 0.003797136917502915, 0.7320040584400107, 1, 0.001216510928316015],
[212.0278841909682, 580.7812492720009, 1, 0, 0.2674387506925356, 0.004716360792900828, 0, -0.01039310730725046, 1, 0.2674387506925356, 0.001217699437424843],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217811758144707],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217731858115649],
[211.9160968536317, 578.4340691230385, 1, 3.5, 0.268129376036453, 0.004718848708744811, 0.006050819249471829, 0.002935168314669561, 0.6500927746255283, 0.7545548694087669, 0.003678917930123103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.8749079947002, 0, 1, 0.2675594230880614, 0, 0.001721541051673597, 0.003793637015813586, 0.7324405769119386, 1, 0.00121826306440502],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001217536041161586],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001217877444470828],
[212.2111397419789, 580.3395032632015, 0, 1, 0.2677571983757658, 0, 0.001723129296518817, 0.003797136917502915, 0.7322428016242342, 1, 0.001217399639946888],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217623367234297],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.5227588142122, 0, 1, 0.2676782814105927, 0, 0.001722585350559934, 0.003795938262656891, 0.7323217185894073, 1, 0.001217822859301468],
[212.0272066116939, 580.7819268512752, 1, 0, 0.2674378960362941, 0.004716375865062437, 0, -0.01039314052069613, 1, 0.2674378960362941, 0.001217224382513803],
[212.2863746487569, 580.5227588142122, 0, 1, 0.2677647944360778, 0, 0.001722585350559934, 0.003795938262656891, 0.7322352055639223, 1, 0.001217699610547633],
[212.3333272808492, 580.5582805536183, 0, 1, 0.2677961592515407, 0, 0.001722479953341469, 0.003795706006336924, 0.7322038407484592, 1, 0.001217607862291894],
[212.1927159260576, 580.3579270791229, 0, 1, 0.2677339521440154, 0, 0.001723074594729651, 0.003797016375078435, 0.7322660478559846, 1, 0.00121773210682981],
[212.0990572033583, 580.7100762596108, 0, 1, 0.2675285238918922, 0, 0.001722029702740929, 0.003794713821257782, 0.7324714761081077, 1, 0.001217269503658216],
[212.4696301997676, 580.3395032632015, 0, 1, 0.2679959415599892, 0, 0.001723129296518817, 0.003797136917502915, 0.7320040584400107, 1, 0.001217185488931094],
[212.1927159260576, 580.9768226957283, 0, 1, 0.2675250442607319, 0, 0.001721239059692618, 0.003792971537661667, 0.732474955739268, 1, 0.001217428075992308],
[212.1927159260576, 580.5539086349, 0, 1, 0.2676677633835087, 0, 0.001722492924647386, 0.003795734590277005, 0.7323322366164913, 1, 0.001217610300545855],
[212.5990572033583, 580.2100762596108, 1, 0, 0.2681591927110266, 0.004703689720709652, 0, -0.01036518497077886, 1, 0.2681591927110265, 0.001218126487627359],
[211.9342254682689, 580.8749079947002, 1, 1, 0.2673206154204429, 0.004718445063747956, 0.001721541051673597, -0.0066040632501868, 0.9285396885712358, 0.4631809194121214, 0.002438379446400581],
[212.3041208854039, 580.4225382060667, 0, 1, 0.2678150387029014, 0, 0.001722882786548463, 0.003796593701093761, 0.7321849612970986, 1, 0.001222157496831322],
[212.3982652277321, 580.410868235237, 1, 0, 0.2679059262347069, 0.004708136382035918, 0, -0.01037498376064084, 1, 0.267905926234707, 0.001217630749695203],
[212.357547661147, 580.4515858018221, 1, 0, 0.2678545676354344, 0.004709039122996805, 0, -0.01037697306639778, 1, 0.2678545676354345, 0.001217630749695203],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001218346881737897],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217630598798033],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001223846317735749],
[212.4342254682689, 580.5759265779665, 0, 1, 0.2678833617957053, 0, 0.001722427600286848, 0.003795590639650948, 0.7321166382042947, 1, 0.001218178620355174],
[212.5990572033583, 580.2100762596108, 0, 1, 0.2681591927110266, 0, 0.001723513673610448, 0.00379798394183697, 0.7318408072889735, 1, 0.00121794724519727],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3228205089226, 580.8926542313473, 0, 1, 0.2676735732852987, 0, 0.001721488458695052, 0.003793521120424403, 0.7323264267147013, 1, 0.00121841858486513],
[212.2863746487568, 580.5227588142122, 0, 1, 0.2677647944360778, 0, 0.001722585350559934, 0.003795938262656891, 0.7322352055639223, 1, 0.001217844490277249],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001222522020192435],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001223309245299677],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001218523048407539],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001218018275071721],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001263486474380726],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 0, 0.267646659163985, 0, 0, 0, 1, 1, 8.985698541406007e-05],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001128836895128919],
[212.1927159260576, 580.5227588142122, 0, 1, 0.2676782814105927, 0, 0.001722585350559934, 0.003795938262656891, 0.7323217185894073, 1, 0.001217504234700311],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9342254682689, 580.8531166592738, 0, 1, 0.2673279632587439, 0, 0.001721605637155591, 0.003793779338225787, 0.7326720367412561, 1, 0.001218076591583205],
[212.0278841909682, 580.7812492720009, 1, 0, 0.2674387506925356, 0.004716360792900828, 0, -0.01039310730725046, 1, 0.2674387506925356, 0.00121750272527741],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001219097830485572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4342254682689, 580.5759265779665, 0, 1, 0.2678833617957053, 0, 0.001722427600286848, 0.003795590639650948, 0.7321166382042947, 1, 0.001217976340775563],
[211.9871666243831, 580.821966838586, 1, 0, 0.2673873920932631, 0.004717266690827022, 0, -0.01039510356978629, 1, 0.267387392093263, 0.001217084548127207],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001217819734851045],
[211.9342254682689, 580.8749079947002, 0, 1, 0.2673206154204429, 0, 0.001721541051673597, 0.003793637015813586, 0.7326793845795572, 1, 0.001219025446091727],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217146216123717],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5456304276153, 580.8571617580532, 0, 1, 0.2669672955645617, 0, 0.001721593647865763, 0.003793752918284397, 0.7330327044354383, 1, 0.001217243572881527],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001216798600210354],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8398014244999, 580.6065734320213, 0, 1, 0.2673238318023163, 0, 0.001722336683322243, 0.003795390292431837, 0.7326761681976837, 1, 0.001217425083487295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7096968416349, 580.3303367375855, 0, 1, 0.2672967121180997, 0, 0.001723156513963497, 0.003797196894641138, 0.7327032878819002, 1, 0.001216795685253905],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.001216424171127137],
[212.0626113431926, 580.9879146540806, 0, 1, 0.2674011357303125, 0, 0.001721206198575402, 0.003792899123965502, 0.7325988642696875, 1, 0.001218162666738059],
[211.9325067603276, 580.7116779596448, 0, 1, 0.2673740763457436, 0, 0.001722024953094697, 0.00379470335480173, 0.7326259236542565, 1, 0.001218153245180479],
[211.7676750252382, 580.8765096947342, 1, 0, 0.2671661246086755, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2671661246086755, 0.001218596754231379],
[211.6740163025389, 581.3305735762502, 0, 2, 0.2669265966479378, 0, 0.003440383304969371, 0.007581326882464292, 0.5373966147021753, 1, 0.002439747333598064],
[211.9325067603276, 580.3878110538425, 0, 1, 0.2674833675160581, 0, 0.001722985874193747, 0.003796820867972321, 0.7325166324839419, 1, 0.001218632116470422],
[211.5456304276153, 580.8571617580532, 0, 1, 0.2669672955645617, 0, 0.001721593647865763, 0.003793752918284397, 0.7330327044354383, 1, 0.001218412140920943],
[210.6066893318412, 578.5929234567021, 0.375, 2.375, 0.2668611158939718, 0.001780570224002399, 0.004104785772026001, 0.005121707743849688, 0.5857100638029249, 0.5741445604701796, 0.002458522660850012],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001216045124193253],
[211.7676750252382, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2674402864163682, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2674402864163683, 0.001217064217357372],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4339496606716, 580.3040107899075, 0, 1, 0.2670504134225726, 0, 0.001723234686313479, 0.003797369157463577, 0.7329495865774274, 1, 0.001217601893446473],
[211.4155258447502, 580.5809250636174, 0, 1, 0.2669399914636872, 0, 0.001722412771123034, 0.003795557961682159, 0.7330600085363128, 1, 0.001217293019279859],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.00121706756914155],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217422153216995],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217061384501477],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3388480376283, 579.6576028707394, 0, 1, 0.2681058075375081, 0, 0.001725156359629419, 0.003801603811651209, 0.731894192462492, 1, 0.00122290678671538],
[212.522119832852, 579.2158406177271, 0, 1, 0.2684248203937391, 0, 0.001726472119501275, 0.0038045032576731, 0.7315751796062608, 1, 0.001216117764563947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2181013886291, 579.7783495197385, 0, 1, 0.2679533489641638, 0, 0.001724797072585331, 0.003800812076462306, 0.7320466510358361, 1, 0.001216354490808608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6924401184602, 579.7870298743301, 0, 1, 0.2674642213024029, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.732535778697597, 1, 0.001217593904505291],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4693543921702, 580.0101156006201, 0, 1, 0.2671823621579174, 0, 0.001724107861402497, 0.003799293311021091, 0.7328176378420826, 1, 0.001217692335377494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.8070353680086, 577.7212111127176, 1, 0.75, 0.2673424018845992, 0.004743674698779797, 0.001298204022240183, -0.007592537559713787, 0.9506932672594722, 0.4198011665450574, 0.001219038078703268],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217458860622707],
[211.5087827957726, 580.8940093898957, 0, 1, 0.2669207944262442, 0, 0.001721484442661554, 0.003793512270578318, 0.7330792055737558, 1, 0.001217232695117563],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.001217417589180261],
[211.7094210340375, 580.2045555028318, 0, 1, 0.2673389121882494, 0, 0.001723530073171098, 0.003798020080377067, 0.7326610878117505, 1, 0.001218024619479528],
[211.4510066507774, 578.3278073719348, 0.5, 1, 0.2677344629868694, 0.00236461394967855, 0.001729123149973107, -0.001400385671098499, 0.7984483741714687, 0.3733819615012299, 0.001219072538285257],
[211.7676750252382, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673708803754644, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673708803754644, 0.001217223514366493],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.00121710225333722],
[212.1555924866176, 580.2471996990508, 0, 1, 0.2677370581966693, 0, 0.001723403405511749, 0.003797740951906244, 0.7322629418033306, 1, 0.00121690569883625],
[212.486596895646, 579.8778287293341, 5, 13, 0.2681677647605728, 0.02353089593907677, 0.02241851534225139, -0.002451273644440327, 0.6528798805568359, 0.5523602461676436, 0.0223915333839328],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217808758901748],
[211.8388480376283, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2674744915771569, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7325255084228431, 1, 0.001217792764471046],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.00121685062746136],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001216850032653743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673708803754644, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673708803754644, 0.001216792264096324],
[211.9325067603276, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2674710329538155, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.7325289670461845, 1, 0.001217011621172093],
[209.3856790492024, 570.7016465847905, 1.5, 3.5, 0.2684131278239015, 0.007163813718356178, 0.006132801650292762, -0.00227196763118343, 0.7350686809170076, 0.5982059077804347, 0.001843062825707023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0445892989482, 579.6933711516309, 0, 1, 0.2678216782460112, 0, 0.001725049913911175, 0.003801369244827195, 0.7321783217539888, 1, 0.001832719486570056],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.001217282333434924],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5444722910407, 580.9253658204652, 0, 1, 0.2669432477015926, 0, 0.001721391522622976, 0.003793307509328206, 0.7330567522984074, 1, 0.001220207483756515],
[211.8500323888292, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2673947779750389, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.732605222024961, 1, 0.001218028173877207],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.001217064655488159],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001218067528635478],
[211.6028432901488, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2672877612750302, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7327122387249698, 1, 0.001217241935933474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6028432901488, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2671661342791992, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.7328338657208008, 1, 0.00121698220558786],
[211.6028432901488, 580.0639441480402, 0, 0, 0.2672877612750302, 0, 0, 0, 1, 1, 6.217985283868001e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2674402864163682, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2674402864163682, 0.001155487545615488],
[211.7096968416349, 580.3303367375855, 0, 1, 0.2672967121180997, 0, 0.001723156513963497, 0.003797196894641138, 0.7327032878819002, 1, 0.001217421594938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.00121734301124422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4155258447502, 580.5373423927647, 0, 1, 0.2669546816785371, 0, 0.001722542077790142, 0.003795842905545829, 0.7330453183214629, 1, 0.001217419122449375],
[211.6740163025389, 580.3006432704024, 0, 1, 0.267273723652573, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327262763474269, 1, 0.001217345964371972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9693543921702, 579.6974330460187, 0, 1, 0.267750722596431, 0, 0.001725037826621903, 0.003801342608931431, 0.7322492774035689, 1, 0.001217241996151474],
[211.9509305762489, 579.8806885970295, 0, 1, 0.2676717188908658, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785743, 0.7323282811091342, 1, 0.001217064188390903],
[212.1927159260576, 579.9686837253068, 0, 1, 0.267865508240423, 0, 0.001724231028435381, 0.003799564725411485, 0.732134491759577, 1, 0.001217425059235694],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.0163139366734, 0, 1, 0.2677291423556867, 0, 0.001724089436748465, 0.003799252709927396, 0.7322708576443133, 1, 0.001217347321817673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369116, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200554, 0.732353340836015, 1, 0.001218543723808712],
[212.0278841909682, 580.781249272001, 1, 0, 0.2674387506925356, 0.004716360792900828, 0, -0.01039310730725046, 1, 0.2674387506925356, 0.001217722113192389],
[212.3582252404212, 580.3684338510495, 1, 0, 0.2678832896622917, 0.004709024097690827, 0, -0.01037693995620452, 1, 0.2678832896622917, 0.001218620196599205],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424759, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670013, 0.003797132484135448, 0.7323802825602562, 1, 0.00121734221859907],
[211.5214081569785, 580.4750427513892, 0, 1, 0.2670736818509444, 0, 0.001722726950085757, 0.003796250295415017, 0.7329263181490556, 1, 0.001217234675156762],
[211.3565764218891, 580.6398744864787, 1, 0, 0.2668655600406757, 0.00473134083135364, 0, -0.01042611774770301, 1, 0.2668655600406757, 0.001216728352391169],
[211.5214081569785, 580.4750427513892, 0, 1, 0.2670736818509444, 0, 0.001722726950085757, 0.003796250295415017, 0.7329263181490556, 1, 0.001217415607360073],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.726957458653, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673332149605168, 0.004723064138846299, 0, -0.01040787899177336, 1, 0.2673332149605168, 0.001217070335977566],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6383357634429, 579.7601523114573, 0, 1, 0.2683477302941845, 0, 0.001724851209613286, 0.003800931374362855, 0.7316522697058154, 1, 0.001217420029269724],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2854212618852, 579.9120482297487, 0, 1, 0.26797033496978, 0, 0.001724399420658047, 0.003799935799321375, 0.73202966503022, 1, 0.001217346172001632],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.622454599475, 564.5631697483454, 1.083333333333333, 5.833333333333333, 0.2650693375996821, 0.005320303870534553, 0.0103324723359718, 0.01104495754050798, 0.4415713333089734, 0.8564850138867113, 0.001230850980753629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2871399698266, 581.0697160973579, 0, 2, 0.2666565428846512, 0, 0.003441927783524174, 0.007584730339506419, 0.5377926260938913, 1, 0.002437056614794376],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217073443791808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.7847544656736, 0, 1, 0.2673494285119474, 0, 0.001721808281486327, 0.003794225891059005, 0.7326505714880526, 1, 0.001217219262806625],
[210.4533621784546, 576.7960853524447, 0.6875, 2.5625, 0.2673274180610897, 0.003266757028177256, 0.004442644575914924, 0.002591219374754512, 0.6605310225231791, 0.6361207390556856, 0.001225206048236728],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.7847544656736, 0, 0, 0.2673494285119474, 0, 0, 0, 1, 1, 5.60877542523093e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2674710329538155, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.7325289670461845, 1, 0.001161762945132698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 0, 0.2675927480700891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004640124403973308],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.0007529345071670884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.618359468037, 575.5585922843139, 1.25, 1.25, 0.267901976773268, 0.005934905215087375, 0.002171803213012457, -0.008292479017840065, 0.9069107102650538, 0.4365274468086806, 0.001221794146452634],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217740428281708],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8500323888292, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2673947779750389, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.732605222024961, 1, 0.001218235174820549],
[211.9325067603276, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2676243963926296, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7323756036073703, 1, 0.001217710239836125],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001218321054461217],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217720009095139],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4155258447502, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2670271433296357, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7329728566703643, 1, 0.001233463710533787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217719934193184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2675611072319028, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7324388927680971, 1, 0.001217969541370518],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.001217233056683109],
[210.9325067603276, 581.0639441480402, 1, 0, 0.2663301161493866, 0.004740852964575308, 0, -0.01044707895606571, 1, 0.2663301161493866, 0.001282170119375814],
[210.9325067603276, 581.0639441480402, 0, 0, 0.2663301161493866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001070079492586439],
[211.4325067603276, 580.5639441480402, 0, 1, 0.2669614321097379, 0, 0.001722463149976476, 0.003795668977962046, 0.7330385678902621, 1, 0.001109973333217276],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001218032444684842],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3388480376283, 579.6576028707394, 0, 1, 0.2681058075375081, 0, 0.001725156359629419, 0.003801603811651209, 0.731894192462492, 1, 0.00121804582575379],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217758065524903],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217624901718913],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217256429795094],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001216198262126884],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217509238906347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2006180578144, 580.7958328505533, 0, 1, 0.2666686420318944, 0, 0.001721775438869778, 0.003794153518131438, 0.7333313579681056, 1, 0.001218087286069161],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217953397068686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217595809507242],
[211.2224093932408, 580.7740415151269, 0, 1, 0.2666961564675985, 0, 0.00172184004193988, 0.003794295879301296, 0.7333038435324015, 1, 0.00121686352627865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217624266535419]
],
"NAMES": [
["epi_isl_425611_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1"],
["epi_isl_421827_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_423511_England_20200401_null_9"],
["epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29"],
["epi_isl_423876_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2"],
["epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5"],
["epi_isl_423410_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_421665_India_20200310_null_3"],
["epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2"],
["epi_isl_418738_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1"],
["epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1"],
["epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1"],
["epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1"],
["epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3"],
["epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1"],
["epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4"],
["epi_isl_423561_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1"],
["epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2"],
["epi_isl_423338_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_425280_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2"],
["epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4"],
["epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1"],
["epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1"],
["epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1"],
["epi_isl_429010_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1"],
["epi_isl_423060_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_1"],
["epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3"],
["epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5"],
["epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1"],
["Node50"],
["epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3"],
["epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2"],
["epi_isl_429020_California_20200331_null_1"],
["epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6"],
["epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1"],
["epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1"],
["epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1"],
["epi_isl_421663_India_20200310_null_1"],
["Node68"],
["epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2"],
["epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1"],
["epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1"],
["epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1"],
["epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1"],
["epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2"],
["epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3"],
["epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5"],
["epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2"],
["epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_421956_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1"],
["epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_425439_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2"],
["epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2"],
["Node835"],
["epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2"],
["epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1"],
["epi_isl_418925_USA_20200301_null_1"],
["epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115"],
["epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2"],
["Node815"],
["epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15"],
["Node814"],
["epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1"],
["epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1"],
["epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1"],
["Node806"],
["epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1"],
["epi_isl_423542_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18"],
["epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1"],
["Node798"],
["epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_4"],
["epi_isl_423726_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_421990_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_430199_Washington_20200317_null_3"],
["Node789"],
["epi_isl_424154_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_427346_Liege_20200330_null_3"],
["Node786"],
["epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1"],
["Node766"],
["epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1"],
["Node765"],
["epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3"],
["epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2"],
["epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2"],
["Node713"],
["epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3"],
["epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1"],
["Node703"],
["epi_isl_423505_England_20200330_null_7"],
["epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2"],
["epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2"],
["Node698"],
["epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4"],
["epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7"],
["Node695"],
["epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5"],
["Node691"],
["epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2"],
["epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_2"],
["Node686"],
["epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2"],
["epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_425639_England_20200330_null_3"],
["epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2"],
["Node679"],
["epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2"],
["epi_isl_421858_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1"],
["Node673"],
["epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1"],
["Node672"],
["epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1"],
["Node652"],
["epi_isl_425632_England_20200330_null_3"],
["epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1"],
["Node649"],
["epi_isl_430006_Amman_20200323_null_2"],
["epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11"],
["epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1"],
["Node644"],
["epi_isl_429004_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2"],
["Node641"],
["epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3"],
["Node638"],
["epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1"],
["epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_4"],
["Node635"],
["epi_isl_420669_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2"],
["Node632"],
["epi_isl_423922_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1"],
["Node629"],
["epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1"],
["epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_2"],
["Node626"],
["epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2"],
["epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1"],
["Node623"],
["epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2"],
["epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2"],
["Node620"],
["epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2"],
["Node617"],
["epi_isl_421854_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1"],
["Node614"],
["epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1"],
["epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1"],
["Node611"],
["epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1"],
["epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_5"],
["Node608"],
["epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2"],
["Node605"],
["epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1"],
["epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1"],
["Node599"],
["epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1"],
["epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9"],
["Node596"],
["epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423926_England_20200318_null_1"],
["Node457"],
["epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1"],
["Node456"],
["epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1"],
["epi_isl_423687_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_424013_England_20200321_null_9"],
["Node439"],
["epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2"],
["epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1"],
["epi_isl_420518_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1"],
["Node434"],
["epi_isl_423840_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1"],
["Node431"],
["epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423846_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423913_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_423957_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5"],
["epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["epi_isl_425627_England_20200329_null_4"],
["Node416"],
["epi_isl_423998_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424037_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_422006_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_1287"],
["epi_isl_423080_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6"],
["epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1"],
["epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1"],
["epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_421893_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423914_England_20200318_null_1"],
["Node395"],
["epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_418713_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_423047_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_423995_England_20200321_null_2"],
["epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6"],
["epi_isl_423341_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_422436_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423663_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420685_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_418698_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_424021_England_20200320_null_1"],
["Node352"],
["epi_isl_423647_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1"],
["epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1"],
["Node351"],
["epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_425585_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_430011_Amman_20200319_null_24"],
["Node450"],
["epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3"],
["Node448"],
["epi_isl_423619_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423558_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_424012_England_20200320_null_28"],
["Node591"],
["epi_isl_421775_England_20200325_null_1"],
["Node590"],
["epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1"],
["epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1"],
["epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2"],
["Node564"],
["epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1"],
["epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1"],
["epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1"],
["epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2"],
["epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1"],
["epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_427605_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2"],
["epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1"],
["Node548"],
["epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1"],
["epi_isl_424136_England_20200320_null_3"],
["epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2"],
["epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2"],
["epi_isl_430842_Nonthaburi_20200318_null_2695"],
["epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1"],
["epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2"],
["epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3"],
["epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1"],
["epi_isl_420704_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_7"],
["epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1"],
["epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1"],
["epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1"],
["epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1"],
["epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1"],
["epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1"],
["epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1"],
["epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1"],
["epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1"],
["epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1"],
["Node525"],
["epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_423863_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1"],
["epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_423633_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1"],
["epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1"],
["epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1"],
["epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1"],
["Node570"],
["epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1"],
["epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1"],
["epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1"],
["Node575"],
["epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_423562_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_423564_England_20200401_null_1"],
["Node586"],
["epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_81"],
["epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1"],
["epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1"],
["Node580"],
["epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2"],
["Node345"],
["epi_isl_423586_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2"],
["Node602"],
["epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1"],
["epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2"],
["epi_isl_425609_England_20200325_null_4"],
["epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1"],
["Node658"],
["epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_418730_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1"],
["epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1"],
["Node665"],
["epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1"],
["epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1"],
["Node709"],
["epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1"],
["epi_isl_423203_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_425602_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1"],
["epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_12"],
["Node732"],
["epi_isl_421932_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1"],
["Node729"],
["epi_isl_423155_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1"],
["Node723"],
["epi_isl_423363_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6"],
["Node726"],
["epi_isl_423340_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_423670_England_20200320_null_12"],
["epi_isl_423952_England_20200319_null_3"],
["Node761"],
["epi_isl_423567_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_421866_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_430466_West_Bengal_20200326_null_163"],
["epi_isl_423431_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1"],
["Node744"],
["epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6"],
["Node740"],
["epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_11"],
["epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_423319_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3"],
["epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2"],
["epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_3"],
["Node777"],
["epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2"],
["epi_isl_423960_England_20200319_null_2"],
["epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_3"],
["Node312"],
["epi_isl_418728_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_424103_England_20200313_null_3"],
["Node309"],
["epi_isl_423897_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5"],
["epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1"],
["Node223"],
["epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1"],
["epi_isl_427174_Washington_20200326_null_6"],
["epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5"],
["Node229"],
["epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1"],
["epi_isl_423364_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2"],
["Node295"],
["epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6"],
["epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["Node289"],
["epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1"],
["Node288"],
["epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1"],
["epi_isl_423919_England_20200320_null_1"],
["Node245"],
["epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1"],
["epi_isl_425325_England_20200329_null_1"],
["Node241"],
["epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1"],
["epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1"],
["Node254"],
["epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1"],
["Node250"],
["epi_isl_427420_Doha_20200323_null_31"],
["epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_423175_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17"],
["Node269"],
["epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1"],
["epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6"],
["epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_39"],
["Node259"],
["epi_isl_421872_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1"],
["epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2"],
["Node277"],
["epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2"],
["epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_421891_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_423517_England_20200330_null_1"],
["Node282"],
["epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2"],
["epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2"],
["epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_145"],
["Node301"],
["epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1"],
["Node300"],
["epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_423166_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_423309_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1"],
["epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1"],
["epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1"],
["epi_isl_423821_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423712_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_423575_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423239_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_421830_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26"],
["epi_isl_423291_England_20200326_null_1"],
["Node197"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2"],
["Node196"],
["epi_isl_420706_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_420671_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423659_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2"],
["Node120"],
["epi_isl_424122_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2"],
["Node117"],
["epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3"],
["epi_isl_424115_England_20200312_null_6"],
["epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1"],
["epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1"],
["epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1"],
["Node149"],
["epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2"],
["epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1"],
["epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_421963_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_423531_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423802_England_20200223_null_1"],
["epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1"],
["epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1"],
["epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1"],
["Node144"],
["epi_isl_430797_Buenos_Aires_20200327_null_6638"],
["epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1"],
["epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1"],
["Node164"],
["epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1"],
["epi_isl_413752_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2"],
["Node159"],
["epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1"],
["epi_isl_423572_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8"],
["epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1"],
["Node170"],
["epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2"],
["Node168"],
["epi_isl_423396_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8"],
["Node176"],
["epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7"],
["epi_isl_423290_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_421972_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1"],
["epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_429816_NB_20200314_null_32"],
["Node183"],
["epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["Node188"]
],
"RESOLVED": [
[211.8388480376283, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2674744915771568, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7325255084228433, 1, 0.001217897652581235],
[211.745189314929, 580.1887526914271, 0, 2, 0.2673773380371535, 0, 0.003447154035169135, 0.00759624705685394, 0.5367359648215272, 1, 0.002437102737976505],
[212.2854212618852, 579.9120482297487, 0, 1, 0.26797033496978, 0, 0.001724399420658047, 0.003799935799321375, 0.73202966503022, 1, 0.001217473771721971],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001218280102702086],
[212.0619337639183, 580.0169915159478, 0, 1, 0.2677282869115477, 0, 0.001724087422657004, 0.003799248271617947, 0.7322717130884524, 1, 0.001217327558340091],
[211.9325067603276, 580.3006432704024, 0, 1, 0.267512798160626, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.732487201839374, 1, 0.001217316208031233],
[212.0774900338375, 579.5950939687278, 1, 0, 0.2678853535152232, 0.004715257615697203, 0, -0.01039067631446605, 1, 0.2678853535152232, 0.001217327328720576],
[211.8388480376283, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2674744915771568, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7325255084228433, 1, 0.001217897427654838],
[211.6740163025389, 580.3006432704024, 0, 1, 0.267273723652573, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327262763474269, 1, 0.001217473622573932],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217897430552087],
[211.9325067603276, 580.4243493068568, 1, 0, 0.2674710329538155, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2674710329538155, 0.001217327557370237],
[211.726957458653, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673332149605168, 0.004723064138846299, 0, -0.01040787899177336, 1, 0.2673332149605168, 0.001217897649817929],
[211.9727219116753, 580.0237289966924, 1, 0, 0.2676435250038767, 0.004717588145217475, 0, -0.01039581193585943, 1, 0.2676435250038767, 0.001220085968485083],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.001217897427695961],
[211.8030797567368, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2675666069848333, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7324333930151667, 1, 0.001218348129672195],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217316211998557],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217473771721971],
[211.9509305762489, 579.8806885970293, 0, 1, 0.2676717188908659, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785744, 0.7323282811091341, 1, 0.001217897654062387],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217392582846086],
[211.7676750252382, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2674402864163682, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2674402864163682, 0.001217897651082689],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217473771721971],
[212.0973384954169, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2677451462758242, 0.004714816353160453, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2677451462758242, 0.001218044003452127],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217263196279518],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001218257061641727],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001218257061641727],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.00121750754768481],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217997187931941],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217404992308783],
[211.8971020288289, 580.5056901568395, 0, 2, 0.2674108472590783, 0, 0.003445271999762216, 0.00759209974989439, 0.5366868667136616, 1, 0.002437121930126864],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217897652581235],
[211.5261654830268, 580.4702854253409, 1, 0, 0.2670796886026702, 0.004727547524517677, 0, -0.01041775870845079, 1, 0.2670796886026703, 0.001217473772789045],
[211.726957458653, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673332149605168, 0.004723064138846299, 0, -0.01040787899177336, 1, 0.2673332149605168, 0.001217897649645231],
[211.6692058826898, 580.3272450256778, 0, 1, 0.2672602959772348, 0, 0.001723165694134786, 0.003797217124328708, 0.7327397040227652, 1, 0.001217392718420415],
[211.7669974459639, 580.4661525847661, 1, 0, 0.2673038832542537, 0.004722171122321209, 0, -0.01040591111506079, 1, 0.2673038832542537, 0.001217316208081588],
[211.921999988401, 580.0744509199667, 0, 1, 0.2675794818844711, 0, 0.0017239166427931, 0.003798871936233651, 0.732420518115529, 1, 0.001217473772824719],
[211.9325067603276, 579.8272450256778, 0, 1, 0.2676727457821171, 0, 0.001724651624391528, 0.003800491562669528, 0.7323272542178829, 1, 0.001218401602672358],
[212.0973384954169, 579.8991124129508, 1, 0, 0.2678008698803578, 0.004714816353160453, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2678008698803578, 0.001218044008522965],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217473772789045],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217897427695961],
[211.6740163025389, 580.3006432704024, 0, 1, 0.267273723652573, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327262763474269, 1, 0.001217473772963648],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217473767749674],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001218280038213345],
[212.8033555643341, 579.9139056616669, 0, 2, 0.2684479901891081, 0, 0.003448787795005624, 0.007599847256677599, 0.5351683430583553, 1, 0.002439937344879908],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3211018009812, 580.0357542662032, 0, 1, 0.2679614622820635, 0, 0.001724031652609224, 0.003799125375148282, 0.7320385377179366, 1, 0.001216805616304939],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217997113012974],
[211.9140829444063, 580.2471996990508, 0, 1, 0.2675138101135731, 0, 0.001723403405511749, 0.003797740951906244, 0.732486189886427, 1, 0.001218043775696917],
[212.3388480376283, 579.6576028707394, 0, 1, 0.2681058075375081, 0, 0.001725156359629419, 0.003801603811651209, 0.731894192462492, 1, 0.001222963397798959],
[212.1909972181162, 579.8054536902514, 0, 1, 0.2679191263732901, 0, 0.001724716443481797, 0.003800634399867592, 0.7320808736267099, 1, 0.001217316211998557],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217392409872878],
[212.097338495417, 579.8991124129507, 1, 0, 0.2678008698803578, 0.004714816353160452, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2678008698803578, 0.001218044008566111],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.0012174737718609],
[212.0731181151192, 580.0058071647469, 0, 1, 0.2677424071599774, 0, 0.001724120668529714, 0.003799321533172304, 0.7322575928400226, 1, 0.001216597525280365],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.001217014131885398],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9859335360706, 580.0323087077235, 0, 1, 0.2676528421056474, 0, 0.001724041893852325, 0.003799147943043993, 0.7323471578943526, 1, 0.001222501976214838],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217095359850455],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217822783121808],
[211.9325067603276, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2675611072319028, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7324388927680971, 1, 0.001218043775696917],
[211.9325067603276, 580.1576028707394, 1, 0, 0.2675611072319028, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675611072319029, 0.001220086486813655],
[211.9636565810153, 580.0327943273523, 0, 1, 0.2676320788280137, 0, 0.001724040450436379, 0.003799144762291401, 0.7323679211719863, 1, 0.001217316212857201],
[212.1740163025389, 580.0234531890951, 0, 1, 0.2678297072050664, 0, 0.001724068215693318, 0.00379920594660436, 0.7321702927949336, 1, 0.001217473771721971],
[212.0973384954169, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2677451462758242, 0.004714816353160453, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2677451462758242, 0.001218044008509641],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.0012174737718609],
[211.9509305762489, 579.8806885970295, 0, 1, 0.2676717188908658, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785743, 0.7323282811091342, 1, 0.001217897649645231],
[211.9325067603276, 580.0421528126137, 0, 1, 0.2676001109361359, 0, 0.00172401263451461, 0.003799083466331975, 0.7323998890638641, 1, 0.001217392410100946],
[211.9325067603276, 579.7860133607218, 0, 1, 0.2676866858286001, 0, 0.001724774273535013, 0.003800761835824053, 0.7323133141713999, 1, 0.001217316208081588],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217473772789045],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.00121828003798795],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217473772807214],
[212.4859335360706, 579.5323087077235, 1, 0, 0.2682841406961742, 0.004706193880030391, 0, -0.01037070320775812, 1, 0.2682841406961742, 0.001218043775710621],
[211.9325067603276, 579.8054536902515, 0, 1, 0.2676801130511874, 0, 0.001724716443481796, 0.003800634399867592, 0.7323198869488126, 1, 0.001217473772963648],
[212.3388480376283, 579.6576028707394, 1, 0, 0.2681058075375081, 0.004709453824590737, 0, -0.01037788691467095, 1, 0.268105807537508, 0.001221196680933042],
[211.9325067603276, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2675611072319028, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7324388927680971, 1, 0.001218044008506569],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001218401602827934],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7669974459639, 580.2294534624037, 1, 0, 0.2673837707266, 0.004722171122321209, 0, -0.01040591111506079, 1, 0.2673837707266, 0.001216208752295477],
[212.0626113431926, 580.0163139366734, 0, 1, 0.2677291423556867, 0, 0.001724089436748465, 0.003799252709927396, 0.7322708576443133, 1, 0.001217545565259481],
[211.9325067603276, 580.1098802665241, 0, 1, 0.2675772284812614, 0, 0.001723811357152826, 0.00379863992579057, 0.7324227715187386, 1, 0.001222536967958469],
[211.726957458653, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673332149605168, 0.004723064138846299, 0, -0.01040787899177336, 1, 0.2673332149605168, 0.001217270665346708],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.2370318614583, 1, 0, 0.2675342795041666, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675342795041666, 0.001255522160896516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2854212618852, 579.7247307843502, 0, 1, 0.2680337123374305, 0, 0.001724956599051812, 0.003801163613538726, 0.7319662876625694, 1, 0.001217926639959259],
[211.9325067603276, 579.8766267026416, 0, 1, 0.2676560522021802, 0, 0.001724504754892968, 0.003800167916849006, 0.7323439477978197, 1, 0.001216722516029851],
[211.9325067603276, 579.8766267026416, 0, 0, 0.2676560522021802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000523851504633947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2676243963926296, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7323756036073703, 1, 0.0006930897111784938],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001218304884929935],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.001216850641412117],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001222862752097698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0036797727177, 579.9927711356499, 0, 1, 0.2676826133874255, 0, 0.001724159420197528, 0.003799406927453957, 0.7323173866125745, 1, 0.001217638679613825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0973384954169, 579.8991124129507, 1, 0, 0.2678008698803578, 0.004714816353160453, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2678008698803578, 0.001217713111846857],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217598852754638],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.4533045097636, 0, 1, 0.2677992247803864, 0, 0.00172576459952374, 0.003802944146449122, 0.7322007752196136, 1, 0.001217258123437565],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.8054536902515, 0, 1, 0.2676801130511874, 0, 0.001724716443481796, 0.003800634399867592, 0.7323198869488126, 1, 0.001217102489812014],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001216850635880582],
[212.1958076379653, 579.8006432704024, 0, 1, 0.2679252001629435, 0, 0.001724730752900577, 0.003800665932511387, 0.7320747998370565, 1, 0.001217506276959511],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 0, 0.2675927480700891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002779824783096041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.0009400911252972383],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001216582388381528],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217405167895264],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5456304276153, 580.8571617580532, 0, 1, 0.2669672955645617, 0, 0.001721593647865763, 0.003793752918284397, 0.7330327044354383, 1, 0.001217244212499525],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217067301719715],
[212.5803575798396, 579.7774129284754, 1, 0, 0.2682883483851804, 0.00470410348060698, 0, -0.01036609674390251, 1, 0.2682883483851803, 0.001218161704974199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5456304276153, 580.2591989245857, 0, 1, 0.2680932589692798, 0, 0.001723367767117409, 0.003797662418122912, 0.7319067410307203, 1, 0.001217429001304443],
[212.1740163025389, 580.0234531890951, 0, 1, 0.2678297072050665, 0, 0.001724068215693318, 0.00379920594660436, 0.7321702927949335, 1, 0.001217881787410464],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5087827957726, 580.8940093898958, 0, 1, 0.2669207944262441, 0, 0.001721484442661553, 0.003793512270578317, 0.7330792055737558, 1, 0.001217234293885064],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.001217289489313755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6524839791014, 579.9152569495637, 0, 1, 0.26830827574427, 0, 0.001724389879411246, 0.003799914773957498, 0.73169172425573, 1, 0.001217532677304869],
[212.357547661147, 579.8038519902175, 1, 0, 0.2680735867142819, 0.004709039122996805, 0, -0.01037697306639778, 1, 0.2680735867142819, 0.001217844438946622],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.0163139366734, 0, 1, 0.2677291423556867, 0, 0.001724089436748465, 0.003799252709927396, 0.7322708576443133, 1, 0.001218096466695113],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0994589750352, 579.9736697404544, 0, 1, 0.2677776221483468, 0, 0.001724216205276203, 0.003799532060674681, 0.7322223778516532, 1, 0.001217238010171229],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9509305762489, 579.8806885970295, 0, 1, 0.2676717188908658, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785743, 0.7323282811091342, 1, 0.001217217756338545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217235148077795],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217326556099665],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217664531900969],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.8766267026416, 0, 1, 0.2676560522021802, 0, 0.001724504754892968, 0.003800167916849006, 0.7323439477978197, 1, 0.001219971259420407],
[211.9509305762489, 579.5997124289316, 0, 1, 0.267766734130316, 0, 0.001725328668313679, 0.003801983515987694, 0.732233265869684, 1, 0.00121899111862671],
[211.9325067603276, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2676243963926296, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7323756036073703, 1, 0.0009126324487251197],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 0, 0.2675927480700891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003027723987400084],
[211.8752938977941, 580.4024804838513, 0, 1, 0.267425517601018, 0, 0.001722942326446214, 0.003796724904912459, 0.7325744823989819, 1, 0.001217430460250177],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.745189314929, 580.4866489482323, 0, 1, 0.267276798391675, 0, 0.001722692506041047, 0.003796174393534631, 0.7327232016083249, 1, 0.001217359311137105],
[211.8388480376283, 580.0950939687278, 0, 1, 0.2674956038643032, 0, 0.001723855296135134, 0.003798736750986556, 0.7325043961356967, 1, 0.001217332545141702],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217234081858409],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217067883674408],
[212.0994589750352, 579.9736697404544, 0, 1, 0.2677776221483468, 0, 0.001724216205276203, 0.003799532060674681, 0.7322223778516532, 1, 0.001217238294588678],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9693543921702, 579.6974330460188, 0, 1, 0.267750722596431, 0, 0.001725037826621902, 0.00380134260893143, 0.732249277403569, 1, 0.001222294159995904],
[211.9509305762489, 579.8806885970295, 0, 1, 0.2676717188908658, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785743, 0.7323282811091342, 1, 0.00121706771030895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217295280119324],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.00121706807827042],
[211.5892130984681, 580.8135790872003, 0, 1, 0.2670222962173642, 0, 0.001721722831569448, 0.003794037591182358, 0.7329777037826357, 1, 0.001217235651602673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217062008250844],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7329478730138, 580.3401808424758, 0, 1, 0.267314898330641, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.732685101669359, 1, 0.001217356822640583],
[211.7676750252382, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2674402864163682, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2674402864163683, 0.001217061963692547],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217234918570841],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217061871990516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217341245740507],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.0012170670634288],
[212.3228205089226, 580.8007819943792, 0, 1, 0.2677045795116641, 0, 0.001721760767205161, 0.003794121187232375, 0.7322954204883358, 1, 0.001217421738301123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.2942447239918, 0, 1, 0.2676352324327104, 0, 0.001723263687503285, 0.003797433065313492, 0.7323647675672895, 1, 0.001217408439790616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2867764204338, 580.5990348496573, 0, 1, 0.2668147015812227, 0, 0.001722359046392394, 0.003795439572331743, 0.7331852984187773, 1, 0.001217240457169858],
[211.5445892989482, 580.1933711516309, 1, 0, 0.2671901561705566, 0.00472713579351742, 0, -0.01041685140626266, 1, 0.2671901561705565, 0.001217067260209532],
[211.7329478730138, 580.6698443126546, 0, 1, 0.2672036872674251, 0, 0.001722149014271115, 0.003794976739552345, 0.732796312732575, 1, 0.001217235154864674],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.001217067617052161],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217233490848747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217068165643257],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5892130984681, 580.8135790872003, 0, 1, 0.2670222962173642, 0, 0.001721722831569448, 0.003794037591182358, 0.7329777037826357, 1, 0.001217233686103671],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217069914771493],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.5456304276153, 580.2591989245857, 0, 1, 0.2680932589692798, 0, 0.001723367767117409, 0.003797662418122912, 0.7319067410307203, 1, 0.001217427080178357],
[212.1740163025389, 580.0234531890951, 0, 1, 0.2678297072050665, 0, 0.001724068215693318, 0.00379920594660436, 0.7321702927949335, 1, 0.001217342710897524],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001218652338047653],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001218025036467935],
[212.0626113431926, 580.1528633970772, 0, 1, 0.2676829954788726, 0, 0.001723683641143325, 0.00379835848714542, 0.7323170045211274, 1, 0.001217420958003433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2676243963926296, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7323756036073703, 1, 0.001217346391059749],
[211.8398014245, 580.6065734320212, 0, 1, 0.2673238318023163, 0, 0.001722336683322244, 0.003795390292431837, 0.7326761681976837, 1, 0.00121697831376745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0813109667113, 580.7496138316842, 0, 1, 0.2674987873620599, 0, 0.001721912466548493, 0.003794455476236739, 0.7325012126379401, 1, 0.001217430321264576],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.357547661147, 580.4515858018221, 1, 0, 0.2678545676354344, 0.004709039122996805, 0, -0.01037697306639778, 1, 0.2678545676354345, 0.001217232478461483],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.745189314929, 580.1262437894155, 0, 1, 0.2673984443217406, 0, 0.001723762733897275, 0.003798532778196323, 0.7326015556782594, 1, 0.001217242997739213],
[211.8752938977941, 580.4024804838513, 0, 1, 0.267425517601018, 0, 0.001722942326446214, 0.003796724904912459, 0.7325744823989819, 1, 0.001217364796578795],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0990572033583, 580.6475673575993, 0, 1, 0.2675496187963259, 0, 0.001722215085737433, 0.003795122336522031, 0.732450381203674, 1, 0.001218113008719748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217767260813654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.00121841859468068],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001218471504283918],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001223287353502627],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217594337305033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001223536375153864],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1380560620021, 579.8583948463656, 1, 0, 0.2678522811796615, 0.00471391139601905, 0, -0.0103877097463453, 1, 0.2678522811796615, 0.00121784455235879],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217811758117691],
[212.0626113431926, 580.0163139366734, 0, 1, 0.2677291423556867, 0, 0.001724089436748465, 0.003799252709927396, 0.7322708576443133, 1, 0.001216633057653888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217533350645644],
[211.9325067603276, 580.1098802665241, 0, 1, 0.2675772284812614, 0, 0.001723811357152826, 0.00379863992579057, 0.7324227715187386, 1, 0.001222805425816361],
[212.0309759028759, 579.9654750054917, 1, 1, 0.2677170783526749, 0.004716292021681141, 0.001724240567924377, -0.006593370014125349, 0.9283275659583079, 0.4637617226636574, 0.002438132810967043],
[212.0261654830268, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2677110045630214, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7322889954369786, 1, 0.00121722458915581],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.00121782264313846],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9950156623391, 580.2599257038172, 0, 2, 0.2675843400822178, 0, 0.003446731217176736, 0.007595315323053368, 0.5364326988928004, 1, 0.002446217442124041],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217156174227643],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217899412093202],
[211.4325067603276, 580.5639441480402, 0, 1, 0.2669614321097379, 0, 0.001722463149976476, 0.003795668977962046, 0.7330385678902621, 1, 0.001217822994668498],
[212.1555924866176, 579.8408584217501, 0, 1, 0.267874423229156, 0, 0.001724611133340736, 0.003800402335433882, 0.732125576770844, 1, 0.001217224383139918],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217822643212102],
[211.9325067603276, 579.8272450256778, 0, 1, 0.2676727457821171, 0, 0.001724651624391528, 0.003800491562669528, 0.7323272542178829, 1, 0.001218412142112674],
[212.097338495417, 579.8991124129508, 1, 0, 0.2678008698803578, 0.004714816353160452, 0, -0.01038970393574091, 1, 0.2678008698803578, 0.001217844421512836],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.001218418020933395],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217811758237389],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001220867455367543],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217630748726005],
[212.1909972181162, 579.8054536902514, 0, 1, 0.2679191263732901, 0, 0.001724716443481797, 0.003800634399867592, 0.7320808736267099, 1, 0.001223846314604352],
[212.0626113431926, 580.3401808424759, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670013, 0.003797132484135448, 0.7323802825602562, 1, 0.001217806600312385],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 1, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0.001723947868314302, -0.006598843842492102, 0.9283941211802977, 0.4635796173204761, 0.002437745129227432],
[212.2854212618852, 579.9120482297487, 0, 1, 0.26797033496978, 0, 0.001724399420658047, 0.003799935799321375, 0.73202966503022, 1, 0.001218197697096023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001218058286176106],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9342254682689, 580.8749079947002, 0, 1, 0.2673206154204429, 0, 0.001721541051673597, 0.003793637015813586, 0.7326793845795572, 1, 0.001217693909965423],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001216893507886091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217002533068295],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001217844227730518],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217783166019886],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001169327375542395],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 0, 0.267646659163985, 0, 0, 0, 1, 1, 4.742660332815148e-05],
[211.9342254682689, 580.8749079947002, 0, 1, 0.2673206154204429, 0, 0.001721541051673597, 0.003793637015813586, 0.7326793845795572, 1, 0.00121819545983808],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.00121761455913181],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.9248669830076, 579.8842664799615, 1, 0, 0.2685701488490142, 0.00469649230815208, 0, -0.01034932454696269, 1, 0.2685701488490142, 0.001218475131209735],
[212.4560168036953, 580.3531166592738, 0, 1, 0.2679787704711386, 0, 0.001723088876917502, 0.003797047847715375, 0.7320212295288614, 1, 0.001216915647161083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.3579270791229, 0, 1, 0.2677339521440154, 0, 0.001723074594729651, 0.003797016375078435, 0.7322660478559846, 1, 0.001217820985199736],
[212.5990572033583, 580.2100762596108, 0, 1, 0.2681591927110266, 0, 0.001723513673610448, 0.00379798394183697, 0.7318408072889735, 1, 0.00121782287929774],
[211.9560168036953, 580.8531166592738, 0, 1, 0.2673481016520043, 0, 0.001721605637155591, 0.003793779338225787, 0.7326518983479957, 1, 0.001217822994787602],
[212.4696301997676, 580.3395032632015, 0, 1, 0.2679959415599892, 0, 0.001723129296518817, 0.003797136917502915, 0.7320040584400107, 1, 0.001217897183916132],
[212.4696301997676, 580.3395032632015, 0, 1, 0.2679959415599892, 0, 0.001723129296518817, 0.003797136917502915, 0.7320040584400107, 1, 0.001216510928316015],
[212.0278841909682, 580.7812492720009, 1, 0, 0.2674387506925356, 0.004716360792900828, 0, -0.01039310730725046, 1, 0.2674387506925356, 0.001217699437424843],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217811758144707],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217731858115649],
[211.9148670745486, 578.4334726357545, 1, 3, 0.2681284396095835, 0.004718876093050207, 0.005186421847839935, 0.001030297174866967, 0.7073492524636442, 0.7130940959564001, 0.003678917930123103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.8749079947002, 0, 1, 0.2675594230880614, 0, 0.001721541051673597, 0.003793637015813586, 0.7324405769119386, 1, 0.00121826306440502],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001217536041161586],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001217877444470828],
[212.2111397419789, 580.3395032632015, 0, 1, 0.2677571983757658, 0, 0.001723129296518817, 0.003797136917502915, 0.7322428016242342, 1, 0.001217399639946888],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217623367234297],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.5227588142122, 0, 1, 0.2676782814105927, 0, 0.001722585350559934, 0.003795938262656891, 0.7323217185894073, 1, 0.001217822859301468],
[212.0272066116939, 580.7819268512752, 1, 0, 0.2674378960362941, 0.004716375865062437, 0, -0.01039314052069613, 1, 0.2674378960362941, 0.001217224382513803],
[212.2863746487569, 580.5227588142122, 0, 1, 0.2677647944360778, 0, 0.001722585350559934, 0.003795938262656891, 0.7322352055639223, 1, 0.001217699610547633],
[212.3333272808492, 580.5582805536183, 0, 1, 0.2677961592515407, 0, 0.001722479953341469, 0.003795706006336924, 0.7322038407484592, 1, 0.001217607862291894],
[212.1927159260576, 580.3579270791229, 0, 1, 0.2677339521440154, 0, 0.001723074594729651, 0.003797016375078435, 0.7322660478559846, 1, 0.00121773210682981],
[212.0990572033583, 580.7100762596108, 0, 1, 0.2675285238918922, 0, 0.001722029702740929, 0.003794713821257782, 0.7324714761081077, 1, 0.001217269503658216],
[212.4696301997676, 580.3395032632015, 0, 1, 0.2679959415599892, 0, 0.001723129296518817, 0.003797136917502915, 0.7320040584400107, 1, 0.001217185488931094],
[212.1927159260576, 580.9768226957283, 0, 1, 0.2675250442607319, 0, 0.001721239059692618, 0.003792971537661667, 0.732474955739268, 1, 0.001217428075992308],
[212.1927159260576, 580.5539086349, 0, 1, 0.2676677633835087, 0, 0.001722492924647386, 0.003795734590277005, 0.7323322366164913, 1, 0.001217610300545855],
[212.5990572033583, 580.2100762596108, 1, 0, 0.2681591927110266, 0.004703689720709652, 0, -0.01036518497077886, 1, 0.2681591927110265, 0.001218126487627359],
[211.9342254682689, 580.8749079947002, 1, 1, 0.2673206154204429, 0.004718445063747956, 0.001721541051673597, -0.0066040632501868, 0.9285396885712358, 0.4631809194121214, 0.002438379446400581],
[212.3041208854039, 580.4225382060667, 0, 1, 0.2678150387029014, 0, 0.001722882786548463, 0.003796593701093761, 0.7321849612970986, 1, 0.001222157496831322],
[212.3982652277321, 580.410868235237, 1, 0, 0.2679059262347069, 0.004708136382035918, 0, -0.01037498376064084, 1, 0.267905926234707, 0.001217630749695203],
[212.357547661147, 580.4515858018221, 1, 0, 0.2678545676354344, 0.004709039122996805, 0, -0.01037697306639778, 1, 0.2678545676354345, 0.001217630749695203],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001218346881737897],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001217630598798033],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001223846317735749],
[212.4342254682689, 580.5759265779665, 0, 1, 0.2678833617957053, 0, 0.001722427600286848, 0.003795590639650948, 0.7321166382042947, 1, 0.001218178620355174],
[212.5990572033583, 580.2100762596108, 0, 1, 0.2681591927110266, 0, 0.001723513673610448, 0.00379798394183697, 0.7318408072889735, 1, 0.00121794724519727],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3228205089226, 580.8926542313473, 0, 1, 0.2676735732852987, 0, 0.001721488458695052, 0.003793521120424403, 0.7323264267147013, 1, 0.00121841858486513],
[212.2863746487568, 580.5227588142122, 0, 1, 0.2677647944360778, 0, 0.001722585350559934, 0.003795938262656891, 0.7322352055639223, 1, 0.001217844490277249],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001222522020192435],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001223309245299677],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001218523048407539],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001218018275071721],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001263486474380726],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 0, 0.267646659163985, 0, 0, 0, 1, 1, 8.985698541406007e-05],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 1, 0, 0.267646659163985, 0.004712697114204751, 0, -0.0103850339202685, 1, 0.267646659163985, 0.001128836895128919],
[212.1927159260576, 580.5227588142122, 0, 1, 0.2676782814105927, 0, 0.001722585350559934, 0.003795938262656891, 0.7323217185894073, 1, 0.001217504234700311],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9342254682689, 580.8531166592738, 0, 1, 0.2673279632587439, 0, 0.001721605637155591, 0.003793779338225787, 0.7326720367412561, 1, 0.001218076591583205],
[212.0278841909682, 580.7812492720009, 1, 0, 0.2674387506925356, 0.004716360792900828, 0, -0.01039310730725046, 1, 0.2674387506925356, 0.00121750272527741],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001219097830485572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.4342254682689, 580.5759265779665, 0, 1, 0.2678833617957053, 0, 0.001722427600286848, 0.003795590639650948, 0.7321166382042947, 1, 0.001217976340775563],
[211.9871666243831, 580.821966838586, 1, 0, 0.2673873920932631, 0.004717266690827022, 0, -0.01039510356978629, 1, 0.267387392093263, 0.001217084548127207],
[212.1927159260576, 580.6164175369115, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200555, 0.732353340836015, 1, 0.001217819734851045],
[211.9342254682689, 580.8749079947002, 0, 1, 0.2673206154204429, 0, 0.001721541051673597, 0.003793637015813586, 0.7326793845795572, 1, 0.001219025446091727],
[212.0626113431926, 580.3401808424758, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670014, 0.003797132484135449, 0.7323802825602562, 1, 0.001217146216123717],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5456304276153, 580.8571617580532, 0, 1, 0.2669672955645617, 0, 0.001721593647865763, 0.003793752918284397, 0.7330327044354383, 1, 0.001217243572881527],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001216798600210354],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8398014244999, 580.6065734320213, 0, 1, 0.2673238318023163, 0, 0.001722336683322243, 0.003795390292431837, 0.7326761681976837, 1, 0.001217425083487295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7096968416349, 580.3303367375855, 0, 1, 0.2672967121180997, 0, 0.001723156513963497, 0.003797196894641138, 0.7327032878819002, 1, 0.001216795685253905],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.001216424171127137],
[212.0626113431926, 580.9879146540806, 0, 1, 0.2674011357303125, 0, 0.001721206198575402, 0.003792899123965502, 0.7325988642696875, 1, 0.001218162666738059],
[211.9325067603276, 580.7116779596448, 0, 1, 0.2673740763457436, 0, 0.001722024953094697, 0.00379470335480173, 0.7326259236542565, 1, 0.001218153245180479],
[211.7676750252382, 580.8765096947342, 1, 0, 0.2671661246086755, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2671661246086755, 0.001218596754231379],
[211.6740163025389, 581.3305735762502, 0, 2, 0.2669265966479378, 0, 0.003440383304969371, 0.007581326882464292, 0.5373966147021753, 1, 0.002439747333598064],
[211.9325067603276, 580.3878110538425, 0, 1, 0.2674833675160581, 0, 0.001722985874193747, 0.003796820867972321, 0.7325166324839419, 1, 0.001218632116470422],
[211.5456304276153, 580.8571617580532, 0, 1, 0.2669672955645617, 0, 0.001721593647865763, 0.003793752918284397, 0.7330327044354383, 1, 0.001218412140920943],
[210.6066893318412, 578.5929234567021, 0.375, 2.375, 0.2668611158939718, 0.001780570224002399, 0.004104785772026001, 0.005121707743849688, 0.5857100638029249, 0.5741445604701796, 0.002458522660850012],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001216045124193253],
[211.7676750252382, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2674402864163682, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2674402864163683, 0.001217064217357372],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4339496606716, 580.3040107899075, 0, 1, 0.2670504134225726, 0, 0.001723234686313479, 0.003797369157463577, 0.7329495865774274, 1, 0.001217601893446473],
[211.4155258447502, 580.5809250636174, 0, 1, 0.2669399914636872, 0, 0.001722412771123034, 0.003795557961682159, 0.7330600085363128, 1, 0.001217293019279859],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.00121706756914155],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217422153216995],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217061384501477],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3388480376283, 579.6576028707394, 0, 1, 0.2681058075375081, 0, 0.001725156359629419, 0.003801603811651209, 0.731894192462492, 1, 0.00122290678671538],
[212.522119832852, 579.2158406177271, 0, 1, 0.2684248203937391, 0, 0.001726472119501275, 0.0038045032576731, 0.7315751796062608, 1, 0.001216117764563947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2181013886291, 579.7783495197385, 0, 1, 0.2679533489641638, 0, 0.001724797072585331, 0.003800812076462306, 0.7320466510358361, 1, 0.001216354490808608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6924401184602, 579.7870298743301, 0, 1, 0.2674642213024029, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.732535778697597, 1, 0.001217593904505291],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4693543921702, 580.0101156006201, 0, 1, 0.2671823621579174, 0, 0.001724107861402497, 0.003799293311021091, 0.7328176378420826, 1, 0.001217692335377494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.8072089641977, 577.7210375165284, 1, 0, 0.2673426220367496, 0.004743670792443509, 0, -0.01045328840201218, 1, 0.2673426220367496, 0.001219038078703268],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9509305762489, 579.7870298743302, 0, 1, 0.2677033831441243, 0, 0.001724771249568573, 0.003800755172125265, 0.7322966168558758, 1, 0.001217458860622707],
[211.5087827957726, 580.8940093898957, 0, 1, 0.2669207944262442, 0, 0.001721484442661554, 0.003793512270578318, 0.7330792055737558, 1, 0.001217232695117563],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.001217417589180261],
[211.7094210340375, 580.2045555028318, 0, 1, 0.2673389121882494, 0, 0.001723530073171098, 0.003798020080377067, 0.7326610878117505, 1, 0.001218024619479528],
[211.4507852501875, 578.3278073719348, 0, 1, 0.2677342577090568, 0, 0.001729123149973107, 0.003810345144114445, 0.7322657422909431, 1, 0.001219072538285257],
[211.7676750252382, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673708803754644, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673708803754644, 0.001217223514366493],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.00121710225333722],
[212.1555924866176, 580.2471996990508, 0, 1, 0.2677370581966693, 0, 0.001723403405511749, 0.003797740951906244, 0.7322629418033306, 1, 0.00121690569883625],
[212.486596895646, 579.8778287293341, 5, 13, 0.2681677647605728, 0.02353089593907677, 0.02241851534225139, -0.002451273644440327, 0.6528798805568359, 0.5523602461676436, 0.0223915333839328],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217808758901748],
[211.8388480376283, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2674744915771569, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7325255084228431, 1, 0.001217792764471046],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.00121685062746136],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001216850032653743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673708803754644, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673708803754644, 0.001216792264096324],
[211.9325067603276, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2674710329538155, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.7325289670461845, 1, 0.001217011621172093],
[209.384464014171, 570.703079827833, 1, 2, 0.268411495180314, 0.004775903526119877, 0.003504449284912481, -0.002801812869154905, 0.8225410755634252, 0.6084379272052571, 0.001843062825707023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0445892989482, 579.6933711516309, 0, 1, 0.2678216782460112, 0, 0.001725049913911175, 0.003801369244827195, 0.7321783217539888, 1, 0.001832719486570056],
[211.7676750252382, 580.2287758831295, 1, 0, 0.2673846262598205, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2673846262598205, 0.001217282333434924],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5444722910407, 580.9253658204652, 0, 1, 0.2669432477015926, 0, 0.001721391522622976, 0.003793307509328206, 0.7330567522984074, 1, 0.001220207483756515],
[211.8500323888292, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2673947779750389, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.732605222024961, 1, 0.001218028173877207],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.001217064655488159],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001218067528635478],
[211.6028432901488, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2672877612750302, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7327122387249698, 1, 0.001217241935933474],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6028432901488, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2671661342791992, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.7328338657208008, 1, 0.00121698220558786],
[211.6028432901488, 580.0639441480402, 0, 0, 0.2672877612750302, 0, 0, 0, 1, 1, 6.217985283868001e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7676750252382, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2674402864163682, 0.004722156013097001, 0, -0.01040587781994292, 1, 0.2674402864163682, 0.001155487545615488],
[211.7096968416349, 580.3303367375855, 0, 1, 0.2672967121180997, 0, 0.001723156513963497, 0.003797196894641138, 0.7327032878819002, 1, 0.001217421594938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8211018009812, 580.1971404428128, 0, 1, 0.2674447260215754, 0, 0.001723552100302992, 0.003798068619993839, 0.7325552739784246, 1, 0.00121734301124422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4155258447502, 580.5373423927647, 0, 1, 0.2669546816785371, 0, 0.001722542077790142, 0.003795842905545829, 0.7330453183214629, 1, 0.001217419122449375],
[211.6740163025389, 580.3006432704024, 0, 1, 0.267273723652573, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327262763474269, 1, 0.001217345964371972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9693543921702, 579.6974330460187, 0, 1, 0.267750722596431, 0, 0.001725037826621903, 0.003801342608931431, 0.7322492774035689, 1, 0.001217241996151474],
[211.9509305762489, 579.8806885970295, 0, 1, 0.2676717188908658, 0, 0.001724492675242234, 0.003800141297785743, 0.7323282811091342, 1, 0.001217064188390903],
[212.1927159260576, 579.9686837253068, 0, 1, 0.267865508240423, 0, 0.001724231028435381, 0.003799564725411485, 0.732134491759577, 1, 0.001217425059235694],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.0163139366734, 0, 1, 0.2677291423556867, 0, 0.001724089436748465, 0.003799252709927396, 0.7322708576443133, 1, 0.001217347321817673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1927159260576, 580.6164175369116, 0, 1, 0.267646659163985, 0, 0.001722307481834902, 0.003795325943200554, 0.732353340836015, 1, 0.001218543723808712],
[212.0278841909682, 580.781249272001, 1, 0, 0.2674387506925356, 0.004716360792900828, 0, -0.01039310730725046, 1, 0.2674387506925356, 0.001217722113192389],
[212.3582252404212, 580.3684338510495, 1, 0, 0.2678832896622917, 0.004709024097690827, 0, -0.01037693995620452, 1, 0.2678832896622917, 0.001218620196599205],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0626113431926, 580.3401808424759, 0, 1, 0.2676197174397438, 0, 0.001723127284670013, 0.003797132484135448, 0.7323802825602562, 1, 0.00121734221859907],
[211.5214081569785, 580.4750427513892, 0, 1, 0.2670736818509444, 0, 0.001722726950085757, 0.003796250295415017, 0.7329263181490556, 1, 0.001217234675156762],
[211.3565764218891, 580.6398744864787, 1, 0, 0.2668655600406757, 0.00473134083135364, 0, -0.01042611774770301, 1, 0.2668655600406757, 0.001216728352391169],
[211.5214081569785, 580.4750427513892, 0, 1, 0.2670736818509444, 0, 0.001722726950085757, 0.003796250295415017, 0.7329263181490556, 1, 0.001217415607360073],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.726957458653, 580.2694934497147, 1, 0, 0.2673332149605168, 0.004723064138846299, 0, -0.01040787899177336, 1, 0.2673332149605168, 0.001217070335977566],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.6383357634429, 579.7601523114573, 0, 1, 0.2683477302941845, 0, 0.001724851209613286, 0.003800931374362855, 0.7316522697058154, 1, 0.001217420029269724],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.2854212618852, 579.9120482297487, 0, 1, 0.26797033496978, 0, 0.001724399420658047, 0.003799935799321375, 0.73202966503022, 1, 0.001217346172001632],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[203.624033928776, 564.5621918137908, 0, 1, 0.2650711860030332, 0, 0.001771284040093548, 0.003903252085383761, 0.7349288139969667, 1, 0.001230850980753629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2871399698266, 581.0697160973579, 0, 2, 0.2666565428846512, 0, 0.003441927783524174, 0.007584730339506419, 0.5377926260938913, 1, 0.002437056614794376],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217073443791808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.7847544656736, 0, 1, 0.2673494285119474, 0, 0.001721808281486327, 0.003794225891059005, 0.7326505714880526, 1, 0.001217219262806625],
[210.4534916776933, 576.7955540617961, 0, 1, 0.2673277189939395, 0, 0.001733716553392267, 0.003820467299042176, 0.7326722810060604, 1, 0.001225206048236728],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.7847544656736, 0, 0, 0.2673494285119474, 0, 0, 0, 1, 1, 5.60877542523093e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2674710329538155, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.7325289670461845, 1, 0.001161762945132698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 0, 0.2675927480700891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004640124403973308],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.0007529345071670884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.6183122626085, 575.5591246636471, 1, 1, 0.2679017513986028, 0.004747925236211913, 0.0017374409633144, -0.006633989100687451, 0.9282286515975613, 0.4640321543947669, 0.001221794146452634],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001217740428281708],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8500323888292, 580.4243493068568, 0, 1, 0.2673947779750389, 0, 0.001722877410629311, 0.003796581854564821, 0.732605222024961, 1, 0.001218235174820549],
[211.9325067603276, 579.9702854253409, 0, 1, 0.2676243963926296, 0, 0.001724226266638154, 0.003799554232179154, 0.7323756036073703, 1, 0.001217710239836125],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 0, 1, 0.2675927480700891, 0, 0.001723947868314302, 0.003798940745683738, 0.7324072519299109, 1, 0.001218321054461217],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217720009095139],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4155258447502, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2670271433296357, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7329728566703643, 1, 0.001233463710533787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6740163025389, 580.3224346058288, 0, 1, 0.2672663697668882, 0, 0.001723179977832889, 0.003797248600293683, 0.7327336302331118, 1, 0.001217719934193184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.1576028707394, 0, 1, 0.2675611072319028, 0, 0.001723669559877857, 0.00379832745726678, 0.7324388927680971, 1, 0.001217969541370518],
[211.6555924866176, 580.3408584217501, 0, 1, 0.2672431072688048, 0, 0.001723125272825908, 0.003797128050778335, 0.7327568927311952, 1, 0.001217233056683109],
[210.9325067603276, 581.0639441480402, 1, 0, 0.2663301161493866, 0.004740852964575308, 0, -0.01044707895606571, 1, 0.2663301161493866, 0.001282170119375814],
[210.9325067603276, 581.0639441480402, 0, 0, 0.2663301161493866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001070079492586439],
[211.4325067603276, 580.5639441480402, 0, 1, 0.2669614321097379, 0, 0.001722463149976476, 0.003795668977962046, 0.7330385678902621, 1, 0.001109973333217276],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001218032444684842],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3388480376283, 579.6576028707394, 0, 1, 0.2681058075375081, 0, 0.001725156359629419, 0.003801603811651209, 0.731894192462492, 1, 0.00121804582575379],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217758065524903],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217624901718913],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217256429795094],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001216198262126884],
[211.9325067603276, 580.0639441480402, 1, 0, 0.2675927480700891, 0.004718483328897206, 0, -0.01039778458817584, 1, 0.2675927480700891, 0.001217509238906347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2006180578144, 580.7958328505533, 0, 1, 0.2666686420318944, 0, 0.001721775438869778, 0.003794153518131438, 0.7333313579681056, 1, 0.001218087286069161],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217953397068686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217595809507242],
[211.2224093932408, 580.7740415151269, 0, 1, 0.2666961564675985, 0, 0.00172184004193988, 0.003794295879301296, 0.7333038435324015, 1, 0.00121686352627865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6958076379653, 580.3006432704024, 0, 1, 0.2672938842025923, 0, 0.001723244686347919, 0.003797391193824995, 0.7327061157974077, 1, 0.001217624266535419]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.000969905845098989, 2.999030094154901, 0, 0.75, 0.0003233019483663297, 0, 0.25008085162658, 0.5510853050843513, 0.9997575137382659, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.7061819387615864, 2.250301768305659, 0.25, 0.5, 0.2388587283851804, 0.3540164174099648, 0.2221924219419112, -0.2904911203214616, 0.8765932898695917, 0.1851100651956123, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.001414646914318331, 2.998585353085681, 0, 1, 0.0004715489714394438, 0, 0.3334905904782581, 0.734889387176647, 0.9995284510285606, 1, 0.4537969880875369],
[0.8350512570032101, 2, 0, 0, 0.2945453825360113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9365974229430001, 2.063402577057002, 2, 0, 0.3121991409809998, 2.135389176830691, 0, -4.705604560819116, 0.9999999999999999, 0.09746830362927428, 0.4537969880875369],
[0.8132917922218917, 2.184329833925011, 1.25, 2.5, 0.2713123581468435, 1.536963746535586, 1.144515796640365, -0.8648095077694046, 0.7857736022313397, 0.5883184853953327, 0.4537969880875369],
[0.9986574757791179, 2.001120760198727, 0, 2, 0.3329104344453592, 0, 0.9994399337506168, 2.202394374547559, 0.4450084884718793, 1, 0.4537969880875369],
[0.526438424419553, 2.473561575580448, 1, 0, 0.1754794748065176, 1.899557390976148, 0, -4.185918903916845, 1, 0.1754794748065176, 0.4537969880875369],
[1, 1.281153366467139, 1, 1, 0.4383747338955632, 1, 0.780546674718237, -0.4835936135376701, 0.8078275926819942, 0.6845770604731205, 0.4537969880875369],
[1.002774380372693, 2.005548760745385, 0, 0.75, 0.3333333333333334, 0, 0.3739624858192198, 0.8263607071972523, 0.7377879464668811, 1, 0.4525414659266404],
[1.004467385835137, 1.995508525462091, 0, 7, 0.3348251504462222, 0, 3.507877771847175, 7.751505742494374, 0.057617013099097, 1, 0.4525414659266404],
[0.9989527377125207, 2.009370403405558, 0, 2, 0.3320629768985682, 0, 0.9953366470464198, 2.199437448253128, 0.4461398668296027, 1, 0.4525414659266404],
[0.7068881597585228, 2.257907260179528, 0, 1, 0.2384272975480019, 0, 0.4428879864270818, 0.9786682984292019, 0.761572702451998, 1, 0.4525414659266404],
[0.2241278986565789, 2.619232490913711, 0, 2, 0.07882500560910283, 0, 0.763582464305147, 1.687320437568318, 0.8485633702910693, 1, 0.4525414659266404],
[0.5553650784717465, 1.638144913554275, 0, 1, 0.2531855703829218, 0, 0.6104466044034559, 1.348929656983992, 0.7468144296170782, 1, 0.4525414659266404],
[1.002774380372693, 2.005548760745385, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525414659266404],
[0.5549202708864276, 1.730592750600517, 1, 0, 0.2427989977171072, 1.802060678739675, 0, -3.982089630283293, 1, 0.2427989977171072, 0.4525414659266404],
[0.9397489983959904, 2.06857414272209, 1, 0, 0.3123829968766989, 1.064113930109901, 0, -2.351417516914129, 1, 0.3123829968766989, 0.4525414659266404],
[0.2242339807021795, 2.611702145119646, 0, 2, 0.07906876980072984, 0, 0.7657841089334392, 1.687503727516412, 0.8481143307563411, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830662898511396, 2.51644853624406, 0.25, 0.5, 0.1610481420690294, 0.5175273150959039, 0.1986927182489804, -0.7025930211449987, 0.9177351012359368, 0.1233973481460948, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 3.75, 0.3333333333333333, 1, 1.875, 1.928174983460255, 0.4918586309779209, 0.8542641093398753, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.000148256016917, 1.811459292337691, 0, 2, 0.355721144866828, 0, 1.104082221698174, 2.432987108070444, 0.4150952431717108, 1, 0.4537969880875369],
[0.4834615120117139, 2.51445846404874, 1, 2, 0.1612656494744157, 2.068416978714473, 0.7953998956815667, -2.805256792024681, 0.9303681165067113, 0.4099710921259955, 0.4537969880875369],
[0.4834613619045548, 2.516538638095445, 1, 0, 0.1611537873015183, 2.068417620925456, 0, -4.558024128019246, 1, 0.1611537873015183, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.998743642121818, 2.000417850270611, 1, 1, 0.3330076238492649, 1.001257938298874, 0.4998955592526445, -1.104816453628638, 0.8891059224582665, 0.5551211701567962, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -1.101814276263003, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4537969880875369],
[0.9980953693087663, 2.001904630691234, 0, 1, 0.3326984564362554, 0, 0.4995242953480316, 1.100765999909356, 0.6673015435637446, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9986581852385129, 2.001341814761488, 2, 1, 0.3328860617461709, 2.002687235294961, 0.4996647712170928, -3.312103216929983, 0.9631118535296221, 0.2586630973738703, 0.4537969880875369],
[0.4469146331717945, 2.553085366828208, 0, 1, 0.148971544390598, 0, 0.3916829468347691, 0.8631237251826228, 0.851028455609402, 1, 0.4537969880875369],
[1.001090580705227, 1.998909419294773, 4, 1, 0.3336968602350757, 3.995642429461443, 0.500272793928204, -7.702496330493465, 0.9958622847318236, 0.04544725400188332, 0.4537969880875369],
[0.4469141988839851, 2.553085801116017, 0, 1, 0.1489713996279949, 0, 0.3916828802082856, 0.8631235783626013, 0.8510286003720051, 1, 0.4537969880875369],
[0.5654344106530846, 1.643022626994388, 0, 2, 0.2560314287369637, 0, 1.217268689511987, 2.682408040304527, 0.5534892350271636, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[1.000148250105829, 1.811459351181355, 0, 2, 0.3557211360674764, 0, 1.104082185833034, 2.432987029036997, 0.4150952545101834, 1, 0.4537969880875369],
[0.9997487689211561, 2.000251231078845, 0, 1, 0.3332495896403853, 0, 0.4999372001189298, 1.101675888651982, 0.6667504103596147, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.203628552526006, 0.4444444444444445, 1, 0.4537969880875369],
[0.8112510267776905, 2.18874897322231, 4, 1, 0.2704170089258968, 4.930656317179777, 0.4568819961696131, -9.858536831335645, 0.9985539942370284, 0.0209525673851445, 0.4537969880875369],
[0.9997785944309504, 1.281124083924456, 0, 2, 0.438325845253432, 0, 1.56112903121251, 3.440148507357148, 0.3154778561102716, 1, 0.4537969880875369],
[0.0009471723796282982, 2.553972495551582, 0, 1, 0.0003707249161361109, 0, 0.3915468947851883, 0.8628239170015367, 0.9996292750838639, 1, 0.4537969880875369],
[0.9965328228354849, 2.003467177164516, 0, 1, 0.3321776076118282, 0, 0.4991347057730631, 1.099907489198189, 0.6678223923881718, 1, 0.4537969880875369],
[0.526601755275475, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1755339184251583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993065063016447, 2.000693493698356, 0, 1, 0.3331021687672149, 0, 0.4998266866712618, 1.101432358063262, 0.6668978312327851, 1, 0.4537969880875369],
[0.9994970087164138, 2.00016728915193, 1, 1, 0.333202955219585, 1.000503244411139, 0.4999581812099324, -1.103015393096112, 0.8889757906329353, 0.5553817010721052, 0.4537969880875369],
[0.9993644854469187, 2.000635514553082, 0, 3, 0.3331214951489728, 0, 1.499523515491608, 3.30439283392148, 0.296578836969116, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.999364840964127, 2.000635159035873, 1, 1, 0.3331216136547089, 1.000635562719277, 0.4998412606533968, -1.103564622974706, 0.8890299905160828, 0.5552732178255007, 0.4537969880875369],
[0.9979201657376101, 2.00207983426239, 0, 1, 0.33264005524587, 0, 0.4994805815865088, 1.100669671016326, 0.6673599447541301, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 4, 0.3333333333333333, 1, 2, 2.203628552526006, 0.4609053497942389, 0.868312757201646, 0.4537969880875369],
[0.9979179064495635, 2.002082093550437, 0, 2, 0.3326393021498544, 0, 0.9989600358760788, 2.201336857888931, 0.4453703010350333, 1, 0.4537969880875369],
[0.4834614395161242, 2.516480101289455, 1, 1, 0.1611569535406012, 2.068417288875938, 0.3973804519604967, -3.68234448614961, 0.9740284363255125, 0.2963423434067149, 0.4537969880875369],
[0.2791650676831546, 2.082779327117962, 1, 32, 0.1181929042434808, 3.58211006949829, 15.36408566349652, 25.96309782409904, 0.08542404488289397, 0.9842482633026124, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993060601241645, 2.000693939875836, 0, 3, 0.3331020200413881, 0, 1.499479725612695, 3.304296337293996, 0.2966048210429446, 1, 0.4537969880875369],
[0.999748639324528, 2.000251360675473, 1, 1, 0.3332495464415093, 1.000251423873547, 0.499937167727913, -1.102506780078328, 0.8889447397965283, 0.5554438326795469, 0.4537969880875369],
[0.554175740244934, 2.281096757374494, 0, 1, 0.1954576643727314, 0, 0.4383856128711454, 0.9660390535394681, 0.8045423356272686, 1, 0.4537969880875369],
[0.9372322664263733, 2.062767733573629, 1, 1, 0.3124107554754575, 1.066971374996464, 0.4847855547301763, -1.282921296414566, 0.9023995198632537, 0.527221030814169, 0.4537969880875369],
[0.4461714525800527, 2.55382854741995, 0, 0, 0.1487238175266841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.2258824442411748, 2.610275418023301, 1, 1, 0.07964381928332552, 4.427081543939287, 0.3831013360104643, -8.911430252042006, 0.993656862049965, 0.152944500616616, 0.4537969880875369],
[0.8354401800363814, 1.998742291924947, 1, 0, 0.2947728977584972, 1.196973791656097, 0, -2.63768562391869, 1, 0.2947728977584971, 0.4537969880875369],
[0.001595694579319869, 2.553863710358482, 0, 2, 0.0006244257201803239, 0, 0.783127146483186, 1.725721340248564, 0.9987515384671194, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.633488897978582, 0, 0, 0.2531998949603952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.809561116303819, 1.188358899950025, 1, 0, 0.6036055353354687, 0.5526201856296429, 0, -1.217769619755703, 1, 0.6036055353354687, 0.4537969880875369],
[1, 1.999748677958042, 0, 2, 0.3333612603442199, 0, 1.000125676813656, 2.203905497540969, 0.444407209209847, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.9997486392781058, 2.000251360721895, 1, 3, 0.3332495464260352, 1.000251423919992, 1.499811503148931, 1.100844854291043, 0.5927415470921028, 0.8023698140790028, 0.4537969880875369],
[0.2231872008157474, 2.611339794865334, 0, 2, 0.07873878116377578, 0, 0.7658903693546859, 1.687737886014675, 0.8487222333316055, 1, 0.4537969880875369],
[1.000620946041265, 2.007555566055453, 1, 1, 0.3326337207997897, 0.9993794392934494, 0.4981182174523074, -1.107604114872439, 0.8893548077868876, 0.554622249386467, 0.4525635243770031],
[1.004835337348569, 2.01176304493732, 0, 1, 0.3331021269683022, 0, 0.497076433786046, 1.101432289029191, 0.6668978730316979, 1, 0.4513000379026224],
[0.81431544023694, 2.192358289969368, 1, 4, 0.2708359846484122, 1.228025345692858, 1.824519294269136, 1.318121081533064, 0.5889275685656558, 0.7938771497631533, 0.4525335016131561],
[0.4843676875158511, 2.524008398253777, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525335016131561],
[1.002792028589876, 2.005584057179752, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4986078725646622, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4525335016131561],
[0.8149515875284121, 2.068057640935062, 0, 0, 0.282673943420829, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525335016131561],
[0.8149515875284121, 2.193424498241216, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525335016131561],
[0.707644423022979, 2.257144780489972, 0, 2, 0.2386828791013195, 0, 0.8860751943284063, 1.9580322587605, 0.5796037585734561, 1, 0.4525335016131561],
[1.816650415623403, 1.191725670146224, 2, 0, 0.6038641326184631, 1.100927279568908, 0, -2.432808345999597, 0.9999999999999999, 0.3646518906630488, 0.4525335016131561],
[0.703477319424667, 2.26238991738987, 1, 2, 0.2371911023840131, 1.421509936976848, 0.884020912852816, -1.187733111931012, 0.8579097049739861, 0.5561387310638173, 0.4525335016131561],
[0.7055298874013667, 2.250945950190111, 0, 1, 0.2386388139657971, 0, 0.4442576686106309, 0.9789788832290226, 0.7613611860342029, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516278313736465, 0, 1, 0.1610440780961384, 0, 0.3974123190352036, 0.8757491333515489, 0.8389559219038616, 1, 0.4537969880875369],
[1.000049428518144, 1.999257077781239, 1, 2, 0.3334268859877309, 0.9999505739249138, 1.000371599144011, 0.0009277831941359941, 0.7406159951177489, 0.7038284230728544, 0.4537969880875369],
[0.9977716380623375, 2.002228361937663, 0, 1, 0.3325905460207791, 0, 0.4994435295243979, 1.100588022034328, 0.6674094539792209, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993065062993031, 2.000693493700697, 0, 1, 0.3331021687664343, 0, 0.4998266866706768, 1.101432358061973, 0.6668978312335657, 1, 0.4537969880875369],
[0.8116836781014295, 2.001163051619645, 1.375, 2.375, 0.2885630665635013, 1.694009670388096, 1.18680983944701, -1.117680029298139, 0.7919482222858701, 0.5619565189592706, 0.4537969880875369],
[1.000049445727448, 1.812190734445038, 0, 1, 0.355605987275991, 0, 0.5518182942847006, 1.216002549091964, 0.6443940127240091, 1, 0.4537969880875369],
[0.8118927682691458, 2.185133789734825, 1, 2, 0.2708994239977203, 1.231689749043923, 0.9152757645300559, -0.6972588906932788, 0.8196012262658301, 0.6124191382426309, 0.4537969880875369],
[0.9986711870858839, 2.001328812914117, 0, 2, 0.3328903956952945, 0, 0.9993360346857836, 2.202165419601712, 0.4450352241555807, 1, 0.4537969880875369],
[0.7115927822950775, 2.243107630648911, 0, 2, 0.2408341567144076, 0, 0.8916201668938275, 1.964799657775241, 0.5763327776115246, 1, 0.4537969880875369],
[0.9964693742242036, 2.003530625775797, 1, 1, 0.3321564580747345, 1.003543135260474, 0.4991188989750456, -1.111563649664695, 0.8896720873592472, 0.5539850035087162, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[0.9991303440429377, 2.000869655957063, 0, 7.75, 0.3330434480143125, 0, 3.873315773931807, 8.535349232385494, 0.04332673476430996, 1, 0.4537969880875369],
[0.9987437280847996, 2.000417821680307, 1, 2, 0.3330076461413094, 1.001257852119491, 0.9997911327944701, -0.003232104583158837, 0.7411748841888663, 0.703269241935498, 0.4537969880875369],
[1.018661001899275, 1.981338998100725, 1, 1, 0.3395536672997584, 0.9816808517608094, 0.5047091895725979, -1.051068373543732, 0.884703307023285, 0.5638106416228017, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[0.9991308784347914, 2.00086912156521, 0, 1.75, 0.3330436261449304, 0, 0.8746199244811357, 1.927337438194769, 0.4922327412562164, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9869940638991263, 2.013005936100874, 1, 2, 0.3289980212997087, 1.013177319475959, 0.9935390473184265, -0.04327545724861474, 0.7465021988913685, 0.697885616316125, 0.4537969880875369],
[0.4842488635057313, 2.016835006013975, 0, 4.5, 0.1936156037817011, 0, 2.231218709801003, 4.916777255847728, 0.3796990578646988, 1, 0.4537969880875369],
[0.9997037688889229, 2.000296231111078, 1, 1, 0.3332345896296409, 1.000296318889951, 0.4999259531897149, -1.10263042469492, 0.8889547082743647, 0.5554238875336466, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2, 0, 0, 0.1945289456101749, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 5, 0.3333333333333333, 0, 2.5, 5.509071381315015, 0.131687242798354, 1, 0.4537969880875369],
[1.036354199336142, 1.447742261005486, 1, 1, 0.4171956346629215, 0.9649210671800919, 0.6907306824803747, -0.6042137605523863, 0.8259478024182021, 0.6603390717440452, 0.4537969880875369],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -4.407257105052012, 1, 0.1111111111111109, 0.4537969880875369],
[0.8113561277507313, 2, 1, 0, 0.288599555119283, 1.232504403180184, 0, -2.715981893961877, 1, 0.288599555119283, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187149723961491, 0, 1, 0.2709093306345707, 0, 0.4572160694096161, 1.007534385224742, 0.7290906693654293, 1, 0.4537969880875369],
[0.7058290031153359, 2.250588326031879, 0, 0, 0.2387447117687318, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.2231592419493028, 1.96524920620389, 0, 1, 0.101973304909158, 0, 0.5088413198912405, 1.121297261217357, 0.898026695090842, 1, 0.4537969880875369],
[0.4957736814494225, 2.504226318550577, 0, 1, 0.1652578938164742, 0, 0.3993249302558208, 0.8799638180471826, 0.8347421061835258, 1, 0.4537969880875369],
[0.4469137872561698, 2.553086212743833, 0, 1, 0.1489712624187231, 0, 0.3916828170582175, 0.8631234392033081, 0.8510287375812768, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8294696246200974, 1.991867798519013, 0, 2, 0.2939987318841157, 0, 1.004082701415743, 2.212625309937176, 0.4984377905812367, 1, 0.4537969880875369],
[0.4462795756905357, 2.553720424309467, 1, 0, 0.1487598585635118, 2.240747850610648, 0, -4.937775942616901, 1, 0.1487598585635118, 0.4537969880875369],
[0.448155773603727, 2.551844226396276, 1, 0, 0.1493852578679089, 2.231366990898639, 0, -4.917104012308277, 1, 0.1493852578679089, 0.4537969880875369],
[0.003378368135066342, 2.996621631864934, 1, 2, 0.00112612271168878, 296.0008974807486, 0.6674182615291705, -650.8052873243176, 0.999996198399105, 0.003374565106076144, 0.4537969880875369],
[0.5044488965167977, 2.495329627939185, 1, 1, 0.1681620467658627, 1.982361358910616, 0.4007486581345442, -3.485286906467922, 0.9717215260275158, 0.3080456195592411, 0.4537969880875369],
[0.9993645358946787, 2.000635464105322, 0, 1, 0.3331215119648928, 0, 0.4998411844344652, 1.101464305748205, 0.6668784880351072, 1, 0.4537969880875369],
[0.004783967136359047, 2.552831820176837, 0, 2, 0.001870479201797803, 0, 0.7834436973844434, 1.726418900852903, 0.9962625402888486, 1, 0.4537969880875369],
[1.015168375453033, 1.984831624546967, 1, 1, 0.3383894584843443, 0.9850582663725472, 0.5038210736027784, -1.060468018524924, 0.8854925743866723, 0.5622714913553608, 0.4537969880875369],
[0.8543986972506142, 2.169920558553676, 1, 0, 0.282509426083522, 1.170413769611212, 0, -2.713024967232603, 1, 0.2825094260835219, 0.4314054547036041],
[0.004629873661197608, 2.552877566497325, 1, 2, 0.001810307015533309, 215.9886150632737, 0.7834296584556146, -474.2322912097101, 0.9999901802310465, 0.005421095344887439, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8117241768561113, 2.063259080574359, 1.333333333333333, 0.3333333333333333, 0.282340488334389, 1.642594087190388, 0.1615567024382327, -3.263656268398293, 0.9762281337056468, 0.2990080005163225, 0.4537969880875369],
[1.000084772646543, 1.999639693594521, 0.75, 1, 0.3333922111518939, 0.749936425904437, 0.5000900928318819, -0.5505685133026049, 0.8146004710463803, 0.508217385357894, 0.4537969880875369],
[0.9998094743898981, 2.000084630750131, 1, 0.75, 0.3332815890657011, 1.000190561917027, 0.3749841324057937, -1.377722739293793, 0.9222599840909068, 0.5080745585578768, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122401802547088, 2.187759819745291, 1, 0, 0.2707467267515696, 1.231162929770862, 0, -2.71302578485464, 1, 0.2707467267515695, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.036847631842635, 1.446171452580052, 0, 0, 0.4175753776309402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9972265573292852, 2.002773442670715, 0, 2, 0.332408852443095, 0, 0.9986151989977375, 2.200576965497854, 0.4456779402963452, 1, 0.4537969880875369],
[0.4834615120116934, 2, 1, 0, 0.1946724399284417, 2.068416978714561, 0, -4.558022712824982, 1, 0.1946724399284416, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9998705007612499, 2.000007867046386, 1.6875, 0.8125, 0.3333036804062069, 1.68771855826852, 0.4062484020124886, -2.823884225535753, 0.9334547636930939, 0.3252228810461555, 0.4537969880875369],
[0.8144391107842547, 2.193682513874152, 1, 1, 0.2707467358061826, 1.227838873107483, 0.455854479249119, -1.705772265296308, 0.9266962050502974, 0.4681896766626623, 0.4525717820393002],
[0.4834615120098564, 2.000523423602307, 1, 0.75, 0.1946314186847957, 2.06841697872242, 0.3749018837527472, -3.731878217408961, 0.9742504420328, 0.3153151861569843, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9986128474161565, 2.001387152583844, 0, 2, 0.3328709491387188, 0, 0.9993069044227384, 2.202101227322323, 0.445061170503074, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122397659384184, 2.062851809927402, 1, 0, 0.282509180840202, 1.231163557776137, 0, -2.713027168744996, 1, 0.282509180840202, 0.4537969880875369],
[0.0006482037479460129, 2.554271486199249, 0, 1, 0.0002537080717239335, 0, 0.391501062202279, 0.862722919013202, 0.999746291928276, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9980953713823867, 2.001904628617614, 0, 1, 0.3326984571274622, 0, 0.4995242958654507, 1.100766001049555, 0.6673015428725378, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 1, 0.1610063614742291, 0, 0.3973013834992201, 0.875504672636966, 0.8389936385257709, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.472762730171526, 0, 1, 0.1634149997262226, 0, 0.4044059657639024, 0.8911605329691896, 0.8365850002737774, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2, 0, 0, 0.2889350429083954, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.186563673776247, 0, 1, 0.2709622660894528, 0, 0.4573386140056815, 1.00780442799559, 0.7290377339105472, 1, 0.4537969880875369],
[0.4832404850125547, 2, 0.5, 0, 0.1946007597448265, 1.034681520913981, 0, -2.280053742257083, 1, 0.1025596174368052, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1633798718674184, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4461714525800527, 2.55382854741995, 0, 0, 0.1487238175266841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9998264038109016, 2.000173596189099, 0, 1.75, 0.3332754679369671, 0, 0.8749240582588675, 1.928007636071167, 0.491933345095639, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2, 0, 0, 0.2889350429083954, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9954948667027629, 2.003811681823336, 0, 3, 0.331908343010808, 0, 1.497146676612943, 3.2991551639037, 0.298200347481417, 1, 0.4537969880875369],
[0.9872454029732648, 2.012754597026736, 0, 1, 0.3290818009910882, 0, 0.4968315568510993, 1.09483220447303, 0.6709181990089118, 1, 0.4537969880875369],
[0.9951281296335511, 2.00487187036645, 0, 3, 0.3317093765445169, 0, 1.496354976266718, 3.297410550415714, 0.2984668507687788, 1, 0.4537969880875369],
[1.000049445727268, 1.812190734446822, 0, 1, 0.3556059872757244, 0, 0.5518182942841576, 1.216002549090768, 0.6443940127242755, 1, 0.4537969880875369],
[0.526601755275475, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1755339184251583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.5271532863716863, 2.472846713628315, 1, 0, 0.1757177621238953, 1.896981439464873, 0, -4.180242463616677, 1, 0.1757177621238953, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.000247498392809, 1.810472583123904, 1, 1, 0.3558687700601827, 0.9997525628474885, 0.5523419737594352, -0.9859267488169144, 0.8733574184958527, 0.5850949586162184, 0.4537969880875369],
[0.9986126693073089, 2.001270375549626, 0, 2, 0.3328838672625429, 0, 0.9993652154325839, 2.202229723128545, 0.4450439345585804, 1, 0.4537969880875369],
[0.4837124883746154, 2.515593870772709, 0, 2, 0.1612747850513445, 0, 0.795040894015879, 1.751974814479193, 0.7034599861906684, 1, 0.4537969880875369],
[0.9999364914632994, 2.000063508536701, 0, 0.75, 0.3333121638210997, 0, 0.3749880925274816, 0.8263344675508223, 0.7378055173344663, 1, 0.4537969880875369],
[0.9964297877595839, 2.003348844938301, 1, 3, 0.332167772947777, 1.003583004326319, 1.49749256480211, 1.088393209830021, 0.5946646936053561, 0.801084103927324, 0.4537969880875369],
[1.001692466397303, 2.006695664503355, 0, 1.75, 0.3329664999367665, 0, 0.8720804210403844, 1.927186439896304, 0.4923323579059926, 1, 0.4525148179681611],
[0.4843876863171307, 2.524112610701646, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[1.002833432339592, 2.005666864679185, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.528730926514365, 2.479769370504414, 0, 1, 0.1757456786819339, 0, 0.4032633082311959, 0.8911604487161114, 0.8242543213180661, 1, 0.4525148179681611],
[1.002833432339592, 2.005666864679185, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.5553977831367969, 1.730249828983829, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.4843876863171307, 2.523416953694474, 0, 1, 0.1610435996651903, 0, 0.3962880563736897, 0.8757460322582686, 0.8389564003348097, 1, 0.4525148179681611],
[0.8149852356335017, 2.193515061385275, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.8149852356335017, 2.005918952493775, 0, 1, 0.288909222462656, 0, 0.4985246282043407, 1.101675809076857, 0.711090777537344, 1, 0.4525148179681611],
[0.2258929047338758, 1.975279184383971, 0, 1, 0.1026239183436156, 0, 0.5062575497710563, 1.118764578901981, 0.8973760816563844, 1, 0.4525148179681611],
[0.526601755275475, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1755339184251583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.48346287416649, 2.002028355341059, 1, 2, 0.1945140133374273, 2.068411150957643, 0.9989868498437359, -2.356613924699776, 0.9012120440936244, 0.4773945099821446, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.5544269325848979, 1.724762749781645, 0, 1, 0.243256161114779, 0, 0.5797898871172861, 1.277641549717481, 0.756743838885221, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.0006479362820411063, 2.554271531041995, 0, 1, 0.0002536034072023961, 0, 0.3915010553290934, 0.8627229038672537, 0.9997463965927976, 1, 0.4537969880875369],
[0.5533846000640482, 1.725805082302495, 1, 0, 0.2427988351936791, 1.807061490117833, 0, -3.982092295793847, 1, 0.2427988351936792, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[1, 1.288918784517253, 1, 4, 0.436887497609884, 1, 3.103376293408701, 4.635060056861732, 0.2762652636330543, 0.9433792198616239, 0.4537969880875369],
[0.9992565857845014, 2.000743414215499, 1, 1, 0.3330855285948338, 1.000743967291359, 0.499814215503543, -1.103863103849396, 0.8890540306407002, 0.5552250878303677, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.472762724674186, 0, 1, 0.1634150000301516, 0, 0.4044059666629604, 0.8911605349503795, 0.8365849999698484, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993645488546502, 2.00063545114535, 0, 1, 0.3331215162848833, 0, 0.4998411876724002, 1.101464312883411, 0.6668784837151167, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.036847631842635, 1.446171452580052, 0, 0, 0.4175753776309402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 1, 0.2708941848671571, 0, 0.4571810105129941, 1.007457128439126, 0.7291058151328429, 1, 0.4537969880875369],
[0.4837162080317667, 2.516283791968233, 0, 1, 0.1612387360105889, 0, 0.3974114538240545, 0.8757472267475568, 0.8387612639894111, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2, 0, 0, 0.2889350429083954, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8113562140835391, 2.188643785916461, 1, 0, 0.2704520713611797, 1.232504272034869, 0, -2.715981604966318, 1, 0.2704520713611798, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 1.812682554601471, 0, 0, 0.3555324785458024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122405604767111, 2.187759439523289, 1, 0, 0.270746853492237, 1.231162353445008, 0, -2.713024514846534, 1, 0.270746853492237, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2, 0, 0, 0.1945289456101749, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8104493220164825, 2, 1, 0, 0.2883700181560254, 1.233883443213816, 0, -2.719020785955065, 1, 0.2883700181560254, 0.4537969880875369],
[0.2231590664920013, 1.974817852594986, 0, 2, 0.1015293038585222, 0, 1.012751630420964, 2.231728409412902, 0.8072495918249517, 1, 0.4537969880875369],
[1.812682554601471, 1.187317445398529, 0, 0, 0.6042275182004904, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122401801735685, 2, 1, 0, 0.288823190103001, 1.231162929893851, 0, -2.713025785125664, 1, 0.2888231901030009, 0.4537969880875369],
[1, 1.812682554601471, 0, 0, 0.3555324785458024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993647872471044, 2.000635212752896, 0, 1, 0.3331215957490348, 0, 0.4998412472326672, 1.101464444132116, 0.6668784042509652, 1, 0.4537969880875369],
[0.5561247673991943, 1.631316457875354, 0, 2, 0.2542352960040764, 0, 1.22600369189239, 2.701656740956367, 0.5561649937261276, 1, 0.4537969880875369],
[0.7055301192099337, 2.250945673038694, 0, 1, 0.2386388960328079, 0, 0.4442577233105927, 0.9789790037674201, 0.7613611039671921, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122399262397875, 2.187760073760212, 1, 1, 0.2707466420799292, 1.231163314797188, 0.4570885134955636, -1.705773333939153, 0.9266962558024427, 0.4681895399623011, 0.4537969880875369],
[0.9980954663090474, 2.001904533690953, 0, 1, 0.3326984887696824, 0, 0.4995243195519815, 1.100766053245871, 0.6673015112303176, 1, 0.4537969880875369],
[0.9979196539576839, 2.001904968123925, 0, 2, 0.3326593316862695, 0, 0.9990484223006301, 2.201531628737727, 0.4453435675854164, 1, 0.4537969880875369],
[0.9986117740312465, 2.001388225968754, 0, 1, 0.3328705913437487, 0, 0.4996531842371357, 1.101050023145489, 0.6671294086562513, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9998518607131696, 2.000148139286831, 0, 0.75, 0.3332839535710564, 0, 0.3749722259409338, 0.8262995034876744, 0.7378289318550009, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.812933904351249, 2.187066095648751, 0, 1, 0.270977968117083, 0, 0.4572335522870283, 1.007572910992588, 0.729022031882917, 1, 0.4537969880875369],
[0.9338412659890124, 2.066158734010989, 1, 0, 0.3112804219963373, 1.070845802622483, 0, -2.359746386011532, 1, 0.3112804219963372, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2, 0, 0, 0.2889350429083954, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4843459525452586, 2.515654047454741, 1, 0, 0.1614486508484196, 2.064639943298705, 0, -4.5496995297387, 1, 0.1614486508484195, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.526601755275475, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1755339184251583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.2297764406413666, 2.059091343073398, 0, 4, 0.1003886909834723, 0, 1.94260444708082, 4.280778625851289, 0.6549673111329203, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.203628552526006, 0.4444444444444445, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.5550266318720525, 1.634473074017448, 0, 1, 0.2534947277586267, 0, 0.6118179711226768, 1.348219550114462, 0.7465052722413732, 1, 0.4537969880875369],
[0.5287849464148253, 2.471215053585176, 2, 2, 0.1762616488049417, 3.782255931376353, 0.8093184755808487, -6.551249862464994, 0.9809911866851496, 0.1454956930618115, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9377003586245511, 2.062299641375451, 0, 0, 0.3125667862081835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8131861309168426, 2.186813869083157, 0, 1, 0.2710620436389475, 0, 0.457286289490774, 1.007689124200542, 0.7289379563610525, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993065062986749, 2.000635030599859, 0, 15, 0.3331086602880268, 0, 7.497619391130266, 16.5219681662673, 0.002295229754177606, 1, 0.4537969880875369],
[1, 1.812682554601471, 0, 0, 0.3555324785458024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9994970087164138, 2.000502991283587, 1, 1, 0.3331656695721379, 1.000503244411139, 0.4998742837961807, -1.103200271832538, 0.889000636618549, 0.5553319757628248, 0.4537969880875369],
[1.002036312515806, 1.285560725317387, 0, 1, 0.4380300795742125, 0, 0.7778706834351323, 1.718771373149808, 0.5619699204257875, 1, 0.4525736788422372],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.002701261586442, 2.005402523172885, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525744660673444],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 1, 0.1610063614742291, 0, 0.3973013834992201, 0.875504672636966, 0.8389936385257709, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[1.000049428518188, 1.999257077780576, 0, 1, 0.3334268859878144, 0, 0.5001857995721711, 1.102223709505286, 0.6665731140121856, 1, 0.4537969880875369],
[0.0003000337371631796, 2.999477847839689, 0, 1, 0.000100018651049412, 0, 0.3333913603396768, 0.7346707208099981, 0.9998999813489506, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.001090469344862, 1.998658185369757, 0, 2, 0.3337247831652417, 0, 1.000671357733936, 2.205107975597467, 0.4439226645682042, 1, 0.4537969880875369],
[0.5258954029205579, 2.474104597079443, 0, 1, 0.1752984676401859, 0, 0.4041866302582559, 0.8906771989863642, 0.8247015323598141, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2, 0, 0, 0.1945289456101749, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4834615120116983, 2.515844994286976, 1, 1, 0.1611910990078567, 2.068416978714539, 0.3974807678019978, -3.682122743816493, 0.9740174296006394, 0.2963996276163526, 0.4537969880875369],
[0.5553977831367969, 1.730249828983829, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[1.003927191653089, 2.004573105365689, 0, 1, 0.3336968896589152, 0, 0.4988593318563818, 1.102415461434639, 0.6663031103410848, 1, 0.4525148179681611],
[1.001487960006946, 2.007012337011832, 1, 1, 0.332886109733595, 0.99851425072855, 0.4982530408800893, -1.105513432896376, 0.8891868379464329, 0.5549590574136229, 0.4525148179681611],
[0.9985370763794218, 2.009963220639356, 1, 1, 0.3319052610262014, 1.001465066901554, 0.4975215415543308, -1.113650880229696, 0.8898388977031291, 0.5536494197555319, 0.4525148179681611],
[1.002833432339592, 2.005666864679185, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.9987299117900689, 2.001270088209932, 0, 2, 0.3329099705966896, 0, 0.9993653589201107, 2.202230039321756, 0.4450091073293095, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.001095072294878, 1.998904927705122, 1, 1, 0.333698357431626, 0.9989061255766971, 0.5002739180537553, -1.098800169706627, 0.8886454062474349, 0.5560421211106866, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.7049326053311571, 2.251660063449995, 0, 1, 0.2384273670074964, 0, 0.4441167724349116, 0.9786684003932657, 0.7615726329925036, 1, 0.4537969880875369]
],
"RESOLVED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.7058290031153359, 2.250588326031879, 0, 0, 0.2387447117687318, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.001414646914318331, 2.998585353085681, 0, 1, 0.0004715489714394438, 0, 0.3334905904782581, 0.734889387176647, 0.9995284510285606, 1, 0.4537969880875369],
[0.8350512570032101, 2, 0, 0, 0.2945453825360113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9365974229430001, 2.063402577057002, 2, 0, 0.3121991409809998, 2.135389176830691, 0, -4.705604560819116, 0.9999999999999999, 0.09746830362927428, 0.4537969880875369],
[0.8133995986818859, 2.184506613396258, 1, 3, 0.2713225635294436, 1.229408032190451, 1.373307813124856, 0.3171016659692916, 0.7018357924400503, 0.7180700027283125, 0.4537969880875369],
[0.9986574757791179, 2.001120760198727, 0, 2, 0.3329104344453592, 0, 0.9994399337506168, 2.202394374547559, 0.4450084884718793, 1, 0.4537969880875369],
[0.526438424419553, 2.473561575580448, 1, 0, 0.1754794748065176, 1.899557390976148, 0, -4.185918903916845, 1, 0.1754794748065176, 0.4537969880875369],
[1, 1.281153366467139, 1, 1, 0.4383747338955632, 1, 0.780546674718237, -0.4835936135376701, 0.8078275926819942, 0.6845770604731205, 0.4537969880875369],
[1.002774380372693, 2.005548760745385, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525414659266404],
[1.004467385835137, 1.995508525462091, 0, 7, 0.3348251504462222, 0, 3.507877771847175, 7.751505742494374, 0.057617013099097, 1, 0.4525414659266404],
[0.9989527377125207, 2.009370403405558, 0, 2, 0.3320629768985682, 0, 0.9953366470464198, 2.199437448253128, 0.4461398668296027, 1, 0.4525414659266404],
[0.7068881597585228, 2.257907260179528, 0, 1, 0.2384272975480019, 0, 0.4428879864270818, 0.9786682984292019, 0.761572702451998, 1, 0.4525414659266404],
[0.2241278986565789, 2.619232490913711, 0, 2, 0.07882500560910283, 0, 0.763582464305147, 1.687320437568318, 0.8485633702910693, 1, 0.4525414659266404],
[0.5553650784717465, 1.638144913554275, 0, 1, 0.2531855703829218, 0, 0.6104466044034559, 1.348929656983992, 0.7468144296170782, 1, 0.4525414659266404],
[1.002774380372693, 2.005548760745385, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525414659266404],
[0.5549202708864276, 1.730592750600517, 1, 0, 0.2427989977171072, 1.802060678739675, 0, -3.982089630283293, 1, 0.2427989977171072, 0.4525414659266404],
[0.9397489983959904, 2.06857414272209, 1, 0, 0.3123829968766989, 1.064113930109901, 0, -2.351417516914129, 1, 0.3123829968766989, 0.4525414659266404],
[0.2242339807021795, 2.611702145119646, 0, 2, 0.07906876980072984, 0, 0.7657841089334392, 1.687503727516412, 0.8481143307563411, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 4, 0.3333333333333333, 1, 2, 2.203628552526006, 0.4609053497942389, 0.868312757201646, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.000148256016917, 1.811459292337691, 0, 2, 0.355721144866828, 0, 1.104082221698174, 2.432987108070444, 0.4150952431717108, 1, 0.4537969880875369],
[0.4834615120117139, 2.51445846404874, 1, 2, 0.1612656494744157, 2.068416978714473, 0.7953998956815667, -2.805256792024681, 0.9303681165067113, 0.4099710921259955, 0.4537969880875369],
[0.4834613619045548, 2.516538638095445, 1, 0, 0.1611537873015183, 2.068417620925456, 0, -4.558024128019246, 1, 0.1611537873015183, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.998743642121818, 2.000417850270611, 1, 1, 0.3330076238492649, 1.001257938298874, 0.4998955592526445, -1.104816453628638, 0.8891059224582665, 0.5551211701567962, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -1.101814276263003, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4537969880875369],
[0.9980953693087663, 2.001904630691234, 0, 1, 0.3326984564362554, 0, 0.4995242953480316, 1.100765999909356, 0.6673015435637446, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9986581852385129, 2.001341814761488, 2, 1, 0.3328860617461709, 2.002687235294961, 0.4996647712170928, -3.312103216929983, 0.9631118535296221, 0.2586630973738703, 0.4537969880875369],
[0.4469146331717945, 2.553085366828208, 0, 1, 0.148971544390598, 0, 0.3916829468347691, 0.8631237251826228, 0.851028455609402, 1, 0.4537969880875369],
[1.001090580705227, 1.998909419294773, 4, 1, 0.3336968602350757, 3.995642429461443, 0.500272793928204, -7.702496330493465, 0.9958622847318236, 0.04544725400188332, 0.4537969880875369],
[0.4469141988839851, 2.553085801116017, 0, 1, 0.1489713996279949, 0, 0.3916828802082856, 0.8631235783626013, 0.8510286003720051, 1, 0.4537969880875369],
[0.5654344106530846, 1.643022626994388, 0, 2, 0.2560314287369637, 0, 1.217268689511987, 2.682408040304527, 0.5534892350271636, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[1.000148250105829, 1.811459351181355, 0, 2, 0.3557211360674764, 0, 1.104082185833034, 2.432987029036997, 0.4150952545101834, 1, 0.4537969880875369],
[0.9997487689211561, 2.000251231078845, 0, 1, 0.3332495896403853, 0, 0.4999372001189298, 1.101675888651982, 0.6667504103596147, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.203628552526006, 0.4444444444444445, 1, 0.4537969880875369],
[0.8112510267776905, 2.18874897322231, 4, 1, 0.2704170089258968, 4.930656317179777, 0.4568819961696131, -9.858536831335645, 0.9985539942370284, 0.0209525673851445, 0.4537969880875369],
[0.9997785944309504, 1.281124083924456, 0, 2, 0.438325845253432, 0, 1.56112903121251, 3.440148507357148, 0.3154778561102716, 1, 0.4537969880875369],
[0.0009471723796282982, 2.553972495551582, 0, 1, 0.0003707249161361109, 0, 0.3915468947851883, 0.8628239170015367, 0.9996292750838639, 1, 0.4537969880875369],
[0.9965328228354849, 2.003467177164516, 0, 1, 0.3321776076118282, 0, 0.4991347057730631, 1.099907489198189, 0.6678223923881718, 1, 0.4537969880875369],
[0.526601755275475, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1755339184251583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993065063016447, 2.000693493698356, 0, 1, 0.3331021687672149, 0, 0.4998266866712618, 1.101432358063262, 0.6668978312327851, 1, 0.4537969880875369],
[0.9994970087164138, 2.00016728915193, 1, 1, 0.333202955219585, 1.000503244411139, 0.4999581812099324, -1.103015393096112, 0.8889757906329353, 0.5553817010721052, 0.4537969880875369],
[0.9993644854469187, 2.000635514553082, 0, 3, 0.3331214951489728, 0, 1.499523515491608, 3.30439283392148, 0.296578836969116, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.999364840964127, 2.000635159035873, 1, 1, 0.3331216136547089, 1.000635562719277, 0.4998412606533968, -1.103564622974706, 0.8890299905160828, 0.5552732178255007, 0.4537969880875369],
[0.9979201657376101, 2.00207983426239, 0, 1, 0.33264005524587, 0, 0.4994805815865088, 1.100669671016326, 0.6673599447541301, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 4, 0.3333333333333333, 1, 2, 2.203628552526006, 0.4609053497942389, 0.868312757201646, 0.4537969880875369],
[0.9979179064495635, 2.002082093550437, 0, 2, 0.3326393021498544, 0, 0.9989600358760788, 2.201336857888931, 0.4453703010350333, 1, 0.4537969880875369],
[0.4834614395161242, 2.516480101289455, 1, 1, 0.1611569535406012, 2.068417288875938, 0.3973804519604967, -3.68234448614961, 0.9740284363255125, 0.2963423434067149, 0.4537969880875369],
[0.2791650676831546, 2.082779327117962, 1, 32, 0.1181929042434808, 3.58211006949829, 15.36408566349652, 25.96309782409904, 0.08542404488289397, 0.9842482633026124, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993060601241645, 2.000693939875836, 0, 3, 0.3331020200413881, 0, 1.499479725612695, 3.304296337293996, 0.2966048210429446, 1, 0.4537969880875369],
[0.999748639324528, 2.000251360675473, 1, 1, 0.3332495464415093, 1.000251423873547, 0.499937167727913, -1.102506780078328, 0.8889447397965283, 0.5554438326795469, 0.4537969880875369],
[0.554175740244934, 2.281096757374494, 0, 1, 0.1954576643727314, 0, 0.4383856128711454, 0.9660390535394681, 0.8045423356272686, 1, 0.4537969880875369],
[0.9372322664263733, 2.062767733573629, 1, 1, 0.3124107554754575, 1.066971374996464, 0.4847855547301763, -1.282921296414566, 0.9023995198632537, 0.527221030814169, 0.4537969880875369],
[0.4461714525800527, 2.55382854741995, 0, 0, 0.1487238175266841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.2258824442411748, 2.610275418023301, 1, 1, 0.07964381928332552, 4.427081543939287, 0.3831013360104643, -8.911430252042006, 0.993656862049965, 0.152944500616616, 0.4537969880875369],
[0.8354401800363814, 1.998742291924947, 1, 0, 0.2947728977584972, 1.196973791656097, 0, -2.63768562391869, 1, 0.2947728977584971, 0.4537969880875369],
[0.001595694579319869, 2.553863710358482, 0, 2, 0.0006244257201803239, 0, 0.783127146483186, 1.725721340248564, 0.9987515384671194, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.633488897978582, 0, 0, 0.2531998949603952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.809561116303819, 1.188358899950025, 1, 0, 0.6036055353354687, 0.5526201856296429, 0, -1.217769619755703, 1, 0.6036055353354687, 0.4537969880875369],
[1, 1.999748677958042, 0, 2, 0.3333612603442199, 0, 1.000125676813656, 2.203905497540969, 0.444407209209847, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.9997486392781058, 2.000251360721895, 1, 3, 0.3332495464260352, 1.000251423919992, 1.499811503148931, 1.100844854291043, 0.5927415470921028, 0.8023698140790028, 0.4537969880875369],
[0.2231872008157474, 2.611339794865334, 0, 2, 0.07873878116377578, 0, 0.7658903693546859, 1.687737886014675, 0.8487222333316055, 1, 0.4537969880875369],
[1.000620946041265, 2.007555566055453, 1, 1, 0.3326337207997897, 0.9993794392934494, 0.4981182174523074, -1.107604114872439, 0.8893548077868876, 0.554622249386467, 0.4525635243770031],
[1.004835337348569, 2.01176304493732, 0, 1, 0.3331021269683022, 0, 0.497076433786046, 1.101432289029191, 0.6668978730316979, 1, 0.4513000379026224],
[0.81431544023694, 2.192358289969368, 1, 4, 0.2708359846484122, 1.228025345692858, 1.824519294269136, 1.318121081533064, 0.5889275685656558, 0.7938771497631533, 0.4525335016131561],
[0.4843676875158511, 2.524008398253777, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525335016131561],
[1.002792028589876, 2.005584057179752, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4986078725646622, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4525335016131561],
[0.8149515875284121, 2.068057640935062, 0, 0, 0.282673943420829, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525335016131561],
[0.8149515875284121, 2.193424498241216, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525335016131561],
[0.707644423022979, 2.257144780489972, 0, 2, 0.2386828791013195, 0, 0.8860751943284063, 1.9580322587605, 0.5796037585734561, 1, 0.4525335016131561],
[1.816650415623403, 1.191725670146224, 2, 0, 0.6038641326184631, 1.100927279568908, 0, -2.432808345999597, 0.9999999999999999, 0.3646518906630488, 0.4525335016131561],
[0.703477319424667, 2.26238991738987, 1, 2, 0.2371911023840131, 1.421509936976848, 0.884020912852816, -1.187733111931012, 0.8579097049739861, 0.5561387310638173, 0.4525335016131561],
[0.7055298874013667, 2.250945950190111, 0, 1, 0.2386388139657971, 0, 0.4442576686106309, 0.9789788832290226, 0.7613611860342029, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516278313736465, 0, 1, 0.1610440780961384, 0, 0.3974123190352036, 0.8757491333515489, 0.8389559219038616, 1, 0.4537969880875369],
[1.000049428518144, 1.999257077781239, 1, 2, 0.3334268859877309, 0.9999505739249138, 1.000371599144011, 0.0009277831941359941, 0.7406159951177489, 0.7038284230728544, 0.4537969880875369],
[0.9977716380623375, 2.002228361937663, 0, 1, 0.3325905460207791, 0, 0.4994435295243979, 1.100588022034328, 0.6674094539792209, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993065062993031, 2.000693493700697, 0, 1, 0.3331021687664343, 0, 0.4998266866706768, 1.101432358061973, 0.6668978312335657, 1, 0.4537969880875369],
[0.8116836781014295, 2.001163051619645, 1.375, 2.375, 0.2885630665635013, 1.694009670388096, 1.18680983944701, -1.117680029298139, 0.7919482222858701, 0.5619565189592706, 0.4537969880875369],
[1.000049445727448, 1.812190734445038, 0, 1, 0.355605987275991, 0, 0.5518182942847006, 1.216002549091964, 0.6443940127240091, 1, 0.4537969880875369],
[0.8118927682691458, 2.185133789734825, 1, 2, 0.2708994239977203, 1.231689749043923, 0.9152757645300559, -0.6972588906932788, 0.8196012262658301, 0.6124191382426309, 0.4537969880875369],
[0.9986711870858839, 2.001328812914117, 0, 2, 0.3328903956952945, 0, 0.9993360346857836, 2.202165419601712, 0.4450352241555807, 1, 0.4537969880875369],
[0.7115927822950775, 2.243107630648911, 0, 2, 0.2408341567144076, 0, 0.8916201668938275, 1.964799657775241, 0.5763327776115246, 1, 0.4537969880875369],
[0.9964693742242036, 2.003530625775797, 1, 1, 0.3321564580747345, 1.003543135260474, 0.4991188989750456, -1.111563649664695, 0.8896720873592472, 0.5539850035087162, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993056224393552, 2.000694377560646, 0, 7, 0.3331018741464516, 0, 3.498785261012618, 7.710023100324558, 0.05867005274182668, 1, 0.4537969880875369],
[0.9987437280847996, 2.000417821680307, 1, 2, 0.3330076461413094, 1.001257852119491, 0.9997911327944701, -0.003232104583158837, 0.7411748841888663, 0.703269241935498, 0.4537969880875369],
[1.018661001899275, 1.981338998100725, 1, 1, 0.3395536672997584, 0.9816808517608094, 0.5047091895725979, -1.051068373543732, 0.884703307023285, 0.5638106416228017, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993061568312089, 2.000693843168792, 0, 1, 0.3331020522770696, 0, 0.4998265993642254, 1.101432165670984, 0.6668979477229304, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9869940638991263, 2.013005936100874, 1, 2, 0.3289980212997087, 1.013177319475959, 0.9935390473184265, -0.04327545724861474, 0.7465021988913685, 0.697885616316125, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.016238518729943, 0, 4, 0.1932650255073322, 0, 1.983892264155163, 4.371761638427783, 0.423568389355605, 1, 0.4537969880875369],
[0.9997037688889229, 2.000296231111078, 1, 1, 0.3332345896296409, 1.000296318889951, 0.4999259531897149, -1.10263042469492, 0.8889547082743647, 0.5554238875336466, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2, 0, 0, 0.1945289456101749, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 5, 0.3333333333333333, 0, 2.5, 5.509071381315015, 0.131687242798354, 1, 0.4537969880875369],
[1.036354199336142, 1.447742261005486, 1, 1, 0.4171956346629215, 0.9649210671800919, 0.6907306824803747, -0.6042137605523863, 0.8259478024182021, 0.6603390717440452, 0.4537969880875369],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -4.407257105052012, 1, 0.1111111111111109, 0.4537969880875369],
[0.8113561277507313, 2, 1, 0, 0.288599555119283, 1.232504403180184, 0, -2.715981893961877, 1, 0.288599555119283, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187149723961491, 0, 1, 0.2709093306345707, 0, 0.4572160694096161, 1.007534385224742, 0.7290906693654293, 1, 0.4537969880875369],
[0.7058290031153359, 2.250588326031879, 0, 0, 0.2387447117687318, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.2231592419493028, 1.96524920620389, 0, 1, 0.101973304909158, 0, 0.5088413198912405, 1.121297261217357, 0.898026695090842, 1, 0.4537969880875369],
[0.4957736814494225, 2.504226318550577, 0, 1, 0.1652578938164742, 0, 0.3993249302558208, 0.8799638180471826, 0.8347421061835258, 1, 0.4537969880875369],
[0.4469137872561698, 2.553086212743833, 0, 1, 0.1489712624187231, 0, 0.3916828170582175, 0.8631234392033081, 0.8510287375812768, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8294696246200974, 1.991867798519013, 0, 2, 0.2939987318841157, 0, 1.004082701415743, 2.212625309937176, 0.4984377905812367, 1, 0.4537969880875369],
[0.4462795756905357, 2.553720424309467, 1, 0, 0.1487598585635118, 2.240747850610648, 0, -4.937775942616901, 1, 0.1487598585635118, 0.4537969880875369],
[0.448155773603727, 2.551844226396276, 1, 0, 0.1493852578679089, 2.231366990898639, 0, -4.917104012308277, 1, 0.1493852578679089, 0.4537969880875369],
[0.003378368135066342, 2.996621631864934, 1, 2, 0.00112612271168878, 296.0008974807486, 0.6674182615291705, -650.8052873243176, 0.999996198399105, 0.003374565106076144, 0.4537969880875369],
[0.5044488965167977, 2.495329627939185, 1, 1, 0.1681620467658627, 1.982361358910616, 0.4007486581345442, -3.485286906467922, 0.9717215260275158, 0.3080456195592411, 0.4537969880875369],
[0.9993645358946787, 2.000635464105322, 0, 1, 0.3331215119648928, 0, 0.4998411844344652, 1.101464305748205, 0.6668784880351072, 1, 0.4537969880875369],
[0.004783967136359047, 2.552831820176837, 0, 2, 0.001870479201797803, 0, 0.7834436973844434, 1.726418900852903, 0.9962625402888486, 1, 0.4537969880875369],
[1.015168375453033, 1.984831624546967, 1, 1, 0.3383894584843443, 0.9850582663725472, 0.5038210736027784, -1.060468018524924, 0.8854925743866723, 0.5622714913553608, 0.4537969880875369],
[0.8543986972506142, 2.169920558553676, 1, 0, 0.282509426083522, 1.170413769611212, 0, -2.713024967232603, 1, 0.2825094260835219, 0.4314054547036041],
[0.004629873661197608, 2.552877566497325, 1, 2, 0.001810307015533309, 215.9886150632737, 0.7834296584556146, -474.2322912097101, 0.9999901802310465, 0.005421095344887439, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122405816809819, 2.062850792675996, 1, 0, 0.2825094843681765, 1.231162321304408, 0, -2.713024444020589, 1, 0.2825094843681765, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122401802547088, 2.187759819745291, 1, 0, 0.2707467267515696, 1.231162929770862, 0, -2.71302578485464, 1, 0.2707467267515695, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.036847631842635, 1.446171452580052, 0, 0, 0.4175753776309402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9972265573292852, 2.002773442670715, 0, 2, 0.332408852443095, 0, 0.9986151989977375, 2.200576965497854, 0.4456779402963452, 1, 0.4537969880875369],
[0.4834615120116934, 2, 1, 0, 0.1946724399284417, 2.068416978714561, 0, -4.558022712824982, 1, 0.1946724399284416, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.8144391107842547, 2.193682513874152, 1, 1, 0.2707467358061826, 1.227838873107483, 0.455854479249119, -1.705772265296308, 0.9266962050502974, 0.4681896766626623, 0.4525717820393002],
[0.4834615120098564, 2, 1, 0, 0.194672439927846, 2.06841697872242, 0, -4.5580227128423, 1, 0.194672439927846, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9986128474161565, 2.001387152583844, 0, 2, 0.3328709491387188, 0, 0.9993069044227384, 2.202101227322323, 0.445061170503074, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122397659384184, 2.062851809927402, 1, 0, 0.282509180840202, 1.231163557776137, 0, -2.713027168744996, 1, 0.282509180840202, 0.4537969880875369],
[0.0006482037479460129, 2.554271486199249, 0, 1, 0.0002537080717239335, 0, 0.391501062202279, 0.862722919013202, 0.999746291928276, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9980953713823867, 2.001904628617614, 0, 1, 0.3326984571274622, 0, 0.4995242958654507, 1.100766001049555, 0.6673015428725378, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 1, 0.1610063614742291, 0, 0.3973013834992201, 0.875504672636966, 0.8389936385257709, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.472762730171526, 0, 1, 0.1634149997262226, 0, 0.4044059657639024, 0.8911605329691896, 0.8365850002737774, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2, 0, 0, 0.2889350429083954, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.186563673776247, 0, 1, 0.2709622660894528, 0, 0.4573386140056815, 1.00780442799559, 0.7290377339105472, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2, 0, 0, 0.1945289456101749, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1633798718674184, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4461714525800527, 2.55382854741995, 0, 0, 0.1487238175266841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2, 0, 0, 0.2889350429083954, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9954948667027629, 2.003811681823336, 0, 3, 0.331908343010808, 0, 1.497146676612943, 3.2991551639037, 0.298200347481417, 1, 0.4537969880875369],
[0.9872454029732648, 2.012754597026736, 0, 1, 0.3290818009910882, 0, 0.4968315568510993, 1.09483220447303, 0.6709181990089118, 1, 0.4537969880875369],
[0.9951281296335511, 2.00487187036645, 0, 3, 0.3317093765445169, 0, 1.496354976266718, 3.297410550415714, 0.2984668507687788, 1, 0.4537969880875369],
[1.000049445727268, 1.812190734446822, 0, 1, 0.3556059872757244, 0, 0.5518182942841576, 1.216002549090768, 0.6443940127242755, 1, 0.4537969880875369],
[0.526601755275475, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1755339184251583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.5271532863716863, 2.472846713628315, 1, 0, 0.1757177621238953, 1.896981439464873, 0, -4.180242463616677, 1, 0.1757177621238953, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.000247498392809, 1.810472583123904, 1, 1, 0.3558687700601827, 0.9997525628474885, 0.5523419737594352, -0.9859267488169144, 0.8733574184958527, 0.5850949586162184, 0.4537969880875369],
[0.9986126693073089, 2.001270375549626, 0, 2, 0.3328838672625429, 0, 0.9993652154325839, 2.202229723128545, 0.4450439345585804, 1, 0.4537969880875369],
[0.4837124883746154, 2.515593870772709, 0, 2, 0.1612747850513445, 0, 0.795040894015879, 1.751974814479193, 0.7034599861906684, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9964297877595839, 2.003348844938301, 1, 3, 0.332167772947777, 1.003583004326319, 1.49749256480211, 1.088393209830021, 0.5946646936053561, 0.801084103927324, 0.4537969880875369],
[1.002088552405405, 2.006411744613373, 0, 1, 0.333085741556485, 0, 0.4984021862335619, 1.101405227946877, 0.666914258443515, 1, 0.4525148179681611],
[0.4843876863171307, 2.524112610701646, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[1.002833432339592, 2.005666864679185, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.528730926514365, 2.479769370504414, 0, 1, 0.1757456786819339, 0, 0.4032633082311959, 0.8911604487161114, 0.8242543213180661, 1, 0.4525148179681611],
[1.002833432339592, 2.005666864679185, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.5553977831367969, 1.730249828983829, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.4843876863171307, 2.523416953694474, 0, 1, 0.1610435996651903, 0, 0.3962880563736897, 0.8757460322582686, 0.8389564003348097, 1, 0.4525148179681611],
[0.8149852356335017, 2.193515061385275, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.8149852356335017, 2.005918952493775, 0, 1, 0.288909222462656, 0, 0.4985246282043407, 1.101675809076857, 0.711090777537344, 1, 0.4525148179681611],
[0.2258929047338758, 1.975279184383971, 0, 1, 0.1026239183436156, 0, 0.5062575497710563, 1.118764578901981, 0.8973760816563844, 1, 0.4525148179681611],
[0.526601755275475, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1755339184251583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.48346287416649, 2.002028355341059, 1, 2, 0.1945140133374273, 2.068411150957643, 0.9989868498437359, -2.356613924699776, 0.9012120440936244, 0.4773945099821446, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.5544269325848979, 1.724762749781645, 0, 1, 0.243256161114779, 0, 0.5797898871172861, 1.277641549717481, 0.756743838885221, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.0006479362820411063, 2.554271531041995, 0, 1, 0.0002536034072023961, 0, 0.3915010553290934, 0.8627229038672537, 0.9997463965927976, 1, 0.4537969880875369],
[0.5533846000640482, 1.725805082302495, 1, 0, 0.2427988351936791, 1.807061490117833, 0, -3.982092295793847, 1, 0.2427988351936792, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 1.101814276263003, 0.6666666666666667, 1, 0.4537969880875369],
[1, 1.288918784517253, 1, 4, 0.436887497609884, 1, 3.103376293408701, 4.635060056861732, 0.2762652636330543, 0.9433792198616239, 0.4537969880875369],
[0.9992565857845014, 2.000743414215499, 1, 1, 0.3330855285948338, 1.000743967291359, 0.499814215503543, -1.103863103849396, 0.8890540306407002, 0.5552250878303677, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.472762724674186, 0, 1, 0.1634150000301516, 0, 0.4044059666629604, 0.8911605349503795, 0.8365849999698484, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993645488546502, 2.00063545114535, 0, 1, 0.3331215162848833, 0, 0.4998411876724002, 1.101464312883411, 0.6668784837151167, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.036847631842635, 1.446171452580052, 0, 0, 0.4175753776309402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 1, 0.2708941848671571, 0, 0.4571810105129941, 1.007457128439126, 0.7291058151328429, 1, 0.4537969880875369],
[0.4837162080317667, 2.516283791968233, 0, 1, 0.1612387360105889, 0, 0.3974114538240545, 0.8757472267475568, 0.8387612639894111, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2, 0, 0, 0.2889350429083954, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8113562140835391, 2.188643785916461, 1, 0, 0.2704520713611797, 1.232504272034869, 0, -2.715981604966318, 1, 0.2704520713611798, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 1.812682554601471, 0, 0, 0.3555324785458024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122405604767111, 2.187759439523289, 1, 0, 0.270746853492237, 1.231162353445008, 0, -2.713024514846534, 1, 0.270746853492237, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2, 0, 0, 0.1945289456101749, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8104493220164825, 2, 1, 0, 0.2883700181560254, 1.233883443213816, 0, -2.719020785955065, 1, 0.2883700181560254, 0.4537969880875369],
[0.2231590664920013, 1.974817852594986, 0, 2, 0.1015293038585222, 0, 1.012751630420964, 2.231728409412902, 0.8072495918249517, 1, 0.4537969880875369],
[1.812682554601471, 1.187317445398529, 0, 0, 0.6042275182004904, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122401801735685, 2, 1, 0, 0.288823190103001, 1.231162929893851, 0, -2.713025785125664, 1, 0.2888231901030009, 0.4537969880875369],
[1, 1.812682554601471, 0, 0, 0.3555324785458024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993647872471044, 2.000635212752896, 0, 1, 0.3331215957490348, 0, 0.4998412472326672, 1.101464444132116, 0.6668784042509652, 1, 0.4537969880875369],
[0.5561247673991943, 1.631316457875354, 0, 2, 0.2542352960040764, 0, 1.22600369189239, 2.701656740956367, 0.5561649937261276, 1, 0.4537969880875369],
[0.7055301192099337, 2.250945673038694, 0, 1, 0.2386388960328079, 0, 0.4442577233105927, 0.9789790037674201, 0.7613611039671921, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8122399262397875, 2.187760073760212, 1, 1, 0.2707466420799292, 1.231163314797188, 0.4570885134955636, -1.705773333939153, 0.9266962558024427, 0.4681895399623011, 0.4537969880875369],
[0.9980954663090474, 2.001904533690953, 0, 1, 0.3326984887696824, 0, 0.4995243195519815, 1.100766053245871, 0.6673015112303176, 1, 0.4537969880875369],
[0.9979196539576839, 2.001904968123925, 0, 2, 0.3326593316862695, 0, 0.9990484223006301, 2.201531628737727, 0.4453435675854164, 1, 0.4537969880875369],
[0.9986117740312465, 2.001388225968754, 0, 1, 0.3328705913437487, 0, 0.4996531842371357, 1.101050023145489, 0.6671294086562513, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.812933904351249, 2.187066095648751, 0, 1, 0.270977968117083, 0, 0.4572335522870283, 1.007572910992588, 0.729022031882917, 1, 0.4537969880875369],
[0.9338412659890124, 2.066158734010989, 1, 0, 0.3112804219963373, 1.070845802622483, 0, -2.359746386011532, 1, 0.3112804219963372, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2, 0, 0, 0.2889350429083954, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4843459525452586, 2.515654047454741, 1, 0, 0.1614486508484196, 2.064639943298705, 0, -4.5496995297387, 1, 0.1614486508484195, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 2.281222709583263, 0, 0, 0.1953504530303878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.526601755275475, 2.473398244724526, 0, 0, 0.1755339184251583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.2297764406413666, 2.059091343073398, 0, 4, 0.1003886909834723, 0, 1.94260444708082, 4.280778625851289, 0.6549673111329203, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.203628552526006, 0.4444444444444445, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 0, 0.1610063614742291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[0.5550266318720525, 1.634473074017448, 0, 1, 0.2534947277586267, 0, 0.6118179711226768, 1.348219550114462, 0.7465052722413732, 1, 0.4537969880875369],
[0.5287849464148253, 2.471215053585176, 2, 2, 0.1762616488049417, 3.782255931376353, 0.8093184755808487, -6.551249862464994, 0.9809911866851496, 0.1454956930618115, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9377003586245511, 2.062299641375451, 0, 0, 0.3125667862081835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.8131861309168426, 2.186813869083157, 0, 1, 0.2710620436389475, 0, 0.457286289490774, 1.007689124200542, 0.7289379563610525, 1, 0.4537969880875369],
[0.9993065062986749, 2.000635030599859, 0, 15, 0.3331086602880268, 0, 7.497619391130266, 16.5219681662673, 0.002295229754177606, 1, 0.4537969880875369],
[1, 1.812682554601471, 0, 0, 0.3555324785458024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.9994970087164138, 2.000502991283587, 1, 1, 0.3331656695721379, 1.000503244411139, 0.4998742837961807, -1.103200271832538, 0.889000636618549, 0.5553319757628248, 0.4537969880875369],
[1.002036312515806, 1.285560725317387, 0, 1, 0.4380300795742125, 0, 0.7778706834351323, 1.718771373149808, 0.5619699204257875, 1, 0.4525736788422372],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.002701261586442, 2.005402523172885, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525744660673444],
[0.4830190844226872, 2.516980915577312, 0, 1, 0.1610063614742291, 0, 0.3973013834992201, 0.875504672636966, 0.8389936385257709, 1, 0.4537969880875369],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.203628552526006, 1, 0.3333333333333333, 0.4537969880875369],
[1.000049428518188, 1.999257077780576, 0, 1, 0.3334268859878144, 0, 0.5001857995721711, 1.102223709505286, 0.6665731140121856, 1, 0.4537969880875369],
[0.0003000337371631796, 2.999477847839689, 0, 1, 0.000100018651049412, 0, 0.3333913603396768, 0.7346707208099981, 0.9998999813489506, 1, 0.4537969880875369],
[0.5538285474199477, 1.725361134946596, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.001090469344862, 1.998658185369757, 0, 2, 0.3337247831652417, 0, 1.000671357733936, 2.205107975597467, 0.4439226645682042, 1, 0.4537969880875369],
[0.5258954029205579, 2.474104597079443, 0, 1, 0.1752984676401859, 0, 0.4041866302582559, 0.8906771989863642, 0.8247015323598141, 1, 0.4537969880875369],
[0.4830190844226872, 2, 0, 0, 0.1945289456101749, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.4834615120116983, 2.515844994286976, 1, 1, 0.1611910990078567, 2.068416978714539, 0.3974807678019978, -3.682122743816493, 0.9740174296006394, 0.2963996276163526, 0.4537969880875369],
[0.5553977831367969, 1.730249828983829, 0, 0, 0.2429936181726186, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[1.003927191653089, 2.004573105365689, 0, 1, 0.3336968896589152, 0, 0.4988593318563818, 1.102415461434639, 0.6663031103410848, 1, 0.4525148179681611],
[1.001487960006946, 2.007012337011832, 1, 1, 0.332886109733595, 0.99851425072855, 0.4982530408800893, -1.105513432896376, 0.8891868379464329, 0.5549590574136229, 0.4525148179681611],
[0.9985370763794218, 2.009963220639356, 1, 1, 0.3319052610262014, 1.001465066901554, 0.4975215415543308, -1.113650880229696, 0.8898388977031291, 0.5536494197555319, 0.4525148179681611],
[1.002833432339592, 2.005666864679185, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4525148179681611],
[0.9987299117900689, 2.001270088209932, 0, 2, 0.3329099705966896, 0, 0.9993653589201107, 2.202230039321756, 0.4450091073293095, 1, 0.4537969880875369],
[0.8126825546014713, 2.187317445398528, 0, 0, 0.2708941848671571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[1.001095072294878, 1.998904927705122, 1, 1, 0.333698357431626, 0.9989061255766971, 0.5002739180537553, -1.098800169706627, 0.8886454062474349, 0.5560421211106866, 0.4537969880875369],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4537969880875369],
[0.7049326053311571, 2.251660063449995, 0, 1, 0.2384273670074964, 0, 0.4441167724349116, 0.9786684003932657, 0.7615726329925036, 1, 0.4537969880875369]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node117":{
"Global MG94xREV":0.001218235174820549,
"Nucleotide GTR":0.001213612080769799,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node120":{
"Global MG94xREV":0.001217740428281708,
"Nucleotide GTR":0.001213119211750033,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "S", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "TCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node144":{
"Global MG94xREV":0.001217719934193184,
"Nucleotide GTR":0.001213098795434752,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node149":{
"Global MG94xREV":0.001217720009095139,
"Nucleotide GTR":0.00121309887005246,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "I", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "ATT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node159":{
"Global MG94xREV":0.001109973333217276,
"Nucleotide GTR":0.001105761083218793,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node164":{
"Global MG94xREV":0.001217969541370518,
"Nucleotide GTR":0.001213347455375066,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node168":{
"Global MG94xREV":0.001217624901718913,
"Nucleotide GTR":0.001213004123600261,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"Node170":{
"Global MG94xREV":0.001217758065524903,
"Nucleotide GTR":0.001213136782061462,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node176":{
"Global MG94xREV":0.001216198262126884,
"Nucleotide GTR":0.001211582897978497,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node183":{
"Global MG94xREV":0.001217595809507242,
"Nucleotide GTR":0.001212975141790944,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node188":{
"Global MG94xREV":0.001217624266535419,
"Nucleotide GTR":0.001213003490827233,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node196":{
"Global MG94xREV":0.0007529345071670884,
"Nucleotide GTR":0.0007500771877326837,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node197":{
"Global MG94xREV":0.0004640124403973308,
"Nucleotide GTR":0.0004622515544887531,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node223":{
"Global MG94xREV":0.001832719486570056,
"Nucleotide GTR":0.001825764479252765,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTA", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node229":{
"Global MG94xREV":0.001218028173877207,
"Nucleotide GTR":0.00121340586537661,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node241":{
"Global MG94xREV":0.001217345964371972,
"Nucleotide GTR":0.001212726244795723,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.00121734301124422,
"Nucleotide GTR":0.001212723302874829,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node250":{
"Global MG94xREV":0.001217347321817673,
"Nucleotide GTR":0.001212727597090039,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node254":{
"Global MG94xREV":0.001217064188390903,
"Nucleotide GTR":0.001212445538129422,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node259":{
"Global MG94xREV":0.001217070335977566,
"Nucleotide GTR":0.00121245166238654,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node269":{
"Global MG94xREV":0.00121734221859907,
"Nucleotide GTR":0.001212722513237697,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node277":{
"Global MG94xREV":0.001217346172001632,
"Nucleotide GTR":0.001212726451637449,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node282":{
"Global MG94xREV":0.001217073443791808,
"Nucleotide GTR":0.001212454758406903,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node288":{
"Global MG94xREV":0.001155487545615488,
"Nucleotide GTR":0.001151102573232272,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node289":{
"Global MG94xREV":6.217985283868001e-05,
"Nucleotide GTR":6.194388583191764e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.001218067528635478,
"Nucleotide GTR":0.001213445070787076,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node300":{
"Global MG94xREV":0.001161762945132698,
"Nucleotide GTR":0.001157354158166901,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":5.60877542523093e-05,
"Nucleotide GTR":5.587490621741163e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node309":{
"Global MG94xREV":0.001216850032653743,
"Nucleotide GTR":0.001212232195094222,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node312":{
"Global MG94xREV":0.00121685062746136,
"Nucleotide GTR":0.001212232787644596,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node345":{
"Global MG94xREV":0.001217146216123717,
"Nucleotide GTR":0.001212527254574292,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node351":{
"Global MG94xREV":0.001216893507886091,
"Nucleotide GTR":0.001212275505341933,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node352":{
"Global MG94xREV":0.001218058286176106,
"Nucleotide GTR":0.001213435863402016,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node395":{
"Global MG94xREV":0.001218418020933395,
"Nucleotide GTR":0.001213794232997922,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node416":{
"Global MG94xREV":0.001217533350645644,
"Nucleotide GTR":0.001212912919955167,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node431":{
"Global MG94xREV":0.001223536375153864,
"Nucleotide GTR":0.001218893163519721,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node434":{
"Global MG94xREV":0.001217594337305033,
"Nucleotide GTR":0.001212973675175611,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node439":{
"Global MG94xREV":0.00121841859468068,
"Nucleotide GTR":0.001213794804567887,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node448":{
"Global MG94xREV":0.001217783166019886,
"Nucleotide GTR":0.001213161787302299,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node450":{
"Global MG94xREV":0.001217844227730518,
"Nucleotide GTR":0.001213222617289175,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node456":{
"Global MG94xREV":0.001218113008719748,
"Nucleotide GTR":0.001213490378278476,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node457":{
"Global MG94xREV":0.001217364796578795,
"Nucleotide GTR":0.001212745005535998,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node50":{
"Global MG94xREV":0.001216805616304939,
"Nucleotide GTR":0.001212187947301508,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "G", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GGG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node525":{
"Global MG94xREV":0.00121841858486513,
"Nucleotide GTR":0.001213794794789587,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "H", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAT", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.00121826306440502,
"Nucleotide GTR":0.001213639864515778,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548_1":{
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node564":{
"Global MG94xREV":0.001216915647161083,
"Nucleotide GTR":0.001212297560600346,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node570":{
"Global MG94xREV":0.001128836895128919,
"Nucleotide GTR":0.001124553059592068,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTA", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node575":{
"Global MG94xREV":0.001218076591583205,
"Nucleotide GTR":0.001213454099341723,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node580":{
"Global MG94xREV":0.001217819734851045,
"Nucleotide GTR":0.001213198217358,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node586":{
"Global MG94xREV":0.001219097830485572,
"Nucleotide GTR":0.001214471462733359,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node590":{
"Global MG94xREV":4.742660332815148e-05,
"Nucleotide GTR":4.724662359006359e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node591":{
"Global MG94xREV":0.001169327375542395,
"Nucleotide GTR":0.001164889882236519,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node596":{
"Global MG94xREV":0.001217232478461483,
"Nucleotide GTR":0.001212613189554163,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAC", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node599":{
"Global MG94xREV":0.001217430321264576,
"Nucleotide GTR":0.001212810281561429,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node602":{
"Global MG94xREV":0.001216798600210354,
"Nucleotide GTR":0.001212180957832377,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node605":{
"Global MG94xREV":0.001217346391059749,
"Nucleotide GTR":0.001212726669864259,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node608":{
"Global MG94xREV":0.001218025036467935,
"Nucleotide GTR":0.001213402739873528,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node611":{
"Global MG94xREV":0.001217342710897524,
"Nucleotide GTR":0.001212723003667921,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node614":{
"Global MG94xREV":0.001217069914771493,
"Nucleotide GTR":0.001212451242778906,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node617":{
"Global MG94xREV":0.001217068165643257,
"Nucleotide GTR":0.001212449500288456,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node620":{
"Global MG94xREV":0.001217067617052161,
"Nucleotide GTR":0.001212448953779216,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node623":{
"Global MG94xREV":0.001217067260209532,
"Nucleotide GTR":0.001212448598290772,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node626":{
"Global MG94xREV":0.001217408439790616,
"Nucleotide GTR":0.001212788483125714,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node629":{
"Global MG94xREV":0.0012170670634288,
"Nucleotide GTR":0.001212448402256805,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node632":{
"Global MG94xREV":0.001217061871990516,
"Nucleotide GTR":0.001212443230519568,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node635":{
"Global MG94xREV":0.001217061963692547,
"Nucleotide GTR":0.001212443321873598,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node638":{
"Global MG94xREV":0.001217062008250844,
"Nucleotide GTR":0.001212443366262798,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node641":{
"Global MG94xREV":0.00121706807827042,
"Nucleotide GTR":0.001212449413247193,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node644":{
"Global MG94xREV":0.00121706771030895,
"Nucleotide GTR":0.001212449046682102,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node649":{
"Global MG94xREV":0.001217067883674408,
"Nucleotide GTR":0.001212449219389655,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node652":{
"Global MG94xREV":0.001217332545141702,
"Nucleotide GTR":0.001212712876490237,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node658":{
"Global MG94xREV":0.001216424171127137,
"Nucleotide GTR":0.001211807949674203,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node665":{
"Global MG94xREV":0.001218632116470422,
"Nucleotide GTR":0.001214007516061441,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node672":{
"Global MG94xREV":0.0003027723987400084,
"Nucleotide GTR":0.0003016234044372024,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node673":{
"Global MG94xREV":0.0009126324487251197,
"Nucleotide GTR":0.0009091690898175564,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node679":{
"Global MG94xREV":0.001217664531900969,
"Nucleotide GTR":0.001213043603389304,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node68":{
"Global MG94xREV":0.001217095359850455,
"Nucleotide GTR":0.001212476591296058,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node686":{
"Global MG94xREV":0.001217217756338545,
"Nucleotide GTR":0.001212598523300371,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node691":{
"Global MG94xREV":0.001218096466695113,
"Nucleotide GTR":0.001213473899029352,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node695":{
"Global MG94xREV":0.001217844438946622,
"Nucleotide GTR":0.001213222827703733,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node698":{
"Global MG94xREV":0.001217289489313755,
"Nucleotide GTR":0.001212669984055326,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node703":{
"Global MG94xREV":0.001217881787410464,
"Nucleotide GTR":0.001213260034433477,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node709":{
"Global MG94xREV":0.001216045124193253,
"Nucleotide GTR":0.001211430341189691,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "F", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "TTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node713":{
"Global MG94xREV":0.001217067301719715,
"Nucleotide GTR":0.001212448639643429,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node723":{
"Global MG94xREV":0.00122290678671538,
"Nucleotide GTR":0.001218265964313318,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "CTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node726":{
"Global MG94xREV":0.001216354490808608,
"Nucleotide GTR":0.001211738533786278,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node729":{
"Global MG94xREV":0.001217061384501477,
"Nucleotide GTR":0.001212442744880506,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node732":{
"Global MG94xREV":0.00121706756914155,
"Nucleotide GTR":0.00121244890605042,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node740":{
"Global MG94xREV":0.001217417589180261,
"Nucleotide GTR":0.001212797597794241,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node744":{
"Global MG94xREV":0.001217458860622707,
"Nucleotide GTR":0.001212838712615236,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node761":{
"Global MG94xREV":0.001217593904505291,
"Nucleotide GTR":0.001212973244018307,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node765":{
"Global MG94xREV":0.001216582388381528,
"Nucleotide GTR":0.001211965566508196,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node766":{
"Global MG94xREV":0.0009400911252972383,
"Nucleotide GTR":0.0009365235631562381,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "P", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "CCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node777":{
"Global MG94xREV":0.001217808758901748,
"Nucleotide GTR":0.001213187283061452,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node786":{
"Global MG94xREV":0.001216850635880582,
"Nucleotide GTR":0.001212232796031869,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCT", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node789":{
"Global MG94xREV":0.001217102489812014,
"Nucleotide GTR":0.001212483694200049,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node798":{
"Global MG94xREV":0.001217713111846857,
"Nucleotide GTR":0.001213091998978622,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node806":{
"Global MG94xREV":0.001216850641412117,
"Nucleotide GTR":0.001212232801542411,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAT", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node814":{
"Global MG94xREV":0.0006930897111784938,
"Nucleotide GTR":0.0006904594974179544,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node815":{
"Global MG94xREV":0.000523851504633947,
"Nucleotide GTR":0.0005218635348029938,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node835":{
"Global MG94xREV":0.001216208752295477,
"Nucleotide GTR":0.001211593348337832,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAG", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217224383139918,
"Nucleotide GTR":0.001212605124953621,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "G", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GGA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002439937344879908,
"Nucleotide GTR":0.002430677999840081,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "V", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "V", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GTG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GTC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218043775710621,
"Nucleotide GTR":0.001213421408002456,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "CTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001233463710533787,
"Nucleotide GTR":0.001228782825545529,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "-", "-", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "Y", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "NNN", "NNN", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TAT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218348129672195,
"Nucleotide GTR":0.001213724606967836,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Q", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAA", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217473771721971,
"Nucleotide GTR":0.001212853567128205,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "L", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "TTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217420029269724,
"Nucleotide GTR":0.001212800028623781,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217233056683109,
"Nucleotide GTR":0.001212613765581488,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "I", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ATA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218044008522965,
"Nucleotide GTR":0.001213421639931299,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAC", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217316208081588,
"Nucleotide GTR":0.001212696601427814,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTG", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTN", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "HPRL", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CNT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0]
],
"original name":"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001282170119375814,
"Nucleotide GTR":0.001277304397901462,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACG", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218024619479528,
"Nucleotide GTR":0.001213402324467555,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "K", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AAA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217897649645231,
"Nucleotide GTR":0.001213275836472477,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217219262806625,
"Nucleotide GTR":0.001212600024051538,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217506276959511,
"Nucleotide GTR":0.001212885949011264,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217473771721971,
"Nucleotide GTR":0.001212853567128205,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "V", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GTT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217282333434924,
"Nucleotide GTR":0.001212662855332417,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTT", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001070079492586439,
"Nucleotide GTR":0.0001066018636162115,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "SRGC", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "NGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217630749695203,
"Nucleotide GTR":0.001213009949384003,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTC", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121697831376745,
"Nucleotide GTR":0.001212359989392519,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "ILVF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "NTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCN", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002437102737976505,
"Nucleotide GTR":0.002427854150017565,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "C", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "F", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "TGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TTC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001216792264096324,
"Nucleotide GTR":0.001212174645763336,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217316212857201,
"Nucleotide GTR":0.001212696606185302,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "V", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "GTC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217822994668498,
"Nucleotide GTR":0.001213201464804736,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "M", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ATG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217429001304443,
"Nucleotide GTR":0.001212808966610427,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217731858115649,
"Nucleotide GTR":0.001213110674106993,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACT", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218412140920943,
"Nucleotide GTR":0.001213788375299593,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "F", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "TTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "NHDY", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "NAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218304884929935,
"Nucleotide GTR":0.001213681526335523,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "I", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "ATT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217241935933474,
"Nucleotide GTR":0.00121262261113589,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121686352627865,
"Nucleotide GTR":0.00121224563751202,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218087286069161,
"Nucleotide GTR":0.001213464753243059,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "H", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CAT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "KTRI", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "NTSI", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "ANA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ANT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418698_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220867455367543,
"Nucleotide GTR":0.001216234372046423,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCT", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418713_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "DAGV", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GNT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418728_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218153245180479,
"Nucleotide GTR":0.001213530462045419,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418730_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220085968485083,
"Nucleotide GTR":0.001215455850837118,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATT", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418738_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218043775696917,
"Nucleotide GTR":0.001213421407988804,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "P", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "CCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002437121930126864,
"Nucleotide GTR":0.002427873269335417,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "F", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "P", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "TTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CCA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218346881737897,
"Nucleotide GTR":0.001213723363769339,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "V", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GTC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418925_USA_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217270665346708,
"Nucleotide GTR":0.001212651231523557,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATT", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418925_USA_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218401602672358,
"Nucleotide GTR":0.001213777877042723,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "Y", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TAT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218257061641727,
"Nucleotide GTR":0.001213633884532438,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "D", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GAT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121773210682981,
"Nucleotide GTR":0.001213110921877305,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "Y", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "TAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217430460250177,
"Nucleotide GTR":0.001212810420019593,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218471504283918,
"Nucleotide GTR":0.00121384751338389,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCA", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "NHDY", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "NAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "ILVF", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "NTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "NHDY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCN", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "NAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "EAGV", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GNA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAN", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTN", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "SL", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TNA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223846314604352,
"Nucleotide GTR":0.00121920192677758,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "T", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "ACT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219072538285257,
"Nucleotide GTR":0.001214446266514694,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "D", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "GAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAN", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "TPAS", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "NCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217630598798033,
"Nucleotide GTR":0.001213009799059475,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGC", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "KN", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAN", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "QH", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAN", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "KN", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAN", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121750272527741,
"Nucleotide GTR":0.001212882410807479,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAG", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218126487627359,
"Nucleotide GTR":0.001213503806034832,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTA", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218596754231379,
"Nucleotide GTR":0.001213972288018949,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216633057653888,
"Nucleotide GTR":0.001212016043495177,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217316211998557,
"Nucleotide GTR":0.001212696605329918,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "G", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GGT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217421594938,
"Nucleotide GTR":0.001212801588350485,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAT", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "NTSI", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ANT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420518_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "HPRL", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "NTSI", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CNT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ANT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "ED", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAN", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217235154864674,
"Nucleotide GTR":0.001212615855800643,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121761455913181,
"Nucleotide GTR":0.001212993820262356,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420669_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420669_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "SWL"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TNG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2]
],
"original name":"epi_isl_420671_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "YSCF", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TNC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420685_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217185488931094,
"Nucleotide GTR":0.00121256637834486,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "V", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "GTA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420704_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "ILV", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "NTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420706_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217392582846086,
"Nucleotide GTR":0.001212772686356878,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCG", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217822643212102,
"Nucleotide GTR":0.001213201114682084,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "V", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GTC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001217473622573932,
"Nucleotide GTR":0.001212853418546171,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "HPRL", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CNT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217926639959259,
"Nucleotide GTR":0.001213304716770844,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "L", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TTG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218412142112674,
"Nucleotide GTR":0.001213788376486801,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "Y", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TAT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218043775696917,
"Nucleotide GTR":0.001213421407988804,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "S", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TCA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217897652581235,
"Nucleotide GTR":0.001213275839397341,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGT", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217504234700311,
"Nucleotide GTR":0.001212883914502254,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001217509238906347,
"Nucleotide GTR":0.001212888899717774,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218523048407539,
"Nucleotide GTR":0.001213898861902151,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "T", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "ACT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001219025446091727,
"Nucleotide GTR":0.001214399353031846,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "D", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GAT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217415607360073,
"Nucleotide GTR":0.001212795623494883,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "A", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GCT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217997113012974,
"Nucleotide GTR":0.001213374922385591,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCC", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222501976214838,
"Nucleotide GTR":0.001217862690032594,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "F", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTC", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421663_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217327557370237,
"Nucleotide GTR":0.001212707907646923,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGC", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCN", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217473771721971,
"Nucleotide GTR":0.001212853567128205,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "L", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TTG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421827_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421830_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "NHDY", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "NAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421830_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421854_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421854_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421858_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001219971259420407,
"Nucleotide GTR":0.001215341577083134,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "N", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "AAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421858_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "KQE", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "NAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217692335377494,
"Nucleotide GTR":0.001213071301354112,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "M", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ATG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421866_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "QPRL", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CNA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "LF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTN", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421872_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421891_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421891_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421893_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001843062825707023,
"Nucleotide GTR":0.001836068566338391,
"amino-acid": [
["IM", "D", "MLV", "F", "M", "R", "I", "LF", "T", "I", "G", "TPAS", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATN", "GAT", "NTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTN", "ACA", "ATA", "GGA", "NCT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421932_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "TPAS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "NCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421932_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421956_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217473772963648,
"Nucleotide GTR":0.00121285356836517,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "Y", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "TAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421956_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["IM", "NHDY", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATN", "NAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421972_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "HPRL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CNT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421972_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217258123437565,
"Nucleotide GTR":0.001212638737209843,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421990_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121782264313846,
"Nucleotide GTR":0.001213201114608724,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAT", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422006_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217425059235694,
"Nucleotide GTR":0.00121280503950148,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "TPAS", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "NCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218543723808712,
"Nucleotide GTR":0.001213919458842017,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001216722516029851,
"Nucleotide GTR":0.001212105162384565,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "V", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GTT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218280102702086,
"Nucleotide GTR":0.001213656838154025,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "N", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "AAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "NHDY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "NAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002779824783096041,
"Nucleotide GTR":0.0002769275595482284,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "P", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "CCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "NHDY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "NAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217844421512836,
"Nucleotide GTR":0.001213222810336107,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTC", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001255522160896516,
"Nucleotide GTR":0.001250757566052601,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGC", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217811758237389,
"Nucleotide GTR":0.001213190271014883,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "L", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CTT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217792764471046,
"Nucleotide GTR":0.001213171349328192,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "ILVF", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "NTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "QPRL", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGN", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CNA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422436_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "H", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAT", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217233490848747,
"Nucleotide GTR":0.001212614198099507,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217316211998557,
"Nucleotide GTR":0.001212696605329918,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTG", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0223915333839328,
"Nucleotide GTR":0.02230655950785859,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "P", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "S", "F", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "G", "I", "N", "F", "V", "E", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "-", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "T", "N", "A", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CCA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTT", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TCG", "TTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGT", "CTG", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTT", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "GGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "GAA", "ATA", "ATT", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTG", "NNN", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "ACA", "AAT", "GCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218032444684842,
"Nucleotide GTR":0.001213410119976911,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACA", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAC", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217404992308783,
"Nucleotide GTR":0.00121278504872677,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "-", "-", "-", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTA", "NNN", "NNN", "NNN", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423047_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217630748726005,
"Nucleotide GTR":0.001213009948418481,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "P", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "CCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423047_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217473772789045,
"Nucleotide GTR":0.00121285356819123,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "S", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "TCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423080_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002446217442124041,
"Nucleotide GTR":0.002436934264674178,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "I", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "H", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "ATC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "CAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423080_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423155_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "ILV", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "NTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423155_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423166_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCN", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423166_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423175_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217722113192389,
"Nucleotide GTR":0.001213100966164848,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423175_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "ILV", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "NTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423203_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423239_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["MLV", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["NTG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423239_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423290_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "TPAS", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "HPRL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "NCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CNT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423290_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423291_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "NHDY", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "TPAS", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "NAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "NCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423291_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423309_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "ILV", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "NTA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423309_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121710225333722,
"Nucleotide GTR":0.001212483458622654,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTT", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423319_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121750754768481,
"Nucleotide GTR":0.001212887214914273,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "V", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GTT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423338_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423340_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "ILV", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "KTRI", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "NTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ANA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423340_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423341_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "ILV", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "NTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423341_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216117764563947,
"Nucleotide GTR":0.001211502705896645,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423363_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423364_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACN", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423364_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423396_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423396_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423410_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217897430552087,
"Nucleotide GTR":0.001213275618210772,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGT", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423410_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423431_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCN", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423431_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423505_England_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "KTRI", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ANA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423505_England_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423511_England_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001217327558340091,
"Nucleotide GTR":0.001212707908613096,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "N", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAC", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423511_England_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423517_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002437056614794376,
"Nucleotide GTR":0.002427808201868803,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423517_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "TPAS", "S", "D", "YSCF", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "NCT", "TCA", "GAT", "TNT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423542_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "ILVF", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "NTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423542_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "KQE", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "NAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423558_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423561_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217263196279518,
"Nucleotide GTR":0.001212643790800813,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "F", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "TTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423561_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423562_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "ILVF", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "EAGV", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "NTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GNA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423564_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "IM", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "ILVF", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATN", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "NTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423567_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423572_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTN", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423572_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTN", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423575_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423586_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423586_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423619_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCN", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423619_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423633_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "KN", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "YSCF", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "IMLVF", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAN", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TNT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "NTN", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423633_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423647_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423647_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221794146452634,
"Nucleotide GTR":0.001217157546421333,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "ED", "TPAS", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAN", "NCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAC", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423659_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423663_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "DAGV", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GNC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423663_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423670_England_20200320_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423670_England_20200320_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACN", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423712_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "DAGV", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GNT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423712_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "NHDY", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "NAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423726_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "NTSI", "KNQHEDY", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ANT", "NAN", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 17, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423802_England_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423821_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "KTRI", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "ANA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423821_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423840_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "NHDY", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "NAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423840_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423846_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "CW", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGN", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423846_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTN", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423863_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423876_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217327328720576,
"Nucleotide GTR":0.001212707679864966,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "CGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423876_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423897_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "ILVF", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "NTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423897_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "KTRI", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ANA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423913_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423914_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "LF", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTN", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423914_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423919_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423919_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423922_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423922_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423926_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217242997739213,
"Nucleotide GTR":0.001212623668912171,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423926_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423952_England_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "KTRI", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ANA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423952_England_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423957_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "LF"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTN"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2]
],
"original name":"epi_isl_423957_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_423960_England_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "LF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTN", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423960_England_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423995_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002437745129227432,
"Nucleotide GTR":0.002428494103450871,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "A", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GCT", "GCA", "CTC", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423995_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222805425816361,
"Nucleotide GTR":0.001218164988069888,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "E", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "GAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423998_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424012_England_20200320_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424012_England_20200320_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424013_England_20200321_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424013_England_20200321_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "IM", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATN", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424021_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424037_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002438132810967043,
"Nucleotide GTR":0.002428880313972787,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "I", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATT", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAT", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424037_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424103_England_20200313_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424103_England_20200313_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424115_England_20200312_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "TPAS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "NCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424115_England_20200312_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "TPAS", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "RG", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "TPAS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "NCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "NGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "NCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424122_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424136_England_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217877444470828,
"Nucleotide GTR":0.001213255707974913,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424136_England_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCN", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424154_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217243572881527,
"Nucleotide GTR":0.00121262424187187,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218161704974199,
"Nucleotide GTR":0.001213538889734977,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGC", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217897651082689,
"Nucleotide GTR":0.00121327583790448,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAT", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217425083487295,
"Nucleotide GTR":0.001212805063661046,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217235651602673,
"Nucleotide GTR":0.001212616350653564,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221196680933042,
"Nucleotide GTR":0.001216562348230205,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTA", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121819545983808,
"Nucleotide GTR":0.001213572516502155,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001217316208031233,
"Nucleotide GTR":0.00121269660137765,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "C", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TGT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121722458915581,
"Nucleotide GTR":0.001212605330187703,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "R", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CGC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217822994787602,
"Nucleotide GTR":0.001213201464923388,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "I", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ATT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217392410100946,
"Nucleotide GTR":0.001212772514267291,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "C", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TGT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217421738301123,
"Nucleotide GTR":0.001212801731169558,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217233686103671,
"Nucleotide GTR":0.001212614392613455,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217420958003433,
"Nucleotide GTR":0.001212800953833029,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218162666738059,
"Nucleotide GTR":0.001213539847849027,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAN", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217699437424843,
"Nucleotide GTR":0.001213078376449824,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAT", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217545565259481,
"Nucleotide GTR":0.001212925088215631,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425280_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217997187931941,
"Nucleotide GTR":0.001213374997020251,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACC", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425280_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425325_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217419122449375,
"Nucleotide GTR":0.001212799125244735,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425325_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425439_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218401602827934,
"Nucleotide GTR":0.00121377787719771,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "I", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "ATT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425439_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425585_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425602_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217601893446473,
"Nucleotide GTR":0.001212981202642167,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425602_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425609_England_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425609_England_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425611_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217897652581235,
"Nucleotide GTR":0.001213275839397341,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "F", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TTC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425611_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425627_England_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425627_England_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425632_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425632_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425639_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217326556099665,
"Nucleotide GTR":0.001212706910176082,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425639_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222536967958469,
"Nucleotide GTR":0.001217897548985672,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "E", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "GAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002439747333598064,
"Nucleotide GTR":0.002430488709634141,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "DAGV", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GNT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217897654062387,
"Nucleotide GTR":0.001213275840872869,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "L", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TTA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217064217357372,
"Nucleotide GTR":0.001212445566985965,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00121784455235879,
"Nucleotide GTR":0.001213222940685513,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218620196599205,
"Nucleotide GTR":0.001213995641425075,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGA", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217806600312385,
"Nucleotide GTR":0.001213185132663745,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "H", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAT", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217897649817929,
"Nucleotide GTR":0.00121327583664452,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATT", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217293019279859,
"Nucleotide GTR":0.001212673500625522,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217710239836125,
"Nucleotide GTR":0.001213089137866914,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "S", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "TCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "CTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217422153216995,
"Nucleotide GTR":0.001212802144510861,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217241996151474,
"Nucleotide GTR":0.001212622671125367,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002438379446400581,
"Nucleotide GTR":0.002429126013446812,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "F", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTT", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "TTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003678917930123103,
"Nucleotide GTR":0.003664956764046565,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "NTSIHPRLDAGVYCF", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "H", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "NNT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "CAC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121782287929774,
"Nucleotide GTR":0.001213201349871799,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "L", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CTA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217341245740507,
"Nucleotide GTR":0.001212721544071045,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220086486813655,
"Nucleotide GTR":0.00121545636719868,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCT", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001218475131209735,
"Nucleotide GTR":0.001213851126545846,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATC", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001216728352391169,
"Nucleotide GTR":0.001212110976597414,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222157496831322,
"Nucleotide GTR":0.001217519517917674,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "K", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "AAG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121899111862671,
"Nucleotide GTR":0.001214365155836504,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "I", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "ATT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001225206048236728,
"Nucleotide GTR":0.001220556500341856,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "EDAGV", "-", "NHDY", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "S", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GNN", "NNN", "NAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "TCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217399639946888,
"Nucleotide GTR":0.00121277971667661,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "L", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "TTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217014131885398,
"Nucleotide GTR":0.0012123956715839,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "F", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTT", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217822859301468,
"Nucleotide GTR":0.001213201329951411,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "S", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "TCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217897427654838,
"Nucleotide GTR":0.001213275615324519,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "F", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TTC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217638679613825,
"Nucleotide GTR":0.001213017849209289,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217359311137105,
"Nucleotide GTR":0.00121273954091107,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217693909965423,
"Nucleotide GTR":0.00121307286996662,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "F", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "TTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217473771721971,
"Nucleotide GTR":0.001212853567128205,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "C", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGT", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001217473767749674,
"Nucleotide GTR":0.001212853563170984,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "F", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "TTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001217223514366493,
"Nucleotide GTR":0.001212604259477115,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGT", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219038078703268,
"Nucleotide GTR":0.001214411937703752,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "HPRL", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGT", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CNT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002458522660850012,
"Nucleotide GTR":0.002449192786190398,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "IM", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "F", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "AT-", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "TTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 9.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001217899412093202,
"Nucleotide GTR":0.001213277592232114,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "A", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GCA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427174_Washington_20200326_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427174_Washington_20200326_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217897427695961,
"Nucleotide GTR":0.001213275615365486,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAT", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001220207483756515,
"Nucleotide GTR":0.001215576904968912,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "K", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "AAA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218257061641727,
"Nucleotide GTR":0.001213633884532438,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "I", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "ATT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427346_Liege_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCT", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427346_Liege_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217976340775563,
"Nucleotide GTR":0.001213354228976975,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "C", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGT", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217630749695203,
"Nucleotide GTR":0.001213009949384003,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATC", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218018275071721,
"Nucleotide GTR":0.00121339600413621,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217953397068686,
"Nucleotide GTR":0.001213331372339422,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "T", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ACT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001218044003452127,
"Nucleotide GTR":0.001213421634879702,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAC", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "ILVF", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "NTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "KTRI", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ANA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427420_Doha_20200323_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427420_Doha_20200323_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001217256429795094,
"Nucleotide GTR":0.001212637049994596,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121828003798795,
"Nucleotide GTR":0.001213656773685474,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "I", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "ATA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217234918570841,
"Nucleotide GTR":0.001212615620403523,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217156174227643,
"Nucleotide GTR":0.001212537174888098,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTG", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218044008509641,
"Nucleotide GTR":0.001213421639918026,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAC", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218652338047653,
"Nucleotide GTR":0.001214027660899588,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217238010171229,
"Nucleotide GTR":0.001212618700271564,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427605_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217811758144707,
"Nucleotide GTR":0.001213190270922553,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCT", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427605_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001217428075992308,
"Nucleotide GTR":0.00121280804480977,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217316208081588,
"Nucleotide GTR":0.001212696601427814,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "E", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "GAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121698220558786,
"Nucleotide GTR":0.001212363866443819,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001218044008566111,
"Nucleotide GTR":0.00121342163997428,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAC", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217623367234297,
"Nucleotide GTR":0.001213002594938878,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCT", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "G", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GGG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222862752097698,
"Nucleotide GTR":0.001218222096803092,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "L", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "CTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217405167895264,
"Nucleotide GTR":0.001212785223646914,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "V", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "GTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217392718420415,
"Nucleotide GTR":0.001212772821416714,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "M", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATG", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217234675156762,
"Nucleotide GTR":0.001212615377913179,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217234081858409,
"Nucleotide GTR":0.00121261478686634,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217897649645231,
"Nucleotide GTR":0.001213275836472477,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATT", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121804582575379,
"Nucleotide GTR":0.001213423450265894,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "L", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CTG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216510928316015,
"Nucleotide GTR":0.001211894377627271,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "V", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "GTA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "ED", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAN", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217011621172093,
"Nucleotide GTR":0.001212393170398528,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "V", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "S", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "TCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217897427695961,
"Nucleotide GTR":0.001213275615365486,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "V", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GTT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429004_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429004_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429010_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217473772824719,
"Nucleotide GTR":0.00121285356822677,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "S", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGT", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429010_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429020_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217392409872878,
"Nucleotide GTR":0.001212772514040088,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACG", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429020_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217536041161586,
"Nucleotide GTR":0.001212915600260839,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "A", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "GCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218044008506569,
"Nucleotide GTR":0.001213421639914964,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "P", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "CCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217234293885064,
"Nucleotide GTR":0.001212614998088373,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001222963397798959,
"Nucleotide GTR":0.001218322360562874,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "L", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "CTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217699610547633,
"Nucleotide GTR":0.001213078548915626,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "CTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218178620355174,
"Nucleotide GTR":0.001213555740923587,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "C", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGT", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00121794724519727,
"Nucleotide GTR":0.001213325243813812,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "L", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CTG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216795685253905,
"Nucleotide GTR":0.00121217805393793,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "S", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AGT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217064655488159,
"Nucleotide GTR":0.001212446003454085,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "I", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ATA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217610300545855,
"Nucleotide GTR":0.001212989577837355,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "C", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TGC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217269503658216,
"Nucleotide GTR":0.001212650074243569,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "F", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "TTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223287353502627,
"Nucleotide GTR":0.001218645086883483,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "P", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "CCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001217473772789045,
"Nucleotide GTR":0.00121285356819123,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "L", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CTT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218321054461217,
"Nucleotide GTR":0.001213697634504873,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "T", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "ACA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217084548127207,
"Nucleotide GTR":0.001212465820602337,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATT", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_81":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_81",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429816_NB_20200314_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429816_NB_20200314_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217224382513803,
"Nucleotide GTR":0.001212605124329885,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAG", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217240457169858,
"Nucleotide GTR":0.001212621137984051,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217897183916132,
"Nucleotide GTR":0.001213275372510779,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "T", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ACA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430006_Amman_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217238294588678,
"Nucleotide GTR":0.001212618983609674,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430006_Amman_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001263486474380726,
"Nucleotide GTR":0.001258691655676058,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGG", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430011_Amman_20200319_null_24":{
"Global MG94xREV":0.001217002533068295,
"Nucleotide GTR":0.001212384116783274,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430011_Amman_20200319_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":8.985698541406007e-05,
"Nucleotide GTR":8.951598615277436e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTA", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0012174737718609,
"Nucleotide GTR":0.001212853567266607,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "F", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTT", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001218280038213345,
"Nucleotide GTR":0.001213656773910012,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "I", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "ATT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430199_Washington_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430199_Washington_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217473772963648,
"Nucleotide GTR":0.00121285356836517,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "C", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "TGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217232695117563,
"Nucleotide GTR":0.001212613405388052,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217427080178357,
"Nucleotide GTR":0.001212807052774844,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217235148077795,
"Nucleotide GTR":0.001212615849039519,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222522020192435,
"Nucleotide GTR":0.001217882657945079,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "-", "D", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "NNN", "GAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223309245299677,
"Nucleotide GTR":0.001218666895603113,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "T", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "-", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "ACT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "NNN", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00121690569883625,
"Nucleotide GTR":0.001212287650028522,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "P", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CCA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217295280119324,
"Nucleotide GTR":0.001212675752885304,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "L", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CTT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223846317735749,
"Nucleotide GTR":0.001219201929897095,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "L", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217820985199736,
"Nucleotide GTR":0.001213199462961729,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "Y", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "TAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217844490277249,
"Nucleotide GTR":0.001213222878839564,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "S", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TCC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001217473772789045,
"Nucleotide GTR":0.00121285356819123,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTT", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430466_West_Bengal_20200326_null_163":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430466_West_Bengal_20200326_null_163",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001217598852754638,
"Nucleotide GTR":0.001212978173489489,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001217532677304869,
"Nucleotide GTR":0.00121291224916966,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001217356822640583,
"Nucleotide GTR":0.001212737061858172,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001230850980753629,
"Nucleotide GTR":0.001226180010842323,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "DAGV", "G", "L", "E", "A", "HPRL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "CW", "R", "YSCF", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "DAGV", "T", "KTRI", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "NTSI", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GNT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CNT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGN", "CGN", "TNC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GNC", "ACA", "ANA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ANC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "LF", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "EAGV", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "ILVF", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "KQE", "L", "Y", "SL", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACN", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTN", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GNA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "NTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCN", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "NAG", "CTG", "TAC", "TNA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "TPAS", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "NCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "ILVF", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "NTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217244212499525,
"Nucleotide GTR":0.001212624879062576,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "ILVF", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "NTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGN", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "QH", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAN", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "HPRL", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CNT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_145":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_145",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "ILVF", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "TPAS", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "NTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "NCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "DAGV", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GNT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "LF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "SRGC", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "KQE", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "KNTRSIM", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTN", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "NGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "NAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "ANN", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217811758117691,
"Nucleotide GTR":0.001213190270895639,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "S", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "TCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "ILVF", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "ILVF", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "ILVF", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "NTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "NTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "NTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "SRGC", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "NGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001217607862291894,
"Nucleotide GTR":0.001212987148836353,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "R", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AGG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "HPRL", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CNT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "NHDY", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "NAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "NHDY", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "NAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCN", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001218197697096023,
"Nucleotide GTR":0.001213574745269902,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "L", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TTG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "SWL", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TNG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "NTSIHPRLDAGVYCF", "Y", "L", "Y", "TPAS", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "ILVF", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "NNC", "TAT", "CTT", "TAT", "NCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "NTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "QH", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAN", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "RS", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "NHDY", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGN", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "NAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_39":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KTRM", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "QH", "-", "KQE", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "ILVF", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "SRGC", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ANG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAN", "NNN", "NAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "NTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "NGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001217822783121808,
"Nucleotide GTR":0.001213201254060847,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "P", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "CCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "YSCF", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "QPRL", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TNC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CNA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_1287":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_1287",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001217473772807214,
"Nucleotide GTR":0.001212853568209331,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "L", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "TTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001217767260813654,
"Nucleotide GTR":0.00121314594245491,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222294159995904,
"Nucleotide GTR":0.001217655662457712,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "G", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GGT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430797_Buenos_Aires_20200327_null_6638":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430797_Buenos_Aires_20200327_null_6638",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "NTSI", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ANT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001216597525280365,
"Nucleotide GTR":0.001211980645963847,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "R", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AGG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0012174737718609,
"Nucleotide GTR":0.001212853567266607,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "F", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430842_Nonthaburi_20200318_null_2695":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430842_Nonthaburi_20200318_null_2695",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":9289.223191534827,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02330414280183891],
[0.01836075228931243],
[0.01213370864709291],
[0.03326506901695377],
[0.01699588833775281],
[0.01339063609246632],
[0.008849205870492004],
[0.0242604674785624],
[0.01151970562986571],
[0.009076088458360795],
[0.005997935774837285],
[0.01644359142882678],
[0.0251149692126482],
[0.01978745720828462],
[0.01307654701991163],
[0.03584989979341727],
[0.0144210446543816],
[0.0113619810393249],
[0.007508568571300354],
[0.02058505433148659],
[0.01051737739267012],
[0.008286379064961479],
[0.005476056085792221],
[0.01501283646515046],
[0.007128611882712783],
[0.005616455325480167],
[0.003711636183254764],
[0.0101756056118402],
[0.01554161831176382],
[0.01224485304710801],
[0.008092014801951252],
[0.02218459654028469],
[0.02236014855110451],
[0.01761700278744695],
[0.01164220156612711],
[0.03191758182683024],
[0.01630742616116091],
[0.01284821393206111],
[0.00849074602340205],
[0.02327773483679002],
[0.01105307032054689],
[0.008708438148426485],
[0.005754973957452874],
[0.01577750145923506],
[0.02409762278005422],
[0.01898591535368356],
[0.01254684784533909],
[0.03439770738358874],
[0.019770065761864],
[0.03581839086304391],
[0.01830043915544016],
[0.0144184591115772],
[0.009528443020373182],
[0.02612262449311127],
[0.009772740400551819],
[0.006458318419392522],
[0.01770574967662737],
[0.02704271508691208],
[0.021306280053436],
[0.01408026155182342],
[0.0386016251025102]
],
"Log Likelihood":-4077.009752126997,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.071318576784168, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":565
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":10068.28897167907,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2704006405495981],
[0.2105448992322586],
[0.184652869105904],
[0.3344015911122393]
],
"Log Likelihood":-4128.935377290902,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.4453345459671672,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1644604208310735,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.324976324580522,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.340856751277383,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.615928414295595
},
"display order":0,
"estimated parameters":903
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-28/sequences.ORF3a.compressed.fas",
"number of sequences":449,
"number of sites":275,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_425611_England_20200329_null_2,epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1,epi_isl_421827_England_20200324_null_2,epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1,epi_isl_423511_England_20200401_null_9,epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29,epi_isl_423876_England_20200318_null_3,epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5,epi_isl_423410_England_20200330_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_3,epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2,epi_isl_418738_England_20200317_null_1,epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1,epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1,epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1,epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1,epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1,epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3,epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1,epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4,epi_isl_423561_England_20200331_null_2,epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1,epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2,epi_isl_423338_England_20200327_null_1,epi_isl_425280_England_20200101_null_1,epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1,epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2,epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4,epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1,epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1,epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1,epi_isl_429010_California_20200328_null_1,epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1,epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_1,epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3,epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5,epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4,(epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1)Node50,epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2,epi_isl_429020_California_20200331_null_1,epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6,epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1,epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1,epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1,(epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1,epi_isl_421663_India_20200310_null_1)Node68,epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2,epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1,epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1,epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1,epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1,epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1,epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2,epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3,epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5,epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2,epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_421956_England_20200331_null_2,epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1,epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_425439_England_20200101_null_1,(epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2,epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2)Node835,epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2,epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1,epi_isl_418925_USA_20200301_null_1,((epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1,epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1,epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1,epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115,epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1,epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2)Node815,epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15)Node814,epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1,(epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1,epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1)Node806,epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1,epi_isl_423542_England_20200330_null_1,(epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18,epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1)Node798,epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_4,(epi_isl_423726_England_20200322_null_1,epi_isl_421990_England_20200331_null_1,epi_isl_430199_Washington_20200317_null_3)Node789,(epi_isl_424154_England_20200320_null_1,epi_isl_427346_Liege_20200330_null_3)Node786,epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1,((epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1,epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1)Node766,epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1)Node765,(epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3,epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2,epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2)Node713,(epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1,epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3,epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1)Node703,(epi_isl_423505_England_20200330_null_7,epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2,epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2)Node698,((epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4,epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7)Node695,epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5)Node691,(epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1,epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2,epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_2)Node686,(epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2,epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1,epi_isl_425639_England_20200330_null_3,epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2)Node679,((epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_421858_England_20200326_null_2,epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1)Node673,epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1)Node672,(epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1,epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1)Node652,(epi_isl_425632_England_20200330_null_3,epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1)Node649,(epi_isl_430006_Amman_20200323_null_2,epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11,epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1)Node644,(epi_isl_429004_California_20200328_null_1,epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2)Node641,(epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1,epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3)Node638,(epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1,epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_4)Node635,(epi_isl_420669_England_20200327_null_1,epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2)Node632,(epi_isl_423922_England_20200319_null_1,epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1)Node629,(epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1,epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_2)Node626,(epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2,epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1)Node623,(epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2,epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2)Node620,(epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1,epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2)Node617,(epi_isl_421854_England_20200327_null_1,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1)Node614,(epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1,epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1)Node611,(epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1,epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_5)Node608,(epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2)Node605,((epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1,epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1)Node599,(epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1,epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9)Node596,((epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423926_England_20200318_null_1)Node457,epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1)Node456,epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1,((epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1,(epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_424013_England_20200321_null_9)Node439,epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2,epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1,(epi_isl_420518_England_20200323_null_1,epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1)Node434,(epi_isl_423840_England_20200324_null_1,epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1)Node431,epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_421871_England_20200327_null_1,epi_isl_423846_England_20200324_null_1,epi_isl_423913_England_20200318_null_1,epi_isl_423957_England_20200319_null_1,epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5,epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1,(epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1,epi_isl_425627_England_20200329_null_4)Node416,epi_isl_423998_England_20200321_null_1,epi_isl_424037_England_20200320_null_1,epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_422006_England_20200403_null_1,epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_1287,epi_isl_423080_England_20200323_null_2,epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1,epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6,epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1,epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1,epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1,epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1,epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1,(epi_isl_421893_England_20200327_null_1,epi_isl_423914_England_20200318_null_1)Node395,epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1,epi_isl_418713_England_20200317_null_1,epi_isl_423047_England_20200324_null_1,epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1,epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_423995_England_20200321_null_2,epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6,epi_isl_423341_England_20200327_null_1,epi_isl_422436_England_20200327_null_1,epi_isl_423663_England_20200323_null_1,epi_isl_420685_England_20200329_null_1,epi_isl_418698_England_20200317_null_1,epi_isl_424021_England_20200320_null_1)Node352,epi_isl_423647_England_20200322_null_1,epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1)Node351,(epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1,(epi_isl_425585_England_20200324_null_1,epi_isl_430011_Amman_20200319_null_24)Node450,epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3)Node448,epi_isl_423619_England_20200320_null_1,((epi_isl_423558_England_20200331_null_1,epi_isl_424012_England_20200320_null_28)Node591,epi_isl_421775_England_20200325_null_1)Node590,epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1,(epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1,epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2)Node564,epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1,epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1,epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1,epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1,epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1,epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1,epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_427605_New_York_20200316_null_1,epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2,(epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1,epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1)Node548,epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1,epi_isl_424136_England_20200320_null_3,epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2,epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2,epi_isl_430842_Nonthaburi_20200318_null_2695,epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1,epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2,epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3,epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1,epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1,epi_isl_420704_England_20200328_null_1,epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_7,epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1,epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1,epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1,epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1,epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1,epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1,epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1,epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1,epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1,(epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1,epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1)Node525,epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1,epi_isl_423863_England_20200317_null_1,epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1,epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_423633_England_20200321_null_1,epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1,epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1,(epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1,epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1)Node570,epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1,(epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1,epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1)Node575,epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1,((epi_isl_423562_England_20200401_null_1,epi_isl_423564_England_20200401_null_1)Node586,epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_81,epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1,epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1)Node580,epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2)Node345,(epi_isl_423586_England_20200402_null_2,epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2)Node602,(epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2,epi_isl_425609_England_20200325_null_4,epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1)Node658,(epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1,epi_isl_418730_England_20200318_null_1,epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1,epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1)Node665,(epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1,epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1)Node709,epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1,epi_isl_423203_England_20200324_null_2,(epi_isl_425602_England_20200325_null_1,epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1,epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_12)Node732,(epi_isl_421932_England_20200331_null_1,epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1)Node729,(epi_isl_423155_England_20200323_null_2,epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1)Node723,(epi_isl_423363_England_20200329_null_1,epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6)Node726,(epi_isl_423340_England_20200327_null_2,(epi_isl_423670_England_20200320_null_12,epi_isl_423952_England_20200319_null_3)Node761,epi_isl_423567_England_20200401_null_1,epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_421866_England_20200327_null_1,epi_isl_430466_West_Bengal_20200326_null_163,epi_isl_423431_England_20200329_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1)Node744,(epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1,epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6)Node740,epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_11,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_423319_England_20200326_null_2,epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3,(epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2,epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_3)Node777,epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2,(epi_isl_423960_England_20200319_null_2,epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_3)Node312,(epi_isl_418728_England_20200318_null_1,epi_isl_424103_England_20200313_null_3)Node309,epi_isl_423897_England_20200318_null_1,epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5,epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2,(epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1)Node223,epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1,(epi_isl_427174_Washington_20200326_null_6,epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5)Node229,epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1,(epi_isl_423364_England_20200328_null_1,epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2)Node295,((epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1,epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6,epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1)Node289,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1)Node288,(epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1,epi_isl_423919_England_20200320_null_1)Node245,(epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1,epi_isl_425325_England_20200329_null_1)Node241,epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1,(epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1,epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1)Node254,(epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1,epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1)Node250,epi_isl_427420_Doha_20200323_null_31,(epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1,epi_isl_423175_England_20200324_null_1,epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17)Node269,(epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1,epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6,epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1,epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_39)Node259,epi_isl_421872_England_20200327_null_1,(epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1,epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2)Node277,epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2,(epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_421891_England_20200327_null_2,epi_isl_423517_England_20200330_null_1)Node282,epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2,((epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2,epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_145)Node301,epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1)Node300,epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_423166_England_20200319_null_1,epi_isl_423309_England_20200325_null_1,epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1,epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1,epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1,epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1,epi_isl_423821_England_20200323_null_1,epi_isl_423712_England_20200322_null_1,epi_isl_423575_England_20200331_null_1,epi_isl_423239_England_20200324_null_1,epi_isl_421830_England_20200325_null_1,((epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26,epi_isl_423291_England_20200326_null_1)Node197,epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2)Node196,epi_isl_420706_England_20200328_null_1,epi_isl_420671_England_20200328_null_1,(epi_isl_423659_England_20200323_null_1,epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2)Node120,(epi_isl_424122_England_20200312_null_1,epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2)Node117,epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3,epi_isl_424115_England_20200312_null_6,epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1,epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1,(epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1)Node149,epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2,epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1,epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_423802_England_20200223_null_1,epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1,(epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1)Node144,epi_isl_430797_Buenos_Aires_20200327_null_6638,epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,(epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1,epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1)Node164,epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1,(epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2)Node159,epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1,(epi_isl_423572_England_20200401_null_1,(epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8,epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1)Node170,epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2)Node168,(epi_isl_423396_England_20200328_null_2,epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8)Node176,epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7,epi_isl_423290_England_20200326_null_1,epi_isl_421972_England_20200401_null_1,(epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1,epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1,epi_isl_429816_NB_20200314_null_32)Node183,(epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1)Node188)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node117":"test",
"Node120":"test",
"Node144":"test",
"Node149":"test",
"Node159":"test",
"Node164":"test",
"Node168":"test",
"Node170":"test",
"Node176":"test",
"Node183":"test",
"Node188":"test",
"Node196":"test",
"Node197":"test",
"Node223":"test",
"Node229":"test",
"Node241":"test",
"Node245":"test",
"Node250":"test",
"Node254":"test",
"Node259":"test",
"Node269":"test",
"Node277":"test",
"Node282":"test",
"Node288":"test",
"Node289":"test",
"Node295":"test",
"Node300":"test",
"Node301":"test",
"Node309":"test",
"Node312":"test",
"Node345":"test",
"Node351":"test",
"Node352":"test",
"Node395":"test",
"Node416":"test",
"Node431":"test",
"Node434":"test",
"Node439":"test",
"Node448":"test",
"Node450":"test",
"Node456":"test",
"Node457":"test",
"Node50":"test",
"Node525":"test",
"Node548":"test",
"Node564":"test",
"Node570":"test",
"Node575":"test",
"Node580":"test",
"Node586":"test",
"Node590":"test",
"Node591":"test",
"Node596":"test",
"Node599":"test",
"Node602":"test",
"Node605":"test",
"Node608":"test",
"Node611":"test",
"Node614":"test",
"Node617":"test",
"Node620":"test",
"Node623":"test",
"Node626":"test",
"Node629":"test",
"Node632":"test",
"Node635":"test",
"Node638":"test",
"Node641":"test",
"Node644":"test",
"Node649":"test",
"Node652":"test",
"Node658":"test",
"Node665":"test",
"Node672":"test",
"Node673":"test",
"Node679":"test",
"Node68":"test",
"Node686":"test",
"Node691":"test",
"Node695":"test",
"Node698":"test",
"Node703":"test",
"Node709":"test",
"Node713":"test",
"Node723":"test",
"Node726":"test",
"Node729":"test",
"Node732":"test",
"Node740":"test",
"Node744":"test",
"Node761":"test",
"Node765":"test",
"Node766":"test",
"Node777":"test",
"Node786":"test",
"Node789":"test",
"Node798":"test",
"Node806":"test",
"Node814":"test",
"Node815":"test",
"Node835":"test",
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":"test",
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2":"test",
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":"test",
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5":"test",
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418925_USA_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":"test",
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420669_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":"test",
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7":"test",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_421830_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421854_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421858_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421891_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421932_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421956_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421972_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15":"test",
"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26":"test",
"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115":"test",
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423047_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423080_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423155_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423166_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423175_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423239_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423290_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423291_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423309_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423340_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_423341_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423364_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423396_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_423410_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423431_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423505_England_20200330_null_7":"test",
"epi_isl_423511_England_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_423517_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423542_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423561_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423572_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423586_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_423619_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423633_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423647_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423663_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423670_England_20200320_null_12":"test",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423712_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_423821_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423840_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423846_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423876_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_423897_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423914_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423919_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423922_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423926_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423952_England_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_423957_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423960_England_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_423995_England_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424012_England_20200320_null_28":"test",
"epi_isl_424013_England_20200321_null_9":"test",
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424037_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424103_England_20200313_null_3":"test",
"epi_isl_424115_England_20200312_null_6":"test",
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424136_England_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_425280_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425325_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425439_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425602_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425609_England_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_425611_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_425627_England_20200329_null_4":"test",
"epi_isl_425632_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425639_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17":"test",
"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6":"test",
"epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426432_Pennsylvania_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426527_Arizona_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426545_Arizona_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426584_Montevideo_20200319_null_6":"test",
"epi_isl_426619_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426672_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426702_Victoria_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426744_Victoria_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_426759_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426785_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426805_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426834_Victoria_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_5":"test",
"epi_isl_426899_Northern_territory_20200327_null_11":"test",
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426988_Victoria_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_427167_Idaho_20200326_null_6":"test",
"epi_isl_427174_Washington_20200326_null_6":"test",
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427251_Washington_20200331_null_11":"test",
"epi_isl_427265_Washington_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_427304_Rio_de_Janeiro_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427322_Saint_Petersburg_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_427346_Liege_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_427347_Liege_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427365_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427367_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427382_Liege_20200408_null_4":"test",
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_427418_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427420_Doha_20200323_null_31":"test",
"epi_isl_427453_Wisconsin_20200406_null_8":"test",
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_8":"test",
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_427484_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427508_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427551_New_York_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_427605_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_7":"test",
"epi_isl_427659_New_South_Wales_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427728_New_South_Wales_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_427735_New_South_Wales_20200318_null_6":"test",
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_428378_Connecticut_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_428389_Connecticut_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_3":"test",
"epi_isl_428465_Guangdong_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_3":"test",
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_428674_Madrid_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_428688_Madrid_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_428694_Madrid_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_428711_Madrid_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_428832_Singapore_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_428835_Singapore_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_428864_Moscow_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_428959_Luxembourg_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_429004_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429010_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429020_California_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_429176_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429285_Unknown_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_429412_Unknown_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_429434_Unknown_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_429440_Unknown_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_429544_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429554_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_429630_Washington_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_429647_Washington_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429682_Minas_gerais_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_429701_Minas_gerais_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_429764_Luxembourg_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_429790_Luxembourg_20200327_null_81":"test",
"epi_isl_429816_NB_20200314_null_32":"test",
"epi_isl_429843_Wisconsin_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429845_Iowa_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_429988_Virginia_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_429992_Amman_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_430006_Amman_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_430010_Ohio_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_430011_Amman_20200319_null_24":"test",
"epi_isl_430035_Utah_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_430051_Utah_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430118_Washington_20200303_null_4":"test",
"epi_isl_430199_Washington_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_430204_Washington_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_430252_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_430277_Washington_20200307_null_2":"test",
"epi_isl_430293_Washington_20200308_null_6":"test",
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430338_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430351_New_York_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430370_New_York_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430371_New_Jersey_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_430372_New_York_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_430375_New_York_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430402_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_4":"test",
"epi_isl_430466_West_Bengal_20200326_null_163":"test",
"epi_isl_430473_Victoria_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_430491_Victoria_20200331_null_7":"test",
"epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430523_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430535_Victoria_20200403_null_12":"test",
"epi_isl_430544_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430567_Victoria_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430570_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430583_Victoria_20200407_null_6":"test",
"epi_isl_430584_Victoria_20200407_null_145":"test",
"epi_isl_430589_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430590_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430615_Victoria_20200409_null_3":"test",
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430633_Northern_Territory_20200101_null_3":"test",
"epi_isl_430636_Northern_Territory_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_430650_Victoria_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_430651_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430667_Victoria_20200403_null_18":"test",
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_6":"test",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430689_Victoria_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_430691_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_39":"test",
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430714_Victoria_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_1287":"test",
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_5":"test",
"epi_isl_430740_Beijing_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_430796_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430797_Buenos_Aires_20200327_null_6638":"test",
"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430806_Buenos_Aires_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_430807_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430808_Rio_Negro_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430812_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_430842_Nonthaburi_20200318_null_2695":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":20
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":7
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":27
}
}
}